MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Chicago chromosome

Total Repeats: 295

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017268	T	7	7	1483	1489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017268	A	6	6	1494	1499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017268	T	6	6	12435	12440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017268	G	10	10	12477	12486	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017268	A	6	6	19887	19892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017268	T	7	7	19983	19989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017268	G	6	6	20320	20325	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017268	A	7	7	20749	20755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017268	T	6	6	21543	21548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017268	A	6	6	21611	21616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017268	A	6	6	21851	21856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017268	A	6	6	22461	22466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017268	T	6	6	23233	23238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017268	T	7	7	23934	23940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017268	G	6	6	24746	24751	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017268	A	6	6	24826	24831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017268	G	6	6	24873	24878	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017268	A	6	6	25011	25016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017268	T	7	7	25172	25178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017268	T	9	9	25369	25377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017268	G	6	6	29058	29063	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017268	C	12	12	34077	34088	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
23	NC_017268	T	9	9	38248	38256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017268	A	6	6	55539	55544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017268	A	6	6	57929	57934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017268	A	8	8	58355	58362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017268	T	6	6	59483	59488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017268	C	8	8	69018	69025	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
29	NC_017268	G	7	7	71779	71785	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017268	A	6	6	71791	71796	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017268	A	6	6	72209	72214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017268	T	6	6	72342	72347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017268	C	6	6	73845	73850	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
34	NC_017268	T	6	6	90653	90658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017268	T	6	6	91105	91110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017268	G	6	6	91161	91166	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017268	G	6	6	92188	92193	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017268	A	6	6	93059	93064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017268	A	7	7	93594	93600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017268	C	9	9	94725	94733	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
41	NC_017268	A	6	6	111767	111772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017268	T	6	6	113750	113755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017268	A	6	6	122213	122218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017268	C	10	10	122233	122242	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
45	NC_017268	T	6	6	132837	132842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017268	C	10	10	136741	136750	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
47	NC_017268	C	10	10	140955	140964	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
48	NC_017268	A	6	6	142980	142985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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50	NC_017268	G	9	9	150153	150161	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017268	T	6	6	151274	151279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017268	T	6	6	151355	151360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017268	C	9	9	154143	154151	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
54	NC_017268	A	7	7	156809	156815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017268	G	9	9	156836	156844	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017268	A	6	6	156900	156905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017268	A	6	6	169753	169758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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59	NC_017268	T	6	6	170322	170327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017268	T	6	6	191246	191251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017268	G	6	6	192157	192162	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017268	G	6	6	192695	192700	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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67	NC_017268	A	6	6	193757	193762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017268	A	6	6	194159	194164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017268	A	6	6	194522	194527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017268	A	7	7	194719	194725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017268	T	6	6	194808	194813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017268	A	6	6	195031	195036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017268	A	7	7	195064	195070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017268	A	6	6	195294	195299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017268	T	8	8	195500	195507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017268	T	6	6	195598	195603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017268	A	6	6	196482	196487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017268	T	6	6	199641	199646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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110	NC_017268	G	7	7	326822	326828	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017268	T	6	6	328067	328072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017268	G	11	11	329189	329199	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017268	C	9	9	333588	333596	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
114	NC_017268	C	11	11	335897	335907	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
115	NC_017268	G	6	6	336032	336037	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017268	T	6	6	341090	341095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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118	NC_017268	G	6	6	352611	352616	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017268	G	6	6	373222	373227	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017268	G	13	13	373274	373286	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017268	G	9	9	374012	374020	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017268	C	6	6	374387	374392	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
123	NC_017268	A	8	8	374572	374579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017268	T	6	6	383827	383832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017268	A	8	8	395076	395083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017268	T	6	6	395525	395530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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129	NC_017268	T	7	7	402533	402539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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133	NC_017268	T	8	8	423026	423033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017268	T	9	9	432346	432354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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136	NC_017268	T	6	6	436253	436258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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146	NC_017268	G	6	6	492102	492107	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017268	G	6	6	492164	492169	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_017268	C	6	6	510816	510821	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.