MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Sulfolobus solfataricus 98/2 chromosome

Total Repeats: 502

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017274	CTTAA	2	10	7114	7123	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017274	TTATA	2	10	7191	7200	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017274	CTATA	2	10	7361	7370	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017274	TAACG	2	10	7840	7849	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017274	AGATA	2	10	40401	40410	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017274	TGGTG	2	10	40536	40545	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017274	ATCGT	2	10	54691	54700	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017274	TAGGG	2	10	72265	72274	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017274	ATATG	2	10	86206	86215	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017274	GTATT	2	10	104584	104593	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017274	CTTCA	2	10	106089	106098	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_017274	AATGT	2	10	109825	109834	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017274	CTCAC	2	10	115280	115289	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
14	NC_017274	AACAT	2	10	119260	119269	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017274	CCTCC	2	10	126127	126136	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
16	NC_017274	TCATT	2	10	130378	130387	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017274	AAATA	2	10	144092	144101	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017274	TATAA	2	10	151925	151934	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017274	GAGTC	2	10	152136	152145	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017274	ATTAA	2	10	154576	154585	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017274	ATAGT	2	10	189880	189889	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017274	TAAAT	2	10	226256	226265	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017274	ATGTA	2	10	232321	232330	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017274	GGGGA	2	10	241497	241506	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017274	AGATT	2	10	242993	243002	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017274	TGAAA	2	10	243326	243335	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017274	AATTT	2	10	248285	248294	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017274	GTACT	2	10	255765	255774	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017274	GAGCA	2	10	260077	260086	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017274	TAATA	2	10	262059	262068	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017274	AAATT	2	10	262714	262723	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017274	GGTTC	2	10	263021	263030	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017274	ATTAT	2	10	265612	265621	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017274	ATAAA	2	10	267515	267524	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017274	TCAAT	2	10	281524	281533	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017274	GTTAA	2	10	289163	289172	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017274	ATTAA	2	10	294127	294136	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017274	TTAAA	2	10	296796	296805	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017274	AACAT	2	10	307144	307153	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017274	TACGT	2	10	309514	309523	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017274	CTCAT	2	10	311677	311686	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_017274	CCTCC	2	10	313800	313809	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
43	NC_017274	TATCT	2	10	315588	315597	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_017274	ATTCC	2	10	316129	316138	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_017274	ACTTA	2	10	316437	316446	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017274	CATTT	2	10	318510	318519	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017274	CTATC	2	10	318745	318754	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_017274	ATGTA	2	10	320945	320954	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017274	TATTC	2	10	328527	328536	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_017274	GCACA	2	10	335751	335760	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_017274	GTGAA	2	10	340975	340984	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017274	TACGT	2	10	350595	350604	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017274	TGGTT	2	10	352002	352011	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017274	TACTT	2	10	362050	362059	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017274	TAATG	2	10	371413	371422	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017274	CCTCA	2	10	376891	376900	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
57	NC_017274	GTATA	2	10	377190	377199	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017274	TAAGA	2	10	390186	390195	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017274	ATAAA	2	10	401385	401394	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017274	AATAT	2	10	401408	401417	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017274	ACATA	2	10	419262	419271	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017274	AATTA	2	10	425919	425928	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017274	AACAT	2	10	426352	426361	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017274	ATGTA	2	10	428063	428072	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017274	AACAT	2	10	433707	433716	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017274	ACTTA	2	10	435833	435842	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017274	AAAAT	2	10	446714	446723	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017274	ATTTC	2	10	451529	451538	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017274	TTATC	2	10	454377	454386	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017274	TTAAC	2	10	465464	465473	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_017274	GTCAC	2	10	480140	480149	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
72	NC_017274	AAAGA	2	10	482811	482820	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017274	TACTT	2	10	484770	484779	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_017274	TATAA	2	10	492481	492490	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017274	AATGT	2	10	506007	506016	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017274	TAGAA	2	10	514979	514988	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017274	GAAAT	2	10	515046	515055	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017274	TAAAA	2	10	524288	524297	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017274	ATTTA	2	10	531234	531243	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017274	ATATT	2	10	539321	539330	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017274	CAGTA	2	10	541562	541571	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017274	ATGTA	2	10	541986	541995	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017274	TTGAA	2	10	548944	548953	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017274	ATAAG	2	10	549765	549774	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017274	ATACT	2	10	550580	550589	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017274	CTAAC	2	10	550892	550901	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_017274	AAAGT	2	10	551566	551575	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017274	TTCAT	2	10	561797	561806	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017274	TGAAA	2	10	562731	562740	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017274	AAATT	2	10	592808	592817	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017274	ACAGC	2	10	600960	600969	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
92	NC_017274	CCCTT	2	10	602495	602504	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
93	NC_017274	TCACT	2	10	602785	602794	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
94	NC_017274	TAGAA	2	10	602954	602963	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017274	AAATT	2	10	603697	603706	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017274	GAATA	2	10	603987	603996	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017274	TAAAA	2	10	631041	631050	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017274	TGGTA	2	10	633064	633073	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017274	ACCTC	2	10	636449	636458	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
100	NC_017274	GTCAT	2	10	636634	636643	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017274	ACAGC	2	10	636829	636838	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
102	NC_017274	AACCT	2	10	637243	637252	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
103	NC_017274	TTCTC	2	10	637929	637938	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_017274	TTGAT	2	10	641272	641281	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017274	GTTGA	2	10	642463	642472	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017274	ATAGT	2	10	643517	643526	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017274	CAATA	2	10	643564	643573	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_017274	TACGT	2	10	645826	645835	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_017274	TAATA	2	10	657733	657742	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017274	TCAAA	2	10	659663	659672	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_017274	AACAT	2	10	660740	660749	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_017274	GGGGA	2	10	662801	662810	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017274	TAACT	2	10	664090	664099	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_017274	CAGCT	2	10	673521	673530	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_017274	TAATA	2	10	673800	673809	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017274	TACGT	2	10	675379	675388	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_017274	CCTTA	2	10	675709	675718	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
118	NC_017274	TAACG	2	10	678336	678345	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017274	GAGTA	2	10	684398	684407	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017274	ATAGT	2	10	688796	688805	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017274	GTTAT	2	10	698615	698624	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017274	ATACT	2	10	703665	703674	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017274	ATATT	2	10	711168	711177	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017274	AACAT	2	10	719458	719467	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_017274	ACTTT	2	10	725794	725803	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_017274	TTTTC	2	10	733628	733637	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_017274	TATCA	2	10	737879	737888	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017274	TGGAT	2	10	743465	743474	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017274	TAATA	2	10	745386	745395	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017274	TAAAA	2	10	746514	746523	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017274	ATCGA	2	10	746570	746579	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_017274	TTAAA	2	10	748845	748854	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017274	ACAAT	2	10	749085	749094	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017274	TTATA	2	10	755906	755915	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017274	ATAGT	2	10	766184	766193	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017274	ATAAC	2	10	767040	767049	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_017274	AATTT	2	10	776727	776736	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017274	GGGGA	2	10	787588	787597	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017274	TCATT	2	10	789046	789055	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_017274	GCTAA	2	10	789235	789244	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_017274	TTGGA	2	10	806080	806089	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017274	ATTTT	2	10	809361	809370	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017274	CTTCA	2	10	818918	818927	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
144	NC_017274	TCAAT	2	10	832346	832355	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_017274	TAACG	2	10	833914	833923	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_017274	TGTTT	2	10	835404	835413	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017274	ATGTT	2	10	838765	838774	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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