MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Xanthomonas campestris pv. raphani 756C chromosome

Total Repeats: 84904

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017271	CTG	2	6	31	36	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017271	GAT	2	6	186	191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017271	CGG	2	6	481	486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425692
4	NC_017271	GCA	2	6	556	561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425692
5	NC_017271	TGC	2	6	628	633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425692
6	NC_017271	GCA	2	6	640	645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425692
7	NC_017271	GCC	2	6	708	713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425692
8	NC_017271	TTC	2	6	741	746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384425692
9	NC_017271	GAT	2	6	752	757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425692
10	NC_017271	CAG	2	6	804	809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425692
11	NC_017271	GCT	2	6	818	823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425692
12	NC_017271	CGA	2	6	827	832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425692
13	NC_017271	GCC	2	6	904	909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425692
14	NC_017271	ATC	2	6	915	920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425692
15	NC_017271	CCG	2	6	1011	1016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425692
16	NC_017271	GCG	2	6	1032	1037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425692
17	NC_017271	GCG	2	6	1063	1068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425692
18	NC_017271	CGA	2	6	1079	1084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425692
19	NC_017271	AAG	2	6	1104	1109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384425692
20	NC_017271	TGG	2	6	1153	1158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425692
21	NC_017271	CAG	3	9	1233	1241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425692
22	NC_017271	AGA	2	6	1264	1269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384425692
23	NC_017271	ACT	2	6	1279	1284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425692
24	NC_017271	TGC	2	6	1435	1440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425692
25	NC_017271	CCG	2	6	1727	1732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_017271	CAC	2	6	1749	1754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_017271	GGT	2	6	1852	1857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425693
28	NC_017271	GTC	2	6	1862	1867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425693
29	NC_017271	AAC	2	6	1916	1921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425693
30	NC_017271	CAG	2	6	2243	2248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425693
31	NC_017271	TTA	2	6	2257	2262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384425693
32	NC_017271	CTG	2	6	2273	2278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425693
33	NC_017271	CTG	2	6	2297	2302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425693
34	NC_017271	ATC	2	6	2381	2386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425693
35	NC_017271	GCT	2	6	2410	2415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425693
36	NC_017271	CTG	2	6	2420	2425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425693
37	NC_017271	GGC	2	6	2428	2433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425693
38	NC_017271	GCG	2	6	2484	2489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425693
39	NC_017271	GCG	2	6	2612	2617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425693
40	NC_017271	GAA	2	6	2702	2707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384425693
41	NC_017271	GAT	2	6	2741	2746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425693
42	NC_017271	CTG	2	6	2774	2779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425693
43	NC_017271	CGA	2	6	2800	2805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425693
44	NC_017271	TCG	2	6	2837	2842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425693
45	NC_017271	CAG	2	6	2860	2865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425693
46	NC_017271	CGT	2	6	2881	2886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425693
47	NC_017271	TGA	2	6	3134	3139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017271	CGG	2	6	3302	3307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017271	TGG	2	6	3526	3531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017271	GCC	2	6	3656	3661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_017271	CGC	2	6	3701	3706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_017271	TGC	2	6	3721	3726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017271	TCG	2	6	3831	3836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425694
54	NC_017271	TCG	2	6	4010	4015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425694
55	NC_017271	GCC	2	6	4094	4099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425694
56	NC_017271	GGT	2	6	4149	4154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425694
57	NC_017271	GGC	2	6	4192	4197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425694
58	NC_017271	CGG	2	6	4204	4209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425694
59	NC_017271	AGC	2	6	4286	4291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425694
60	NC_017271	CTG	2	6	4516	4521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425694
61	NC_017271	GGA	2	6	4674	4679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384425694
62	NC_017271	GCG	2	6	4694	4699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425694
63	NC_017271	GAT	2	6	4720	4725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425694
64	NC_017271	TCA	3	9	4746	4754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425694
65	NC_017271	GCC	3	9	4891	4899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425694
66	NC_017271	CCG	2	6	4907	4912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_017271	CCG	2	6	4979	4984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_017271	CGA	2	6	5024	5029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425695
69	NC_017271	TGC	2	6	5083	5088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425695
70	NC_017271	ACG	2	6	5140	5145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425695
71	NC_017271	CAC	2	6	5157	5162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425695
72	NC_017271	GGT	2	6	5174	5179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425695
73	NC_017271	CGA	2	6	5192	5197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425695
74	NC_017271	GAA	2	6	5301	5306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384425695
75	NC_017271	TGC	2	6	5338	5343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425695
76	NC_017271	CGG	2	6	5348	5353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425695
77	NC_017271	ACA	2	6	5365	5370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425695
78	NC_017271	CGG	2	6	5384	5389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425695
79	NC_017271	GGT	2	6	5411	5416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425695
80	NC_017271	CAG	2	6	5472	5477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425695
81	NC_017271	CAC	2	6	5540	5545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425695
82	NC_017271	CGG	2	6	5560	5565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425695
83	NC_017271	CGA	2	6	5663	5668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425695
84	NC_017271	GCG	2	6	5671	5676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425695
85	NC_017271	CGA	2	6	5687	5692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425695
86	NC_017271	GTG	2	6	5799	5804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425695
87	NC_017271	CAA	2	6	5858	5863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425695
