MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Sulfolobus solfataricus 98/2 chromosome

Total Repeats: 1874

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017274	GATAG	2	10	918	927	40 %	20 %	40 %	0 %	384432550
2	NC_017274	CAGAC	2	10	956	965	40 %	0 %	20 %	40 %	384432550
3	NC_017274	ATGGG	2	10	1182	1191	20 %	20 %	60 %	0 %	384432550
4	NC_017274	GATAA	2	10	2580	2589	60 %	20 %	20 %	0 %	384432552
5	NC_017274	GAAGA	2	10	2648	2657	60 %	0 %	40 %	0 %	384432552
6	NC_017274	CAGCT	2	10	2953	2962	20 %	20 %	20 %	40 %	384432552
7	NC_017274	ATATC	2	10	3184	3193	40 %	40 %	0 %	20 %	384432552
8	NC_017274	TTGGC	2	10	5666	5675	0 %	40 %	40 %	20 %	384432557
9	NC_017274	TTTTC	2	10	8502	8511	0 %	80 %	0 %	20 %	384432559
10	NC_017274	TAATT	2	10	8589	8598	40 %	60 %	0 %	0 %	384432559
11	NC_017274	ATATA	2	10	9952	9961	60 %	40 %	0 %	0 %	384432562
12	NC_017274	ATATA	2	10	12094	12103	60 %	40 %	0 %	0 %	384432564
13	NC_017274	AGATA	2	10	12257	12266	60 %	20 %	20 %	0 %	384432564
14	NC_017274	TACTT	2	10	13135	13144	20 %	60 %	0 %	20 %	384432565
15	NC_017274	TTTAT	2	10	13145	13154	20 %	80 %	0 %	0 %	384432565
16	NC_017274	CTCTT	2	10	13351	13360	0 %	60 %	0 %	40 %	384432565
17	NC_017274	CTTTT	2	10	14335	14344	0 %	80 %	0 %	20 %	384432566
18	NC_017274	TCTTT	2	10	14870	14879	0 %	80 %	0 %	20 %	384432566
19	NC_017274	TTCGG	2	10	16157	16166	0 %	40 %	40 %	20 %	384432566
20	NC_017274	ACATA	2	10	16643	16652	60 %	20 %	0 %	20 %	384432567
21	NC_017274	CATTT	2	10	18006	18015	20 %	60 %	0 %	20 %	384432567
22	NC_017274	AATTC	2	10	19276	19285	40 %	40 %	0 %	20 %	384432568
23	NC_017274	TTACT	2	10	21305	21314	20 %	60 %	0 %	20 %	384432571
24	NC_017274	ATGAT	2	10	21619	21628	40 %	40 %	20 %	0 %	384432571
25	NC_017274	AACTA	2	10	21650	21659	60 %	20 %	0 %	20 %	384432571
26	NC_017274	ATAGT	2	10	23572	23581	40 %	40 %	20 %	0 %	384432573
27	NC_017274	CTTAT	2	10	24560	24569	20 %	60 %	0 %	20 %	384432575
28	NC_017274	AATTT	2	10	25630	25639	40 %	60 %	0 %	0 %	384432576
29	NC_017274	AAGAG	2	10	25879	25888	60 %	0 %	40 %	0 %	384432576
30	NC_017274	CTATT	2	10	28644	28653	20 %	60 %	0 %	20 %	384432579
31	NC_017274	CTTTT	2	10	29365	29374	0 %	80 %	0 %	20 %	384432580
32	NC_017274	GATAA	2	10	30113	30122	60 %	20 %	20 %	0 %	384432581
33	NC_017274	TTTCC	2	10	32652	32661	0 %	60 %	0 %	40 %	384432583
34	NC_017274	ATATG	2	10	33672	33681	40 %	40 %	20 %	0 %	384432584
35	NC_017274	TTCAC	2	10	35187	35196	20 %	40 %	0 %	40 %	384432586
36	NC_017274	CTTCT	2	10	35302	35311	0 %	60 %	0 %	40 %	384432586
37	NC_017274	GTACT	2	10	35379	35388	20 %	40 %	20 %	20 %	384432586
38	NC_017274	ATTTT	2	10	37892	37901	20 %	80 %	0 %	0 %	384432590
39	NC_017274	CTTTA	2	10	38149	38158	20 %	60 %	0 %	20 %	384432590
40	NC_017274	ACCTT	2	10	38563	38572	20 %	40 %	0 %	40 %	384432592
41	NC_017274	TTTTC	2	10	40591	40600	0 %	80 %	0 %	20 %	384432596
42	NC_017274	ATTAT	2	10	40898	40907	40 %	60 %	0 %	0 %	384432596
43	NC_017274	TACCT	2	10	42690	42699	20 %	40 %	0 %	40 %	384432598
44	NC_017274	AAGGA	2	10	42725	42734	60 %	0 %	40 %	0 %	384432598
45	NC_017274	GGTTT	2	10	44864	44873	0 %	60 %	40 %	0 %	384432601
