MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Xanthomonas campestris pv. raphani 756C chromosome

Total Repeats: 9308

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017271	CTG	2	6	31	36	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017271	GAT	2	6	186	191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017271	CCG	2	6	1727	1732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_017271	CAC	2	6	1749	1754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_017271	TGA	2	6	3134	3139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017271	CGG	2	6	3302	3307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017271	TGG	2	6	3526	3531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017271	GCC	2	6	3656	3661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_017271	CGC	2	6	3701	3706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_017271	TGC	2	6	3721	3726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017271	CCG	2	6	4907	4912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_017271	CCG	2	6	4979	4984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_017271	CCG	2	6	7465	7470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_017271	CCG	2	6	7477	7482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_017271	TTC	2	6	7541	7546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017271	GAC	2	6	8376	8381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017271	TGC	2	6	9234	9239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017271	CGG	2	6	9340	9345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017271	ATC	2	6	10669	10674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017271	AAC	2	6	10720	10725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017271	ATG	2	6	10747	10752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017271	TCA	2	6	11440	11445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017271	GTA	2	6	12236	12241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017271	TGA	2	6	13194	13199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017271	TGC	2	6	13208	13213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017271	TGC	2	6	13228	13233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017271	GTT	2	6	13264	13269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017271	TGA	2	6	13317	13322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017271	TGA	2	6	13671	13676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017271	GCG	2	6	13690	13695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017271	CGA	2	6	13708	13713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017271	CTG	2	6	13853	13858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017271	AGT	2	6	13906	13911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017271	GCG	2	6	13934	13939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017271	CTT	2	6	14038	14043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017271	GCC	2	6	14103	14108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_017271	GCA	2	6	14284	14289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017271	CGC	2	6	14752	14757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_017271	TGC	2	6	15577	15582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017271	GGC	2	6	15872	15877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017271	GCG	2	6	15915	15920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017271	TGC	2	6	17414	17419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017271	GCT	2	6	17431	17436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017271	CGT	2	6	17532	17537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017271	CAG	2	6	17638	17643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017271	GCC	2	6	17654	17659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_017271	CAA	2	6	18805	18810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017271	CTG	2	6	18818	18823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017271	TGC	2	6	19578	19583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017271	GAT	2	6	19634	19639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017271	CGC	2	6	19640	19645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_017271	ACG	2	6	19654	19659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017271	GTG	2	6	19688	19693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017271	CGG	2	6	19704	19709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017271	CGA	2	6	19724	19729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017271	GCC	2	6	19966	19971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_017271	CAA	2	6	20136	20141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017271	CCG	2	6	20148	20153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_017271	GCA	2	6	20177	20182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017271	GCG	2	6	20183	20188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017271	CGC	2	6	22465	22470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_017271	CGT	2	6	23934	23939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017271	GGT	2	6	24193	24198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017271	AGC	2	6	24219	24224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017271	TGA	2	6	24260	24265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017271	GTG	2	6	24267	24272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017271	GCT	2	6	24350	24355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017271	ACC	2	6	24459	24464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_017271	AAC	2	6	24592	24597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017271	TGC	2	6	24598	24603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017271	ACG	2	6	24633	24638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017271	GCA	2	6	24689	24694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017271	GCG	2	6	26225	26230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017271	AGC	2	6	26250	26255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017271	CTG	2	6	26327	26332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017271	TGC	2	6	26336	26341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017271	GCA	2	6	26407	26412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017271	GCG	2	6	26431	26436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017271	CAC	2	6	28498	28503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_017271	CGC	2	6	28530	28535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_017271	GAG	2	6	28539	28544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017271	GTC	2	6	30528	30533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017271	GGA	2	6	30553	30558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017271	GCT	2	6	30667	30672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017271	GTG	2	6	31199	31204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017271	TGC	2	6	31268	31273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017271	TAA	2	6	31305	31310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017271	CGA	2	6	32619	32624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017271	GAT	2	6	32732	32737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017271	GAG	2	6	32793	32798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017271	CGA	2	6	32897	32902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017271	CAG	2	6	32946	32951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017271	GCT	2	6	32974	32979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017271	GCA	2	6	34381	34386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017271	CGC	2	6	34485	34490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_017271	GCG	2	6	34534	34539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017271	CCT	2	6	35759	35764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_017271	GGC	2	6	35780	35785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017271	TGA	2	6	35891	35896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017271	GTT	2	6	37160	37165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017271	GCG	2	6	37361	37366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017271	CGT	2	6	37407	37412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017271	GCG	2	6	37438	37443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017271	AAT	2	6	37591	37596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017271	GCC	2	6	37607	37612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_017271	GAA	2	6	37615	37620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017271	TGG	2	6	37650	37655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017271	TCA	2	6	37670	37675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017271	CGT	2	6	37689	37694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017271	CTG	3	9	38008	38016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017271	TTC	2	6	38037	38042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017271	AGC	2	6	38161	38166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017271	AGA	2	6	38316	38321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017271	TTG	2	6	38323	38328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017271	CGA	2	6	44805	44810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017271	ATC	2	6	44853	44858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017271	CAG	2	6	44933	44938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017271	CTG	2	6	44966	44971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017271	CGC	3	9	45401	45409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_017271	CAA	2	6	45470	45475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017271	GCG	2	6	46771	46776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017271	GCG	2	6	46802	46807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017271	GCC	2	6	47504	47509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_017271	CGC	2	6	47536	47541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_017271	CCG	2	6	47567	47572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_017271	GCG	2	6	47587	47592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017271	GGT	2	6	47631	47636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017271	GCA	2	6	47814	47819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017271	GCT	2	6	47827	47832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017271	GAC	2	6	47841	47846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017271	GGC	2	6	47993	47998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017271	GCG	2	6	48152	48157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017271	GAA	2	6	48744	48749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017271	GCG	2	6	48804	48809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017271	TGC	2	6	48867	48872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017271	GGA	2	6	48887	48892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017271	AGT	2	6	48906	48911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017271	CCT	2	6	48932	48937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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408	NC_017271	AGA	2	6	160231	160236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
409	NC_017271	ACC	2	6	160290	160295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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429	NC_017271	TCA	2	6	167845	167850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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431	NC_017271	AAG	2	6	168162	168167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
432	NC_017271	CAA	2	6	168455	168460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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