MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Xanthomonas campestris pv. raphani 756C chromosome

Total Repeats: 14344

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017271	TGGA	2	8	69	76	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017271	CAGC	2	8	174	181	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017271	GATG	2	8	200	207	25 %	25 %	50 %	0 %	384425692
4	NC_017271	CCCG	2	8	245	252	0 %	0 %	25 %	75 %	384425692
5	NC_017271	CGGT	2	8	418	425	0 %	25 %	50 %	25 %	384425692
6	NC_017271	CGGC	2	8	676	683	0 %	0 %	50 %	50 %	384425692
7	NC_017271	CGCA	2	8	858	865	25 %	0 %	25 %	50 %	384425692
8	NC_017271	TGCG	2	8	1225	1232	0 %	25 %	50 %	25 %	384425692
9	NC_017271	GCCG	2	8	1413	1420	0 %	0 %	50 %	50 %	384425692
10	NC_017271	GACC	2	8	1942	1949	25 %	0 %	25 %	50 %	384425693
11	NC_017271	CCTG	2	8	2044	2051	0 %	25 %	25 %	50 %	384425693
12	NC_017271	CGAA	2	8	2625	2632	50 %	0 %	25 %	25 %	384425693
13	NC_017271	CGCA	2	8	3118	3125	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017271	TGGC	2	8	3196	3203	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017271	CGAT	2	8	3793	3800	25 %	25 %	25 %	25 %	384425694
16	NC_017271	TCCA	2	8	3817	3824	25 %	25 %	0 %	50 %	384425694
17	NC_017271	CCAG	2	8	3859	3866	25 %	0 %	25 %	50 %	384425694
18	NC_017271	ACGC	2	8	4271	4278	25 %	0 %	25 %	50 %	384425694
19	NC_017271	GCTG	2	8	4350	4357	0 %	25 %	50 %	25 %	384425694
20	NC_017271	CTGG	2	8	4478	4485	0 %	25 %	50 %	25 %	384425694
21	NC_017271	GCCT	2	8	4654	4661	0 %	25 %	25 %	50 %	384425694
22	NC_017271	CGTG	2	8	4989	4996	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017271	CGAA	2	8	6142	6149	50 %	0 %	25 %	25 %	384425695
24	NC_017271	GATC	2	8	6875	6882	25 %	25 %	25 %	25 %	384425695
25	NC_017271	GCAG	2	8	6947	6954	25 %	0 %	50 %	25 %	384425695
26	NC_017271	CGTG	2	8	7710	7717	0 %	25 %	50 %	25 %	384425696
27	NC_017271	CGCC	2	8	7841	7848	0 %	0 %	25 %	75 %	384425696
28	NC_017271	GCCT	2	8	8058	8065	0 %	25 %	25 %	50 %	384425696
29	NC_017271	TGAA	2	8	8415	8422	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017271	GCAA	2	8	8593	8600	50 %	0 %	25 %	25 %	384425697
31	NC_017271	CCAC	2	8	9112	9119	25 %	0 %	0 %	75 %	384425697
32	NC_017271	GGCC	2	8	9686	9693	0 %	0 %	50 %	50 %	384425698
33	NC_017271	ACCT	2	8	9744	9751	25 %	25 %	0 %	50 %	384425698
34	NC_017271	ACCT	2	8	10329	10336	25 %	25 %	0 %	50 %	384425698
35	NC_017271	GCCG	2	8	11159	11166	0 %	0 %	50 %	50 %	384425699
36	NC_017271	GTCG	2	8	11240	11247	0 %	25 %	50 %	25 %	384425699
37	NC_017271	CGGC	2	8	11401	11408	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017271	GGTG	2	8	12066	12073	0 %	25 %	75 %	0 %	384425700
39	NC_017271	GAAG	2	8	12436	12443	50 %	0 %	50 %	0 %	384425701
40	NC_017271	GCAA	2	8	13462	13469	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017271	GATG	2	8	13917	13924	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017271	CGGT	2	8	14855	14862	0 %	25 %	50 %	25 %	384425704
43	NC_017271	GGCC	2	8	14990	14997	0 %	0 %	50 %	50 %	384425704
44	NC_017271	TGCG	2	8	15376	15383	0 %	25 %	50 %	25 %	384425704
45	NC_017271	TGCG	2	8	15711	15718	0 %	25 %	50 %	25 %	384425705
46	NC_017271	CGGC	2	8	15984	15991	0 %	0 %	50 %	50 %	384425706
47	NC_017271	ACGC	2	8	16203	16210	25 %	0 %	25 %	50 %	384425706
48	NC_017271	GCCC	2	8	16301	16308	0 %	0 %	25 %	75 %	384425706
49	NC_017271	CCAG	2	8	16367	16374	25 %	0 %	25 %	50 %	384425706
50	NC_017271	GGGT	2	8	16484	16491	0 %	25 %	75 %	0 %	384425706
