MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome II

Total Repeats: 680

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017269	GAAGG	2	10	2412	2421	40 %	0 %	60 %	0 %	384422538
2	NC_017269	ATGTG	2	10	2522	2531	20 %	40 %	40 %	0 %	384422538
3	NC_017269	AGATG	2	10	3086	3095	40 %	20 %	40 %	0 %	384422538
4	NC_017269	GCTTT	2	10	3646	3655	0 %	60 %	20 %	20 %	384422539
5	NC_017269	GGCAG	2	10	6133	6142	20 %	0 %	60 %	20 %	384422543
6	NC_017269	TGCTC	2	10	6776	6785	0 %	40 %	20 %	40 %	384422544
7	NC_017269	TCTCT	2	10	7358	7367	0 %	60 %	0 %	40 %	384422544
8	NC_017269	TTCAC	2	10	10195	10204	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_017269	GTGGC	2	10	16688	16697	0 %	20 %	60 %	20 %	384422547
10	NC_017269	GTTAG	2	10	17174	17183	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017269	TGGTG	2	10	18191	18200	0 %	40 %	60 %	0 %	384422548
12	NC_017269	GGTTT	2	10	18628	18637	0 %	60 %	40 %	0 %	384422548
13	NC_017269	ACCAC	2	10	19627	19636	40 %	0 %	0 %	60 %	384422549
14	NC_017269	GATCC	2	10	21985	21994	20 %	20 %	20 %	40 %	384422552
15	NC_017269	TTGGC	2	10	24524	24533	0 %	40 %	40 %	20 %	384422553
16	NC_017269	CCAAT	2	10	27473	27482	40 %	20 %	0 %	40 %	384422556
17	NC_017269	CGCGA	2	10	27697	27706	20 %	0 %	40 %	40 %	384422556
18	NC_017269	TTTGT	2	10	30469	30478	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017269	AAGCG	2	10	31551	31560	40 %	0 %	40 %	20 %	384422559
20	NC_017269	AATGC	2	10	32432	32441	40 %	20 %	20 %	20 %	384422559
21	NC_017269	GCAAA	2	10	33413	33422	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017269	GCTTA	2	10	34350	34359	20 %	40 %	20 %	20 %	384422561
23	NC_017269	AAGCT	2	10	34787	34796	40 %	20 %	20 %	20 %	384422561
24	NC_017269	ACTCA	2	10	34906	34915	40 %	20 %	0 %	40 %	384422561
25	NC_017269	GCGGA	2	10	35345	35354	20 %	0 %	60 %	20 %	384422562
26	NC_017269	TGCAC	2	10	35477	35486	20 %	20 %	20 %	40 %	384422562
27	NC_017269	GAGTT	2	10	35629	35638	20 %	40 %	40 %	0 %	384422562
28	NC_017269	GAGCT	2	10	35911	35920	20 %	20 %	40 %	20 %	384422562
29	NC_017269	CCACT	2	10	38161	38170	20 %	20 %	0 %	60 %	384422564
30	NC_017269	GGTTG	2	10	38796	38805	0 %	40 %	60 %	0 %	384422564
31	NC_017269	AGGTG	2	10	39602	39611	20 %	20 %	60 %	0 %	384422564
32	NC_017269	GCTGA	2	10	40586	40595	20 %	20 %	40 %	20 %	384422565
33	NC_017269	TGGGT	2	10	41130	41139	0 %	40 %	60 %	0 %	384422566
34	NC_017269	CTTGG	2	10	41199	41208	0 %	40 %	40 %	20 %	384422566
35	NC_017269	ACTGA	2	10	41262	41271	40 %	20 %	20 %	20 %	384422566
36	NC_017269	GTTGC	2	10	45079	45088	0 %	40 %	40 %	20 %	384422571
37	NC_017269	CAATC	2	10	45250	45259	40 %	20 %	0 %	40 %	384422571
38	NC_017269	CATTT	2	10	47632	47641	20 %	60 %	0 %	20 %	384422572
39	NC_017269	ATTCA	2	10	48563	48572	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017269	CCAAA	2	10	51208	51217	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_017269	TACCT	2	10	52711	52720	20 %	40 %	0 %	40 %	384422575
42	NC_017269	GAACA	2	10	53296	53305	60 %	0 %	20 %	20 %	384422575
43	NC_017269	TGGTT	2	10	53324	53333	0 %	60 %	40 %	0 %	384422575
44	NC_017269	GCTTG	2	10	55045	55054	0 %	40 %	40 %	20 %	384422577
45	NC_017269	CATGC	2	10	55325	55334	20 %	20 %	20 %	40 %	384422577
46	NC_017269	AGTTG	2	10	58719	58728	20 %	40 %	40 %	0 %	384422579
47	NC_017269	CCATG	2	10	59347	59356	20 %	20 %	20 %	40 %	384422580
