MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzicola BLS256 chromosome

Total Repeats: 4140

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017267	GCCTG	2	10	821	830	0 %	20 %	40 %	40 %	384417080
2	NC_017267	ACCAC	2	10	1265	1274	40 %	0 %	0 %	60 %	384417080
3	NC_017267	TGGAA	2	10	4041	4050	40 %	20 %	40 %	0 %	384417083
4	NC_017267	CAAGC	2	10	4661	4670	40 %	0 %	20 %	40 %	384417083
5	NC_017267	GGCGC	2	10	5635	5644	0 %	0 %	60 %	40 %	384417084
6	NC_017267	CCGCG	2	10	5932	5941	0 %	0 %	40 %	60 %	384417084
7	NC_017267	CGGTG	2	10	7536	7545	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017267	CACTG	2	10	11117	11126	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_017267	CGCGC	2	10	12754	12763	0 %	0 %	40 %	60 %	384417090
10	NC_017267	CGCAG	2	10	12852	12861	20 %	0 %	40 %	40 %	384417090
11	NC_017267	CAACA	2	10	13436	13445	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_017267	AGCGC	2	10	15870	15879	20 %	0 %	40 %	40 %	384417094
13	NC_017267	GACCT	2	10	16963	16972	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_017267	CGCGC	2	10	20924	20933	0 %	0 %	40 %	60 %	384417099
15	NC_017267	GCCCG	2	10	21091	21100	0 %	0 %	40 %	60 %	384417099
16	NC_017267	ACGCC	2	10	21124	21133	20 %	0 %	20 %	60 %	384417099
17	NC_017267	GCCTG	2	10	21413	21422	0 %	20 %	40 %	40 %	384417099
18	NC_017267	CAGCG	2	10	23566	23575	20 %	0 %	40 %	40 %	384417100
19	NC_017267	CGTGG	2	10	24393	24402	0 %	20 %	60 %	20 %	384417100
20	NC_017267	TGCGA	2	10	24940	24949	20 %	20 %	40 %	20 %	384417100
21	NC_017267	AGCCC	2	10	26527	26536	20 %	0 %	20 %	60 %	384417102
22	NC_017267	GCCAA	2	10	26721	26730	40 %	0 %	20 %	40 %	384417102
23	NC_017267	TGGAT	2	10	29751	29760	20 %	40 %	40 %	0 %	384417105
24	NC_017267	GCCAG	2	10	30933	30942	20 %	0 %	40 %	40 %	384417105
25	NC_017267	TGCAC	2	10	32595	32604	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_017267	TGCAC	2	10	34114	34123	20 %	20 %	20 %	40 %	384417106
27	NC_017267	ACCGC	2	10	34372	34381	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
28	NC_017267	GACCT	2	10	34812	34821	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_017267	TCAAT	2	10	36176	36185	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017267	GATTT	2	10	37161	37170	20 %	60 %	20 %	0 %	384417108
31	NC_017267	GGCAG	2	10	37216	37225	20 %	0 %	60 %	20 %	384417108
32	NC_017267	AATGA	2	10	37495	37504	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017267	GCAAG	2	10	38539	38548	40 %	0 %	40 %	20 %	384417110
34	NC_017267	GACCT	2	10	39027	39036	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_017267	GATCG	2	10	40499	40508	20 %	20 %	40 %	20 %	384417111
36	NC_017267	AGCTG	2	10	40735	40744	20 %	20 %	40 %	20 %	384417111
37	NC_017267	CGATC	2	10	41379	41388	20 %	20 %	20 %	40 %	384417112
38	NC_017267	AGCCT	2	10	42217	42226	20 %	20 %	20 %	40 %	384417112
39	NC_017267	CCAGC	2	10	42972	42981	20 %	0 %	20 %	60 %	384417112
40	NC_017267	TGCAC	2	10	44997	45006	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_017267	AACTC	2	10	45699	45708	40 %	20 %	0 %	40 %	384417113
42	NC_017267	CAGCC	2	10	46822	46831	20 %	0 %	20 %	60 %	384417114
43	NC_017267	GCATT	2	10	47240	47249	20 %	40 %	20 %	20 %	384417115
44	NC_017267	TGCGG	2	10	48752	48761	0 %	20 %	60 %	20 %	384417117
45	NC_017267	GCGCA	2	10	48850	48859	20 %	0 %	40 %	40 %	384417117
