MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Sulfolobus islandicus HVE10/4 chromosome

Total Repeats: 929

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017275	ATGAGG	2	12	936	947	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385772022
2	NC_017275	GTATTG	2	12	1830	1841	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385772022
3	NC_017275	AATTGC	2	12	2930	2941	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385772024
4	NC_017275	CCTCTG	2	12	4348	4359	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	385772027
5	NC_017275	ATTGAT	2	12	4856	4867	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385772028
6	NC_017275	TAGTCT	2	12	5167	5178	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385772028
7	NC_017275	CAATGG	2	12	8241	8252	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385772032
8	NC_017275	TATTCG	2	12	13377	13388	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385772036
9	NC_017275	GTATTT	2	12	17926	17937	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385772040
10	NC_017275	CTATTC	2	12	18105	18116	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385772040
11	NC_017275	GTCACT	2	12	25813	25824	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385772048
12	NC_017275	TCCTCT	2	12	29411	29422	0 %	50 %	0 %	50 %	385772052
13	NC_017275	TTGATT	2	12	31455	31466	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385772054
14	NC_017275	AGTGCA	2	12	31548	31559	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385772054
15	NC_017275	ACGTCT	2	12	34723	34734	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385772058
16	NC_017275	TTTATC	2	12	36404	36415	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385772061
17	NC_017275	TCAGCT	2	12	38038	38049	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385772064
18	NC_017275	AAGAAA	2	12	39735	39746	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385772066
19	NC_017275	CATTGG	2	12	40053	40064	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385772067
20	NC_017275	CTTAAA	2	12	43906	43917	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385772072
21	NC_017275	ATATTC	2	12	43956	43967	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385772072
22	NC_017275	GGTGAG	2	12	45148	45159	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	385772074
23	NC_017275	CTTTCT	2	12	47374	47385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385772076
24	NC_017275	GTTTTC	2	12	49884	49895	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385772079
25	NC_017275	TAAAAT	2	12	49959	49970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385772079
26	NC_017275	TCTAAT	2	12	54004	54015	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385772083
27	NC_017275	TCTTTT	2	12	54189	54200	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385772083
28	NC_017275	CCTCGT	2	12	55453	55464	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	385772084
29	NC_017275	TATTTC	2	12	56141	56152	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385772084
30	NC_017275	CTTAAT	2	12	59181	59192	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385772087
31	NC_017275	GAGCTG	2	12	59683	59694	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385772087
32	NC_017275	TGATGC	2	12	59939	59950	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385772087
33	NC_017275	AAATGT	2	12	60090	60101	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385772087
34	NC_017275	ATAGTC	2	12	64868	64879	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385772092
35	NC_017275	CTAGTA	2	12	65676	65687	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385772093
36	NC_017275	CCGATA	2	12	75989	76000	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385772109
37	NC_017275	TTTCAT	2	12	78547	78558	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385772112
38	NC_017275	TAGCAT	2	12	82396	82407	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385772116
39	NC_017275	ACTTTT	2	12	90087	90098	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385772123
40	NC_017275	AATGTA	2	12	90465	90476	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385772123
41	NC_017275	CTCATT	2	12	96181	96192	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385772130
42	NC_017275	AAAGCC	2	12	96895	96906	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385772131
43	NC_017275	CTCATA	2	12	101965	101976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385772138
44	NC_017275	TTATGA	2	12	103893	103904	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385772141
45	NC_017275	TCTCTA	2	12	106889	106900	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385772143
46	NC_017275	GTATTA	2	12	109223	109234	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385772146
47	NC_017275	CCAATA	2	12	109573	109584	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385772147
48	NC_017275	TATGCT	2	12	110237	110248	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385772147
49	NC_017275	TATTGT	2	12	110475	110486	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385772148
50	NC_017275	TTACAA	2	12	112082	112093	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385772150
51	NC_017275	AGTATT	2	12	113740	113751	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385772151
52	NC_017275	GTTATA	2	12	115342	115353	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385772154
53	NC_017275	TAAACA	2	12	117277	117288	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385772156
54	NC_017275	TAGAGA	2	12	117427	117438	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385772156
55	NC_017275	CACATC	2	12	124434	124445	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	385772163
56	NC_017275	TAAGAG	2	12	125678	125689	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385772165
57	NC_017275	CTATCC	2	12	125782	125793	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	385772165
58	NC_017275	GTAATT	2	12	127650	127661	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385772167
59	NC_017275	TGGTAT	2	12	129298	129309	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385772169
60	NC_017275	GCTAAA	2	12	132607	132618	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385772175