51	NC_017271	GTTC	2	8	16643	16650	0 %	50 %	25 %	25 %	384425706
52	NC_017271	TGGG	2	8	16762	16769	0 %	25 %	75 %	0 %	384425706
53	NC_017271	GCCG	2	8	16791	16798	0 %	0 %	50 %	50 %	384425706
54	NC_017271	ACCG	2	8	16839	16846	25 %	0 %	25 %	50 %	384425706
55	NC_017271	CATC	2	8	16847	16854	25 %	25 %	0 %	50 %	384425706
56	NC_017271	CGGG	2	8	17099	17106	0 %	0 %	75 %	25 %	384425706
57	NC_017271	CCGC	2	8	17142	17149	0 %	0 %	25 %	75 %	384425706
58	NC_017271	CCAG	2	8	17183	17190	25 %	0 %	25 %	50 %	384425706
59	NC_017271	GCCA	2	8	17350	17357	25 %	0 %	25 %	50 %	384425706
60	NC_017271	GCAG	2	8	17581	17588	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017271	TGGC	2	8	17756	17763	0 %	25 %	50 %	25 %	384425707
62	NC_017271	GGTG	2	8	18937	18944	0 %	25 %	75 %	0 %	384425708
63	NC_017271	GCAG	2	8	19177	19184	25 %	0 %	50 %	25 %	384425708
64	NC_017271	CATG	2	8	19731	19738	25 %	25 %	25 %	25 %	384425709
65	NC_017271	CGTG	2	8	19914	19921	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017271	GACG	2	8	20338	20345	25 %	0 %	50 %	25 %	384425710
67	NC_017271	GCCG	2	8	21339	21346	0 %	0 %	50 %	50 %	384425710
68	NC_017271	GGGT	2	8	21709	21716	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017271	CTGG	2	8	21821	21828	0 %	25 %	50 %	25 %	384425712
70	NC_017271	GCCG	2	8	22037	22044	0 %	0 %	50 %	50 %	384425712
71	NC_017271	ATTC	2	8	22250	22257	25 %	50 %	0 %	25 %	384425712
72	NC_017271	GCCG	2	8	23102	23109	0 %	0 %	50 %	50 %	384425714
73	NC_017271	CGGG	2	8	23282	23289	0 %	0 %	75 %	25 %	384425714
74	NC_017271	GCCG	2	8	23547	23554	0 %	0 %	50 %	50 %	384425714
75	NC_017271	GTGC	2	8	24165	24172	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017271	AGTG	2	8	24435	24442	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017271	CGGC	2	8	24716	24723	0 %	0 %	50 %	50 %	384425717
78	NC_017271	GGCG	3	12	24792	24803	0 %	0 %	75 %	25 %	384425717
79	NC_017271	CACG	2	8	25658	25665	25 %	0 %	25 %	50 %	384425717
80	NC_017271	GCCT	2	8	25761	25768	0 %	25 %	25 %	50 %	384425717
81	NC_017271	CGGC	2	8	25784	25791	0 %	0 %	50 %	50 %	384425717
82	NC_017271	CTGG	2	8	26231	26238	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017271	CAGC	2	8	26459	26466	25 %	0 %	25 %	50 %	384425718
84	NC_017271	CTGG	2	8	26479	26486	0 %	25 %	50 %	25 %	384425718
85	NC_017271	GCCC	2	8	26527	26534	0 %	0 %	25 %	75 %	384425718
86	NC_017271	GCGT	2	8	27236	27243	0 %	25 %	50 %	25 %	384425718
87	NC_017271	GCCA	2	8	27672	27679	25 %	0 %	25 %	50 %	384425718
88	NC_017271	GCGG	2	8	27687	27694	0 %	0 %	75 %	25 %	384425718
89	NC_017271	CAGG	2	8	27756	27763	25 %	0 %	50 %	25 %	384425719
90	NC_017271	CGTG	2	8	28275	28282	0 %	25 %	50 %	25 %	384425720
91	NC_017271	GCCG	2	8	30050	30057	0 %	0 %	50 %	50 %	384425721
92	NC_017271	TGCC	2	8	32061	32068	0 %	25 %	25 %	50 %	384425724
93	NC_017271	TCAT	2	8	32111	32118	25 %	50 %	0 %	25 %	384425724
94	NC_017271	CCCA	2	8	32206	32213	25 %	0 %	0 %	75 %	384425724
95	NC_017271	CGTT	2	8	32663	32670	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017271	CAAA	2	8	32753	32760	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017271	TGCG	2	8	32963	32970	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017271	TGAT	2	8	33000	33007	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017271	CGCC	2	8	33120	33127	0 %	0 %	25 %	75 %	384425725
100	NC_017271	TGGT	2	8	33158	33165	0 %	50 %	50 %	0 %	384425725