48	NC_017269	CAATT	2	10	59553	59562	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017269	GTACA	2	10	59791	59800	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_017269	TGGTT	2	10	61621	61630	0 %	60 %	40 %	0 %	384422583
51	NC_017269	GATTT	2	10	61761	61770	20 %	60 %	20 %	0 %	384422583
52	NC_017269	AATGG	2	10	66655	66664	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017269	GCAAG	2	10	68560	68569	40 %	0 %	40 %	20 %	384422588
54	NC_017269	GACAA	2	10	69606	69615	60 %	0 %	20 %	20 %	384422588
55	NC_017269	TTGAC	2	10	70734	70743	20 %	40 %	20 %	20 %	384422589
56	NC_017269	CGCTA	2	10	71295	71304	20 %	20 %	20 %	40 %	384422589
57	NC_017269	TGTGG	2	10	72145	72154	0 %	40 %	60 %	0 %	384422589
58	NC_017269	TGCGC	2	10	72424	72433	0 %	20 %	40 %	40 %	384422589
59	NC_017269	AACCA	2	10	72515	72524	60 %	0 %	0 %	40 %	384422589
60	NC_017269	ACAGG	2	10	74481	74490	40 %	0 %	40 %	20 %	384422591
61	NC_017269	ATTGG	2	10	75280	75289	20 %	40 %	40 %	0 %	384422592
62	NC_017269	ACCCA	2	10	79980	79989	40 %	0 %	0 %	60 %	384422596
63	NC_017269	ATTTC	2	10	80530	80539	20 %	60 %	0 %	20 %	384422597
64	NC_017269	TAAAA	2	10	81005	81014	80 %	20 %	0 %	0 %	384422597
65	NC_017269	GATCA	2	10	81314	81323	40 %	20 %	20 %	20 %	384422597
66	NC_017269	CTTCA	2	10	84576	84585	20 %	40 %	0 %	40 %	384422601
67	NC_017269	AGCAC	2	10	90398	90407	40 %	0 %	20 %	40 %	384422605
68	NC_017269	CTAAG	2	10	94141	94150	40 %	20 %	20 %	20 %	384422608
69	NC_017269	TTGTT	2	10	94662	94671	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017269	TACCA	2	10	96240	96249	40 %	20 %	0 %	40 %	384422611
71	NC_017269	GCTTG	2	10	97822	97831	0 %	40 %	40 %	20 %	384422613
72	NC_017269	ATCCA	2	10	97946	97955	40 %	20 %	0 %	40 %	384422613
73	NC_017269	ATCTA	2	10	99688	99697	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_017269	AATTA	2	10	99741	99750	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017269	CTTTT	2	10	110052	110061	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017269	CAATG	2	10	110843	110852	40 %	20 %	20 %	20 %	384422624
77	NC_017269	GCTCA	2	10	111272	111281	20 %	20 %	20 %	40 %	384422624
78	NC_017269	TTAAT	2	10	112228	112237	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017269	CGGCT	2	10	112623	112632	0 %	20 %	40 %	40 %	384422625
80	NC_017269	ACTCA	2	10	114649	114658	40 %	20 %	0 %	40 %	384422627
81	NC_017269	TTTCA	2	10	115331	115340	20 %	60 %	0 %	20 %	384422628
82	NC_017269	TGAAC	2	10	116030	116039	40 %	20 %	20 %	20 %	384422628
83	NC_017269	CCGAT	2	10	117587	117596	20 %	20 %	20 %	40 %	384422630
84	NC_017269	CGTCC	2	10	117630	117639	0 %	20 %	20 %	60 %	384422630
85	NC_017269	TGGGG	2	10	117954	117963	0 %	20 %	80 %	0 %	384422630
86	NC_017269	GGTAC	2	10	118330	118339	20 %	20 %	40 %	20 %	384422630
87	NC_017269	GTGAT	2	10	118639	118648	20 %	40 %	40 %	0 %	384422631
88	NC_017269	TCCTG	2	10	124140	124149	0 %	40 %	20 %	40 %	384422636
89	NC_017269	GCTGA	2	10	125044	125053	20 %	20 %	40 %	20 %	384422636
90	NC_017269	CTGCT	2	10	125831	125840	0 %	40 %	20 %	40 %	384422636
91	NC_017269	CAATC	2	10	126432	126441	40 %	20 %	0 %	40 %	384422637
92	NC_017269	TTGCT	2	10	127463	127472	0 %	60 %	20 %	20 %	384422637
93	NC_017269	ACCCT	2	10	127485	127494	20 %	20 %	0 %	60 %	384422637
94	NC_017269	AGCTG	2	10	127852	127861	20 %	20 %	40 %	20 %	384422638
95	NC_017269	GGGTT	2	10	128014	128023	0 %	40 %	60 %	0 %	384422638
