MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome II

Total Repeats: 11668

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017269	TTC	2	6	74	79	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017269	TGA	3	9	146	154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422537
3	NC_017269	ATG	2	6	229	234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422537
4	NC_017269	TCC	2	6	271	276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_017269	GAT	2	6	299	304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017269	CAG	2	6	311	316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017269	TTC	2	6	325	330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017269	TCA	2	6	369	374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017269	GAT	2	6	427	432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017269	TCG	2	6	444	449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017269	TGA	2	6	517	522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017269	AAC	2	6	568	573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017269	ATC	2	6	688	693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017269	ATC	2	6	702	707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017269	TGA	2	6	843	848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017269	AAT	2	6	938	943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017269	ACA	2	6	1045	1050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017269	AGA	2	6	1142	1147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422538
19	NC_017269	AGC	2	6	1208	1213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422538
20	NC_017269	TTG	2	6	1264	1269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422538
21	NC_017269	CAG	2	6	1377	1382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422538
22	NC_017269	AGC	2	6	1391	1396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422538
23	NC_017269	CAT	2	6	1790	1795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422538
24	NC_017269	CGA	2	6	1802	1807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422538
25	NC_017269	TGA	2	6	1810	1815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422538
26	NC_017269	ATC	2	6	1855	1860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422538
27	NC_017269	GAT	2	6	1866	1871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422538
28	NC_017269	CGC	2	6	1906	1911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422538
29	NC_017269	ATT	2	6	2215	2220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422538
30	NC_017269	TCG	2	6	2300	2305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422538
31	NC_017269	ATG	2	6	2319	2324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422538
32	NC_017269	TCG	2	6	2399	2404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422538
33	NC_017269	GTG	2	6	2496	2501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422538
34	NC_017269	ACC	2	6	2562	2567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422538
35	NC_017269	CAT	2	6	2657	2662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422538
36	NC_017269	TGA	2	6	2762	2767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422538
37	NC_017269	TCA	2	6	2856	2861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422538
38	NC_017269	AGA	2	6	2867	2872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422538
39	NC_017269	GCT	2	6	2948	2953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422538
40	NC_017269	ACA	2	6	2962	2967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422538
41	NC_017269	ACA	2	6	3155	3160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017269	CCG	2	6	3182	3187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_017269	TGA	2	6	3226	3231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017269	ATC	2	6	3360	3365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422539
45	NC_017269	GCG	2	6	3529	3534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422539
46	NC_017269	CAG	2	6	3634	3639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422539
47	NC_017269	GCA	2	6	3727	3732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422539
48	NC_017269	TGA	2	6	3754	3759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422539
49	NC_017269	ATC	2	6	3805	3810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422539
50	NC_017269	ATG	2	6	4176	4181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422540
51	NC_017269	CAA	2	6	4198	4203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422540
52	NC_017269	GAA	2	6	4217	4222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422540
53	NC_017269	CAA	2	6	4239	4244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422540
54	NC_017269	TTG	2	6	4340	4345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422540
55	NC_017269	CTT	2	6	4578	4583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422541
56	NC_017269	CAG	2	6	4734	4739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017269	GAA	2	6	4815	4820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422542
58	NC_017269	CGG	2	6	4918	4923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422542
59	NC_017269	TGG	2	6	5077	5082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422542
60	NC_017269	GAT	2	6	5234	5239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422542
61	NC_017269	GAA	2	6	5240	5245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384422542
62	NC_017269	TGA	2	6	5262	5267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422542
63	NC_017269	TTC	2	6	5339	5344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422542
64	NC_017269	TGT	2	6	5428	5433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422542
65	NC_017269	CAG	2	6	5498	5503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422542
66	NC_017269	AAT	2	6	5526	5531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422542
67	NC_017269	GAT	2	6	5849	5854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422543
68	NC_017269	GCA	2	6	5859	5864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422543
69	NC_017269	GCG	2	6	5966	5971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384422543
70	NC_017269	CGA	2	6	6061	6066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422543
71	NC_017269	TGG	2	6	6249	6254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384422543
72	NC_017269	GAT	2	6	6352	6357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422543
73	NC_017269	GCT	2	6	6506	6511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422543
74	NC_017269	TCA	2	6	6566	6571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017269	AAC	2	6	6618	6623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017269	CCG	2	6	6713	6718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422544
77	NC_017269	ATA	2	6	6820	6825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422544
78	NC_017269	GCC	2	6	6862	6867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422544
79	NC_017269	GTA	2	6	6886	6891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422544
80	NC_017269	GAG	2	6	7086	7091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384422544
81	NC_017269	GCT	2	6	7173	7178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422544
82	NC_017269	CTT	2	6	7190	7195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422544
83	NC_017269	ATT	2	6	7287	7292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422544
84	NC_017269	GTT	2	6	7296	7301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384422544
85	NC_017269	TGC	2	6	7435	7440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422544
86	NC_017269	ATG	2	6	7462	7467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422544
87	NC_017269	ATG	2	6	7612	7617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422544
88	NC_017269	ATT	2	6	7630	7635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384422544
89	NC_017269	AGC	2	6	7663	7668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384422544
90	NC_017269	GCT	2	6	7703	7708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384422544
91	NC_017269	ATA	2	6	7851	7856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422544
92	NC_017269	TAA	2	6	7968	7973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384422544
93	NC_017269	CTT	2	6	8051	8056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384422544
94	NC_017269	CAT	2	6	8142	8147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422544
95	NC_017269	CAT	2	6	8211	8216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422544
96	NC_017269	GTT	2	6	8306	8311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017269	TAA	2	6	8451	8456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017269	CAT	2	6	8561	8566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384422545
99	NC_017269	CAA	2	6	8586	8591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422545
100	NC_017269	CAA	2	6	8594	8599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384422545
101	NC_017269	GCC	2	6	8614	8619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384422545
102	NC_017269	ACC	2	6	8856	8861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384422545
103	NC_017269	TGA	2	6	8890	8895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384422545
104	NC_017269	TAG	2	6	8989	8994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017269	CTT	2	6	9032	9037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017269	TGG	2	6	9089	9094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017269	TCA	2	6	9244	9249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017269	GTG	2	6	9274	9279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017269	AGC	2	6	9292	9297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017269	TGC	2	6	9371	9376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017269	ATC	2	6	9456	9461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017269	AGC	2	6	9478	9483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017269	CAG	2	6	9714	9719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017269	GCG	2	6	9910	9915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017269	TGC	2	6	10003	10008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017269	AGT	2	6	10093	10098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017269	CTG	2	6	10149	10154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017269	CAT	2	6	10155	10160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017269	CGA	2	6	10205	10210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017269	TGG	2	6	10352	10357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017269	CGC	2	6	10389	10394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_017269	CAT	2	6	10415	10420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017269	CGC	2	6	10509	10514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_017269	CAG	2	6	10578	10583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017269	TGA	2	6	10621	10626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017269	GGC	3	9	10653	10661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017269	CAT	2	6	10817	10822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017269	GCT	2	6	10836	10841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017269	TCG	2	6	10903	10908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017269	CTT	2	6	10922	10927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017269	TGC	2	6	11005	11010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017269	GTC	2	6	11122	11127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017269	AGG	2	6	11205	11210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017269	ACC	2	6	11227	11232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_017269	TCA	2	6	11290	11295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017269	GGT	2	6	11303	11308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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138	NC_017269	TGA	2	6	11382	11387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017269	GCA	2	6	11459	11464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017269	ATC	2	6	11499	11504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017269	TGG	2	6	11555	11560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017269	CGG	2	6	11573	11578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_017269	TGC	2	6	11614	11619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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