MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzicola BLS256 chromosome

Total Repeats: 13798

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017267	CAGC	2	8	16	23	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017267	GATG	2	8	42	49	25 %	25 %	50 %	0 %	384417080
3	NC_017267	CCCG	2	8	87	94	0 %	0 %	25 %	75 %	384417080
4	NC_017267	GTCG	2	8	837	844	0 %	25 %	50 %	25 %	384417080
5	NC_017267	CGAT	2	8	845	852	25 %	25 %	25 %	25 %	384417080
6	NC_017267	GCCG	2	8	1255	1262	0 %	0 %	50 %	50 %	384417080
7	NC_017267	TGCC	2	8	1284	1291	0 %	25 %	25 %	50 %	384417080
8	NC_017267	CCTG	2	8	1726	1733	0 %	25 %	25 %	50 %	384417081
9	NC_017267	GGAC	2	8	1762	1769	25 %	0 %	50 %	25 %	384417081
10	NC_017267	CCGT	2	8	1994	2001	0 %	25 %	25 %	50 %	384417081
11	NC_017267	TGCG	2	8	2436	2443	0 %	25 %	50 %	25 %	384417081
12	NC_017267	CGAA	2	8	2469	2476	50 %	0 %	25 %	25 %	384417081
13	NC_017267	AGGT	2	8	3199	3206	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017267	CCTG	2	8	3719	3726	0 %	25 %	25 %	50 %	384417082
15	NC_017267	GCCT	2	8	4682	4689	0 %	25 %	25 %	50 %	384417083
16	NC_017267	CCCG	2	8	4846	4853	0 %	0 %	25 %	75 %	384417083
17	NC_017267	CCGT	2	8	5588	5595	0 %	25 %	25 %	50 %	384417084
18	NC_017267	CGAA	2	8	6171	6178	50 %	0 %	25 %	25 %	384417084
19	NC_017267	GCAG	2	8	6976	6983	25 %	0 %	50 %	25 %	384417084
20	NC_017267	GCCG	2	8	8154	8161	0 %	0 %	50 %	50 %	384417085
21	NC_017267	ACCC	2	8	9279	9286	25 %	0 %	0 %	75 %	384417086
22	NC_017267	GCCT	2	8	9451	9458	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017267	GCAA	2	8	9682	9689	50 %	0 %	25 %	25 %	384417087
24	NC_017267	TGGG	2	8	9721	9728	0 %	25 %	75 %	0 %	384417087
25	NC_017267	GTCG	2	8	11540	11547	0 %	25 %	50 %	25 %	384417088
26	NC_017267	GGTG	2	8	12365	12372	0 %	25 %	75 %	0 %	384417089
27	NC_017267	GAAG	2	8	12735	12742	50 %	0 %	50 %	0 %	384417090
28	NC_017267	GCGA	2	8	13573	13580	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017267	GTGC	2	8	14385	14392	0 %	25 %	50 %	25 %	384417092
30	NC_017267	GATC	2	8	14579	14586	25 %	25 %	25 %	25 %	384417093
31	NC_017267	ATGG	2	8	15299	15306	25 %	25 %	50 %	0 %	384417094
32	NC_017267	GGTG	2	8	15622	15629	0 %	25 %	75 %	0 %	384417094
33	NC_017267	CATC	2	8	15754	15761	25 %	25 %	0 %	50 %	384417094
34	NC_017267	GCCA	2	8	16257	16264	25 %	0 %	25 %	50 %	384417094
35	NC_017267	TGTT	2	8	16859	16866	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017267	TTTG	2	8	18383	18390	0 %	75 %	25 %	0 %	384417096
37	NC_017267	ACGC	2	8	18990	18997	25 %	0 %	25 %	50 %	384417096
38	NC_017267	GTGC	2	8	19221	19228	0 %	25 %	50 %	25 %	384417096
39	NC_017267	ATGG	2	8	19240	19247	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017267	TCGC	2	8	19253	19260	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017267	TGCC	2	8	19793	19800	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017267	CCAA	2	8	19826	19833	50 %	0 %	0 %	50 %	384417098
43	NC_017267	ATTC	2	8	20318	20325	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017267	GGTG	2	8	20358	20365	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017267	CGTT	2	8	20422	20429	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017267	GAGC	2	8	20576	20583	25 %	0 %	50 %	25 %	384417099
47	NC_017267	CCTG	2	8	20602	20609	0 %	25 %	25 %	50 %	384417099
48	NC_017267	GCCG	2	8	21212	21219	0 %	0 %	50 %	50 %	384417099