61	NC_017275	TTAGCT	2	12	137209	137220	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385772179
62	NC_017275	TAGGAA	2	12	139742	139753	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385772181
63	NC_017275	TGGTAA	2	12	141436	141447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385772183
64	NC_017275	GGTAGT	2	12	149441	149452	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385772194
65	NC_017275	CTAGAG	2	12	150033	150044	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385772195
66	NC_017275	CATCTT	2	12	153769	153780	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385772200
67	NC_017275	ATAAGG	2	12	159349	159360	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385772206
68	NC_017275	ACTTTT	2	12	166214	166225	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385772213
69	NC_017275	TAAGGA	2	12	172095	172106	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385772219
70	NC_017275	TTCCTC	2	12	174464	174475	0 %	50 %	0 %	50 %	385772223
71	NC_017275	TTAGTT	2	12	177857	177868	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385772229
72	NC_017275	CAAATA	2	12	179668	179679	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385772233
73	NC_017275	GGAGAA	2	12	185417	185428	50 %	0 %	50 %	0 %	385772238
74	NC_017275	TTGCCA	2	12	185592	185603	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385772238
75	NC_017275	ATTCTC	2	12	188527	188538	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385772241
76	NC_017275	CAAAGG	2	12	190765	190776	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385772243
77	NC_017275	GGCTAA	2	12	191098	191109	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385772243
78	NC_017275	TTCTAT	2	12	191432	191443	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385772244
79	NC_017275	TGAGGA	2	12	192662	192673	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385772245
80	NC_017275	AATGGT	2	12	193070	193081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385772245
81	NC_017275	ACTTTT	2	12	195216	195227	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385772249
82	NC_017275	GAATAA	2	12	198369	198380	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385772255
83	NC_017275	TAATTC	2	12	204159	204170	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385772261
84	NC_017275	TCTATA	2	12	204242	204253	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385772261
85	NC_017275	CACTGC	2	12	206707	206718	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385772264
86	NC_017275	AGGTTT	2	12	207188	207199	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385772265
87	NC_017275	TCCAAA	2	12	209389	209400	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385772267
88	NC_017275	TTCCAG	2	12	209817	209828	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385772267
89	NC_017275	AATTAA	2	12	214786	214797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385772274
90	NC_017275	AGTTTT	2	12	217393	217404	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385772277
91	NC_017275	TTTACC	2	12	220368	220379	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385772279
92	NC_017275	TATTTT	2	12	220932	220943	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385772280
93	NC_017275	CAGAAG	2	12	222223	222234	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385772281
94	NC_017275	GCTGGA	2	12	223492	223503	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385772282
95	NC_017275	GCTATT	2	12	224921	224932	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385772283
96	NC_017275	GTAATC	2	12	233355	233366	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385772293
97	NC_017275	GAAGAG	2	12	235104	235115	50 %	0 %	50 %	0 %	385772295
98	NC_017275	AATTAA	2	12	235117	235128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385772295
99	NC_017275	AACAAT	2	12	236897	236908	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385772298
100	NC_017275	TACCCA	2	12	238632	238643	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	385772301
101	NC_017275	CCTATA	2	12	238871	238882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385772301
102	NC_017275	TTCTTT	2	12	240661	240672	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385772303
103	NC_017275	GTTATA	2	12	244695	244706	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385772307
104	NC_017275	CTTCAA	2	12	245389	245400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385772307
105	NC_017275	AAGTTG	2	12	248689	248700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385772312
106	NC_017275	TTCTAT	2	12	260365	260376	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385772323
107	NC_017275	AATAGG	2	12	260691	260702	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385772323
108	NC_017275	AGTTAC	2	12	263716	263727	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385772327
109	NC_017275	TTTTTA	2	12	269353	269364	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385772331
110	NC_017275	TTCATG	2	12	271985	271996	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385772334
111	NC_017275	CTAATG	2	12	272346	272357	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385772335
112	NC_017275	AAGAGA	2	12	276838	276849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385772338
113	NC_017275	TACCGT	2	12	277119	277130	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385772339
114	NC_017275	TTACTG	2	12	278643	278654	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385772340
115	NC_017275	ATAAGT	2	12	280041	280052	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385772341
116	NC_017275	TTAATC	2	12	283588	283599	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385772345
117	NC_017275	GAGTAG	2	12	289416	289427	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385772355
118	NC_017275	AGGTTA	2	12	293557	293568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385772361
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153	NC_017275	TATAAT	2	12	434592	434603	50 %	50 %	0 %	0 %	385772485
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459	NC_017275	TACTGT	2	12	1398070	1398081	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385773421
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