46	NC_017267	GGCTG	2	10	50747	50756	0 %	20 %	60 %	20 %	384417119
47	NC_017267	ACGCA	2	10	51340	51349	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_017267	GGATG	2	10	52553	52562	20 %	20 %	60 %	0 %	384417120
49	NC_017267	GCGCA	2	10	54004	54013	20 %	0 %	40 %	40 %	384417122
50	NC_017267	GACCA	2	10	55390	55399	40 %	0 %	20 %	40 %	384417124
51	NC_017267	GGTGA	2	10	57490	57499	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017267	GCTTG	2	10	57787	57796	0 %	40 %	40 %	20 %	384417126
53	NC_017267	AGCGC	2	10	59655	59664	20 %	0 %	40 %	40 %	384417127
54	NC_017267	AGCGA	2	10	60924	60933	40 %	0 %	40 %	20 %	384417128
55	NC_017267	GGCCG	2	10	62999	63008	0 %	0 %	60 %	40 %	384417131
56	NC_017267	GCCGC	2	10	63228	63237	0 %	0 %	40 %	60 %	384417131
57	NC_017267	AACCC	2	10	63610	63619	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
58	NC_017267	GTTGC	2	10	66155	66164	0 %	40 %	40 %	20 %	384417133
59	NC_017267	CCTGC	2	10	68011	68020	0 %	20 %	20 %	60 %	384417136
60	NC_017267	CGTGC	2	10	69577	69586	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
61	NC_017267	GGGCA	2	10	69622	69631	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017267	TGCAC	2	10	69999	70008	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_017267	GGTGT	2	10	71232	71241	0 %	40 %	60 %	0 %	384417137
64	NC_017267	TGCAC	2	10	72596	72605	20 %	20 %	20 %	40 %	384417138
65	NC_017267	TGCAC	2	10	75233	75242	20 %	20 %	20 %	40 %	384417140
66	NC_017267	CTATC	2	10	76068	76077	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_017267	CACGC	2	10	76955	76964	20 %	0 %	20 %	60 %	384417141
68	NC_017267	ACGGC	2	10	78137	78146	20 %	0 %	40 %	40 %	384417142
69	NC_017267	GCACG	2	10	80014	80023	20 %	0 %	40 %	40 %	384417144
70	NC_017267	CGCTG	2	10	81280	81289	0 %	20 %	40 %	40 %	384417145
71	NC_017267	GTCGT	2	10	81615	81624	0 %	40 %	40 %	20 %	384417145
72	NC_017267	ATCGC	2	10	82068	82077	20 %	20 %	20 %	40 %	384417145
73	NC_017267	TGGTC	2	10	82905	82914	0 %	40 %	40 %	20 %	384417146
74	NC_017267	CGCAG	2	10	83933	83942	20 %	0 %	40 %	40 %	384417148
75	NC_017267	GCGCG	2	10	84167	84176	0 %	0 %	60 %	40 %	384417148
76	NC_017267	TTGGC	2	10	84852	84861	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017267	CGAAC	2	10	85023	85032	40 %	0 %	20 %	40 %	384417149
78	NC_017267	ATCAC	2	10	87327	87336	40 %	20 %	0 %	40 %	384417151
79	NC_017267	TTGCG	2	10	89427	89436	0 %	40 %	40 %	20 %	384417153
80	NC_017267	AGGTG	2	10	90419	90428	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017267	CCTCG	2	10	90449	90458	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
82	NC_017267	GACGA	2	10	96561	96570	40 %	0 %	40 %	20 %	384417162
83	NC_017267	CAGCG	2	10	98832	98841	20 %	0 %	40 %	40 %	384417165
84	NC_017267	CGGCG	2	10	99746	99755	0 %	0 %	60 %	40 %	384417166
85	NC_017267	GCCGC	2	10	99969	99978	0 %	0 %	40 %	60 %	384417167
86	NC_017267	CGCCA	2	10	100355	100364	20 %	0 %	20 %	60 %	384417168
87	NC_017267	TGGGG	2	10	101905	101914	0 %	20 %	80 %	0 %	384417168
88	NC_017267	CGGGG	2	10	102947	102956	0 %	0 %	80 %	20 %	384417169
89	NC_017267	ACAGA	2	10	103091	103100	60 %	0 %	20 %	20 %	384417169
90	NC_017267	GTGCG	2	10	104041	104050	0 %	20 %	60 %	20 %	384417169
91	NC_017267	GGTCG	2	10	104177	104186	0 %	20 %	60 %	20 %	384417169
92	NC_017267	CGGCG	2	10	106193	106202	0 %	0 %	60 %	40 %	384417169
