MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae LMA3984-4 chromosome II

Total Repeats: 384

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017269	CT	3	6	694	699	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017269	TG	3	6	787	792	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017269	AG	3	6	3959	3964	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017269	AG	3	6	4796	4801	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017269	AG	3	6	8516	8521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017269	GC	3	6	9564	9569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017269	GC	5	10	9596	9605	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017269	AG	3	6	9723	9728	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017269	GC	3	6	9956	9961	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017269	GC	3	6	10692	10697	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017269	TC	3	6	11703	11708	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017269	GA	3	6	14798	14803	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017269	AC	3	6	17074	17079	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017269	GA	3	6	24871	24876	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017269	TC	3	6	30595	30600	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017269	AG	3	6	30677	30682	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017269	AG	3	6	33289	33294	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017269	TC	4	8	33498	33505	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017269	CT	3	6	44803	44808	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017269	AT	3	6	46170	46175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017269	GA	3	6	46393	46398	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017269	TG	3	6	49091	49096	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017269	GT	3	6	49277	49282	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017269	TC	3	6	49365	49370	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017269	GT	3	6	52405	52410	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017269	GA	3	6	59653	59658	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017269	CT	3	6	59673	59678	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017269	GA	3	6	63983	63988	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017269	GC	3	6	66724	66729	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017269	AC	3	6	67247	67252	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017269	TC	3	6	67438	67443	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017269	GC	3	6	67907	67912	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017269	AC	3	6	83767	83772	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017269	TG	3	6	84003	84008	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017269	GA	3	6	86057	86062	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017269	CA	3	6	86499	86504	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017269	TC	3	6	89872	89877	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017269	AG	3	6	89976	89981	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017269	GA	3	6	90028	90033	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017269	CT	3	6	91055	91060	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017269	TC	4	8	94181	94188	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017269	TA	3	6	94223	94228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017269	TG	3	6	94946	94951	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017269	GT	3	6	97544	97549	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017269	TC	3	6	97614	97619	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017269	AT	3	6	99148	99153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017269	AG	3	6	99341	99346	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017269	CA	3	6	99838	99843	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017269	GA	3	6	106475	106480	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017269	AG	4	8	106838	106845	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017269	GA	3	6	108183	108188	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017269	AT	3	6	112418	112423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017269	AT	3	6	113825	113830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017269	AT	3	6	114013	114018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017269	CA	3	6	134848	134853	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017269	AG	3	6	138018	138023	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017269	AT	3	6	138051	138056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017269	TA	3	6	138180	138185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017269	AG	3	6	138245	138250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017269	AG	3	6	138287	138292	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017269	TA	3	6	138590	138595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017269	GA	3	6	145321	145326	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017269	CT	3	6	146800	146805	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017269	GA	4	8	148801	148808	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017269	AG	3	6	150606	150611	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017269	GA	3	6	151087	151092	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017269	GC	3	6	152639	152644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017269	CG	3	6	156421	156426	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017269	TA	3	6	161217	161222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017269	GA	3	6	165362	165367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017269	AG	3	6	179005	179010	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017269	AT	4	8	181661	181668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017269	AT	3	6	183417	183422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017269	CT	3	6	183702	183707	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017269	AC	3	6	193838	193843	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017269	GC	3	6	197071	197076	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017269	GT	4	8	197121	197128	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017269	TC	3	6	197241	197246	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017269	GA	3	6	209368	209373	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017269	AG	3	6	211117	211122	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017269	AG	4	8	212665	212672	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017269	GT	3	6	220774	220779	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017269	GC	3	6	222637	222642	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017269	AC	3	6	222694	222699	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017269	AT	3	6	227530	227535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017269	AG	3	6	227569	227574	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017269	AT	3	6	227849	227854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017269	TC	3	6	227901	227906	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017269	AT	3	6	237739	237744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017269	TC	3	6	238834	238839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017269	CA	3	6	238969	238974	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017269	AT	3	6	243791	243796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017269	GT	3	6	248913	248918	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017269	GC	3	6	249760	249765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017269	GT	3	6	250544	250549	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017269	AG	3	6	255516	255521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017269	GA	3	6	260374	260379	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017269	CT	3	6	261834	261839	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017269	GT	3	6	262026	262031	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017269	CG	3	6	262922	262927	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017269	AG	3	6	270143	270148	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017269	AC	3	6	277084	277089	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_017269	CT	3	6	277570	277575	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017269	GT	3	6	279374	279379	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017269	CA	3	6	280143	280148	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_017269	CA	3	6	280476	280481	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017269	TG	3	6	282105	282110	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017269	GC	3	6	284434	284439	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017269	GT	3	6	284931	284936	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017269	GT	3	6	285064	285069	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017269	AC	3	6	285394	285399	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017269	GC	3	6	285940	285945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017269	GC	3	6	286061	286066	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017269	CA	3	6	286578	286583	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017269	GA	3	6	289436	289441	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017269	CA	3	6	291125	291130	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017269	GA	3	6	293983	293988	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017269	CG	3	6	295729	295734	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017269	TC	3	6	295827	295832	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017269	CG	3	6	296266	296271	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017269	CG	3	6	297460	297465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017269	GT	3	6	299958	299963	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017269	AT	3	6	300787	300792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017269	CG	3	6	301490	301495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017269	AG	3	6	302103	302108	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017269	GT	3	6	302872	302877	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017269	GT	3	6	306320	306325	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017269	AT	3	6	307077	307082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017269	CG	3	6	307333	307338	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017269	TG	3	6	307451	307456	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017269	TC	3	6	307876	307881	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_017269	GT	3	6	308171	308176	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017269	GT	3	6	309107	309112	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017269	GA	3	6	309147	309152	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017269	GT	3	6	309257	309262	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017269	CA	4	8	309359	309366	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_017269	CG	3	6	309395	309400	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017269	CG	3	6	309877	309882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_017269	CG	3	6	310524	310529	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_017269	AT	3	6	311198	311203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017269	CA	3	6	311391	311396	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_017269	CG	4	8	311788	311795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_017269	AC	4	8	312871	312878	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_017269	CG	3	6	313903	313908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_017269	CA	3	6	316179	316184	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_017269	AG	3	6	316542	316547	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017269	CT	3	6	316674	316679	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_017269	AG	3	6	316844	316849	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017269	AG	3	6	317011	317016	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017269	AT	3	6	317934	317939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017269	CT	3	6	318014	318019	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_017269	GT	3	6	320847	320852	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017269	CG	3	6	322496	322501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
154	NC_017269	CG	3	6	324391	324396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
155	NC_017269	CG	3	6	324931	324936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.