MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome chromosome I

Total Repeats: 7058

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017270	ATCA	2	8	283	290	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017270	GCTC	2	8	985	992	0 %	25 %	25 %	50 %	384423364
3	NC_017270	TTGG	2	8	1554	1561	0 %	50 %	50 %	0 %	384423364
4	NC_017270	ATCA	2	8	1779	1786	50 %	25 %	0 %	25 %	384423364
5	NC_017270	ATGA	2	8	1964	1971	50 %	25 %	25 %	0 %	384423364
6	NC_017270	GCGT	2	8	2060	2067	0 %	25 %	50 %	25 %	384423364
7	NC_017270	TCAA	2	8	2261	2268	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017270	ACTT	2	8	2269	2276	25 %	50 %	0 %	25 %	384423365
9	NC_017270	ACCA	2	8	2347	2354	50 %	0 %	0 %	50 %	384423365
10	NC_017270	CCAA	2	8	2541	2548	50 %	0 %	0 %	50 %	384423365
11	NC_017270	CAAC	2	8	2904	2911	50 %	0 %	0 %	50 %	384423365
12	NC_017270	TTTG	2	8	3024	3031	0 %	75 %	25 %	0 %	384423365
13	NC_017270	CATA	2	8	3305	3312	50 %	25 %	0 %	25 %	384423365
14	NC_017270	CACT	2	8	3479	3486	25 %	25 %	0 %	50 %	384423365
15	NC_017270	GAAA	2	8	3846	3853	75 %	0 %	25 %	0 %	384423365
16	NC_017270	TTAT	2	8	3899	3906	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017270	CAAG	2	8	4164	4171	50 %	0 %	25 %	25 %	384423366
18	NC_017270	GCGA	2	8	4366	4373	25 %	0 %	50 %	25 %	384423366
19	NC_017270	CGTA	2	8	4467	4474	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017270	ACTC	2	8	4784	4791	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017270	TTGA	2	8	4886	4893	25 %	50 %	25 %	0 %	384423368
22	NC_017270	CACC	2	8	5080	5087	25 %	0 %	0 %	75 %	384423368
23	NC_017270	GAGG	2	8	5782	5789	25 %	0 %	75 %	0 %	384423369
24	NC_017270	CAAC	2	8	6018	6025	50 %	0 %	0 %	50 %	384423369
25	NC_017270	TCCT	2	8	6283	6290	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017270	CAGA	2	8	6560	6567	50 %	0 %	25 %	25 %	384423370
27	NC_017270	ATCA	2	8	6777	6784	50 %	25 %	0 %	25 %	384423370
28	NC_017270	CAAA	2	8	6878	6885	75 %	0 %	0 %	25 %	384423370
29	NC_017270	TGAG	2	8	7398	7405	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017270	CAAC	2	8	8191	8198	50 %	0 %	0 %	50 %	384423372
31	NC_017270	CTTT	2	8	8376	8383	0 %	75 %	0 %	25 %	384423372
32	NC_017270	CGTG	2	8	8407	8414	0 %	25 %	50 %	25 %	384423372
33	NC_017270	GATT	2	8	8476	8483	25 %	50 %	25 %	0 %	384423372
34	NC_017270	CGTG	2	8	8485	8492	0 %	25 %	50 %	25 %	384423372
35	NC_017270	ACCA	2	8	8663	8670	50 %	0 %	0 %	50 %	384423372
36	NC_017270	GCAG	2	8	9065	9072	25 %	0 %	50 %	25 %	384423373
37	NC_017270	CTCA	2	8	9260	9267	25 %	25 %	0 %	50 %	384423373
38	NC_017270	CCAA	2	8	9312	9319	50 %	0 %	0 %	50 %	384423373
39	NC_017270	CGGA	2	8	10161	10168	25 %	0 %	50 %	25 %	384423374
40	NC_017270	AGCA	2	8	10477	10484	50 %	0 %	25 %	25 %	384423374
41	NC_017270	TCAA	2	8	10592	10599	50 %	25 %	0 %	25 %	384423374
42	NC_017270	GTCA	2	8	11309	11316	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017270	CCGA	2	8	11337	11344	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017270	ATGA	2	8	12162	12169	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017270	GCGG	2	8	12387	12394	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017270	TGAT	2	8	12844	12851	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017270	TACT	2	8	13116	13123	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017270	TTGA	2	8	13191	13198	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017270	GTCT	2	8	13291	13298	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017270	CATT	2	8	13726	13733	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017270	CTCG	2	8	14016	14023	0 %	25 %	25 %	50 %	384423375