96	NC_017269	CAGTG	2	10	128559	128568	20 %	20 %	40 %	20 %	384422639
97	NC_017269	AGCAC	2	10	128580	128589	40 %	0 %	20 %	40 %	384422639
98	NC_017269	CGATG	2	10	129712	129721	20 %	20 %	40 %	20 %	384422639
99	NC_017269	GCGTC	2	10	132885	132894	0 %	20 %	40 %	40 %	384422640
100	NC_017269	GATCA	2	10	132935	132944	40 %	20 %	20 %	20 %	384422640
101	NC_017269	TGATC	2	10	134229	134238	20 %	40 %	20 %	20 %	384422641
102	NC_017269	AGCCA	2	10	135531	135540	40 %	0 %	20 %	40 %	384422642
103	NC_017269	TGCTT	2	10	135807	135816	0 %	60 %	20 %	20 %	384422642
104	NC_017269	CGGAG	2	10	136716	136725	20 %	0 %	60 %	20 %	384422642
105	NC_017269	GGCGC	2	10	136933	136942	0 %	0 %	60 %	40 %	384422642
106	NC_017269	AATTT	2	10	138414	138423	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017269	GAGCT	2	10	140177	140186	20 %	20 %	40 %	20 %	384422645
108	NC_017269	ACTGA	2	10	140630	140639	40 %	20 %	20 %	20 %	384422645
109	NC_017269	GCGTG	2	10	140671	140680	0 %	20 %	60 %	20 %	384422645
110	NC_017269	TCGGT	2	10	141515	141524	0 %	40 %	40 %	20 %	384422646
111	NC_017269	GATTG	2	10	144900	144909	20 %	40 %	40 %	0 %	384422649
112	NC_017269	GTTTG	2	10	145433	145442	0 %	60 %	40 %	0 %	384422650
113	NC_017269	TTCTT	2	10	145728	145737	0 %	80 %	0 %	20 %	384422650
114	NC_017269	TTGCC	2	10	152274	152283	0 %	40 %	20 %	40 %	384422656
115	NC_017269	GCGCT	2	10	154696	154705	0 %	20 %	40 %	40 %	384422657
116	NC_017269	CGGTG	2	10	155638	155647	0 %	20 %	60 %	20 %	384422658
117	NC_017269	AGTGA	2	10	156221	156230	40 %	20 %	40 %	0 %	384422658
118	NC_017269	GTTTG	2	10	156280	156289	0 %	60 %	40 %	0 %	384422658
119	NC_017269	TGCTG	2	10	158500	158509	0 %	40 %	40 %	20 %	384422661
120	NC_017269	TTTCC	2	10	158761	158770	0 %	60 %	0 %	40 %	384422661
121	NC_017269	AAACG	2	10	162093	162102	60 %	0 %	20 %	20 %	384422663
122	NC_017269	TGGTG	2	10	162903	162912	0 %	40 %	60 %	0 %	384422663
123	NC_017269	AACCA	2	10	169771	169780	60 %	0 %	0 %	40 %	384422669
124	NC_017269	ACGTG	2	10	171245	171254	20 %	20 %	40 %	20 %	384422671
125	NC_017269	CAGCA	2	10	171473	171482	40 %	0 %	20 %	40 %	384422671
126	NC_017269	AATCC	2	10	171692	171701	40 %	20 %	0 %	40 %	384422671
127	NC_017269	ATGGA	2	10	172430	172439	40 %	20 %	40 %	0 %	384422671
128	NC_017269	TGGCT	2	10	173991	174000	0 %	40 %	40 %	20 %	384422673
129	NC_017269	CTGAA	2	10	174922	174931	40 %	20 %	20 %	20 %	384422674
130	NC_017269	TCTGC	2	10	177029	177038	0 %	40 %	20 %	40 %	384422675
131	NC_017269	CGCTT	2	10	178080	178089	0 %	40 %	20 %	40 %	384422677
132	NC_017269	AGAGA	2	10	182654	182663	60 %	0 %	40 %	0 %	384422682
133	NC_017269	GCTGC	2	10	183056	183065	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
134	NC_017269	CCAAG	2	10	183368	183377	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
135	NC_017269	ATGGC	2	10	183780	183789	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_017269	GATTG	2	10	186606	186615	20 %	40 %	40 %	0 %	384422684
137	NC_017269	CGGCA	2	10	192699	192708	20 %	0 %	40 %	40 %	384422690
138	NC_017269	GTTCA	2	10	193110	193119	20 %	40 %	20 %	20 %	384422690
139	NC_017269	AGGAC	2	10	193741	193750	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
140	NC_017269	AAACG	2	10	196097	196106	60 %	0 %	20 %	20 %	384422693
141	NC_017269	TTTGC	2	10	197328	197337	0 %	60 %	20 %	20 %	384422695