88	NC_017271	GGC	2	6	5880	5885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425695
89	NC_017271	CGA	2	6	5984	5989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425695
90	NC_017271	CGG	2	6	6088	6093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425695
91	NC_017271	TCG	2	6	6172	6177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425695
92	NC_017271	GCC	2	6	6180	6185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425695
93	NC_017271	CGC	2	6	6225	6230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425695
94	NC_017271	TCG	2	6	6313	6318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425695
95	NC_017271	TGC	2	6	6376	6381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425695
96	NC_017271	CGA	2	6	6488	6493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425695
97	NC_017271	ACC	2	6	6517	6522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425695
98	NC_017271	CAT	2	6	6524	6529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425695
99	NC_017271	TGA	2	6	6532	6537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425695
100	NC_017271	GCT	3	9	6572	6580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425695
101	NC_017271	TTC	2	6	6585	6590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384425695
102	NC_017271	GCC	2	6	6641	6646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425695
103	NC_017271	GAC	2	6	6690	6695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425695
104	NC_017271	CAG	2	6	6719	6724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425695
105	NC_017271	CGA	2	6	6758	6763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425695
106	NC_017271	GCC	2	6	6764	6769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425695
107	NC_017271	CTG	3	9	6795	6803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425695
108	NC_017271	AGG	2	6	6820	6825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384425695
109	NC_017271	GCC	2	6	6884	6889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425695
110	NC_017271	GTG	2	6	6897	6902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425695
111	NC_017271	GCC	3	9	7020	7028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425695
112	NC_017271	TGC	2	6	7075	7080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425695
113	NC_017271	GTG	2	6	7099	7104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425695
114	NC_017271	CAA	2	6	7178	7183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425695
115	NC_017271	GCT	2	6	7223	7228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425695
116	NC_017271	GCC	2	6	7246	7251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425695
117	NC_017271	CTG	2	6	7332	7337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425695
118	NC_017271	GGC	2	6	7361	7366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425695
119	NC_017271	TGG	2	6	7399	7404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425695
120	NC_017271	CCG	2	6	7465	7470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_017271	CCG	2	6	7477	7482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_017271	TTC	2	6	7541	7546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017271	CCG	2	6	7595	7600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425696
124	NC_017271	CTG	2	6	7621	7626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425696
125	NC_017271	TGC	2	6	7643	7648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425696
126	NC_017271	GCA	2	6	7688	7693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425696
127	NC_017271	GGC	2	6	7723	7728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425696
128	NC_017271	GCC	2	6	7741	7746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425696
129	NC_017271	GCT	2	6	7773	7778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425696
130	NC_017271	CGG	2	6	7805	7810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425696
131	NC_017271	TGC	2	6	7811	7816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425696
132	NC_017271	GCC	2	6	7912	7917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384425696
133	NC_017271	GAA	2	6	8002	8007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384425696
134	NC_017271	GAA	2	6	8068	8073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384425696
135	NC_017271	CTG	2	6	8074	8079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425696
136	NC_017271	GTT	2	6	8091	8096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425696
137	NC_017271	CTG	2	6	8104	8109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384425696
138	NC_017271	GGC	2	6	8117	8122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384425696
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140	NC_017271	CAG	2	6	8142	8147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425696
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144	NC_017271	GAC	2	6	8376	8381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_017271	GTT	2	6	8429	8434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425697
146	NC_017271	GTT	2	6	8439	8444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425697
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161	NC_017271	ATG	2	6	9072	9077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425697
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164	NC_017271	TGC	2	6	9234	9239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_017271	CGG	2	6	9340	9345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_017271	TGT	2	6	9391	9396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384425698
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191	NC_017271	ATC	2	6	10542	10547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384425698
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194	NC_017271	ATG	2	6	10747	10752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
195	NC_017271	TGA	2	6	10825	10830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425699
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227	NC_017271	GTA	2	6	12236	12241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
228	NC_017271	AGT	2	6	12287	12292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384425701
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238	NC_017271	CAC	2	6	12601	12606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384425701
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241	NC_017271	GAC	2	6	12871	12876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425702
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243	NC_017271	AAC	2	6	12932	12937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384425702
244	NC_017271	GCA	2	6	12961	12966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384425702
245	NC_017271	GAA	2	6	12974	12979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384425702
246	NC_017271	GTG	2	6	12980	12985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384425702
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248	NC_017271	GAA	2	6	13075	13080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384425702
249	NC_017271	GAA	2	6	13090	13095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384425702
250	NC_017271	TGA	2	6	13194	13199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
251	NC_017271	TGC	2	6	13208	13213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
252	NC_017271	TGC	2	6	13228	13233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
253	NC_017271	GTT	2	6	13264	13269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
254	NC_017271	TGA	2	6	13317	13322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
255	NC_017271	TGA	2	6	13671	13676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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257	NC_017271	CGA	2	6	13708	13713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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