MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome chromosome I

Total Repeats: 35517

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017270	TTA	2	6	42	47	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017270	CTA	2	6	51	56	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017270	CAA	2	6	95	100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017270	ATT	2	6	367	372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423363
5	NC_017270	TGA	2	6	383	388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423363
6	NC_017270	CAG	2	6	486	491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423363
7	NC_017270	GGT	2	6	580	585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423363
8	NC_017270	TGA	2	6	653	658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423363
9	NC_017270	GGT	2	6	749	754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423363
10	NC_017270	TGC	2	6	782	787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423363
11	NC_017270	ATG	2	6	833	838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423364
12	NC_017270	ATC	2	6	858	863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423364
13	NC_017270	GTT	2	6	953	958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423364
14	NC_017270	CGG	2	6	1009	1014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423364
15	NC_017270	TTA	2	6	1174	1179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423364
16	NC_017270	CAA	2	6	1217	1222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423364
17	NC_017270	TGG	2	6	1259	1264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423364
18	NC_017270	GAT	2	6	1374	1379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423364
19	NC_017270	GGT	2	6	1428	1433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423364
20	NC_017270	CAC	2	6	1521	1526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423364
21	NC_017270	ATG	2	6	1591	1596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423364
22	NC_017270	TCT	3	9	1642	1650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423364
23	NC_017270	CCA	2	6	1700	1705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423364
24	NC_017270	CGG	2	6	1894	1899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423364
25	NC_017270	GAC	2	6	1914	1919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423364
26	NC_017270	GCT	2	6	2006	2011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423364
27	NC_017270	TGT	2	6	2169	2174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423364
28	NC_017270	CAG	2	6	2217	2222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017270	CAA	2	6	2224	2229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017270	GCC	2	6	2245	2250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_017270	GAA	3	9	2385	2393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423365
32	NC_017270	TCT	2	6	2423	2428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423365
33	NC_017270	TCT	2	6	2462	2467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423365
34	NC_017270	CAG	2	6	2493	2498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423365
35	NC_017270	GTA	2	6	2508	2513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423365
36	NC_017270	CAT	2	6	2676	2681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423365
37	NC_017270	ATC	2	6	2703	2708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423365
38	NC_017270	GCA	2	6	2744	2749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423365
39	NC_017270	CAC	2	6	2801	2806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423365
40	NC_017270	GAT	2	6	2826	2831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423365
41	NC_017270	CAA	2	6	2849	2854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423365
42	NC_017270	ACC	2	6	2920	2925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423365
43	NC_017270	ATT	2	6	3057	3062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423365
44	NC_017270	TCA	2	6	3094	3099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423365
45	NC_017270	AGT	2	6	3122	3127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423365
46	NC_017270	ATC	2	6	3133	3138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423365
47	NC_017270	GTC	2	6	3192	3197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423365
48	NC_017270	CTT	2	6	3207	3212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423365
49	NC_017270	CAC	3	9	3239	3247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423365
50	NC_017270	CCA	2	6	3271	3276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423365
51	NC_017270	CAG	2	6	3282	3287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423365
52	NC_017270	ATT	2	6	3336	3341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423365
53	NC_017270	ATT	2	6	3501	3506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423365
54	NC_017270	CAA	2	6	3579	3584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423365
55	NC_017270	CGC	2	6	3647	3652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423365
56	NC_017270	CGC	2	6	3711	3716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423365
57	NC_017270	CTG	2	6	3789	3794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423365
58	NC_017270	TTC	2	6	3814	3819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423365
59	NC_017270	TTG	2	6	3831	3836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423365
60	NC_017270	TGG	2	6	3926	3931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017270	TGG	2	6	3982	3987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017270	TAA	2	6	4087	4092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017270	TTC	2	6	4180	4185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423366
64	NC_017270	ACA	2	6	4220	4225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423366
65	NC_017270	TTA	2	6	4358	4363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423366
66	NC_017270	GAG	2	6	4386	4391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384423366
67	NC_017270	AAT	2	6	4480	4485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017270	ATT	2	6	4491	4496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423367
69	NC_017270	ACG	2	6	4522	4527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423367
70	NC_017270	ATG	2	6	4628	4633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423367
71	NC_017270	AGT	2	6	4649	4654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017270	CAA	2	6	4717	4722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017270	CTT	2	6	4996	5001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423368
74	NC_017270	ACC	2	6	5025	5030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423368
75	NC_017270	CAG	3	9	5123	5131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423368
76	NC_017270	TGC	2	6	5172	5177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423368
77	NC_017270	GCC	2	6	5180	5185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423368
78	NC_017270	TGC	2	6	5192	5197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423368
79	NC_017270	ATC	2	6	5231	5236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423368
80	NC_017270	TCA	2	6	5424	5429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423368
81	NC_017270	GAT	2	6	5510	5515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423368
82	NC_017270	ATC	2	6	5604	5609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423368
83	NC_017270	ACC	2	6	5672	5677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423369
84	NC_017270	AAG	2	6	5699	5704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423369
85	NC_017270	TCA	2	6	5817	5822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423369
86	NC_017270	GAT	2	6	5932	5937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423369
87	NC_017270	GTA	2	6	6049	6054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423369
88	NC_017270	AGC	2	6	6074	6079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423369
89	NC_017270	GCA	2	6	6240	6245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423369
90	NC_017270	AAT	2	6	6293	6298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017270	ATT	2	6	6353	6358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423370
92	NC_017270	GGC	2	6	6420	6425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423370
93	NC_017270	AGA	2	6	7053	7058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423370
94	NC_017270	AGT	2	6	7166	7171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017270	ACT	2	6	7211	7216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017270	AAT	2	6	7293	7298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384423371
97	NC_017270	CGA	2	6	7328	7333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423371
98	NC_017270	CTC	2	6	7373	7378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_017270	CTG	2	6	7595	7600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423372
100	NC_017270	ATG	2	6	7617	7622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423372