49	NC_017267	CCAT	2	8	21452	21459	25 %	25 %	0 %	50 %	384417099
50	NC_017267	CGAC	2	8	21974	21981	25 %	0 %	25 %	50 %	384417099
51	NC_017267	CACC	2	8	22160	22167	25 %	0 %	0 %	75 %	384417099
52	NC_017267	TGCA	2	8	22642	22649	25 %	25 %	25 %	25 %	384417099
53	NC_017267	GCCA	2	8	22902	22909	25 %	0 %	25 %	50 %	384417099
54	NC_017267	CCGG	2	8	23334	23341	0 %	0 %	50 %	50 %	384417100
55	NC_017267	ACCT	2	8	23554	23561	25 %	25 %	0 %	50 %	384417100
56	NC_017267	CCAG	2	8	23829	23836	25 %	0 %	25 %	50 %	384417100
57	NC_017267	CCAG	2	8	24233	24240	25 %	0 %	25 %	50 %	384417100
58	NC_017267	GCTG	2	8	25688	25695	0 %	25 %	50 %	25 %	384417102
59	NC_017267	GGCA	2	8	25768	25775	25 %	0 %	50 %	25 %	384417102
60	NC_017267	TGCG	2	8	27172	27179	0 %	25 %	50 %	25 %	384417103
61	NC_017267	TATT	2	8	27647	27654	25 %	75 %	0 %	0 %	384417104
62	NC_017267	AGGC	2	8	27911	27918	25 %	0 %	50 %	25 %	384417104
63	NC_017267	GCTC	2	8	28069	28076	0 %	25 %	25 %	50 %	384417104
64	NC_017267	TTTG	2	8	28309	28316	0 %	75 %	25 %	0 %	384417104
65	NC_017267	TGGG	2	8	28782	28789	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017267	GCCC	2	8	28999	29006	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
67	NC_017267	CGGA	2	8	29827	29834	25 %	0 %	50 %	25 %	384417105
68	NC_017267	GGGC	2	8	30595	30602	0 %	0 %	75 %	25 %	384417105
69	NC_017267	GGCA	2	8	30802	30809	25 %	0 %	50 %	25 %	384417105
70	NC_017267	TGCG	2	8	31159	31166	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017267	TTCG	2	8	31421	31428	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017267	ACGC	2	8	31805	31812	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017267	ACAA	2	8	32171	32178	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017267	GCTG	2	8	32340	32347	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017267	TTCG	2	8	32940	32947	0 %	50 %	25 %	25 %	384417106
76	NC_017267	ACGC	2	8	33324	33331	25 %	0 %	25 %	50 %	384417106
77	NC_017267	ACAA	2	8	33690	33697	75 %	0 %	0 %	25 %	384417106
78	NC_017267	CGGC	2	8	34655	34662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017267	GACA	2	8	36313	36320	50 %	0 %	25 %	25 %	384417108
80	NC_017267	ATGG	2	8	37443	37450	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017267	GGAC	2	8	37637	37644	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017267	CAGC	2	8	37979	37986	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017267	CGTG	2	8	38061	38068	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017267	CGTG	2	8	38218	38225	0 %	25 %	50 %	25 %	384417109
85	NC_017267	ACAT	2	8	38875	38882	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017267	GGGT	2	8	40142	40149	0 %	25 %	75 %	0 %	384417111
87	NC_017267	GGCC	2	8	40252	40259	0 %	0 %	50 %	50 %	384417111
88	NC_017267	GGAG	2	8	40318	40325	25 %	0 %	75 %	0 %	384417111
89	NC_017267	CCAG	2	8	40362	40369	25 %	0 %	25 %	50 %	384417111
90	NC_017267	GTCG	2	8	40447	40454	0 %	25 %	50 %	25 %	384417111
91	NC_017267	CCTT	2	8	41190	41197	0 %	50 %	0 %	50 %	384417111
92	NC_017267	TGAT	2	8	41262	41269	25 %	50 %	25 %	0 %	384417111
93	NC_017267	TCCG	2	8	41277	41284	0 %	25 %	25 %	50 %	384417111
94	NC_017267	CTGG	2	8	41641	41648	0 %	25 %	50 %	25 %	384417112
95	NC_017267	GCAA	2	8	41776	41783	50 %	0 %	25 %	25 %	384417112
96	NC_017267	CTAT	2	8	41887	41894	25 %	50 %	0 %	25 %	384417112
97	NC_017267	GCTG	2	8	42029	42036	0 %	25 %	50 %	25 %	384417112
