MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome II

Total Repeats: 610

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017269	TCAA	2	8	546	553	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017269	AGGA	2	8	732	739	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017269	TTTA	2	8	1059	1066	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017269	GCTC	2	8	3271	3278	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017269	CTTA	2	8	4395	4402	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017269	CTTG	2	8	8397	8404	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017269	AGTG	2	8	8483	8490	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017269	AATG	2	8	9251	9258	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017269	TGGT	2	8	9409	9416	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017269	TCAA	2	8	10012	10019	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017269	CAGC	2	8	10271	10278	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017269	GCCA	2	8	10441	10448	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017269	TTGA	2	8	10500	10507	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017269	AGTT	2	8	10748	10755	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017269	GAGC	2	8	10985	10992	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017269	GTTG	2	8	11105	11112	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017269	CACG	2	8	11177	11184	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017269	AATC	2	8	11914	11921	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017269	TCAC	2	8	12129	12136	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017269	AATC	2	8	30450	30457	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017269	TGAT	2	8	35201	35208	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017269	AAGT	2	8	43093	43100	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017269	TGAG	2	8	46028	46035	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017269	ATCT	2	8	48593	48600	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017269	ATCG	2	8	49317	49324	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017269	TCTG	2	8	49794	49801	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017269	CGTT	2	8	49884	49891	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017269	CTCA	2	8	50886	50893	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017269	AATC	2	8	50976	50983	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017269	TGGT	2	8	51372	51379	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017269	GCGT	2	8	51444	51451	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017269	GAAA	2	8	51535	51542	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017269	GATG	2	8	51766	51773	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017269	CGTT	2	8	52384	52391	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017269	TGGT	2	8	59750	59757	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017269	AATT	2	8	64432	64439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017269	GTTC	2	8	64535	64542	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017269	TCAA	2	8	66211	66218	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017269	AATG	2	8	66576	66583	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017269	GATC	2	8	66774	66781	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017269	ACTT	2	8	66891	66898	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017269	TCAA	2	8	66986	66993	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017269	GCTT	2	8	67747	67754	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017269	TTCT	2	8	68343	68350	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017269	CTTG	2	8	74866	74873	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017269	AAGT	2	8	74897	74904	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017269	AAAT	2	8	76660	76667	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017269	ATTT	2	8	83880	83887	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017269	AATT	2	8	83902	83909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017269	TATT	2	8	83943	83950	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017269	ATTA	2	8	85995	86002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017269	GGTT	2	8	86105	86112	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017269	ATAA	2	8	90074	90081	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017269	TTAT	2	8	90984	90991	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017269	TTGG	2	8	90994	91001	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017269	ATTT	2	8	91007	91014	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017269	CACT	2	8	97479	97486	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017269	AGTG	2	8	98020	98027	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017269	ACCA	2	8	98056	98063	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017269	TCAC	2	8	99645	99652	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017269	ATTT	2	8	99793	99800	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017269	GTTG	2	8	106239	106246	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017269	TCAA	2	8	106421	106428	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017269	AGCA	2	8	106558	106565	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017269	GTAA	2	8	106698	106705	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017269	TCAC	2	8	107376	107383	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017269	TGAA	2	8	108247	108254	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017269	TTTA	2	8	111896	111903	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017269	ACTT	2	8	111919	111926	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017269	TAAT	2	8	112008	112015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017269	ATTT	2	8	114058	114065	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017269	TTGA	2	8	114156	114163	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017269	TCAA	2	8	114170	114177	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017269	CGGG	2	8	137515	137522	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017269	ATTA	2	8	138065	138072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017269	TTCC	2	8	138103	138110	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017269	AATG	2	8	138644	138651	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017269	TTAA	2	8	138673	138680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017269	ATTT	2	8	150347	150354	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017269	TGAT	2	8	150402	150409	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017269	CAAG	2	8	151294	151301	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017269	AAAG	2	8	157697	157704	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017269	ATTG	2	8	161235	161242	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017269	CACG	2	8	161487	161494	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017269	CTGG	2	8	167454	167461	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017269	GATT	2	8	177416	177423	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017269	TAGA	2	8	177556	177563	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017269	GCTG	2	8	179166	179173	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017269	ATTG	2	8	179238	179245	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017269	AAAT	2	8	181474	181481	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017269	GATT	2	8	181901	181908	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017269	CATT	2	8	181995	182002	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017269	ATTG	2	8	182881	182888	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017269	GGCT	2	8	183468	183475	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017269	TGCC	2	8	183526	183533	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017269	CTTG	2	8	183628	183635	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017269	GCCT	2	8	184028	184035	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017269	GCTC	2	8	184111	184118	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017269	GTTC	2	8	184244	184251	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017269	TGAC	2	8	184526	184533	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017269	AGTG	2	8	192424	192431	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017269	ATAG	2	8	192445	192452	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017269	GAAC	2	8	192468	192475	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017269	GTGA	2	8	193316	193323	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017269	TGCT	2	8	196947	196954	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017269	GATT	2	8	197173	197180	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017269	AGCC	2	8	199718	199725	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017269	GGCT	2	8	199732	199739	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017269	ACGG	2	8	200055	200062	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017269	CCAA	2	8	200074	200081	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017269	TTAT	2	8	200245	200252	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017269	AATG	2	8	200903	200910	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017269	AGGT	2	8	200932	200939	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017269	TTAA	2	8	201336	201343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017269	TCAC	2	8	208989	208996	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017269	GCTT	2	8	210649	210656	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017269	GTAT	2	8	210966	210973	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017269	GCAA	2	8	215165	215172	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017269	CTGA	2	8	215846	215853	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017269	TCTG	2	8	215867	215874	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017269	GAAT	2	8	217546	217553	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017269	CCTT	2	8	219577	219584	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017269	GGAT	2	8	225687	225694	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017269	AATT	2	8	227327	227334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017269	AGTA	2	8	227508	227515	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017269	TTTG	2	8	227889	227896	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017269	AAGC	2	8	232134	232141	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017269	TTAA	2	8	232350	232357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017269	TGGC	2	8	237496	237503	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017269	GTTA	2	8	237670	237677	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017269	TAAA	2	8	237685	237692	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017269	AATA	2	8	237706	237713	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017269	GGAA	2	8	239068	239075	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017269	TCAA	2	8	248086	248093	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017269	CCTT	2	8	248732	248739	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017269	AGAA	2	8	248981	248988	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017269	GCTG	2	8	249665	249672	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017269	AATT	2	8	249827	249834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017269	CAAA	2	8	251728	251735	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017269	TCAC	2	8	258433	258440	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_017269	ATGA	2	8	259624	259631	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017269	TAAC	2	8	260358	260365	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017269	TTGA	2	8	262904	262911	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017269	TCGC	2	8	262932	262939	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_017269	TATG	2	8	269807	269814	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017269	TACT	2	8	270450	270457	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017269	TGAC	2	8	275676	275683	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_017269	TGCT	2	8	275798	275805	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_017269	GCTC	2	8	277540	277547	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_017269	TGAG	2	8	278105	278112	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017269	TGTC	2	8	278199	278206	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_017269	TCAA	2	8	278244	278251	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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500	NC_017269	AAAT	2	8	755821	755828	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

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