46	NC_017274	ATATT	2	10	45385	45394	40 %	60 %	0 %	0 %	384432602
47	NC_017274	TCCTT	2	10	48009	48018	0 %	60 %	0 %	40 %	384432606
48	NC_017274	CTCTT	2	10	48252	48261	0 %	60 %	0 %	40 %	384432606
49	NC_017274	TCTCT	2	10	48364	48373	0 %	60 %	0 %	40 %	384432606
50	NC_017274	CCTAT	2	10	48409	48418	20 %	40 %	0 %	40 %	384432606
51	NC_017274	TATAG	2	10	49292	49301	40 %	40 %	20 %	0 %	384432606
52	NC_017274	TTGTT	2	10	56633	56642	0 %	80 %	20 %	0 %	384432612
53	NC_017274	TTTCA	2	10	56996	57005	20 %	60 %	0 %	20 %	384432612
54	NC_017274	CATTA	2	10	57323	57332	40 %	40 %	0 %	20 %	384432612
55	NC_017274	TATTT	2	10	57377	57386	20 %	80 %	0 %	0 %	384432612
56	NC_017274	TTTAG	2	10	57714	57723	20 %	60 %	20 %	0 %	384432612
57	NC_017274	TTCTA	2	10	58250	58259	20 %	60 %	0 %	20 %	384432612
58	NC_017274	TACCT	2	10	60522	60531	20 %	40 %	0 %	40 %	384432614
59	NC_017274	CTGTA	2	10	60781	60790	20 %	40 %	20 %	20 %	384432614
60	NC_017274	ATTTA	2	10	61035	61044	40 %	60 %	0 %	0 %	384432614
61	NC_017274	CATTT	2	10	61694	61703	20 %	60 %	0 %	20 %	384432615
62	NC_017274	TTTCC	2	10	62065	62074	0 %	60 %	0 %	40 %	384432615
63	NC_017274	TAAAT	2	10	63576	63585	60 %	40 %	0 %	0 %	384432616
64	NC_017274	CAACA	2	10	64393	64402	60 %	0 %	0 %	40 %	384432618
65	NC_017274	TTAAT	2	10	68619	68628	40 %	60 %	0 %	0 %	384432621
66	NC_017274	TATCT	2	10	72547	72556	20 %	60 %	0 %	20 %	384432628
67	NC_017274	AATAG	2	10	73226	73235	60 %	20 %	20 %	0 %	384432629
68	NC_017274	AGGAT	2	10	76656	76665	40 %	20 %	40 %	0 %	384432634
69	NC_017274	ACTTT	2	10	80619	80628	20 %	60 %	0 %	20 %	384432639
70	NC_017274	CTTAT	2	10	82092	82101	20 %	60 %	0 %	20 %	384432641
71	NC_017274	TCTTT	2	10	82636	82645	0 %	80 %	0 %	20 %	384432641
72	NC_017274	CTCTT	2	10	84024	84033	0 %	60 %	0 %	40 %	384432642
73	NC_017274	TTGTT	2	10	84418	84427	0 %	80 %	20 %	0 %	384432643
74	NC_017274	AGGAT	2	10	87372	87381	40 %	20 %	40 %	0 %	384432646
75	NC_017274	ATTTT	2	10	88357	88366	20 %	80 %	0 %	0 %	384432646
76	NC_017274	ATTTC	2	10	92565	92574	20 %	60 %	0 %	20 %	384432650
77	NC_017274	AGATT	2	10	93039	93048	40 %	40 %	20 %	0 %	384432650
78	NC_017274	ATTGT	2	10	93049	93058	20 %	60 %	20 %	0 %	384432650
79	NC_017274	TATTT	2	10	94086	94095	20 %	80 %	0 %	0 %	384432651
80	NC_017274	TACAT	2	10	94711	94720	40 %	40 %	0 %	20 %	384432651
81	NC_017274	CTAAT	2	10	96652	96661	40 %	40 %	0 %	20 %	384432653
82	NC_017274	TTATC	2	10	99055	99064	20 %	60 %	0 %	20 %	384432656
83	NC_017274	ATTCC	2	10	101373	101382	20 %	40 %	0 %	40 %	384432659
84	NC_017274	CTATC	2	10	101750	101759	20 %	40 %	0 %	40 %	384432660
85	NC_017274	AGCAC	2	10	102180	102189	40 %	0 %	20 %	40 %	384432660
86	NC_017274	TAAAC	2	10	102894	102903	60 %	20 %	0 %	20 %	384432661
87	NC_017274	GAGAT	2	10	104064	104073	40 %	20 %	40 %	0 %	384432662
88	NC_017274	TTTAC	2	10	104824	104833	20 %	60 %	0 %	20 %	384432664
89	NC_017274	TTATC	2	10	104876	104885	20 %	60 %	0 %	20 %	384432664
90	NC_017274	AGGTT	2	10	108654	108663	20 %	40 %	40 %	0 %	384432667
91	NC_017274	GCTGT	2	10	109073	109082	0 %	40 %	40 %	20 %	384432667
