MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 4504

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017268	TC	3	6	795	800	0 %	50 %	0 %	50 %	384421555
2	NC_017268	CT	3	6	1062	1067	0 %	50 %	0 %	50 %	384421555
3	NC_017268	CT	3	6	1084	1089	0 %	50 %	0 %	50 %	384421555
4	NC_017268	TC	3	6	1221	1226	0 %	50 %	0 %	50 %	384421555
5	NC_017268	TG	3	6	1519	1524	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017268	TC	3	6	2017	2022	0 %	50 %	0 %	50 %	384421556
7	NC_017268	TA	3	6	2175	2180	50 %	50 %	0 %	0 %	384421556
8	NC_017268	AT	3	6	2819	2824	50 %	50 %	0 %	0 %	384421557
9	NC_017268	CG	3	6	2952	2957	0 %	0 %	50 %	50 %	384421557
10	NC_017268	CA	3	6	3004	3009	50 %	0 %	0 %	50 %	384421557
11	NC_017268	AG	3	6	3247	3252	50 %	0 %	50 %	0 %	384421557
12	NC_017268	AT	3	6	3877	3882	50 %	50 %	0 %	0 %	384421558
13	NC_017268	GT	3	6	3929	3934	0 %	50 %	50 %	0 %	384421558
14	NC_017268	TC	3	6	4346	4351	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017268	GA	3	6	6214	6219	50 %	0 %	50 %	0 %	384421559
16	NC_017268	CG	3	6	6306	6311	0 %	0 %	50 %	50 %	384421559
17	NC_017268	AC	3	6	6624	6629	50 %	0 %	0 %	50 %	384421559
18	NC_017268	GT	3	6	6728	6733	0 %	50 %	50 %	0 %	384421559
19	NC_017268	GT	3	6	6771	6776	0 %	50 %	50 %	0 %	384421559
20	NC_017268	GC	3	6	7548	7553	0 %	0 %	50 %	50 %	384421561
21	NC_017268	GA	3	6	7912	7917	50 %	0 %	50 %	0 %	384421561
22	NC_017268	GC	3	6	8016	8021	0 %	0 %	50 %	50 %	384421561
23	NC_017268	AT	4	8	8573	8580	50 %	50 %	0 %	0 %	384421562
24	NC_017268	CG	3	6	8707	8712	0 %	0 %	50 %	50 %	384421562
25	NC_017268	AG	3	6	9425	9430	50 %	0 %	50 %	0 %	384421563
26	NC_017268	AC	3	6	9823	9828	50 %	0 %	0 %	50 %	384421563
27	NC_017268	AG	3	6	9886	9891	50 %	0 %	50 %	0 %	384421564
28	NC_017268	TC	3	6	9943	9948	0 %	50 %	0 %	50 %	384421564
29	NC_017268	GC	3	6	10083	10088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017268	TC	3	6	10700	10705	0 %	50 %	0 %	50 %	384421566
31	NC_017268	GC	3	6	11289	11294	0 %	0 %	50 %	50 %	384421566
32	NC_017268	GT	3	6	11330	11335	0 %	50 %	50 %	0 %	384421566
33	NC_017268	GT	3	6	11520	11525	0 %	50 %	50 %	0 %	384421566
34	NC_017268	TA	3	6	11907	11912	50 %	50 %	0 %	0 %	384421566
35	NC_017268	CA	3	6	12027	12032	50 %	0 %	0 %	50 %	384421566
36	NC_017268	GT	3	6	12353	12358	0 %	50 %	50 %	0 %	384421566
37	NC_017268	GA	3	6	12511	12516	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017268	GT	3	6	12519	12524	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017268	GC	3	6	12613	12618	0 %	0 %	50 %	50 %	384421567
40	NC_017268	GC	3	6	13060	13065	0 %	0 %	50 %	50 %	384421567
41	NC_017268	GT	3	6	13143	13148	0 %	50 %	50 %	0 %	384421567
42	NC_017268	CA	4	8	13235	13242	50 %	0 %	0 %	50 %	384421567
43	NC_017268	GA	3	6	13319	13324	50 %	0 %	50 %	0 %	384421567
44	NC_017268	GC	3	6	13530	13535	0 %	0 %	50 %	50 %	384421567
45	NC_017268	CT	4	8	13579	13586	0 %	50 %	0 %	50 %	384421567
46	NC_017268	GC	3	6	14266	14271	0 %	0 %	50 %	50 %	384421568
47	NC_017268	CG	3	6	14300	14305	0 %	0 %	50 %	50 %	384421568
48	NC_017268	AT	3	6	14543	14548	50 %	50 %	0 %	0 %	384421568
49	NC_017268	TG	3	6	15953	15958	0 %	50 %	50 %	0 %	384421569
50	NC_017268	CG	3	6	16388	16393	0 %	0 %	50 %	50 %	384421569
