MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome chromosome I

Total Repeats: 1464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017270	CAGTG	2	10	2878	2887	20 %	20 %	40 %	20 %	384423365
2	NC_017270	CGCAG	2	10	5470	5479	20 %	0 %	40 %	40 %	384423368
3	NC_017270	TCTGC	2	10	5631	5640	0 %	40 %	20 %	40 %	384423369
4	NC_017270	TTGAT	2	10	5790	5799	20 %	60 %	20 %	0 %	384423369
5	NC_017270	AAGTG	2	10	9241	9250	40 %	20 %	40 %	0 %	384423373
6	NC_017270	AGCTC	2	10	9415	9424	20 %	20 %	20 %	40 %	384423373
7	NC_017270	CTGCG	2	10	9863	9872	0 %	20 %	40 %	40 %	384423373
8	NC_017270	GCTAA	2	10	15665	15674	40 %	20 %	20 %	20 %	384423378
9	NC_017270	CGCAG	2	10	15732	15741	20 %	0 %	40 %	40 %	384423378
10	NC_017270	GGTTG	2	10	15928	15937	0 %	40 %	60 %	0 %	384423378
11	NC_017270	TCTGC	2	10	17583	17592	0 %	40 %	20 %	40 %	384423379
12	NC_017270	TCGAT	2	10	17790	17799	20 %	40 %	20 %	20 %	384423379
13	NC_017270	GGCGT	2	10	18561	18570	0 %	20 %	60 %	20 %	384423379
14	NC_017270	TTCTG	2	10	18733	18742	0 %	60 %	20 %	20 %	384423380
15	NC_017270	CCAGA	2	10	19092	19101	40 %	0 %	20 %	40 %	384423380
16	NC_017270	GTACC	2	10	23643	23652	20 %	20 %	20 %	40 %	384423386
17	NC_017270	TGCAT	2	10	27269	27278	20 %	40 %	20 %	20 %	384423388
18	NC_017270	CGCAG	2	10	27786	27795	20 %	0 %	40 %	40 %	384423390
19	NC_017270	GTGCT	2	10	31755	31764	0 %	40 %	40 %	20 %	384423391
20	NC_017270	GCCAT	2	10	33202	33211	20 %	20 %	20 %	40 %	384423393
21	NC_017270	TAAAG	2	10	34921	34930	60 %	20 %	20 %	0 %	384423394
22	NC_017270	CTCTG	2	10	38359	38368	0 %	40 %	20 %	40 %	384423399
23	NC_017270	AATCC	2	10	39079	39088	40 %	20 %	0 %	40 %	384423400
24	NC_017270	CCCAC	2	10	39909	39918	20 %	0 %	0 %	80 %	384423400
25	NC_017270	CGGCG	2	10	40620	40629	0 %	0 %	60 %	40 %	384423401
26	NC_017270	GCAGC	2	10	42300	42309	20 %	0 %	40 %	40 %	384423402
27	NC_017270	AAAAG	2	10	47960	47969	80 %	0 %	20 %	0 %	384423408
28	NC_017270	CAATC	2	10	48853	48862	40 %	20 %	0 %	40 %	384423409
29	NC_017270	TGCGC	2	10	49918	49927	0 %	20 %	40 %	40 %	384423411
30	NC_017270	GTTTG	2	10	49963	49972	0 %	60 %	40 %	0 %	384423411
31	NC_017270	AAGAT	2	10	50520	50529	60 %	20 %	20 %	0 %	384423412
32	NC_017270	AGCAC	2	10	53011	53020	40 %	0 %	20 %	40 %	384423415
33	NC_017270	GAAGC	2	10	59774	59783	40 %	0 %	40 %	20 %	384423417
34	NC_017270	GCAGC	2	10	63423	63432	20 %	0 %	40 %	40 %	384423419
35	NC_017270	GCTGC	2	10	64412	64421	0 %	20 %	40 %	40 %	384423421
36	NC_017270	CCAAG	2	10	64497	64506	40 %	0 %	20 %	40 %	384423421
37	NC_017270	GTGAA	2	10	69055	69064	40 %	20 %	40 %	0 %	384423424
38	NC_017270	TCCGA	2	10	74128	74137	20 %	20 %	20 %	40 %	384423428
39	NC_017270	CAAGC	2	10	75708	75717	40 %	0 %	20 %	40 %	384423430
40	NC_017270	GCCAC	2	10	76788	76797	20 %	0 %	20 %	60 %	384423432
41	NC_017270	GCGCT	2	10	77239	77248	0 %	20 %	40 %	40 %	384423433
42	NC_017270	AAGCC	2	10	79691	79700	40 %	0 %	20 %	40 %	384423435
43	NC_017270	CAAGC	2	10	83147	83156	40 %	0 %	20 %	40 %	384423439
44	NC_017270	GCTTT	2	10	87275	87284	0 %	60 %	20 %	20 %	384423443
45	NC_017270	ATGGC	2	10	87696	87705	20 %	20 %	40 %	20 %	384423444
46	NC_017270	GATCC	2	10	87774	87783	20 %	20 %	20 %	40 %	384423444
47	NC_017270	CATCA	2	10	89273	89282	40 %	20 %	0 %	40 %	384423445