92	NC_017274	ATTTT	2	10	110642	110651	20 %	80 %	0 %	0 %	384432669
93	NC_017274	TATCA	2	10	111058	111067	40 %	40 %	0 %	20 %	384432669
94	NC_017274	TTATC	2	10	111571	111580	20 %	60 %	0 %	20 %	384432670
95	NC_017274	TCTTA	2	10	112559	112568	20 %	60 %	0 %	20 %	384432670
96	NC_017274	TATTT	2	10	113266	113275	20 %	80 %	0 %	0 %	384432671
97	NC_017274	AACTG	2	10	114111	114120	40 %	20 %	20 %	20 %	384432673
98	NC_017274	TCACT	2	10	114511	114520	20 %	40 %	0 %	40 %	384432673
99	NC_017274	TGATA	2	10	114870	114879	40 %	40 %	20 %	0 %	384432674
100	NC_017274	TCTCC	2	10	116089	116098	0 %	40 %	0 %	60 %	384432675
101	NC_017274	TCCTT	2	10	116222	116231	0 %	60 %	0 %	40 %	384432675
102	NC_017274	ATATT	2	10	116454	116463	40 %	60 %	0 %	0 %	384432676
103	NC_017274	CCAGA	2	10	117924	117933	40 %	0 %	20 %	40 %	384432677
104	NC_017274	GTAGA	2	10	120029	120038	40 %	20 %	40 %	0 %	384432679
105	NC_017274	ATTTT	2	10	120728	120737	20 %	80 %	0 %	0 %	384432681
106	NC_017274	TACCT	2	10	121048	121057	20 %	40 %	0 %	40 %	384432681
107	NC_017274	ACATT	2	10	121603	121612	40 %	40 %	0 %	20 %	384432682
108	NC_017274	GGATT	2	10	124527	124536	20 %	40 %	40 %	0 %	384432685
109	NC_017274	TATCA	2	10	126859	126868	40 %	40 %	0 %	20 %	384432687
110	NC_017274	GAGAT	2	10	127234	127243	40 %	20 %	40 %	0 %	384432687
111	NC_017274	GAGAT	2	10	127420	127429	40 %	20 %	40 %	0 %	384432687
112	NC_017274	CTTCA	2	10	127776	127785	20 %	40 %	0 %	40 %	384432688
113	NC_017274	AATTT	2	10	132477	132486	40 %	60 %	0 %	0 %	384432692
114	NC_017274	ATAAA	2	10	133783	133792	80 %	20 %	0 %	0 %	384432694
115	NC_017274	TATCT	2	10	137053	137062	20 %	60 %	0 %	20 %	384432698
116	NC_017274	AAGCG	2	10	139092	139101	40 %	0 %	40 %	20 %	384432701
117	NC_017274	TATTG	2	10	139929	139938	20 %	60 %	20 %	0 %	384432702
118	NC_017274	AATCT	2	10	141202	141211	40 %	40 %	0 %	20 %	384432705
119	NC_017274	TTTTA	2	10	142611	142620	20 %	80 %	0 %	0 %	384432706
120	NC_017274	GAAAT	2	10	143628	143637	60 %	20 %	20 %	0 %	384432706
121	NC_017274	CTTAA	2	10	148053	148062	40 %	40 %	0 %	20 %	384432711
122	NC_017274	AGGAA	2	10	148832	148841	60 %	0 %	40 %	0 %	384432712
123	NC_017274	TCAAT	2	10	150712	150721	40 %	40 %	0 %	20 %	384432714
124	NC_017274	GATTG	2	10	154338	154347	20 %	40 %	40 %	0 %	384432717
125	NC_017274	AAAAT	2	10	155603	155612	80 %	20 %	0 %	0 %	384432718
126	NC_017274	GTATA	2	10	160433	160442	40 %	40 %	20 %	0 %	384432725
127	NC_017274	CCAAC	2	10	161385	161394	40 %	0 %	0 %	60 %	384432727
128	NC_017274	AGGTA	2	10	164626	164635	40 %	20 %	40 %	0 %	384432731
129	NC_017274	ATTAT	2	10	165606	165615	40 %	60 %	0 %	0 %	384432732
130	NC_017274	AAGGG	2	10	166158	166167	40 %	0 %	60 %	0 %	384432733
131	NC_017274	GCAAT	2	10	167224	167233	40 %	20 %	20 %	20 %	384432734
132	NC_017274	TCTAT	2	10	168298	168307	20 %	60 %	0 %	20 %	384432734
133	NC_017274	TCATT	2	10	168536	168545	20 %	60 %	0 %	20 %	384432734
134	NC_017274	AATGA	2	10	168903	168912	60 %	20 %	20 %	0 %	384432735
135	NC_017274	AGGTC	2	10	169017	169026	20 %	20 %	40 %	20 %	384432735
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