93	NC_017267	GCCAC	2	10	107400	107409	20 %	0 %	20 %	60 %	384417171
94	NC_017267	CGCGG	2	10	108176	108185	0 %	0 %	60 %	40 %	384417171
95	NC_017267	ATCGC	2	10	110738	110747	20 %	20 %	20 %	40 %	384417172
96	NC_017267	AGCGC	2	10	110877	110886	20 %	0 %	40 %	40 %	384417172
97	NC_017267	TTGCG	2	10	111900	111909	0 %	40 %	40 %	20 %	384417175
98	NC_017267	ACGGC	2	10	112805	112814	20 %	0 %	40 %	40 %	384417177
99	NC_017267	GCCGC	3	15	113831	113845	0 %	0 %	40 %	60 %	384417178
100	NC_017267	TTCGA	2	10	114861	114870	20 %	40 %	20 %	20 %	384417180
101	NC_017267	CGACC	2	10	115630	115639	20 %	0 %	20 %	60 %	384417181
102	NC_017267	CGTGG	2	10	116539	116548	0 %	20 %	60 %	20 %	384417183
103	NC_017267	GCCCG	2	10	116588	116597	0 %	0 %	40 %	60 %	384417183
104	NC_017267	CGACG	2	10	118571	118580	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
105	NC_017267	CACGC	2	10	120175	120184	20 %	0 %	20 %	60 %	384417187
106	NC_017267	GTGCG	2	10	121242	121251	0 %	20 %	60 %	20 %	384417188
107	NC_017267	AATGC	2	10	121975	121984	40 %	20 %	20 %	20 %	384417189
108	NC_017267	CGGTG	2	10	123269	123278	0 %	20 %	60 %	20 %	384417190
109	NC_017267	GTGCA	2	10	124324	124333	20 %	20 %	40 %	20 %	384417191
110	NC_017267	GCCCA	2	10	127692	127701	20 %	0 %	20 %	60 %	384417192
111	NC_017267	GTGCA	2	10	129296	129305	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
112	NC_017267	CTTGG	2	10	129425	129434	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_017267	CTGGT	2	10	132304	132313	0 %	40 %	40 %	20 %	384417195
114	NC_017267	CAGCG	2	10	133386	133395	20 %	0 %	40 %	40 %	384417195
115	NC_017267	AGGCC	2	10	134095	134104	20 %	0 %	40 %	40 %	384417196
116	NC_017267	CACCG	2	10	136454	136463	20 %	0 %	20 %	60 %	384417196
117	NC_017267	CGCTG	2	10	137653	137662	0 %	20 %	40 %	40 %	384417196
118	NC_017267	ACACC	2	10	138010	138019	40 %	0 %	0 %	60 %	384417196
119	NC_017267	CGTTG	2	10	138970	138979	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_017267	GACGC	2	10	139365	139374	20 %	0 %	40 %	40 %	384417198
121	NC_017267	GAGCC	2	10	141042	141051	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
122	NC_017267	CAGCG	2	10	141608	141617	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
123	NC_017267	CCAGG	2	10	144393	144402	20 %	0 %	40 %	40 %	384417204
124	NC_017267	GCTGC	2	10	144984	144993	0 %	20 %	40 %	40 %	384417204
125	NC_017267	AGGCC	2	10	146693	146702	20 %	0 %	40 %	40 %	384417204
126	NC_017267	ATTAA	2	10	146833	146842	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017267	GCGTT	2	10	147947	147956	0 %	40 %	40 %	20 %	384417205
128	NC_017267	GCAAG	2	10	148516	148525	40 %	0 %	40 %	20 %	384417207
129	NC_017267	GACCA	2	10	149321	149330	40 %	0 %	20 %	40 %	384417207
130	NC_017267	GCTGG	2	10	155786	155795	0 %	20 %	60 %	20 %	384417211
131	NC_017267	GGCGT	2	10	155886	155895	0 %	20 %	60 %	20 %	384417211
132	NC_017267	GCGAG	2	10	158148	158157	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
133	NC_017267	CAGCG	2	10	161765	161774	20 %	0 %	40 %	40 %	384417218
134	NC_017267	GCACC	2	10	161950	161959	20 %	0 %	20 %	60 %	384417218
135	NC_017267	CAGGC	2	10	163843	163852	20 %	0 %	40 %	40 %	384417219
136	NC_017267	CATTT	2	10	165381	165390	20 %	60 %	0 %	20 %	384417220
137	NC_017267	CCAGA	2	10	167117	167126	40 %	0 %	20 %	40 %	384417221
138	NC_017267	CAGCG	2	10	167697	167706	20 %	0 %	40 %	40 %	384417222
