MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome II

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017269	AGCGGT	2	12	8329	8340	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017269	TCTTGC	2	12	10672	10683	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017269	TGCTTT	2	12	25073	25084	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017269	TTCATA	2	12	45967	45978	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017269	TTCAAT	2	12	50737	50748	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017269	TATGGC	2	12	67689	67700	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017269	ATATTT	2	12	177499	177510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017269	CTGTTT	2	12	183077	183088	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017269	GGATGT	2	12	183715	183726	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017269	AAGTGA	2	12	192575	192586	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017269	TGTTGA	2	12	193774	193785	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017269	GAAGGA	2	12	234329	234340	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017269	GATGGA	2	12	248926	248937	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017269	CTTGTT	2	12	282058	282069	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017269	GTTTGG	2	12	295777	295788	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017269	ATTTGA	2	12	301646	301657	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017269	ATTGAA	2	12	302505	302516	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017269	TTTTGG	2	12	337043	337054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017269	TTTTCA	2	12	340982	340993	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017269	TAGTGA	2	12	350610	350621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017269	TAGTGG	2	12	380117	380128	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017269	CTGATT	2	12	453976	453987	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017269	CTTGCC	2	12	455949	455960	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017269	TGGTTA	2	12	476479	476490	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017269	GATCAA	2	12	484877	484888	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017269	CTGAAA	2	12	486538	486549	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017269	TCTTTT	2	12	486581	486592	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017269	AAACTC	2	12	488248	488259	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017269	ATTCAA	2	12	511480	511491	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017269	CAAATA	2	12	522706	522717	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017269	AAGCTT	2	12	564441	564452	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017269	GACACT	2	12	576567	576578	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017269	AAAACC	2	12	593354	593365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017269	CGATCC	2	12	617777	617788	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017269	ATCCAG	2	12	639304	639315	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017269	CTCCTG	2	12	639412	639423	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017269	CTAAGC	2	12	668344	668355	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017269	GTAAGA	2	12	674442	674453	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017269	CAAAAA	2	12	700565	700576	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017269	CAACAT	2	12	722139	722150	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017269	GTTATT	2	12	722343	722354	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017269	GTCAAG	2	12	725194	725205	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017269	AAATTA	2	12	785560	785571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017269	AATCAC	2	12	817698	817709	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017269	GCGTAA	2	12	825521	825532	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017269	AATCGA	2	12	825627	825638	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017269	AAAATG	2	12	854474	854485	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017269	AAACAC	2	12	855774	855785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017269	AAAATT	2	12	890519	890530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017269	CTAACT	2	12	894910	894921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017269	ACTTTC	2	12	895022	895033	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017269	AAAATG	2	12	902752	902763	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017269	AATTAA	2	12	935616	935627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.