MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome chromosome I

Total Repeats: 28707

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017270	ATT	2	6	367	372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423363
2	NC_017270	TGA	2	6	383	388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423363
3	NC_017270	CAG	2	6	486	491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423363
4	NC_017270	GGT	2	6	580	585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423363
5	NC_017270	TGA	2	6	653	658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423363
6	NC_017270	GGT	2	6	749	754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423363
7	NC_017270	TGC	2	6	782	787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423363
8	NC_017270	ATG	2	6	833	838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423364
9	NC_017270	ATC	2	6	858	863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423364
10	NC_017270	GTT	2	6	953	958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423364
11	NC_017270	CGG	2	6	1009	1014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423364
12	NC_017270	TTA	2	6	1174	1179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423364
13	NC_017270	CAA	2	6	1217	1222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423364
14	NC_017270	TGG	2	6	1259	1264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423364
15	NC_017270	GAT	2	6	1374	1379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423364
16	NC_017270	GGT	2	6	1428	1433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423364
17	NC_017270	CAC	2	6	1521	1526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423364
18	NC_017270	ATG	2	6	1591	1596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423364
19	NC_017270	TCT	3	9	1642	1650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423364
20	NC_017270	CCA	2	6	1700	1705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423364
21	NC_017270	CGG	2	6	1894	1899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423364
22	NC_017270	GAC	2	6	1914	1919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423364
23	NC_017270	GCT	2	6	2006	2011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423364
24	NC_017270	TGT	2	6	2169	2174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423364
25	NC_017270	GAA	3	9	2385	2393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423365
26	NC_017270	TCT	2	6	2423	2428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423365
27	NC_017270	TCT	2	6	2462	2467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423365
28	NC_017270	CAG	2	6	2493	2498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423365
29	NC_017270	GTA	2	6	2508	2513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423365
30	NC_017270	CAT	2	6	2676	2681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423365
31	NC_017270	ATC	2	6	2703	2708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423365
32	NC_017270	GCA	2	6	2744	2749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423365
33	NC_017270	CAC	2	6	2801	2806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423365
34	NC_017270	GAT	2	6	2826	2831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423365
35	NC_017270	CAA	2	6	2849	2854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423365
36	NC_017270	ACC	2	6	2920	2925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423365
37	NC_017270	ATT	2	6	3057	3062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423365
38	NC_017270	TCA	2	6	3094	3099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423365
39	NC_017270	AGT	2	6	3122	3127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423365
40	NC_017270	ATC	2	6	3133	3138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423365
41	NC_017270	GTC	2	6	3192	3197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423365
42	NC_017270	CTT	2	6	3207	3212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423365
43	NC_017270	CAC	3	9	3239	3247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423365
44	NC_017270	CCA	2	6	3271	3276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423365
45	NC_017270	CAG	2	6	3282	3287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423365
46	NC_017270	ATT	2	6	3336	3341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423365
47	NC_017270	ATT	2	6	3501	3506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423365
48	NC_017270	CAA	2	6	3579	3584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423365
49	NC_017270	CGC	2	6	3647	3652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423365
50	NC_017270	CGC	2	6	3711	3716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423365
51	NC_017270	CTG	2	6	3789	3794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423365
52	NC_017270	TTC	2	6	3814	3819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423365
53	NC_017270	TTG	2	6	3831	3836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423365
54	NC_017270	TTC	2	6	4180	4185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423366
55	NC_017270	ACA	2	6	4220	4225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423366
56	NC_017270	TTA	2	6	4358	4363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423366
57	NC_017270	GAG	2	6	4386	4391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384423366
58	NC_017270	ATT	2	6	4491	4496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423367
59	NC_017270	ACG	2	6	4522	4527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423367
60	NC_017270	ATG	2	6	4628	4633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423367
61	NC_017270	CTT	2	6	4996	5001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423368
62	NC_017270	ACC	2	6	5025	5030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423368
63	NC_017270	CAG	3	9	5123	5131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423368
64	NC_017270	TGC	2	6	5172	5177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423368
65	NC_017270	GCC	2	6	5180	5185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423368
66	NC_017270	TGC	2	6	5192	5197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423368