101	NC_017271	AGCC	2	8	33263	33270	25 %	0 %	25 %	50 %	384425725
102	NC_017271	ATTG	2	8	33717	33724	25 %	50 %	25 %	0 %	384425725
103	NC_017271	CTGC	2	8	33744	33751	0 %	25 %	25 %	50 %	384425725
104	NC_017271	CTGC	2	8	34345	34352	0 %	25 %	25 %	50 %	384425726
105	NC_017271	GACA	2	8	34509	34516	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017271	AGCA	2	8	34567	34574	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017271	CAGG	2	8	34588	34595	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017271	GCTC	2	8	34710	34717	0 %	25 %	25 %	50 %	384425727
109	NC_017271	GCTG	2	8	35920	35927	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017271	GCGG	2	8	36032	36039	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017271	CGCA	2	8	36205	36212	25 %	0 %	25 %	50 %	384425728
112	NC_017271	GCCG	2	8	36895	36902	0 %	0 %	50 %	50 %	384425728
113	NC_017271	CGAC	2	8	37966	37973	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017271	AAAC	2	8	38285	38292	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017271	CGTG	2	8	38304	38311	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017271	CGCA	2	8	38809	38816	25 %	0 %	25 %	50 %	384425731
117	NC_017271	TCGA	2	8	39100	39107	25 %	25 %	25 %	25 %	384425731
118	NC_017271	CGGC	2	8	39339	39346	0 %	0 %	50 %	50 %	384425731
119	NC_017271	GCTT	2	8	40165	40172	0 %	50 %	25 %	25 %	384425732
120	NC_017271	CCAG	2	8	40362	40369	25 %	0 %	25 %	50 %	384425733
121	NC_017271	CAGG	2	8	40756	40763	25 %	0 %	50 %	25 %	384425733
122	NC_017271	GCCG	2	8	40827	40834	0 %	0 %	50 %	50 %	384425733
123	NC_017271	CGGT	2	8	41021	41028	0 %	25 %	50 %	25 %	384425733
124	NC_017271	ACGC	2	8	41266	41273	25 %	0 %	25 %	50 %	384425733
125	NC_017271	TCGA	2	8	41804	41811	25 %	25 %	25 %	25 %	384425733
126	NC_017271	GCCC	2	8	42081	42088	0 %	0 %	25 %	75 %	384425733
127	NC_017271	GCAG	2	8	42753	42760	25 %	0 %	50 %	25 %	384425733
128	NC_017271	GGCC	2	8	42972	42979	0 %	0 %	50 %	50 %	384425733
129	NC_017271	GCTG	2	8	43068	43075	0 %	25 %	50 %	25 %	384425733
130	NC_017271	AGGT	2	8	43442	43449	25 %	25 %	50 %	0 %	384425733
131	NC_017271	GATC	2	8	43539	43546	25 %	25 %	25 %	25 %	384425733
132	NC_017271	GCGG	2	8	43660	43667	0 %	0 %	75 %	25 %	384425733
133	NC_017271	GCCG	2	8	43726	43733	0 %	0 %	50 %	50 %	384425733
134	NC_017271	GCCG	2	8	44485	44492	0 %	0 %	50 %	50 %	384425733
135	NC_017271	CATC	2	8	44573	44580	25 %	25 %	0 %	50 %	384425733
136	NC_017271	TTGC	2	8	45415	45422	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017271	CGGC	2	8	45649	45656	0 %	0 %	50 %	50 %	384425735
138	NC_017271	GCTG	2	8	46037	46044	0 %	25 %	50 %	25 %	384425735
139	NC_017271	AGCC	2	8	46693	46700	25 %	0 %	25 %	50 %	384425735
140	NC_017271	GGTA	2	8	46915	46922	25 %	25 %	50 %	0 %	384425736
141	NC_017271	CGCC	2	8	47139	47146	0 %	0 %	25 %	75 %	384425736
142	NC_017271	CATC	2	8	47179	47186	25 %	25 %	0 %	50 %	384425736
143	NC_017271	GCGT	2	8	47637	47644	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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146	NC_017271	AGCG	2	8	47746	47753	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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148	NC_017271	TGGT	2	8	48667	48674	0 %	50 %	50 %	0 %	384425738
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264	NC_017271	CATG	2	8	87420	87427	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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