MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome chromosome I

Total Repeats: 1555

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017270	ATCA	2	8	283	290	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017270	TCAA	2	8	2261	2268	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017270	TTAT	2	8	3899	3906	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017270	CGTA	2	8	4467	4474	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017270	ACTC	2	8	4784	4791	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017270	TCCT	2	8	6283	6290	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017270	TGAG	2	8	7398	7405	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017270	GTCA	2	8	11309	11316	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017270	CCGA	2	8	11337	11344	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017270	ATGA	2	8	12162	12169	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017270	GCGG	2	8	12387	12394	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017270	TGAT	2	8	12844	12851	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017270	TACT	2	8	13116	13123	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017270	TTGA	2	8	13191	13198	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017270	GTCT	2	8	13291	13298	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017270	CATT	2	8	13726	13733	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017270	ACAA	2	8	19984	19991	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017270	TTGT	2	8	20014	20021	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017270	TGAC	2	8	21642	21649	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017270	TTTC	2	8	21776	21783	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017270	ATGG	2	8	22841	22848	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017270	CTAT	2	8	22881	22888	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017270	TATC	2	8	29438	29445	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017270	GTCT	2	8	29485	29492	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017270	TCAT	2	8	29862	29869	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017270	TGCC	2	8	30216	30223	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017270	TCAA	2	8	35637	35644	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017270	ACTT	2	8	35863	35870	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017270	ATTT	2	8	36682	36689	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017270	TGAG	2	8	36704	36711	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017270	TGAG	2	8	37624	37631	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017270	TTTG	2	8	41727	41734	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017270	CCAT	2	8	43089	43096	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017270	TTAT	2	8	49743	49750	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017270	CAAG	2	8	49755	49762	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017270	GGTA	2	8	53112	53119	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017270	CAAT	2	8	53412	53419	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017270	GATT	2	8	55165	55172	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017270	CTGA	2	8	55973	55980	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017270	GTAC	2	8	56057	56064	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017270	AGTA	2	8	56459	56466	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017270	CGTC	2	8	56496	56503	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017270	AAAG	2	8	56618	56625	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017270	TAAT	2	8	58927	58934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017270	TATT	2	8	59652	59659	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017270	TACC	2	8	59673	59680	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017270	CCAG	2	8	66077	66084	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017270	GCTG	2	8	68219	68226	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017270	CATG	2	8	68552	68559	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017270	TGAG	2	8	68693	68700	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017270	AACA	2	8	68785	68792	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017270	TCAA	2	8	68891	68898	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017270	AACC	2	8	71379	71386	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017270	ATCT	2	8	86160	86167	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017270	TTTA	2	8	94763	94770	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017270	CAGA	2	8	94834	94841	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017270	TTGA	2	8	99347	99354	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017270	TTAC	2	8	102852	102859	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017270	GGTC	2	8	106021	106028	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017270	GATT	2	8	106047	106054	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017270	TGGT	2	8	106989	106996	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017270	GATT	2	8	107169	107176	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017270	TCAA	2	8	114533	114540	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017270	TGCG	2	8	114563	114570	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017270	CTAT	2	8	118831	118838	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017270	AGAT	2	8	126091	126098	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017270	GACC	2	8	132554	132561	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017270	TATT	2	8	134495	134502	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017270	TTGT	2	8	134527	134534	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017270	GTTT	2	8	134572	134579	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017270	TGGT	2	8	134876	134883	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017270	TGGC	2	8	136555	136562	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017270	CGTT	2	8	140786	140793	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017270	CTTG	2	8	142411	142418	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017270	CCAA	2	8	142530	142537	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017270	GAAA	2	8	146402	146409	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017270	CGAA	2	8	147996	148003	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017270	GATT	2	8	149952	149959	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017270	CTGA	2	8	150803	150810	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017270	GTAC	2	8	150887	150894	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017270	AGTA	2	8	151289	151296	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017270	CGTC	2	8	151326	151333	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017270	AAAG	2	8	151448	151455	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017270	CTTT	2	8	156333	156340	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017270	TAAA	2	8	161733	161740	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017270	TGCG	2	8	162607	162614	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017270	TGGT	2	8	163121	163128	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017270	ATGT	2	8	163538	163545	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017270	ACCC	2	8	163621	163628	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
90	NC_017270	ATTT	2	8	164988	164995	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017270	AAGA	2	8	165023	165030	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017270	GTTG	2	8	165524	165531	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017270	GATT	2	8	171304	171311	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017270	ATTT	2	8	171369	171376	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017270	AGCA	2	8	171848	171855	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017270	TGTA	2	8	172221	172228	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017270	TTTA	2	8	180067	180074	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017270	GTGG	2	8	181813	181820	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017270	CATC	2	8	187684	187691	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017270	TGCC	2	8	187753	187760	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017270	TGAA	2	8	187964	187971	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017270	TTGC	2	8	188352	188359	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017270	TTTG	2	8	189021	189028	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017270	TTAA	2	8	189458	189465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017270	TCAA	2	8	196397	196404	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017270	ACGG	2	8	198960	198967	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017270	CTTT	2	8	198998	199005	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017270	TAAA	2	8	199558	199565	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017270	AGGG	2	8	201563	201570	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017270	AAGT	2	8	201669	201676	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017270	AAAG	2	8	203691	203698	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017270	ATCA	2	8	204005	204012	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017270	CCTT	2	8	208203	208210	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017270	TAAG	2	8	243526	243533	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017270	TCAA	2	8	243795	243802	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017270	TAAG	2	8	244885	244892	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017270	ATTA	2	8	245123	245130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017270	TTAG	2	8	245305	245312	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017270	ATAA	2	8	249878	249885	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017270	GAAA	2	8	249913	249920	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017270	GCAG	2	8	249981	249988	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017270	ATAC	2	8	250013	250020	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017270	ATCA	2	8	253502	253509	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017270	TCCC	2	8	253527	253534	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
125	NC_017270	AATC	2	8	254937	254944	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017270	TAGG	2	8	257408	257415	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017270	CTTA	2	8	263827	263834	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017270	TGAT	2	8	266180	266187	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017270	ATGA	2	8	266212	266219	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017270	TTCT	2	8	268025	268032	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017270	TATT	2	8	276994	277001	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017270	TGAT	2	8	285342	285349	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017270	TTTC	2	8	287204	287211	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017270	GCAA	2	8	288033	288040	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017270	TCAG	2	8	290127	290134	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017270	TTAA	2	8	301171	301178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017270	ACTA	2	8	301245	301252	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017270	TTTG	2	8	302564	302571	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017270	GAAC	2	8	302604	302611	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017270	TAGA	2	8	306605	306612	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017270	ATAA	2	8	306679	306686	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017270	CAAT	2	8	306924	306931	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017270	GATT	2	8	308672	308679	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017270	GCCT	2	8	308813	308820	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_017270	CTGA	2	8	309565	309572	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017270	GTAC	2	8	309649	309656	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017270	AGTA	2	8	310051	310058	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017270	CGTC	2	8	310088	310095	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_017270	AAAG	2	8	310210	310217	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017270	GTAG	2	8	317770	317777	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017270	GGTT	2	8	319656	319663	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017270	TAAA	2	8	322664	322671	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_017270	GTAC	2	8	323854	323861	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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161	NC_017270	TGGT	2	8	325917	325924	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017270	CTGA	2	8	326147	326154	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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