MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome II

Total Repeats: 2532

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017269	ATAA	2	8	155	162	75 %	25 %	0 %	0 %	384422537
2	NC_017269	CAAG	2	8	244	251	50 %	0 %	25 %	25 %	384422537
3	NC_017269	TCAA	2	8	546	553	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017269	AGGA	2	8	732	739	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017269	TTTA	2	8	1059	1066	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017269	TGAT	2	8	1336	1343	25 %	50 %	25 %	0 %	384422538
7	NC_017269	CAAA	2	8	1415	1422	75 %	0 %	0 %	25 %	384422538
8	NC_017269	GCTG	2	8	1445	1452	0 %	25 %	50 %	25 %	384422538
9	NC_017269	CCAA	2	8	1483	1490	50 %	0 %	0 %	50 %	384422538
10	NC_017269	TCAA	2	8	1585	1592	50 %	25 %	0 %	25 %	384422538
11	NC_017269	GCCA	2	8	1625	1632	25 %	0 %	25 %	50 %	384422538
12	NC_017269	TTTG	2	8	1817	1824	0 %	75 %	25 %	0 %	384422538
13	NC_017269	CAAA	2	8	1897	1904	75 %	0 %	0 %	25 %	384422538
14	NC_017269	TCGA	2	8	2991	2998	25 %	25 %	25 %	25 %	384422538
15	NC_017269	GCTC	2	8	3271	3278	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017269	CCAC	2	8	3430	3437	25 %	0 %	0 %	75 %	384422539
17	NC_017269	AGCA	2	8	3487	3494	50 %	0 %	25 %	25 %	384422539
18	NC_017269	TTCA	2	8	3783	3790	25 %	50 %	0 %	25 %	384422539
19	NC_017269	CTTA	2	8	4395	4402	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017269	ACTG	2	8	4534	4541	25 %	25 %	25 %	25 %	384422541
21	NC_017269	AAGC	2	8	4601	4608	50 %	0 %	25 %	25 %	384422541
22	NC_017269	ACCA	2	8	5046	5053	50 %	0 %	0 %	50 %	384422542
23	NC_017269	TACC	2	8	5125	5132	25 %	25 %	0 %	50 %	384422542
24	NC_017269	GACA	2	8	5284	5291	50 %	0 %	25 %	25 %	384422542
25	NC_017269	GATC	2	8	5917	5924	25 %	25 %	25 %	25 %	384422543
26	NC_017269	GGCT	2	8	6274	6281	0 %	25 %	50 %	25 %	384422543
27	NC_017269	GATT	2	8	6343	6350	25 %	50 %	25 %	0 %	384422543
28	NC_017269	CACG	2	8	6878	6885	25 %	0 %	25 %	50 %	384422544
29	NC_017269	GAGC	2	8	7213	7220	25 %	0 %	50 %	25 %	384422544
30	NC_017269	GTCG	2	8	7245	7252	0 %	25 %	50 %	25 %	384422544
31	NC_017269	TTGA	2	8	7446	7453	25 %	50 %	25 %	0 %	384422544
32	NC_017269	TGCG	2	8	7541	7548	0 %	25 %	50 %	25 %	384422544
33	NC_017269	GCCA	2	8	7674	7681	25 %	0 %	25 %	50 %	384422544
34	NC_017269	ATAG	2	8	8003	8010	50 %	25 %	25 %	0 %	384422544
35	NC_017269	AAAG	2	8	8245	8252	75 %	0 %	25 %	0 %	384422544
36	NC_017269	CTTG	2	8	8397	8404	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017269	AGTG	2	8	8483	8490	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017269	AATG	2	8	9251	9258	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017269	TGGT	2	8	9409	9416	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017269	TCAA	2	8	10012	10019	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017269	CAGC	2	8	10271	10278	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017269	GCCA	2	8	10441	10448	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017269	TTGA	2	8	10500	10507	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017269	AGTT	2	8	10748	10755	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017269	GAGC	2	8	10985	10992	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017269	GTTG	2	8	11105	11112	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017269	CACG	2	8	11177	11184	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017269	AATC	2	8	11914	11921	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017269	TCAC	2	8	12129	12136	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017269	GTTT	2	8	12719	12726	0 %	75 %	25 %	0 %	384422546