101	NC_017270	GCC	2	6	7650	7655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423372
102	NC_017270	TCG	2	6	7712	7717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423372
103	NC_017270	GAT	2	6	7763	7768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423372
104	NC_017270	TGC	2	6	7774	7779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423372
105	NC_017270	CAA	2	6	7825	7830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423372
106	NC_017270	GCG	2	6	7898	7903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423372
107	NC_017270	GGC	2	6	7925	7930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423372
108	NC_017270	TGC	2	6	7953	7958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423372
109	NC_017270	TTG	2	6	7977	7982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423372
110	NC_017270	AAC	2	6	7985	7990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423372
111	NC_017270	GTG	2	6	8003	8008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423372
112	NC_017270	AAC	2	6	8057	8062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423372
113	NC_017270	GAA	2	6	8069	8074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423372
114	NC_017270	CTA	2	6	8083	8088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423372
115	NC_017270	CGA	2	6	8113	8118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423372
116	NC_017270	CAA	2	6	8134	8139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423372
117	NC_017270	TTC	2	6	8159	8164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423372
118	NC_017270	GCT	2	6	8179	8184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423372
119	NC_017270	ATT	2	6	8201	8206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423372
120	NC_017270	GTG	2	6	8238	8243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423372
121	NC_017270	AGA	2	6	8245	8250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423372
122	NC_017270	GCC	2	6	8296	8301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423372
123	NC_017270	TGA	2	6	8328	8333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423372
124	NC_017270	TTA	2	6	8507	8512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423372
125	NC_017270	TAC	2	6	8567	8572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423372
126	NC_017270	GGC	2	6	8699	8704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423372
127	NC_017270	AGA	2	6	8776	8781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423372
128	NC_017270	AGA	2	6	8865	8870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017270	TGC	2	6	9141	9146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423373
130	NC_017270	CTA	2	6	9328	9333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423373
131	NC_017270	CAC	2	6	9364	9369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423373
132	NC_017270	ATC	2	6	9449	9454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423373
133	NC_017270	AGC	2	6	9504	9509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423373
134	NC_017270	TGC	2	6	9516	9521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423373
135	NC_017270	CGC	2	6	9605	9610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423373
136	NC_017270	GTG	2	6	9708	9713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423373
137	NC_017270	AAG	3	9	9768	9776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423373
138	NC_017270	TGG	2	6	9915	9920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423373
139	NC_017270	GAT	2	6	9929	9934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423373
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141	NC_017270	TAA	2	6	10260	10265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384423374
142	NC_017270	GGC	2	6	10297	10302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423374
143	NC_017270	CTG	2	6	10375	10380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423374
144	NC_017270	GCT	2	6	10494	10499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423374
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148	NC_017270	GCA	2	6	10863	10868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423374
149	NC_017270	GAT	2	6	10909	10914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423374
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151	NC_017270	CAC	2	6	11211	11216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_017270	GGT	2	6	11228	11233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017270	TGA	2	6	11246	11251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017270	TCA	2	6	11380	11385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_017270	CGG	2	6	11402	11407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_017270	GAC	2	6	11415	11420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_017270	CGG	2	6	11438	11443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_017270	GGT	2	6	11465	11470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
159	NC_017270	CGG	2	6	11510	11515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_017270	CAT	2	6	11538	11543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_017270	TAC	2	6	11594	11599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_017270	GAA	2	6	11727	11732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
163	NC_017270	ATG	2	6	11881	11886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
164	NC_017270	CAA	2	6	11915	11920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_017270	TGG	2	6	11936	11941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
166	NC_017270	GTG	2	6	11962	11967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
167	NC_017270	AAC	2	6	11985	11990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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169	NC_017270	GAA	2	6	12014	12019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_017270	TTC	2	6	12128	12133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_017270	ATT	2	6	12228	12233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_017270	GCG	2	6	12237	12242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_017270	GCG	2	6	12255	12260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_017270	TGT	2	6	12487	12492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
176	NC_017270	AAG	2	6	12499	12504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
177	NC_017270	TCA	2	6	12514	12519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
178	NC_017270	CAT	4	12	12562	12573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
179	NC_017270	CTG	2	6	12611	12616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
180	NC_017270	CTT	2	6	12622	12627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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183	NC_017270	TGC	2	6	12907	12912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
184	NC_017270	AAG	2	6	13012	13017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
185	NC_017270	GTG	2	6	13219	13224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
186	NC_017270	CAG	2	6	13241	13246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
187	NC_017270	GCC	2	6	13251	13256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
188	NC_017270	CGC	2	6	13284	13289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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191	NC_017270	ACG	2	6	13425	13430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
192	NC_017270	CGT	2	6	13455	13460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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256	NC_017270	TTG	2	6	18340	18345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423379
257	NC_017270	AGC	2	6	18368	18373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423379
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261	NC_017270	CTT	2	6	18744	18749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423380
262	NC_017270	TAA	2	6	18784	18789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384423380
263	NC_017270	TGG	2	6	19045	19050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423380
264	NC_017270	TGT	2	6	19367	19372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423380
265	NC_017270	TGA	2	6	19385	19390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423380
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272	NC_017270	AAT	2	6	19752	19757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_017270	GGT	2	6	19847	19852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
274	NC_017270	ATA	2	6	20032	20037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_017270	TAC	2	6	20085	20090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423381
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294	NC_017270	TGG	2	6	21357	21362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
295	NC_017270	ATT	2	6	21369	21374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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