MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Thermus thermophilus SG0.5JP17-16 chromosome

Total Repeats: 34766

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017272	GAC	2	6	36	41	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430209
2	NC_017272	CCG	2	6	95	100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430209
3	NC_017272	CCT	2	6	190	195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430209
4	NC_017272	AGG	2	6	238	243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430209
5	NC_017272	CCT	2	6	251	256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430209
6	NC_017272	GTG	2	6	288	293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430209
7	NC_017272	AGG	2	6	310	315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430209
8	NC_017272	GCC	2	6	327	332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430209
9	NC_017272	CCG	2	6	334	339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430209
10	NC_017272	GTG	2	6	387	392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430209
11	NC_017272	CAA	2	6	398	403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384430209
12	NC_017272	CGC	3	9	416	424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430209
13	NC_017272	TCA	2	6	592	597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384430209
14	NC_017272	CCT	2	6	653	658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430209
15	NC_017272	TGG	2	6	661	666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430209
16	NC_017272	ACG	2	6	667	672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430209
17	NC_017272	AGG	2	6	703	708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430209
18	NC_017272	ATC	2	6	753	758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384430209
19	NC_017272	CTC	2	6	761	766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430209
20	NC_017272	GCC	2	6	773	778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430209
21	NC_017272	AGC	2	6	895	900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430209
22	NC_017272	ATC	2	6	1098	1103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384430209
23	NC_017272	GGA	2	6	1136	1141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430209
24	NC_017272	AAG	2	6	1161	1166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430209
25	NC_017272	GGT	2	6	1169	1174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430209
26	NC_017272	CGG	2	6	1250	1255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430209
27	NC_017272	TCC	2	6	1333	1338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430209
28	NC_017272	CTC	2	6	1690	1695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430210
29	NC_017272	CCT	2	6	1710	1715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430210
30	NC_017272	CCG	2	6	1838	1843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430210
31	NC_017272	CTT	2	6	1884	1889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430210
32	NC_017272	CTC	2	6	1971	1976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430210
33	NC_017272	GGA	2	6	2046	2051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430210
34	NC_017272	CGC	2	6	2124	2129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430210
35	NC_017272	GAG	2	6	2137	2142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430210
36	NC_017272	ACC	2	6	2534	2539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430210
37	NC_017272	CCT	2	6	2547	2552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430210
38	NC_017272	GGA	2	6	2556	2561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430210
39	NC_017272	TCC	2	6	2570	2575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430210
40	NC_017272	CCG	2	6	2579	2584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430210
41	NC_017272	AGG	3	9	2606	2614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430210
42	NC_017272	CCT	2	6	2667	2672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430210
43	NC_017272	GGT	3	9	2769	2777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430210
44	NC_017272	ACC	2	6	2848	2853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430211
45	NC_017272	TCG	2	6	2855	2860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430211
46	NC_017272	CGG	2	6	3003	3008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430211
47	NC_017272	CAA	2	6	3144	3149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384430211
48	NC_017272	GCG	2	6	3202	3207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430211
49	NC_017272	TCA	2	6	3287	3292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384430211
50	NC_017272	CCG	2	6	3347	3352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430211
51	NC_017272	GAG	2	6	3487	3492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430211
52	NC_017272	CTC	2	6	3508	3513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430211
53	NC_017272	AGG	2	6	3545	3550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430211
54	NC_017272	ACC	2	6	3602	3607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430211
55	NC_017272	GGA	2	6	3636	3641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430211
56	NC_017272	TGG	2	6	3644	3649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430211
57	NC_017272	GAC	2	6	3712	3717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430211
58	NC_017272	GGC	2	6	3728	3733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430211
59	NC_017272	GAC	2	6	3775	3780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430211
60	NC_017272	GGA	2	6	3951	3956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430211
61	NC_017272	GAG	3	9	4063	4071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430211
62	NC_017272	GCC	2	6	4102	4107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430211
63	NC_017272	GAC	2	6	4151	4156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430212
64	NC_017272	AGG	2	6	4158	4163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430212
65	NC_017272	GGA	2	6	4270	4275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430212
66	NC_017272	TCC	2	6	4296	4301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430212
67	NC_017272	TCC	3	9	4353	4361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430212
68	NC_017272	CCG	2	6	4386	4391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430212
