MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzicola BLS256 chromosome

Total Repeats: 2335

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017267	CAGC	2	8	16	23	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017267	AGGT	2	8	3199	3206	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017267	GCCT	2	8	9451	9458	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017267	GCGA	2	8	13573	13580	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017267	TGTT	2	8	16859	16866	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017267	ATGG	2	8	19240	19247	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017267	TCGC	2	8	19253	19260	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017267	TGCC	2	8	19793	19800	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017267	ATTC	2	8	20318	20325	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017267	GGTG	2	8	20358	20365	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017267	CGTT	2	8	20422	20429	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017267	TGGG	2	8	28782	28789	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017267	GCCC	2	8	28999	29006	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14	NC_017267	TGCG	2	8	31159	31166	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017267	TTCG	2	8	31421	31428	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017267	ACGC	2	8	31805	31812	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017267	ACAA	2	8	32171	32178	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017267	GCTG	2	8	32340	32347	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017267	CGGC	2	8	34655	34662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017267	ATGG	2	8	37443	37450	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017267	GGAC	2	8	37637	37644	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017267	CAGC	2	8	37979	37986	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017267	CGTG	2	8	38061	38068	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017267	ACAT	2	8	38875	38882	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017267	TTCG	2	8	43823	43830	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017267	ACGC	2	8	44207	44214	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017267	ACAA	2	8	44573	44580	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017267	GCTG	2	8	44742	44749	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017267	TGTT	2	8	45175	45182	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017267	CCTC	2	8	46879	46886	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
31	NC_017267	CCGC	2	8	51357	51364	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
32	NC_017267	CGTG	2	8	51445	51452	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017267	TGCG	2	8	51522	51529	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017267	CGCA	2	8	51617	51624	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017267	CGCC	2	8	52928	52935	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
36	NC_017267	CGCA	2	8	53431	53438	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017267	TGTT	2	8	54671	54678	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017267	GTGA	2	8	54887	54894	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017267	CGCC	2	8	55091	55098	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
40	NC_017267	CCTG	2	8	58332	58339	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017267	TTGC	2	8	61424	61431	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017267	GCAG	2	8	65250	65257	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017267	TGCC	2	8	69288	69295	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017267	TTCG	2	8	69306	69313	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017267	GCTG	2	8	69519	69526	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017267	GCAC	2	8	70191	70198	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017267	CATG	2	8	70304	70311	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017267	TCGG	2	8	71820	71827	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017267	GGTC	2	8	90014	90021	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017267	ATGC	2	8	90225	90232	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017267	GAGT	2	8	90241	90248	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017267	CCAG	2	8	90545	90552	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017267	CATC	2	8	90970	90977	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017267	GATG	2	8	91786	91793	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017267	CGGA	2	8	97155	97162	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017267	CCGG	2	8	98886	98893	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017267	GGCA	2	8	99069	99076	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017267	GTTG	2	8	99160	99167	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017267	CGTC	2	8	99293	99300	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017267	GGTC	2	8	106432	106439	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017267	TCGC	2	8	106500	106507	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017267	GTGA	2	8	117199	117206	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017267	CGCC	2	8	118685	118692	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
64	NC_017267	CGAA	2	8	125499	125506	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017267	TGGT	2	8	125790	125797	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017267	CTGC	2	8	125838	125845	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017267	GGCG	2	8	125947	125954	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017267	CATC	2	8	125976	125983	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017267	GATC	2	8	126303	126310	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017267	TGCA	2	8	129616	129623	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017267	TTTG	2	8	129721	129728	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017267	CGAA	2	8	131550	131557	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017267	GCCA	2	8	141252	141259	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017267	GGAC	2	8	141260	141267	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017267	GGCG	2	8	141306	141313	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017267	CAGC	2	8	141488	141495	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017267	AATG	2	8	150741	150748	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017267	GCAG	2	8	150767	150774	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017267	CGTG	2	8	150782	150789	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017267	GTCA	2	8	150799	150806	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017267	GCCT	2	8	155251	155258	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017267	TGCC	2	8	156789	156796	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017267	AGCG	2	8	163313	163320	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017267	TGCG	2	8	163434	163441	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017267	GCCC	2	8	164666	164673	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