48	NC_017270	GATCA	2	10	90363	90372	40 %	20 %	20 %	20 %	384423446
49	NC_017270	AGCTG	2	10	92901	92910	20 %	20 %	40 %	20 %	384423447
50	NC_017270	GAAGA	2	10	92911	92920	60 %	0 %	40 %	0 %	384423447
51	NC_017270	TCATC	2	10	95662	95671	20 %	40 %	0 %	40 %	384423451
52	NC_017270	TCACC	2	10	96346	96355	20 %	20 %	0 %	60 %	384423451
53	NC_017270	AGTTG	2	10	100068	100077	20 %	40 %	40 %	0 %	384423454
54	NC_017270	GCCGA	2	10	100507	100516	20 %	0 %	40 %	40 %	384423455
55	NC_017270	AAAGC	2	10	104126	104135	60 %	0 %	20 %	20 %	384423459
56	NC_017270	ACAGC	2	10	104289	104298	40 %	0 %	20 %	40 %	384423459
57	NC_017270	AAAGT	2	10	105584	105593	60 %	20 %	20 %	0 %	384423459
58	NC_017270	GTTCC	2	10	107792	107801	0 %	40 %	20 %	40 %	384423460
59	NC_017270	GCGCA	2	10	110696	110705	20 %	0 %	40 %	40 %	384423464
60	NC_017270	CAGCG	2	10	110846	110855	20 %	0 %	40 %	40 %	384423464
61	NC_017270	GCTTG	2	10	112999	113008	0 %	40 %	40 %	20 %	384423466
62	NC_017270	CGATG	2	10	113850	113859	20 %	20 %	40 %	20 %	384423467
63	NC_017270	CCGTA	2	10	118353	118362	20 %	20 %	20 %	40 %	384423470
64	NC_017270	CACTG	2	10	118919	118928	20 %	20 %	20 %	40 %	384423472
65	NC_017270	CGCAG	2	10	119587	119596	20 %	0 %	40 %	40 %	384423473
66	NC_017270	GCCGT	2	10	123865	123874	0 %	20 %	40 %	40 %	384423478
67	NC_017270	TTTTG	2	10	124425	124434	0 %	80 %	20 %	0 %	384423478
68	NC_017270	CAAGC	2	10	124485	124494	40 %	0 %	20 %	40 %	384423478
69	NC_017270	CTTGC	2	10	124665	124674	0 %	40 %	20 %	40 %	384423478
70	NC_017270	GTTGG	2	10	126488	126497	0 %	40 %	60 %	0 %	384423479
71	NC_017270	TTGTA	2	10	126830	126839	20 %	60 %	20 %	0 %	384423480
72	NC_017270	TGGAG	2	10	128161	128170	20 %	20 %	60 %	0 %	384423480
73	NC_017270	CTTCG	2	10	130399	130408	0 %	40 %	20 %	40 %	384423482
74	NC_017270	TCGGA	2	10	131951	131960	20 %	20 %	40 %	20 %	384423484
75	NC_017270	GGACA	2	10	132005	132014	40 %	0 %	40 %	20 %	384423484
76	NC_017270	CAAAG	2	10	133265	133274	60 %	0 %	20 %	20 %	384423486
77	NC_017270	TTGTT	2	10	134750	134759	0 %	80 %	20 %	0 %	384423488
78	NC_017270	TTATT	3	15	134817	134831	20 %	80 %	0 %	0 %	384423488
79	NC_017270	TGGTG	2	10	135342	135351	0 %	40 %	60 %	0 %	384423489
80	NC_017270	AAGCC	2	10	136883	136892	40 %	0 %	20 %	40 %	384423492
81	NC_017270	GCAAG	2	10	137414	137423	40 %	0 %	40 %	20 %	384423492
82	NC_017270	CAAAA	2	10	137619	137628	80 %	0 %	0 %	20 %	384423492
83	NC_017270	TGGTT	2	10	139429	139438	0 %	60 %	40 %	0 %	384423494
84	NC_017270	ATTAC	2	10	139945	139954	40 %	40 %	0 %	20 %	384423495
85	NC_017270	GATGG	2	10	142124	142133	20 %	20 %	60 %	0 %	384423496
86	NC_017270	AAAGA	2	10	142619	142628	80 %	0 %	20 %	0 %	384423497
87	NC_017270	TGCTT	2	10	143353	143362	0 %	60 %	20 %	20 %	384423498
88	NC_017270	CTCAG	2	10	143422	143431	20 %	20 %	20 %	40 %	384423498
89	NC_017270	TGATT	2	10	145054	145063	20 %	60 %	20 %	0 %	384423500
90	NC_017270	TTGGG	2	10	146136	146145	0 %	40 %	60 %	0 %	384423500
91	NC_017270	ACCGC	2	10	147544	147553	20 %	0 %	20 %	60 %	384423502
92	NC_017270	ATGAA	2	10	155990	155999	60 %	20 %	20 %	0 %	384423504
93	NC_017270	AACGC	2	10	156142	156151	40 %	0 %	20 %	40 %	384423504
94	NC_017270	CCAGA	2	10	156901	156910	40 %	0 %	20 %	40 %	384423506
95	NC_017270	GCACC	2	10	157447	157456	20 %	0 %	20 %	60 %	384423506