52	NC_017270	GAGC	2	8	14030	14037	25 %	0 %	50 %	25 %	384423375
53	NC_017270	CCAA	2	8	14279	14286	50 %	0 %	0 %	50 %	384423375
54	NC_017270	TTAA	2	8	14440	14447	50 %	50 %	0 %	0 %	384423376
55	NC_017270	TATC	2	8	14976	14983	25 %	50 %	0 %	25 %	384423377
56	NC_017270	CAAT	2	8	15405	15412	50 %	25 %	0 %	25 %	384423378
57	NC_017270	CGAC	2	8	15963	15970	25 %	0 %	25 %	50 %	384423378
58	NC_017270	GCGA	2	8	16253	16260	25 %	0 %	50 %	25 %	384423378
59	NC_017270	GCCA	2	8	16792	16799	25 %	0 %	25 %	50 %	384423379
60	NC_017270	TTGG	2	8	17054	17061	0 %	50 %	50 %	0 %	384423379
61	NC_017270	CGGT	2	8	17618	17625	0 %	25 %	50 %	25 %	384423379
62	NC_017270	GTGC	2	8	18164	18171	0 %	25 %	50 %	25 %	384423379
63	NC_017270	TGCT	2	8	18403	18410	0 %	50 %	25 %	25 %	384423379
64	NC_017270	TTGG	2	8	18452	18459	0 %	50 %	50 %	0 %	384423379
65	NC_017270	AAGT	2	8	18979	18986	50 %	25 %	25 %	0 %	384423380
66	NC_017270	AAGT	2	8	19204	19211	50 %	25 %	25 %	0 %	384423380
67	NC_017270	ACAA	2	8	19984	19991	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017270	TTGT	2	8	20014	20021	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017270	TGGA	2	8	20327	20334	25 %	25 %	50 %	0 %	384423381
70	NC_017270	TTGC	2	8	20491	20498	0 %	50 %	25 %	25 %	384423381
71	NC_017270	TGAC	2	8	21642	21649	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017270	TTTC	2	8	21776	21783	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017270	CGAT	2	8	22189	22196	25 %	25 %	25 %	25 %	384423385
74	NC_017270	GCTG	2	8	22427	22434	0 %	25 %	50 %	25 %	384423385
75	NC_017270	ACCA	2	8	22456	22463	50 %	0 %	0 %	50 %	384423385
76	NC_017270	AATC	2	8	22592	22599	50 %	25 %	0 %	25 %	384423385
77	NC_017270	GTGA	2	8	22743	22750	25 %	25 %	50 %	0 %	384423385
78	NC_017270	ATGG	2	8	22841	22848	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017270	CTAT	2	8	22881	22888	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017270	AGGC	2	8	23924	23931	25 %	0 %	50 %	25 %	384423386
81	NC_017270	ACCG	2	8	24019	24026	25 %	0 %	25 %	50 %	384423386
82	NC_017270	CTGG	2	8	24411	24418	0 %	25 %	50 %	25 %	384423386
83	NC_017270	AGGT	2	8	24917	24924	25 %	25 %	50 %	0 %	384423387
84	NC_017270	TGCG	2	8	25168	25175	0 %	25 %	50 %	25 %	384423387
85	NC_017270	GTTT	2	8	25307	25314	0 %	75 %	25 %	0 %	384423387
86	NC_017270	CCGC	2	8	25421	25428	0 %	0 %	25 %	75 %	384423387
87	NC_017270	CGAT	2	8	25505	25512	25 %	25 %	25 %	25 %	384423387
88	NC_017270	CCTT	2	8	27366	27373	0 %	50 %	0 %	50 %	384423389
89	NC_017270	CTTG	2	8	27557	27564	0 %	50 %	25 %	25 %	384423389
90	NC_017270	GTCG	2	8	28190	28197	0 %	25 %	50 %	25 %	384423390
91	NC_017270	CATC	2	8	28975	28982	25 %	25 %	0 %	50 %	384423390
92	NC_017270	TATC	2	8	29438	29445	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017270	GTCT	2	8	29485	29492	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017270	TCAT	2	8	29862	29869	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017270	TGCC	2	8	30216	30223	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017270	TGCG	2	8	33376	33383	0 %	25 %	50 %	25 %	384423393