139	NC_017267	ATGGA	2	10	168796	168805	40 %	20 %	40 %	0 %	384417223
140	NC_017267	GCTGC	2	10	169678	169687	0 %	20 %	40 %	40 %	384417225
141	NC_017267	TGCGC	2	10	169983	169992	0 %	20 %	40 %	40 %	384417225
142	NC_017267	TCAGG	2	10	170186	170195	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
143	NC_017267	TGGCC	2	10	170736	170745	0 %	20 %	40 %	40 %	384417227
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145	NC_017267	GGGAG	2	10	173720	173729	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017267	TGCAA	2	10	175763	175772	40 %	20 %	20 %	20 %	384417231
147	NC_017267	CCGCA	2	10	176227	176236	20 %	0 %	20 %	60 %	384417232
148	NC_017267	GCCCG	2	10	180174	180183	0 %	0 %	40 %	60 %	384417235
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151	NC_017267	CGATT	2	10	181683	181692	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
152	NC_017267	GCGCA	2	10	181771	181780	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
153	NC_017267	AGGCA	2	10	181892	181901	40 %	0 %	40 %	20 %	384417241
154	NC_017267	CCGCG	2	10	182711	182720	0 %	0 %	40 %	60 %	384417244
155	NC_017267	CTGCA	2	10	184334	184343	20 %	20 %	20 %	40 %	384417247
156	NC_017267	TGCAT	2	10	187035	187044	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
157	NC_017267	AGCGC	2	10	187103	187112	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
158	NC_017267	CGGCA	2	10	187838	187847	20 %	0 %	40 %	40 %	384417253
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160	NC_017267	TGCAC	2	10	189926	189935	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
161	NC_017267	TGCAC	2	10	190999	191008	20 %	20 %	20 %	40 %	384417255
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174	NC_017267	CGCAC	2	10	206263	206272	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
175	NC_017267	GCTGC	2	10	206388	206397	0 %	20 %	40 %	40 %	384417274
176	NC_017267	CACCG	2	10	207059	207068	20 %	0 %	20 %	60 %	384417274
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182	NC_017267	GCCAC	2	10	213785	213794	20 %	0 %	20 %	60 %	384417281
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185	NC_017267	GCCGC	2	10	216103	216112	0 %	0 %	40 %	60 %	384417282
186	NC_017267	TCGTG	2	10	219351	219360	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
187	NC_017267	ACCGT	2	10	221898	221907	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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190	NC_017267	TGCAC	2	10	226785	226794	20 %	20 %	20 %	40 %	384417286
191	NC_017267	TGTCA	2	10	227260	227269	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
192	NC_017267	GATTT	2	10	227331	227340	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
193	NC_017267	GACCT	2	10	227520	227529	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
194	NC_017267	GTGCA	2	10	228849	228858	20 %	20 %	40 %	20 %	384417288
195	NC_017267	GTGCA	2	10	230275	230284	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
196	NC_017267	GCACG	2	10	231178	231187	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
197	NC_017267	GTGCA	2	10	232359	232368	20 %	20 %	40 %	20 %	384417289
198	NC_017267	GCCAA	2	10	235876	235885	40 %	0 %	20 %	40 %	384417291
199	NC_017267	TGCAC	2	10	236006	236015	20 %	20 %	20 %	40 %	384417291
200	NC_017267	GTTTT	2	10	236424	236433	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