96	NC_017270	TGGTG	2	10	157868	157877	0 %	40 %	60 %	0 %	384423506
97	NC_017270	TGGCT	2	10	157993	158002	0 %	40 %	40 %	20 %	384423506
98	NC_017270	TGGTC	2	10	166884	166893	0 %	40 %	40 %	20 %	384423511
99	NC_017270	GCCGA	2	10	167101	167110	20 %	0 %	40 %	40 %	384423511
100	NC_017270	CGCGA	2	10	167265	167274	20 %	0 %	40 %	40 %	384423511
101	NC_017270	CTGGG	2	10	169893	169902	0 %	20 %	60 %	20 %	384423513
102	NC_017270	GCTCA	2	10	173376	173385	20 %	20 %	20 %	40 %	384423516
103	NC_017270	GCCAA	2	10	176591	176600	40 %	0 %	20 %	40 %	384423518
104	NC_017270	TGTGG	2	10	177528	177537	0 %	40 %	60 %	0 %	384423519
105	NC_017270	TGGCG	2	10	178037	178046	0 %	20 %	60 %	20 %	384423519
106	NC_017270	GGGTC	2	10	181382	181391	0 %	20 %	60 %	20 %	384423521
107	NC_017270	ACCAC	2	10	181546	181555	40 %	0 %	0 %	60 %	384423521
108	NC_017270	CGAGG	2	10	183071	183080	20 %	0 %	60 %	20 %	384423522
109	NC_017270	CCAAG	2	10	183383	183392	40 %	0 %	20 %	40 %	384423522
110	NC_017270	ACCAC	2	10	184573	184582	40 %	0 %	0 %	60 %	384423523
111	NC_017270	GCGCT	2	10	189792	189801	0 %	20 %	40 %	40 %	384423528
112	NC_017270	GGGTG	2	10	190007	190016	0 %	20 %	80 %	0 %	384423528
113	NC_017270	CTTGG	2	10	191123	191132	0 %	40 %	40 %	20 %	384423528
114	NC_017270	CCAAC	2	10	191164	191173	40 %	0 %	0 %	60 %	384423528
115	NC_017270	GTGCT	2	10	191608	191617	0 %	40 %	40 %	20 %	384423528
116	NC_017270	GCGCT	2	10	192370	192379	0 %	20 %	40 %	40 %	384423529
117	NC_017270	GCTGA	2	10	193089	193098	20 %	20 %	40 %	20 %	384423530
118	NC_017270	CCAAC	2	10	193159	193168	40 %	0 %	0 %	60 %	384423530
119	NC_017270	CTCAC	2	10	193748	193757	20 %	20 %	0 %	60 %	384423531
120	NC_017270	TCGGC	2	10	194137	194146	0 %	20 %	40 %	40 %	384423531
121	NC_017270	GCTTG	2	10	195091	195100	0 %	40 %	40 %	20 %	384423531
122	NC_017270	TGTGA	2	10	200968	200977	20 %	40 %	40 %	0 %	384423537
123	NC_017270	TGTGC	2	10	201132	201141	0 %	40 %	40 %	20 %	384423537
124	NC_017270	TGAGT	2	10	210089	210098	20 %	40 %	40 %	0 %	384423547
125	NC_017270	GCGCG	2	10	211667	211676	0 %	0 %	60 %	40 %	384423549
126	NC_017270	CGCTG	2	10	212751	212760	0 %	20 %	40 %	40 %	384423550
127	NC_017270	ATCGC	2	10	213242	213251	20 %	20 %	20 %	40 %	384423551
128	NC_017270	TGCTT	2	10	213459	213468	0 %	60 %	20 %	20 %	384423551
129	NC_017270	GTTTG	2	10	215024	215033	0 %	60 %	40 %	0 %	384423553
130	NC_017270	TGCGT	2	10	215164	215173	0 %	40 %	40 %	20 %	384423553
131	NC_017270	ATCCA	2	10	216833	216842	40 %	20 %	0 %	40 %	384423555
132	NC_017270	CTCGC	2	10	217729	217738	0 %	20 %	20 %	60 %	384423556
133	NC_017270	TTGCT	2	10	218032	218041	0 %	60 %	20 %	20 %	384423556
134	NC_017270	ATTTT	2	10	225005	225014	20 %	80 %	0 %	0 %	384423563
135	NC_017270	AGATA	2	10	225165	225174	60 %	20 %	20 %	0 %	384423563
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149	NC_017270	ATGGG	2	10	242699	242708	20 %	20 %	60 %	0 %	384423577
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152	NC_017270	TGCAG	2	10	252488	252497	20 %	20 %	40 %	20 %	384423584
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259	NC_017270	TTGAG	2	10	448636	448645	20 %	40 %	40 %	0 %	384423737
260	NC_017270	TCGTT	2	10	448652	448661	0 %	60 %	20 %	20 %	384423737
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