51	NC_017269	ACCA	2	8	13342	13349	50 %	0 %	0 %	50 %	384422546
52	NC_017269	GAGT	2	8	13380	13387	25 %	25 %	50 %	0 %	384422546
53	NC_017269	GTGC	2	8	13459	13466	0 %	25 %	50 %	25 %	384422546
54	NC_017269	GCTG	2	8	13688	13695	0 %	25 %	50 %	25 %	384422546
55	NC_017269	CGAT	2	8	14857	14864	25 %	25 %	25 %	25 %	384422547
56	NC_017269	ATTG	2	8	15220	15227	25 %	50 %	25 %	0 %	384422547
57	NC_017269	GAAG	2	8	16480	16487	50 %	0 %	50 %	0 %	384422547
58	NC_017269	AGCC	2	8	16975	16982	25 %	0 %	25 %	50 %	384422547
59	NC_017269	TATG	2	8	18869	18876	25 %	50 %	25 %	0 %	384422548
60	NC_017269	GGAT	2	8	19123	19130	25 %	25 %	50 %	0 %	384422548
61	NC_017269	CAAG	2	8	19596	19603	50 %	0 %	25 %	25 %	384422549
62	NC_017269	CAAC	2	8	19697	19704	50 %	0 %	0 %	50 %	384422549
63	NC_017269	GCAG	2	8	19962	19969	25 %	0 %	50 %	25 %	384422550
64	NC_017269	TGGC	2	8	21279	21286	0 %	25 %	50 %	25 %	384422552
65	NC_017269	ATTG	2	8	21355	21362	25 %	50 %	25 %	0 %	384422552
66	NC_017269	CAAA	2	8	21377	21384	75 %	0 %	0 %	25 %	384422552
67	NC_017269	ATTT	2	8	21833	21840	25 %	75 %	0 %	0 %	384422552
68	NC_017269	ATGA	2	8	22957	22964	50 %	25 %	25 %	0 %	384422552
69	NC_017269	ATCG	2	8	23481	23488	25 %	25 %	25 %	25 %	384422552
70	NC_017269	TTAT	2	8	23589	23596	25 %	75 %	0 %	0 %	384422552
71	NC_017269	ATGG	2	8	23928	23935	25 %	25 %	50 %	0 %	384422552
72	NC_017269	TGGG	2	8	24667	24674	0 %	25 %	75 %	0 %	384422553
73	NC_017269	TGTT	2	8	24685	24692	0 %	75 %	25 %	0 %	384422553
74	NC_017269	ATTT	2	8	25183	25190	25 %	75 %	0 %	0 %	384422554
75	NC_017269	TGAC	2	8	25872	25879	25 %	25 %	25 %	25 %	384422555
76	NC_017269	ACAA	2	8	26139	26146	75 %	0 %	0 %	25 %	384422555
77	NC_017269	TAAA	2	8	26605	26612	75 %	25 %	0 %	0 %	384422555
78	NC_017269	TGGT	2	8	28730	28737	0 %	50 %	50 %	0 %	384422557
79	NC_017269	ACTG	2	8	28783	28790	25 %	25 %	25 %	25 %	384422557
80	NC_017269	ATTG	2	8	29355	29362	25 %	50 %	25 %	0 %	384422557
81	NC_017269	TATT	2	8	29622	29629	25 %	75 %	0 %	0 %	384422558
82	NC_017269	TTGG	2	8	29979	29986	0 %	50 %	50 %	0 %	384422558
83	NC_017269	GCAA	2	8	30226	30233	50 %	0 %	25 %	25 %	384422558
84	NC_017269	AATC	2	8	30450	30457	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017269	ATCG	2	8	31501	31508	25 %	25 %	25 %	25 %	384422559
86	NC_017269	TATG	2	8	32068	32075	25 %	50 %	25 %	0 %	384422559
87	NC_017269	TACG	2	8	32363	32370	25 %	25 %	25 %	25 %	384422559
88	NC_017269	ACTG	2	8	32698	32705	25 %	25 %	25 %	25 %	384422559
89	NC_017269	GACA	2	8	32707	32714	50 %	0 %	25 %	25 %	384422559
90	NC_017269	CAGT	2	8	32994	33001	25 %	25 %	25 %	25 %	384422559
91	NC_017269	GGCA	2	8	33130	33137	25 %	0 %	50 %	25 %	384422559
92	NC_017269	AAGT	2	8	33178	33185	50 %	25 %	25 %	0 %	384422559
93	NC_017269	TTGA	2	8	33775	33782	25 %	50 %	25 %	0 %	384422560
94	NC_017269	AATC	2	8	34591	34598	50 %	25 %	0 %	25 %	384422561
95	NC_017269	GTCA	2	8	34873	34880	25 %	25 %	25 %	25 %	384422561
96	NC_017269	GTTG	2	8	35085	35092	0 %	50 %	50 %	0 %	384422561
97	NC_017269	TGCA	2	8	35171	35178	25 %	25 %	25 %	25 %	384422561
