MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 689

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017268	TG	3	6	1519	1524	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017268	TC	3	6	4346	4351	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017268	GC	3	6	10083	10088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017268	GA	3	6	12511	12516	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017268	GT	3	6	12519	12524	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017268	CG	3	6	19428	19433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017268	CG	3	6	19910	19915	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017268	GT	3	6	20343	20348	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017268	CG	3	6	20762	20767	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017268	CT	4	8	21105	21112	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017268	GC	3	6	21124	21129	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017268	GA	3	6	21664	21669	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017268	CA	3	6	21858	21863	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017268	CG	3	6	22423	22428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017268	AC	3	6	22430	22435	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017268	GT	3	6	22593	22598	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017268	CG	3	6	23213	23218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017268	GA	3	6	23681	23686	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017268	GA	4	8	24346	24353	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017268	CA	3	6	24384	24389	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017268	TC	3	6	24425	24430	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017268	GA	4	8	24490	24497	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017268	TC	3	6	24570	24575	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017268	AT	3	6	28936	28941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017268	CG	3	6	33999	34004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017268	GC	3	6	35445	35450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017268	CA	3	6	41700	41705	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017268	GA	3	6	46731	46736	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017268	GT	3	6	55630	55635	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017268	AC	3	6	55730	55735	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017268	CA	3	6	55785	55790	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017268	GT	3	6	55797	55802	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017268	GA	3	6	58196	58201	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017268	GC	3	6	58494	58499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017268	TG	3	6	62909	62914	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017268	CG	3	6	71071	71076	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017268	TG	3	6	71102	71107	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017268	AG	3	6	72203	72208	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017268	GT	3	6	72255	72260	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017268	TG	3	6	73951	73956	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017268	GT	3	6	79044	79049	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017268	GC	3	6	80803	80808	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017268	TG	3	6	90816	90821	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017268	GC	3	6	92000	92005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017268	GC	3	6	92197	92202	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017268	CG	3	6	92356	92361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017268	CT	3	6	92486	92491	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017268	GA	3	6	92523	92528	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017268	CG	3	6	92565	92570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017268	GT	3	6	93081	93086	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017268	GC	3	6	93107	93112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017268	AG	3	6	93893	93898	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017268	CG	4	8	93943	93950	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017268	GC	4	8	94011	94018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017268	GC	4	8	94356	94363	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017268	CA	3	6	94421	94426	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017268	GC	3	6	95356	95361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017268	TG	3	6	97427	97432	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017268	GC	3	6	105857	105862	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017268	CT	3	6	106679	106684	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017268	GA	3	6	106690	106695	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017268	CG	3	6	106774	106779	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017268	GC	3	6	106883	106888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017268	GC	3	6	106910	106915	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017268	CG	3	6	107025	107030	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017268	TG	4	8	107053	107060	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017268	GC	3	6	107069	107074	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017268	AG	3	6	107201	107206	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017268	GC	3	6	107293	107298	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017268	TG	3	6	108195	108200	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017268	CG	3	6	108367	108372	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017268	TA	3	6	113765	113770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017268	CA	3	6	122256	122261	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017268	GC	3	6	124691	124696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017268	TG	3	6	124757	124762	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017268	TG	4	8	124953	124960	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017268	GT	3	6	125179	125184	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017268	AG	3	6	132795	132800	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017268	GT	3	6	139651	139656	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017268	CG	3	6	140984	140989	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017268	CT	3	6	141029	141034	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017268	GC	3	6	142963	142968	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017268	CG	3	6	147610	147615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017268	CA	3	6	148024	148029	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017268	CG	3	6	148402	148407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017268	CG	3	6	148418	148423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017268	GT	3	6	150121	150126	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017268	GC	3	6	151295	151300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017268	CG	3	6	151833	151838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017268	TG	3	6	152008	152013	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017268	CA	3	6	152099	152104	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017268	CG	3	6	154317	154322	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017268	GC	3	6	156761	156766	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017268	TG	3	6	156861	156866	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017268	CG	4	8	157055	157062	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017268	GC	3	6	157233	157238	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017268	GA	4	8	157526	157533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017268	CG	3	6	157598	157603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017268	GC	3	6	157650	157655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017268	GC	3	6	157705	157710	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017268	GC	3	6	157768	157773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017268	CG	4	8	157782	157789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_017268	GT	3	6	157974	157979	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017268	TG	4	8	158004	158011	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017268	GC	3	6	158065	158070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_017268	GT	3	6	158075	158080	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017268	AC	3	6	160431	160436	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017268	GC	3	6	165930	165935	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017268	AG	3	6	165956	165961	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017268	TC	3	6	169305	169310	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017268	GC	3	6	169586	169591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017268	TG	3	6	170135	170140	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017268	GC	3	6	170198	170203	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017268	GC	3	6	170455	170460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017268	AC	3	6	176506	176511	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017268	GA	3	6	176512	176517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017268	TG	3	6	176543	176548	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017268	CT	3	6	177098	177103	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017268	CG	3	6	184511	184516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017268	GC	3	6	191342	191347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017268	TG	3	6	191434	191439	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017268	TG	3	6	191550	191555	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017268	CT	3	6	191747	191752	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017268	GC	3	6	193416	193421	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017268	GC	3	6	193449	193454	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017268	AG	3	6	193666	193671	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017268	CG	3	6	193850	193855	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017268	GC	3	6	193987	193992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_017268	TG	3	6	194291	194296	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017268	GT	3	6	194681	194686	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017268	AC	3	6	194749	194754	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_017268	TG	4	8	195403	195410	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017268	AC	3	6	196223	196228	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017268	CA	4	8	196431	196438	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017268	GC	3	6	196603	196608	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017268	CG	3	6	198438	198443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_017268	CG	3	6	199062	199067	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017268	CG	3	6	199362	199367	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_017268	CA	3	6	199584	199589	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_017268	GC	3	6	204348	204353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_017268	GT	3	6	205802	205807	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017268	GT	4	8	206169	206176	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017268	GT	3	6	212327	212332	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017268	TG	3	6	215323	215328	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017268	GT	3	6	215496	215501	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017268	CG	3	6	215527	215532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_017268	TG	3	6	216391	216396	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017268	TC	3	6	219128	219133	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_017268	GC	3	6	219915	219920	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_017268	TG	3	6	221914	221919	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017268	GC	3	6	227512	227517	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_017268	GC	3	6	227528	227533	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
153	NC_017268	TG	3	6	227547	227552	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017268	CG	3	6	227884	227889	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
155	NC_017268	TG	3	6	228691	228696	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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