142	NC_017269	TAGTG	2	10	198271	198280	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017269	GCATC	2	10	200985	200994	20 %	20 %	20 %	40 %	384422699
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151	NC_017269	CAAGC	2	10	214277	214286	40 %	0 %	20 %	40 %	384422712
152	NC_017269	GGCTT	2	10	214291	214300	0 %	40 %	40 %	20 %	384422712
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154	NC_017269	TGATT	2	10	215337	215346	20 %	60 %	20 %	0 %	384422714
155	NC_017269	GCAGT	2	10	216627	216636	20 %	20 %	40 %	20 %	384422715
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158	NC_017269	TCATC	2	10	225609	225618	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
159	NC_017269	TCTGC	2	10	225758	225767	0 %	40 %	20 %	40 %	384422722
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161	NC_017269	AAATT	2	10	227346	227355	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017269	ACTCA	2	10	227793	227802	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
163	NC_017269	AGCTG	2	10	228141	228150	20 %	20 %	40 %	20 %	384422724
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167	NC_017269	CTTCT	2	10	232337	232346	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
168	NC_017269	GACCA	2	10	235117	235126	40 %	0 %	20 %	40 %	384422728
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171	NC_017269	TGATC	2	10	239735	239744	20 %	40 %	20 %	20 %	384422731
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179	NC_017269	GCTGC	2	10	253889	253898	0 %	20 %	40 %	40 %	384422745
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189	NC_017269	TCATT	2	10	271108	271117	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
190	NC_017269	TAATT	2	10	271913	271922	40 %	60 %	0 %	0 %	384422766
191	NC_017269	TCATT	2	10	272016	272025	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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195	NC_017269	GCGCG	2	10	281052	281061	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
196	NC_017269	AATCG	2	10	281531	281540	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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199	NC_017269	GTGGA	2	10	285919	285928	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
200	NC_017269	GTTTA	2	10	289425	289434	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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205	NC_017269	GTACG	2	10	294529	294538	20 %	20 %	40 %	20 %	384422786
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223	NC_017269	TAAGT	2	10	327691	327700	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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242	NC_017269	CAAAG	2	10	356152	356161	60 %	0 %	20 %	20 %	384422848
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251	NC_017269	GAGTT	2	10	368234	368243	20 %	40 %	40 %	0 %	384422856
252	NC_017269	TTATG	2	10	370464	370473	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
253	NC_017269	ATCTC	2	10	371990	371999	20 %	40 %	0 %	40 %	384422860
254	NC_017269	CGCAG	2	10	372489	372498	20 %	0 %	40 %	40 %	384422861
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256	NC_017269	CTTGG	2	10	373216	373225	0 %	40 %	40 %	20 %	384422862
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258	NC_017269	ATAGG	2	10	374549	374558	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
259	NC_017269	AAAGC	2	10	374765	374774	60 %	0 %	20 %	20 %	384422863