98	NC_017269	TGAT	2	8	35201	35208	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017269	TGGT	2	8	35489	35496	0 %	50 %	50 %	0 %	384422562
100	NC_017269	GGTT	2	8	35772	35779	0 %	50 %	50 %	0 %	384422562
101	NC_017269	TATG	2	8	36054	36061	25 %	50 %	25 %	0 %	384422562
102	NC_017269	AACG	2	8	36690	36697	50 %	0 %	25 %	25 %	384422562
103	NC_017269	TGAG	2	8	37452	37459	25 %	25 %	50 %	0 %	384422563
104	NC_017269	GCAA	2	8	38224	38231	50 %	0 %	25 %	25 %	384422564
105	NC_017269	ACGT	2	8	38386	38393	25 %	25 %	25 %	25 %	384422564
106	NC_017269	TGGA	2	8	39081	39088	25 %	25 %	50 %	0 %	384422564
107	NC_017269	TCGT	2	8	39334	39341	0 %	50 %	25 %	25 %	384422564
108	NC_017269	TGTT	2	8	39682	39689	0 %	75 %	25 %	0 %	384422564
109	NC_017269	CAAG	2	8	41327	41334	50 %	0 %	25 %	25 %	384422566
110	NC_017269	TTTC	2	8	41407	41414	0 %	75 %	0 %	25 %	384422566
111	NC_017269	CAAA	2	8	41884	41891	75 %	0 %	0 %	25 %	384422567
112	NC_017269	CCGC	2	8	41922	41929	0 %	0 %	25 %	75 %	384422567
113	NC_017269	AGTA	2	8	42097	42104	50 %	25 %	25 %	0 %	384422567
114	NC_017269	AAGT	2	8	43093	43100	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017269	AGAA	2	8	43720	43727	75 %	0 %	25 %	0 %	384422568
116	NC_017269	CTTT	2	8	43771	43778	0 %	75 %	0 %	25 %	384422569
117	NC_017269	TGGT	2	8	43944	43951	0 %	50 %	50 %	0 %	384422569
118	NC_017269	TGGG	2	8	44578	44585	0 %	25 %	75 %	0 %	384422570
119	NC_017269	TTTC	2	8	45135	45142	0 %	75 %	0 %	25 %	384422571
120	NC_017269	CATA	2	8	45327	45334	50 %	25 %	0 %	25 %	384422571
121	NC_017269	CAGG	2	8	45369	45376	25 %	0 %	50 %	25 %	384422571
122	NC_017269	CTTT	2	8	45508	45515	0 %	75 %	0 %	25 %	384422571
123	NC_017269	TGAG	2	8	46028	46035	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017269	TGGG	2	8	46551	46558	0 %	25 %	75 %	0 %	384422572
125	NC_017269	GTTG	2	8	47175	47182	0 %	50 %	50 %	0 %	384422572
126	NC_017269	ATCT	2	8	48593	48600	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017269	ATCG	2	8	49317	49324	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017269	TCTG	2	8	49794	49801	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017269	CGTT	2	8	49884	49891	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017269	CTCA	2	8	50886	50893	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017269	AATC	2	8	50976	50983	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_017269	TGGT	2	8	51372	51379	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017269	GCGT	2	8	51444	51451	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017269	GAAA	2	8	51535	51542	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017269	GATG	2	8	51766	51773	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017269	CGTT	2	8	52384	52391	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017269	GACA	2	8	52852	52859	50 %	0 %	25 %	25 %	384422575
138	NC_017269	GCAC	2	8	52907	52914	25 %	0 %	25 %	50 %	384422575
139	NC_017269	AATG	2	8	53825	53832	50 %	25 %	25 %	0 %	384422576
140	NC_017269	ACGT	2	8	54163	54170	25 %	25 %	25 %	25 %	384422577
141	NC_017269	GCAT	2	8	54282	54289	25 %	25 %	25 %	25 %	384422577
142	NC_017269	CCAA	2	8	54526	54533	50 %	0 %	0 %	50 %	384422577
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144	NC_017269	CTCA	2	8	55406	55413	25 %	25 %	0 %	50 %	384422577
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