86	NC_017267	TGCC	2	8	166558	166565	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017267	TGGC	2	8	166583	166590	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017267	CCCG	2	8	167322	167329	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
89	NC_017267	TCAC	2	8	173680	173687	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017267	GTGC	2	8	173916	173923	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017267	GCCG	2	8	173971	173978	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017267	GAAA	2	8	175128	175135	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017267	CGAC	2	8	177999	178006	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017267	TGCG	3	12	179601	179612	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017267	TGCA	2	8	179629	179636	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017267	CAGT	2	8	179651	179658	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017267	TGCC	2	8	184881	184888	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017267	TGCC	2	8	186731	186738	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017267	GGGC	2	8	186967	186974	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017267	CACC	2	8	187190	187197	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
101	NC_017267	AGCC	2	8	187359	187366	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017267	GCAA	2	8	187622	187629	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017267	CCGC	2	8	187678	187685	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
104	NC_017267	ACAA	2	8	189502	189509	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017267	GCTG	2	8	189671	189678	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017267	GCTG	2	8	189967	189974	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017267	TTGC	2	8	190409	190416	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017267	TGCC	2	8	193097	193104	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017267	GGAG	3	12	198796	198807	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017267	TGAT	2	8	206349	206356	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017267	GCAC	2	8	207598	207605	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017267	GGCG	2	8	209438	209445	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017267	CACT	2	8	211990	211997	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017267	GCAC	2	8	212046	212053	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017267	GACC	2	8	212116	212123	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017267	GCCT	2	8	212301	212308	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017267	TCGC	2	8	213654	213661	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017267	GGCG	2	8	216273	216280	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017267	GCTA	2	8	217857	217864	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017267	AGGA	2	8	218153	218160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017267	GAAA	2	8	218726	218733	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017267	GCGT	2	8	218855	218862	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017267	AGCG	2	8	220170	220177	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017267	ATCT	2	8	220186	220193	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017267	GACC	2	8	220741	220748	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017267	GTAC	2	8	221223	221230	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017267	CGTC	2	8	221259	221266	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017267	AAAG	2	8	221382	221389	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017267	GTTG	2	8	221755	221762	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017267	AACG	2	8	223225	223232	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017267	GCCG	2	8	223805	223812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_017267	CGCC	2	8	224781	224788	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
133	NC_017267	TCTT	2	8	226965	226972	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017267	TGCT	2	8	227404	227411	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017267	CAGC	2	8	230532	230539	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017267	TTTG	2	8	230700	230707	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017267	ATAC	2	8	234621	234628	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017267	GATG	2	8	234646	234653	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017267	TGTT	2	8	236240	236247	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017267	CAGC	2	8	245852	245859	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_017267	TGCA	2	8	245909	245916	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017267	GGCA	2	8	246487	246494	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017267	GATA	2	8	246600	246607	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017267	CCGG	2	8	248448	248455	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_017267	CCCA	2	8	248674	248681	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
146	NC_017267	TGCC	2	8	248762	248769	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_017267	GGCA	2	8	249667	249674	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_017267	ACGC	2	8	249758	249765	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_017267	CTCA	2	8	249783	249790	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_017267	GCAA	2	8	250612	250619	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_017267	TTGC	2	8	250707	250714	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_017267	CGGA	2	8	250928	250935	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
153	NC_017267	GCAG	2	8	253291	253298	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
154	NC_017267	TCGT	2	8	253407	253414	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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159	NC_017267	TGCG	2	8	264925	264932	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
160	NC_017267	CAAT	2	8	270741	270748	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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162	NC_017267	GGCT	2	8	275532	275539	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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165	NC_017267	GCAT	2	8	281306	281313	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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167	NC_017267	GATG	2	8	283281	283288	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
168	NC_017267	ACCT	2	8	283357	283364	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
169	NC_017267	TTGC	2	8	285825	285832	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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177	NC_017267	TACG	2	8	293157	293164	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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484	NC_017267	AGGT	2	8	835001	835008	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
485	NC_017267	AGGT	2	8	835174	835181	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
486	NC_017267	AGGT	2	8	835347	835354	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_017267	GGGC	2	8	874308	874315	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding

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