MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 plasmid pTHTHE1601

Total Repeats: 844

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017273	CTCC	2	8	304	311	0 %	25 %	0 %	75 %	384432130
2	NC_017273	TCCG	2	8	778	785	0 %	25 %	25 %	50 %	384432130
3	NC_017273	GTTG	2	8	1178	1185	0 %	50 %	50 %	0 %	384432130
4	NC_017273	CTAT	2	8	1231	1238	25 %	50 %	0 %	25 %	384432131
5	NC_017273	CTCG	2	8	1479	1486	0 %	25 %	25 %	50 %	384432131
6	NC_017273	CCGG	2	8	2075	2082	0 %	0 %	50 %	50 %	384432131
7	NC_017273	ATGA	2	8	2643	2650	50 %	25 %	25 %	0 %	384432132
8	NC_017273	GTCG	2	8	2814	2821	0 %	25 %	50 %	25 %	384432132
9	NC_017273	CGAC	2	8	3161	3168	25 %	0 %	25 %	50 %	384432132
10	NC_017273	CCGT	2	8	3226	3233	0 %	25 %	25 %	50 %	384432132
11	NC_017273	AGGA	2	8	4301	4308	50 %	0 %	50 %	0 %	384432133
12	NC_017273	CTGG	2	8	4324	4331	0 %	25 %	50 %	25 %	384432133
13	NC_017273	ACCT	2	8	4364	4371	25 %	25 %	0 %	50 %	384432133
14	NC_017273	GGTG	2	8	4489	4496	0 %	25 %	75 %	0 %	384432133
15	NC_017273	ATCG	2	8	4972	4979	25 %	25 %	25 %	25 %	384432134
16	NC_017273	AAGA	2	8	5236	5243	75 %	0 %	25 %	0 %	384432134
17	NC_017273	GGAA	2	8	5354	5361	50 %	0 %	50 %	0 %	384432134
18	NC_017273	ATTC	2	8	5568	5575	25 %	50 %	0 %	25 %	384432134
19	NC_017273	ATCT	2	8	5746	5753	25 %	50 %	0 %	25 %	384432134
20	NC_017273	CGCC	2	8	6672	6679	0 %	0 %	25 %	75 %	384432135
21	NC_017273	TCGC	2	8	8108	8115	0 %	25 %	25 %	50 %	384432136
22	NC_017273	GGCG	2	8	8365	8372	0 %	0 %	75 %	25 %	384432136
23	NC_017273	CTCC	3	12	9939	9950	0 %	25 %	0 %	75 %	384432137
24	NC_017273	GGCG	2	8	10217	10224	0 %	0 %	75 %	25 %	384432137
25	NC_017273	AGGA	2	8	10425	10432	50 %	0 %	50 %	0 %	384432137
26	NC_017273	CGCC	2	8	10655	10662	0 %	0 %	25 %	75 %	384432137
27	NC_017273	CGGG	2	8	12753	12760	0 %	0 %	75 %	25 %	384432138
28	NC_017273	GCCC	2	8	13022	13029	0 %	0 %	25 %	75 %	384432138
29	NC_017273	GCTT	2	8	13972	13979	0 %	50 %	25 %	25 %	384432139
30	NC_017273	GGGC	2	8	14177	14184	0 %	0 %	75 %	25 %	384432139
31	NC_017273	GCGG	2	8	14385	14392	0 %	0 %	75 %	25 %	384432139
32	NC_017273	CCAG	2	8	14429	14436	25 %	0 %	25 %	50 %	384432139
33	NC_017273	GTGG	2	8	14835	14842	0 %	25 %	75 %	0 %	384432139
34	NC_017273	GACG	2	8	15497	15504	25 %	0 %	50 %	25 %	384432139
35	NC_017273	GGAG	2	8	15968	15975	25 %	0 %	75 %	0 %	384432139
36	NC_017273	GGGA	2	8	17087	17094	25 %	0 %	75 %	0 %	384432141
37	NC_017273	TGGG	2	8	17286	17293	0 %	25 %	75 %	0 %	384432141
38	NC_017273	AGGG	2	8	17304	17311	25 %	0 %	75 %	0 %	384432141
39	NC_017273	GAGG	2	8	17507	17514	25 %	0 %	75 %	0 %	384432141
40	NC_017273	GGCG	2	8	17729	17736	0 %	0 %	75 %	25 %	384432142
41	NC_017273	ATGG	2	8	18318	18325	25 %	25 %	50 %	0 %	384432143
42	NC_017273	GTGG	2	8	18855	18862	0 %	25 %	75 %	0 %	384432143
43	NC_017273	CTGG	2	8	19313	19320	0 %	25 %	50 %	25 %	384432144
44	NC_017273	CCTC	2	8	19360	19367	0 %	25 %	0 %	75 %	384432144
45	NC_017273	GGAG	2	8	19471	19478	25 %	0 %	75 %	0 %	384432144
46	NC_017273	GCCC	2	8	19857	19864	0 %	0 %	25 %	75 %	384432144