97	NC_017270	TGGG	2	8	33465	33472	0 %	25 %	75 %	0 %	384423393
98	NC_017270	TTTG	2	8	34251	34258	0 %	75 %	25 %	0 %	384423394
99	NC_017270	CAAT	2	8	34682	34689	50 %	25 %	0 %	25 %	384423394
100	NC_017270	CCAA	2	8	35001	35008	50 %	0 %	0 %	50 %	384423394
101	NC_017270	CAAG	2	8	35289	35296	50 %	0 %	25 %	25 %	384423394
102	NC_017270	TCAA	2	8	35637	35644	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017270	ACTT	2	8	35863	35870	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017270	TTTC	2	8	36352	36359	0 %	75 %	0 %	25 %	384423396
105	NC_017270	ATTT	2	8	36682	36689	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017270	TGAG	2	8	36704	36711	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017270	GCCA	2	8	36972	36979	25 %	0 %	25 %	50 %	384423397
108	NC_017270	TGAG	2	8	37624	37631	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017270	GGTT	2	8	37950	37957	0 %	50 %	50 %	0 %	384423398
110	NC_017270	TCGC	2	8	37975	37982	0 %	25 %	25 %	50 %	384423398
111	NC_017270	GGTG	2	8	38106	38113	0 %	25 %	75 %	0 %	384423398
112	NC_017270	ACTG	2	8	38524	38531	25 %	25 %	25 %	25 %	384423399
113	NC_017270	TGGT	2	8	38539	38546	0 %	50 %	50 %	0 %	384423399
114	NC_017270	GCTG	2	8	38844	38851	0 %	25 %	50 %	25 %	384423399
115	NC_017270	GCCA	2	8	39104	39111	25 %	0 %	25 %	50 %	384423400
116	NC_017270	CAAC	2	8	39464	39471	50 %	0 %	0 %	50 %	384423400
117	NC_017270	ACGT	2	8	40124	40131	25 %	25 %	25 %	25 %	384423400
118	NC_017270	GTGA	2	8	40633	40640	25 %	25 %	50 %	0 %	384423401
119	NC_017270	ATCA	2	8	40681	40688	50 %	25 %	0 %	25 %	384423401
120	NC_017270	ACTC	2	8	41043	41050	25 %	25 %	0 %	50 %	384423401
121	NC_017270	ACCA	2	8	41212	41219	50 %	0 %	0 %	50 %	384423401
122	NC_017270	TGGC	2	8	41555	41562	0 %	25 %	50 %	25 %	384423401
123	NC_017270	AGCG	2	8	41668	41675	25 %	0 %	50 %	25 %	384423401
124	NC_017270	TTTG	2	8	41727	41734	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017270	CAAT	2	8	42234	42241	50 %	25 %	0 %	25 %	384423402
126	NC_017270	AGTG	2	8	42996	43003	25 %	25 %	50 %	0 %	384423402
127	NC_017270	CCAT	2	8	43089	43096	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017270	TCGC	2	8	43573	43580	0 %	25 %	25 %	50 %	384423403
129	NC_017270	CATC	2	8	43631	43638	25 %	25 %	0 %	50 %	384423403
130	NC_017270	ATTT	2	8	44076	44083	25 %	75 %	0 %	0 %	384423404
131	NC_017270	GGAC	2	8	44305	44312	25 %	0 %	50 %	25 %	384423404
132	NC_017270	CAAG	2	8	45191	45198	50 %	0 %	25 %	25 %	384423405
133	NC_017270	GGTG	2	8	45308	45315	0 %	25 %	75 %	0 %	384423405
134	NC_017270	CAGC	2	8	45447	45454	25 %	0 %	25 %	50 %	384423405
135	NC_017270	GCAG	2	8	45776	45783	25 %	0 %	50 %	25 %	384423405
136	NC_017270	AAGC	2	8	46037	46044	50 %	0 %	25 %	25 %	384423406
137	NC_017270	TCGC	2	8	46242	46249	0 %	25 %	25 %	50 %	384423406
138	NC_017270	CTCA	2	8	46561	46568	25 %	25 %	0 %	50 %	384423406
139	NC_017270	CAAT	2	8	46651	46658	50 %	25 %	0 %	25 %	384423406
140	NC_017270	GCTA	2	8	46965	46972	25 %	25 %	25 %	25 %	384423406
141	NC_017270	GCGA	2	8	49184	49191	25 %	0 %	50 %	25 %	384423409
142	NC_017270	CAGA	2	8	49449	49456	50 %	0 %	25 %	25 %	384423410
143	NC_017270	TTAT	2	8	49743	49750	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017270	CAAG	2	8	49755	49762	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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