201	NC_017267	AGGCG	2	10	240212	240221	20 %	0 %	60 %	20 %	384417295
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215	NC_017267	GGGGT	2	10	260054	260063	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
216	NC_017267	GGCCA	2	10	262746	262755	20 %	0 %	40 %	40 %	384417315
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225	NC_017267	ACGCG	3	15	271433	271447	20 %	0 %	40 %	40 %	384417322
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229	NC_017267	CGATG	2	10	276185	276194	20 %	20 %	40 %	20 %	384417324
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232	NC_017267	GTGCT	2	10	279117	279126	0 %	40 %	40 %	20 %	384417328
233	NC_017267	ATGCG	2	10	279940	279949	20 %	20 %	40 %	20 %	384417328
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239	NC_017267	GCCCG	2	10	286284	286293	0 %	0 %	40 %	60 %	384417333
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241	NC_017267	GTCGG	2	10	287696	287705	0 %	20 %	60 %	20 %	384417336
242	NC_017267	GCTGT	2	10	292113	292122	0 %	40 %	40 %	20 %	384417341
243	NC_017267	CCGCG	2	10	295867	295876	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
244	NC_017267	CCCGC	2	10	296943	296952	0 %	0 %	20 %	80 %	384417345
245	NC_017267	TCGCT	2	10	297969	297978	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
246	NC_017267	CTGCA	2	10	298479	298488	20 %	20 %	20 %	40 %	384417346
247	NC_017267	CTGGT	2	10	298786	298795	0 %	40 %	40 %	20 %	384417346
248	NC_017267	CAGCA	2	10	298859	298868	40 %	0 %	20 %	40 %	384417346
249	NC_017267	TGCAC	2	10	300067	300076	20 %	20 %	20 %	40 %	384417347
250	NC_017267	ACGTG	2	10	302375	302384	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
251	NC_017267	CCCGT	2	10	304280	304289	0 %	20 %	20 %	60 %	384417349
252	NC_017267	AGCGC	2	10	305888	305897	20 %	0 %	40 %	40 %	384417351
253	NC_017267	GGCGC	2	10	306933	306942	0 %	0 %	60 %	40 %	384417354
254	NC_017267	TGCGC	2	10	311103	311112	0 %	20 %	40 %	40 %	384417358
255	NC_017267	CGGGC	2	10	315592	315601	0 %	0 %	60 %	40 %	384417364
256	NC_017267	TGCGC	2	10	316066	316075	0 %	20 %	40 %	40 %	384417364
257	NC_017267	ATTTC	2	10	316701	316710	20 %	60 %	0 %	20 %	384417364
258	NC_017267	GCAAC	2	10	317870	317879	40 %	0 %	20 %	40 %	384417365
259	NC_017267	ACGCG	2	10	318032	318041	20 %	0 %	40 %	40 %	384417365
260	NC_017267	GAGCC	2	10	318189	318198	20 %	0 %	40 %	40 %	384417365
261	NC_017267	GCCGC	2	10	318240	318249	0 %	0 %	40 %	60 %	384417365
262	NC_017267	CAAGC	2	10	319322	319331	40 %	0 %	20 %	40 %	384417366
263	NC_017267	CTGGC	2	10	319621	319630	0 %	20 %	40 %	40 %	384417366
264	NC_017267	GCAGC	2	10	319657	319666	20 %	0 %	40 %	40 %	384417366
265	NC_017267	GCTGC	2	10	321211	321220	0 %	20 %	40 %	40 %	384417368
266	NC_017267	CAAGG	2	10	324582	324591	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
267	NC_017267	CGGCC	2	10	326004	326013	0 %	0 %	40 %	60 %	384417373
268	NC_017267	GATGG	2	10	326153	326162	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
269	NC_017267	CGCCA	2	10	326419	326428	20 %	0 %	20 %	60 %	384417374
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271	NC_017267	GTGAT	2	10	326738	326747	20 %	40 %	40 %	0 %	384417374
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283	NC_017267	GCCGG	2	10	344174	344183	0 %	0 %	60 %	40 %	384417394
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