47	NC_017273	ACCA	2	8	20419	20426	50 %	0 %	0 %	50 %	384432145
48	NC_017273	TGGA	2	8	20461	20468	25 %	25 %	50 %	0 %	384432145
49	NC_017273	GAAG	2	8	20649	20656	50 %	0 %	50 %	0 %	384432145
50	NC_017273	GGCT	2	8	21479	21486	0 %	25 %	50 %	25 %	384432146
51	NC_017273	AGCA	2	8	22068	22075	50 %	0 %	25 %	25 %	384432147
52	NC_017273	CCTC	2	8	22087	22094	0 %	25 %	0 %	75 %	384432147
53	NC_017273	CCTC	2	8	22168	22175	0 %	25 %	0 %	75 %	384432147
54	NC_017273	TCCA	2	8	22275	22282	25 %	25 %	0 %	50 %	384432147
55	NC_017273	CCAA	2	8	22447	22454	50 %	0 %	0 %	50 %	384432147
56	NC_017273	CTCG	2	8	23554	23561	0 %	25 %	25 %	50 %	384432148
57	NC_017273	TGGT	2	8	23831	23838	0 %	50 %	50 %	0 %	384432148
58	NC_017273	TCCT	2	8	23889	23896	0 %	50 %	0 %	50 %	384432148
59	NC_017273	CGGT	2	8	24238	24245	0 %	25 %	50 %	25 %	384432150
60	NC_017273	CCGT	2	8	24728	24735	0 %	25 %	25 %	50 %	384432151
61	NC_017273	GAAG	2	8	24951	24958	50 %	0 %	50 %	0 %	384432152
62	NC_017273	GAAG	2	8	25005	25012	50 %	0 %	50 %	0 %	384432152
63	NC_017273	TTCC	2	8	25055	25062	0 %	50 %	0 %	50 %	384432152
64	NC_017273	TCCT	2	8	25960	25967	0 %	50 %	0 %	50 %	384432152
65	NC_017273	CAAG	2	8	26280	26287	50 %	0 %	25 %	25 %	384432152
66	NC_017273	CCAC	2	8	27513	27520	25 %	0 %	0 %	75 %	384432155
67	NC_017273	CCGT	2	8	27611	27618	0 %	25 %	25 %	50 %	384432155
68	NC_017273	AAGG	2	8	27785	27792	50 %	0 %	50 %	0 %	384432156
69	NC_017273	CCAC	2	8	29062	29069	25 %	0 %	0 %	75 %	384432157
70	NC_017273	GGGC	2	8	29302	29309	0 %	0 %	75 %	25 %	384432157
71	NC_017273	TCCC	2	8	30689	30696	0 %	25 %	0 %	75 %	384432159
72	NC_017273	CCTC	2	8	30758	30765	0 %	25 %	0 %	75 %	384432159
73	NC_017273	GCCC	2	8	31620	31627	0 %	0 %	25 %	75 %	384432162
74	NC_017273	CCTC	2	8	31680	31687	0 %	25 %	0 %	75 %	384432162
75	NC_017273	CCCA	2	8	32509	32516	25 %	0 %	0 %	75 %	384432163
76	NC_017273	CCTC	2	8	32582	32589	0 %	25 %	0 %	75 %	384432163
77	NC_017273	CTCC	2	8	32887	32894	0 %	25 %	0 %	75 %	384432164
78	NC_017273	GCCC	2	8	33586	33593	0 %	0 %	25 %	75 %	384432165
79	NC_017273	CGCC	2	8	33603	33610	0 %	0 %	25 %	75 %	384432165
80	NC_017273	CCTC	2	8	33938	33945	0 %	25 %	0 %	75 %	384432166
81	NC_017273	CCGC	2	8	34007	34014	0 %	0 %	25 %	75 %	384432166
82	NC_017273	CGGT	2	8	34302	34309	0 %	25 %	50 %	25 %	384432166
83	NC_017273	GGGC	2	8	34727	34734	0 %	0 %	75 %	25 %	384432166
84	NC_017273	TTCC	2	8	34962	34969	0 %	50 %	0 %	50 %	384432166
85	NC_017273	CCGC	2	8	36099	36106	0 %	0 %	25 %	75 %	384432168
86	NC_017273	CTCC	2	8	36571	36578	0 %	25 %	0 %	75 %	384432169
87	NC_017273	CCCG	2	8	36595	36602	0 %	0 %	25 %	75 %	384432169
88	NC_017273	GCCC	2	8	36881	36888	0 %	0 %	25 %	75 %	384432169
89	NC_017273	CGGT	2	8	37035	37042	0 %	25 %	50 %	25 %	384432169
90	NC_017273	CTCC	2	8	37874	37881	0 %	25 %	0 %	75 %	384432170
91	NC_017273	GGAG	2	8	38207	38214	25 %	0 %	75 %	0 %	384432170
92	NC_017273	GGGC	2	8	38236	38243	0 %	0 %	75 %	25 %	384432170
93	NC_017273	CCGC	2	8	38919	38926	0 %	0 %	25 %	75 %	384432171