51	NC_017268	CG	3	6	16495	16500	0 %	0 %	50 %	50 %	384421569
52	NC_017268	GT	4	8	16826	16833	0 %	50 %	50 %	0 %	384421569
53	NC_017268	CA	3	6	16835	16840	50 %	0 %	0 %	50 %	384421569
54	NC_017268	GT	3	6	17216	17221	0 %	50 %	50 %	0 %	384421569
55	NC_017268	CG	3	6	17335	17340	0 %	0 %	50 %	50 %	384421569
56	NC_017268	AG	3	6	17368	17373	50 %	0 %	50 %	0 %	384421569
57	NC_017268	GT	3	6	17513	17518	0 %	50 %	50 %	0 %	384421569
58	NC_017268	CG	4	8	17522	17529	0 %	0 %	50 %	50 %	384421569
59	NC_017268	GT	3	6	18262	18267	0 %	50 %	50 %	0 %	384421569
60	NC_017268	AT	3	6	18649	18654	50 %	50 %	0 %	0 %	384421570
61	NC_017268	GT	3	6	18705	18710	0 %	50 %	50 %	0 %	384421570
62	NC_017268	GC	3	6	18755	18760	0 %	0 %	50 %	50 %	384421570
63	NC_017268	CG	3	6	19428	19433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017268	CG	3	6	19910	19915	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017268	GT	3	6	20343	20348	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017268	CG	3	6	20762	20767	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017268	CT	4	8	21105	21112	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017268	GC	3	6	21124	21129	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017268	GA	3	6	21664	21669	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017268	CA	3	6	21858	21863	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017268	CG	3	6	22423	22428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017268	AC	3	6	22430	22435	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017268	GT	3	6	22593	22598	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017268	CG	3	6	23213	23218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017268	GA	3	6	23681	23686	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017268	GA	4	8	24346	24353	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017268	CA	3	6	24384	24389	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017268	TC	3	6	24425	24430	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017268	GA	4	8	24490	24497	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017268	TC	3	6	24570	24575	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017268	AG	3	6	25791	25796	50 %	0 %	50 %	0 %	384421571
82	NC_017268	TG	3	6	26027	26032	0 %	50 %	50 %	0 %	384421571
83	NC_017268	GT	3	6	26254	26259	0 %	50 %	50 %	0 %	384421571
84	NC_017268	GC	3	6	26471	26476	0 %	0 %	50 %	50 %	384421571
85	NC_017268	CG	3	6	26740	26745	0 %	0 %	50 %	50 %	384421571
86	NC_017268	GA	3	6	27242	27247	50 %	0 %	50 %	0 %	384421571
87	NC_017268	GT	4	8	27413	27420	0 %	50 %	50 %	0 %	384421571
88	NC_017268	GC	4	8	27455	27462	0 %	0 %	50 %	50 %	384421571
89	NC_017268	GT	4	8	27807	27814	0 %	50 %	50 %	0 %	384421572
90	NC_017268	GT	3	6	28048	28053	0 %	50 %	50 %	0 %	384421572
91	NC_017268	AT	4	8	28141	28148	50 %	50 %	0 %	0 %	384421572
92	NC_017268	GT	3	6	28494	28499	0 %	50 %	50 %	0 %	384421572
93	NC_017268	TG	3	6	28509	28514	0 %	50 %	50 %	0 %	384421572
94	NC_017268	AT	3	6	28936	28941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017268	GC	3	6	29214	29219	0 %	0 %	50 %	50 %	384421573