98	NC_017267	GGTC	2	8	42882	42889	0 %	25 %	50 %	25 %	384417112
99	NC_017267	AGGA	2	8	42947	42954	50 %	0 %	50 %	0 %	384417112
100	NC_017267	TTCG	2	8	43823	43830	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017267	ACGC	2	8	44207	44214	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017267	ACAA	2	8	44573	44580	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017267	GCTG	2	8	44742	44749	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017267	TGTT	2	8	45175	45182	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017267	TGCA	2	8	45647	45654	25 %	25 %	25 %	25 %	384417113
106	NC_017267	TTGA	2	8	45718	45725	25 %	50 %	25 %	0 %	384417113
107	NC_017267	CACC	2	8	45984	45991	25 %	0 %	0 %	75 %	384417113
108	NC_017267	TCGA	2	8	46167	46174	25 %	25 %	25 %	25 %	384417114
109	NC_017267	CACC	2	8	46328	46335	25 %	0 %	0 %	75 %	384417114
110	NC_017267	TTCT	2	8	46662	46669	0 %	75 %	0 %	25 %	384417114
111	NC_017267	GCAG	2	8	46783	46790	25 %	0 %	50 %	25 %	384417114
112	NC_017267	GCTC	2	8	46793	46800	0 %	25 %	25 %	50 %	384417114
113	NC_017267	ACCG	2	8	46805	46812	25 %	0 %	25 %	50 %	384417114
114	NC_017267	CCTC	2	8	46879	46886	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
115	NC_017267	TCGA	2	8	47183	47190	25 %	25 %	25 %	25 %	384417115
116	NC_017267	ACGC	2	8	48067	48074	25 %	0 %	25 %	50 %	384417116
117	NC_017267	GTGC	2	8	48298	48305	0 %	25 %	50 %	25 %	384417116
118	NC_017267	TGCG	2	8	49353	49360	0 %	25 %	50 %	25 %	384417117
119	NC_017267	ACGC	2	8	50861	50868	25 %	0 %	25 %	50 %	384417119
120	NC_017267	CCGC	2	8	51357	51364	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
121	NC_017267	CGTG	2	8	51445	51452	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017267	TGCG	2	8	51522	51529	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017267	CGCA	2	8	51617	51624	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017267	AGCA	2	8	51853	51860	50 %	0 %	25 %	25 %	384417120
125	NC_017267	TCGA	2	8	52183	52190	25 %	25 %	25 %	25 %	384417120
126	NC_017267	CGCC	2	8	52928	52935	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
127	NC_017267	CGCA	2	8	53431	53438	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017267	GATC	2	8	53828	53835	25 %	25 %	25 %	25 %	384417122
129	NC_017267	GCAC	2	8	54588	54595	25 %	0 %	25 %	50 %	384417122
130	NC_017267	TGTT	2	8	54671	54678	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017267	GTGA	2	8	54887	54894	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017267	CGCC	2	8	55091	55098	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
133	NC_017267	TTGT	2	8	55649	55656	0 %	75 %	25 %	0 %	384417125
134	NC_017267	GCCG	2	8	55798	55805	0 %	0 %	50 %	50 %	384417125
135	NC_017267	TGCG	2	8	56784	56791	0 %	25 %	50 %	25 %	384417125
136	NC_017267	GTCG	2	8	57334	57341	0 %	25 %	50 %	25 %	384417125
137	NC_017267	CCTG	2	8	58332	58339	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017267	TGCG	2	8	58655	58662	0 %	25 %	50 %	25 %	384417127
139	NC_017267	TCGC	2	8	59001	59008	0 %	25 %	25 %	50 %	384417127
140	NC_017267	ACAA	2	8	59045	59052	75 %	0 %	0 %	25 %	384417127
141	NC_017267	CGGG	2	8	59567	59574	0 %	0 %	75 %	25 %	384417127
142	NC_017267	GCTG	2	8	59636	59643	0 %	25 %	50 %	25 %	384417127
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144	NC_017267	CGCA	2	8	61070	61077	25 %	0 %	25 %	50 %	384417128
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