94	NC_017273	CAGG	2	8	39084	39091	25 %	0 %	50 %	25 %	384432171
95	NC_017273	GCCC	2	8	39370	39377	0 %	0 %	25 %	75 %	384432172
96	NC_017273	CCAC	2	8	39404	39411	25 %	0 %	0 %	75 %	384432172
97	NC_017273	CCTC	2	8	39559	39566	0 %	25 %	0 %	75 %	384432173
98	NC_017273	GGGT	2	8	40010	40017	0 %	25 %	75 %	0 %	384432174
99	NC_017273	CCCT	2	8	40054	40061	0 %	25 %	0 %	75 %	384432174
100	NC_017273	CCTC	2	8	40071	40078	0 %	25 %	0 %	75 %	384432175
101	NC_017273	GGGC	2	8	40645	40652	0 %	0 %	75 %	25 %	384432175
102	NC_017273	GGCG	2	8	40996	41003	0 %	0 %	75 %	25 %	384432175
103	NC_017273	GCCC	2	8	41091	41098	0 %	0 %	25 %	75 %	384432175
104	NC_017273	CCAG	2	8	41431	41438	25 %	0 %	25 %	50 %	384432175
105	NC_017273	GCCC	2	8	41805	41812	0 %	0 %	25 %	75 %	384432175
106	NC_017273	ACCT	2	8	42453	42460	25 %	25 %	0 %	50 %	384432175
107	NC_017273	CGGT	2	8	42731	42738	0 %	25 %	50 %	25 %	384432177
108	NC_017273	GGGC	2	8	42955	42962	0 %	0 %	75 %	25 %	384432177
109	NC_017273	CCGT	2	8	43412	43419	0 %	25 %	25 %	50 %	384432177
110	NC_017273	CGCC	2	8	43854	43861	0 %	0 %	25 %	75 %	384432177
111	NC_017273	GAGG	2	8	44946	44953	25 %	0 %	75 %	0 %	384432178
112	NC_017273	CCGC	2	8	45248	45255	0 %	0 %	25 %	75 %	384432178
113	NC_017273	CCAG	2	8	45377	45384	25 %	0 %	25 %	50 %	384432178
114	NC_017273	GGAG	2	8	45773	45780	25 %	0 %	75 %	0 %	384432178
115	NC_017273	GAAG	2	8	45805	45812	50 %	0 %	50 %	0 %	384432178
116	NC_017273	GCCC	2	8	45999	46006	0 %	0 %	25 %	75 %	384432179
117	NC_017273	GAGG	2	8	47882	47889	25 %	0 %	75 %	0 %	384432179
118	NC_017273	GCCC	2	8	48957	48964	0 %	0 %	25 %	75 %	384432181
119	NC_017273	CGGG	2	8	49886	49893	0 %	0 %	75 %	25 %	384432182
120	NC_017273	CCTC	2	8	50207	50214	0 %	25 %	0 %	75 %	384432182
121	NC_017273	CGGG	2	8	50433	50440	0 %	0 %	75 %	25 %	384432182
122	NC_017273	CAGG	2	8	51605	51612	25 %	0 %	50 %	25 %	384432184
123	NC_017273	CCCT	2	8	52927	52934	0 %	25 %	0 %	75 %	384432188
124	NC_017273	GGTC	2	8	53735	53742	0 %	25 %	50 %	25 %	384432189
125	NC_017273	GGCG	2	8	54209	54216	0 %	0 %	75 %	25 %	384432190
126	NC_017273	GGGA	2	8	54229	54236	25 %	0 %	75 %	0 %	384432190
127	NC_017273	CCCG	2	8	55370	55377	0 %	0 %	25 %	75 %	384432191
128	NC_017273	CCTC	2	8	55557	55564	0 %	25 %	0 %	75 %	384432191
129	NC_017273	CCTT	2	8	56358	56365	0 %	50 %	0 %	50 %	384432192
130	NC_017273	GCAA	2	8	56807	56814	50 %	0 %	25 %	25 %	384432193
131	NC_017273	GTGG	2	8	56839	56846	0 %	25 %	75 %	0 %	384432193
132	NC_017273	CCGG	2	8	61070	61077	0 %	0 %	50 %	50 %	384432196
133	NC_017273	TCCG	2	8	61681	61688	0 %	25 %	25 %	50 %	384432197
134	NC_017273	ACCC	2	8	61860	61867	25 %	0 %	0 %	75 %	384432197
135	NC_017273	GAAG	2	8	62239	62246	50 %	0 %	50 %	0 %	384432198
136	NC_017273	CAGG	2	8	62275	62282	25 %	0 %	50 %	25 %	384432198
137	NC_017273	GGAC	2	8	62460	62467	25 %	0 %	50 %	25 %	384432198
138	NC_017273	CCAC	2	8	62898	62905	25 %	0 %	0 %	75 %	384432198
139	NC_017273	GAAG	2	8	63436	63443	50 %	0 %	50 %	0 %	384432199
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