67	NC_017270	ATC	2	6	5231	5236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423368
68	NC_017270	TCA	2	6	5424	5429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423368
69	NC_017270	GAT	2	6	5510	5515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423368
70	NC_017270	ATC	2	6	5604	5609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423368
71	NC_017270	ACC	2	6	5672	5677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423369
72	NC_017270	AAG	2	6	5699	5704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423369
73	NC_017270	TCA	2	6	5817	5822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423369
74	NC_017270	GAT	2	6	5932	5937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423369
75	NC_017270	GTA	2	6	6049	6054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423369
76	NC_017270	AGC	2	6	6074	6079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423369
77	NC_017270	GCA	2	6	6240	6245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423369
78	NC_017270	ATT	2	6	6353	6358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423370
79	NC_017270	GGC	2	6	6420	6425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423370
80	NC_017270	AGA	2	6	7053	7058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423370
81	NC_017270	AAT	2	6	7293	7298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384423371
82	NC_017270	CGA	2	6	7328	7333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423371
83	NC_017270	CTG	2	6	7595	7600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423372
84	NC_017270	ATG	2	6	7617	7622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423372
85	NC_017270	GCC	2	6	7650	7655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423372
86	NC_017270	TCG	2	6	7712	7717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423372
87	NC_017270	GAT	2	6	7763	7768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423372
88	NC_017270	TGC	2	6	7774	7779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423372
89	NC_017270	CAA	2	6	7825	7830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423372
90	NC_017270	GCG	2	6	7898	7903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423372
91	NC_017270	GGC	2	6	7925	7930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423372
92	NC_017270	TGC	2	6	7953	7958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423372
93	NC_017270	TTG	2	6	7977	7982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384423372
94	NC_017270	AAC	2	6	7985	7990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423372
95	NC_017270	GTG	2	6	8003	8008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423372
96	NC_017270	AAC	2	6	8057	8062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423372
97	NC_017270	GAA	2	6	8069	8074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423372
98	NC_017270	CTA	2	6	8083	8088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423372
99	NC_017270	CGA	2	6	8113	8118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423372
100	NC_017270	CAA	2	6	8134	8139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384423372
101	NC_017270	TTC	2	6	8159	8164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384423372
102	NC_017270	GCT	2	6	8179	8184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423372
103	NC_017270	ATT	2	6	8201	8206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423372
104	NC_017270	GTG	2	6	8238	8243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423372
105	NC_017270	AGA	2	6	8245	8250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423372
106	NC_017270	GCC	2	6	8296	8301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423372
107	NC_017270	TGA	2	6	8328	8333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423372
108	NC_017270	TTA	2	6	8507	8512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423372
109	NC_017270	TAC	2	6	8567	8572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423372
110	NC_017270	GGC	2	6	8699	8704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423372
111	NC_017270	AGA	2	6	8776	8781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423372
112	NC_017270	TGC	2	6	9141	9146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423373
113	NC_017270	CTA	2	6	9328	9333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423373
114	NC_017270	CAC	2	6	9364	9369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384423373
115	NC_017270	ATC	2	6	9449	9454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384423373
116	NC_017270	AGC	2	6	9504	9509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423373
117	NC_017270	TGC	2	6	9516	9521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423373
118	NC_017270	CGC	2	6	9605	9610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384423373
119	NC_017270	GTG	2	6	9708	9713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423373
120	NC_017270	AAG	3	9	9768	9776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384423373
121	NC_017270	TGG	2	6	9915	9920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384423373
122	NC_017270	GAT	2	6	9929	9934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423373
123	NC_017270	CAG	2	6	10055	10060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423374
124	NC_017270	TAA	2	6	10260	10265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384423374
125	NC_017270	GGC	2	6	10297	10302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384423374
126	NC_017270	CTG	2	6	10375	10380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423374
127	NC_017270	GCT	2	6	10494	10499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423374
128	NC_017270	TAT	2	6	10663	10668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384423374
129	NC_017270	CAG	2	6	10729	10734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384423374
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499	NC_017270	GTC	2	6	45175	45180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384423405
500	NC_017270	TGA	3	9	45272	45280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384423405

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