96	NC_017268	TC	3	6	29585	29590	0 %	50 %	0 %	50 %	384421573
97	NC_017268	AG	3	6	29865	29870	50 %	0 %	50 %	0 %	384421574
98	NC_017268	TC	3	6	30394	30399	0 %	50 %	0 %	50 %	384421574
99	NC_017268	TG	3	6	30634	30639	0 %	50 %	50 %	0 %	384421574
100	NC_017268	CA	3	6	30960	30965	50 %	0 %	0 %	50 %	384421574
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102	NC_017268	GC	3	6	31459	31464	0 %	0 %	50 %	50 %	384421574
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104	NC_017268	GT	3	6	32401	32406	0 %	50 %	50 %	0 %	384421574
105	NC_017268	AC	3	6	32442	32447	50 %	0 %	0 %	50 %	384421574
106	NC_017268	GC	3	6	32986	32991	0 %	0 %	50 %	50 %	384421575
107	NC_017268	AG	3	6	33098	33103	50 %	0 %	50 %	0 %	384421575
108	NC_017268	AG	3	6	33107	33112	50 %	0 %	50 %	0 %	384421575
109	NC_017268	CG	3	6	33308	33313	0 %	0 %	50 %	50 %	384421575
110	NC_017268	AC	3	6	33733	33738	50 %	0 %	0 %	50 %	384421575
111	NC_017268	CG	3	6	33999	34004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017268	GT	3	6	34194	34199	0 %	50 %	50 %	0 %	384421576
113	NC_017268	CG	4	8	34818	34825	0 %	0 %	50 %	50 %	384421576
114	NC_017268	GC	3	6	35001	35006	0 %	0 %	50 %	50 %	384421576
115	NC_017268	GC	3	6	35056	35061	0 %	0 %	50 %	50 %	384421576
116	NC_017268	AT	3	6	35130	35135	50 %	50 %	0 %	0 %	384421576
117	NC_017268	TA	3	6	35219	35224	50 %	50 %	0 %	0 %	384421576
118	NC_017268	TG	3	6	35375	35380	0 %	50 %	50 %	0 %	384421576
119	NC_017268	GC	3	6	35445	35450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017268	TG	3	6	35495	35500	0 %	50 %	50 %	0 %	384421577
121	NC_017268	CT	3	6	35673	35678	0 %	50 %	0 %	50 %	384421577
122	NC_017268	GT	4	8	35873	35880	0 %	50 %	50 %	0 %	384421577
123	NC_017268	GC	3	6	36020	36025	0 %	0 %	50 %	50 %	384421577
124	NC_017268	CA	4	8	36069	36076	50 %	0 %	0 %	50 %	384421577
125	NC_017268	AC	3	6	36097	36102	50 %	0 %	0 %	50 %	384421577
126	NC_017268	TG	3	6	36113	36118	0 %	50 %	50 %	0 %	384421577
127	NC_017268	CG	3	6	36640	36645	0 %	0 %	50 %	50 %	384421577
128	NC_017268	TG	3	6	36897	36902	0 %	50 %	50 %	0 %	384421578
129	NC_017268	GT	3	6	36971	36976	0 %	50 %	50 %	0 %	384421578
130	NC_017268	CA	3	6	37021	37026	50 %	0 %	0 %	50 %	384421578
131	NC_017268	GC	3	6	37526	37531	0 %	0 %	50 %	50 %	384421578
132	NC_017268	TG	3	6	37980	37985	0 %	50 %	50 %	0 %	384421578
133	NC_017268	GC	3	6	38090	38095	0 %	0 %	50 %	50 %	384421578
134	NC_017268	CT	3	6	39426	39431	0 %	50 %	0 %	50 %	384421579
135	NC_017268	GT	3	6	40580	40585	0 %	50 %	50 %	0 %	384421581
136	NC_017268	GT	3	6	40605	40610	0 %	50 %	50 %	0 %	384421581
137	NC_017268	TG	3	6	41101	41106	0 %	50 %	50 %	0 %	384421582
138	NC_017268	AT	3	6	41284	41289	50 %	50 %	0 %	0 %	384421582
139	NC_017268	CA	3	6	41621	41626	50 %	0 %	0 %	50 %	384421582
140	NC_017268	CA	3	6	41653	41658	50 %	0 %	0 %	50 %	384421582
141	NC_017268	CA	3	6	41700	41705	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_017268	GT	3	6	42373	42378	0 %	50 %	50 %	0 %	384421583
143	NC_017268	CT	3	6	42799	42804	0 %	50 %	0 %	50 %	384421583
144	NC_017268	AG	3	6	42863	42868	50 %	0 %	50 %	0 %	384421583
145	NC_017268	CG	3	6	43011	43016	0 %	0 %	50 %	50 %	384421584
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