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261	NC_017269	TAGGA	2	10	378166	378175	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
262	NC_017269	GCGCA	2	10	378383	378392	20 %	0 %	40 %	40 %	384422866
263	NC_017269	GGTGA	2	10	379085	379094	20 %	20 %	60 %	0 %	384422866
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265	NC_017269	GATGT	2	10	381121	381130	20 %	40 %	40 %	0 %	384422867
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267	NC_017269	ACCTT	2	10	382144	382153	20 %	40 %	0 %	40 %	384422870
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269	NC_017269	GCAAA	2	10	384821	384830	60 %	0 %	20 %	20 %	384422874
270	NC_017269	TACGT	2	10	384975	384984	20 %	40 %	20 %	20 %	384422874
271	NC_017269	AAATC	2	10	386254	386263	60 %	20 %	0 %	20 %	384422874
272	NC_017269	TGGTT	2	10	389314	389323	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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398	NC_017269	GCTGT	2	10	571648	571657	0 %	40 %	40 %	20 %	384423035
399	NC_017269	GTTTC	2	10	572533	572542	0 %	60 %	20 %	20 %	384423036
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401	NC_017269	CGCAG	2	10	577233	577242	20 %	0 %	40 %	40 %	384423044
402	NC_017269	GCATC	2	10	577267	577276	20 %	20 %	20 %	40 %	384423044
403	NC_017269	CACGC	2	10	577340	577349	20 %	0 %	20 %	60 %	384423044
404	NC_017269	CCGTA	2	10	577651	577660	20 %	20 %	20 %	40 %	384423044
405	NC_017269	GCGTA	2	10	578287	578296	20 %	20 %	40 %	20 %	384423044
406	NC_017269	ATCCC	2	10	578774	578783	20 %	20 %	0 %	60 %	384423045
407	NC_017269	ATGAA	2	10	580035	580044	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
408	NC_017269	CAAAC	2	10	583015	583024	60 %	0 %	0 %	40 %	384423047
409	NC_017269	CGCAC	2	10	584838	584847	20 %	0 %	20 %	60 %	384423049
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414	NC_017269	TGTGA	2	10	590341	590350	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
415	NC_017269	TGCGC	2	10	590521	590530	0 %	20 %	40 %	40 %	384423055
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417	NC_017269	AATCA	2	10	595827	595836	60 %	20 %	0 %	20 %	384423061
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434	NC_017269	TCGAT	2	10	614350	614359	20 %	40 %	20 %	20 %	384423079
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436	NC_017269	CCTAG	2	10	616127	616136	20 %	20 %	20 %	40 %	384423081
437	NC_017269	TTTTG	2	10	619074	619083	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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439	NC_017269	AAGTG	2	10	621210	621219	40 %	20 %	40 %	0 %	384423083
440	NC_017269	CCATT	2	10	622413	622422	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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446	NC_017269	GATTG	2	10	628268	628277	20 %	40 %	40 %	0 %	384423095
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453	NC_017269	CCAAT	2	10	641739	641748	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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498	NC_017269	AAAAT	2	10	703945	703954	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
499	NC_017269	TGTTT	2	10	704499	704508	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
500	NC_017269	GGAGC	2	10	704757	704766	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding

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