69	NC_017272	CCT	2	6	4468	4473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430212
70	NC_017272	GAC	2	6	4478	4483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430212
71	NC_017272	CAA	3	9	4561	4569	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384430212
72	NC_017272	GAC	2	6	4694	4699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430212
73	NC_017272	CTC	3	9	4700	4708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430212
74	NC_017272	GAG	2	6	4790	4795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430212
75	NC_017272	GGA	2	6	4801	4806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430212
76	NC_017272	TGG	2	6	4821	4826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430212
77	NC_017272	GGA	2	6	4858	4863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430212
78	NC_017272	TCC	2	6	4890	4895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430212
79	NC_017272	CGC	2	6	4903	4908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430212
80	NC_017272	CGG	2	6	5043	5048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430212
81	NC_017272	ATG	2	6	5078	5083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430212
82	NC_017272	TCC	2	6	5108	5113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430212
83	NC_017272	TCC	2	6	5139	5144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430212
84	NC_017272	CAC	2	6	5161	5166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430212
85	NC_017272	GGC	2	6	5185	5190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430212
86	NC_017272	GAC	2	6	5192	5197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430212
87	NC_017272	GTG	2	6	5198	5203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430212
88	NC_017272	GGC	2	6	5246	5251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430212
89	NC_017272	GGA	2	6	5259	5264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430212
90	NC_017272	CGA	2	6	5383	5388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430212
91	NC_017272	GGT	2	6	5449	5454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430212
92	NC_017272	CGC	2	6	5458	5463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430212
93	NC_017272	GAC	2	6	5488	5493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384430212
94	NC_017272	AGG	2	6	5607	5612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430213
95	NC_017272	GAG	2	6	5660	5665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430213
96	NC_017272	CCT	2	6	5722	5727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430213
97	NC_017272	GAG	2	6	5741	5746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430213
98	NC_017272	GAG	2	6	5825	5830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430213
99	NC_017272	TCC	2	6	5853	5858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430213
100	NC_017272	GGT	2	6	6005	6010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430213
101	NC_017272	GGC	2	6	6092	6097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430213
102	NC_017272	GGA	2	6	6103	6108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430213
103	NC_017272	GGT	2	6	6197	6202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430213
104	NC_017272	AGA	2	6	6217	6222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430213
105	NC_017272	TCC	2	6	6321	6326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430213
106	NC_017272	GGA	2	6	6352	6357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430213
107	NC_017272	CCT	2	6	6451	6456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430213
108	NC_017272	GAG	2	6	6482	6487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430213
109	NC_017272	CCT	2	6	6534	6539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430214
110	NC_017272	TGA	2	6	6636	6641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384430214
111	NC_017272	AGG	2	6	6683	6688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430214
112	NC_017272	ACC	2	6	6740	6745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430214
113	NC_017272	CTC	2	6	6769	6774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430214
114	NC_017272	CCT	2	6	6789	6794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430214
115	NC_017272	GGT	3	9	6957	6965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430214
116	NC_017272	GGA	2	6	6996	7001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430214
117	NC_017272	GAG	2	6	7006	7011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430214
118	NC_017272	CTT	2	6	7013	7018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384430214
119	NC_017272	CCA	2	6	7041	7046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430214
120	NC_017272	GGC	2	6	7084	7089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430214
121	NC_017272	CGC	2	6	7136	7141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384430215
122	NC_017272	AAG	2	6	7212	7217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384430215
123	NC_017272	TGG	2	6	7308	7313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430215
124	NC_017272	TCC	2	6	7314	7319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430215
125	NC_017272	GAG	2	6	7325	7330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430215
126	NC_017272	CAC	2	6	7391	7396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384430215
127	NC_017272	GTC	2	6	7409	7414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430215
128	NC_017272	CGG	2	6	7417	7422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430215
129	NC_017272	CCT	2	6	7477	7482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430215
130	NC_017272	GCG	2	6	7632	7637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384430215
131	NC_017272	GTG	2	6	7685	7690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384430215
132	NC_017272	CGT	2	6	7762	7767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430215
133	NC_017272	GGA	2	6	7792	7797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384430215
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261	NC_017272	TCC	2	6	18970	18975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384430223
262	NC_017272	TCG	2	6	19032	19037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384430223
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