MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Xanthomonas oryzae pv. oryzicola BLS256 chromosome

Total Repeats: 69556

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017267	TCG	2	6	176	181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417080
2	NC_017267	GCA	2	6	398	403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417080
3	NC_017267	GCC	2	6	418	423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417080
4	NC_017267	TGT	2	6	473	478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384417080
5	NC_017267	GCA	2	6	482	487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417080
6	NC_017267	CGG	2	6	518	523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417080
7	NC_017267	TTC	2	6	583	588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384417080
8	NC_017267	GAT	2	6	594	599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384417080
9	NC_017267	CAG	2	6	646	651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417080
10	NC_017267	TTC	2	6	682	687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384417080
11	NC_017267	TTC	2	6	715	720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384417080
12	NC_017267	GCC	2	6	746	751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417080
13	NC_017267	ATC	2	6	757	762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384417080
14	NC_017267	CCG	2	6	853	858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417080
15	NC_017267	CGA	2	6	921	926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417080
16	NC_017267	AAG	2	6	946	951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384417080
17	NC_017267	TGG	2	6	995	1000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417080
18	NC_017267	ACT	2	6	1121	1126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384417080
19	NC_017267	TGC	2	6	1277	1282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417080
20	NC_017267	TGG	2	6	1821	1826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417081
21	NC_017267	ACC	2	6	1847	1852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384417081
22	NC_017267	GTG	3	9	2027	2035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417081
23	NC_017267	GCA	2	6	2086	2091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417081
24	NC_017267	CTA	2	6	2101	2106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384417081
25	NC_017267	CTG	2	6	2117	2122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417081
26	NC_017267	TTG	2	6	2141	2146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384417081
27	NC_017267	GGC	2	6	2207	2212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417081
28	NC_017267	ATC	2	6	2225	2230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384417081
29	NC_017267	AAG	3	9	2544	2552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384417081
30	NC_017267	CGA	2	6	2584	2589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417081
31	NC_017267	AGT	2	6	2705	2710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384417081
32	NC_017267	TCG	2	6	3859	3864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417083
33	NC_017267	CAA	2	6	4010	4015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384417083
34	NC_017267	AAC	2	6	4022	4027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384417083
35	NC_017267	GGC	2	6	4055	4060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417083
36	NC_017267	TGC	2	6	4063	4068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417083
37	NC_017267	CGT	2	6	4177	4182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417083
38	NC_017267	GCG	2	6	4215	4220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417083
39	NC_017267	GTG	2	6	4221	4226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417083
40	NC_017267	CCG	2	6	4231	4236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417083
41	NC_017267	CGT	2	6	4292	4297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417083
42	NC_017267	GCT	2	6	4327	4332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417083
43	NC_017267	GAC	2	6	4748	4753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417083
44	NC_017267	CAC	2	6	4775	4780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384417083
45	NC_017267	CGA	2	6	5053	5058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417084
46	NC_017267	TGC	2	6	5112	5117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417084
47	NC_017267	GGT	2	6	5203	5208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417084
48	NC_017267	CGA	2	6	5221	5226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417084
49	NC_017267	CGA	2	6	5245	5250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417084
50	NC_017267	GTG	2	6	5255	5260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417084
51	NC_017267	GAA	2	6	5330	5335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384417084
52	NC_017267	TGC	2	6	5367	5372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417084
53	NC_017267	CGG	2	6	5377	5382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417084
54	NC_017267	CGA	2	6	5389	5394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417084
55	NC_017267	CGG	2	6	5413	5418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417084
56	NC_017267	GGT	2	6	5440	5445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417084
57	NC_017267	CAG	2	6	5501	5506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417084
58	NC_017267	AGC	2	6	5541	5546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417084
59	NC_017267	CAC	2	6	5569	5574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384417084
60	NC_017267	CGA	2	6	5692	5697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417084
61	NC_017267	CGA	2	6	5716	5721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417084
62	NC_017267	GGC	2	6	5735	5740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417084
63	NC_017267	CGC	2	6	5778	5783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417084
64	NC_017267	TGG	2	6	5829	5834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417084
65	NC_017267	CAA	2	6	5887	5892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384417084
66	NC_017267	GGC	2	6	5909	5914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417084
67	NC_017267	CGA	2	6	6013	6018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417084
68	NC_017267	CGG	2	6	6117	6122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417084
69	NC_017267	TCG	2	6	6201	6206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417084
70	NC_017267	CGC	2	6	6254	6259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417084
71	NC_017267	TGC	2	6	6405	6410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417084
72	NC_017267	CGA	2	6	6517	6522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417084
73	NC_017267	ACC	2	6	6546	6551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384417084
74	NC_017267	CAT	2	6	6553	6558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384417084
75	NC_017267	TGA	2	6	6561	6566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384417084
76	NC_017267	CTT	2	6	6613	6618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384417084
77	NC_017267	GCC	2	6	6670	6675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417084
78	NC_017267	GCG	2	6	6767	6772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417084
79	NC_017267	CGA	2	6	6787	6792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417084
80	NC_017267	GCC	2	6	6793	6798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417084
81	NC_017267	CTG	2	6	6824	6829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417084
82	NC_017267	GCC	2	6	6913	6918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417084
83	NC_017267	TGG	2	6	7062	7067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417084
84	NC_017267	CCG	2	6	7072	7077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417084
85	NC_017267	GAA	2	6	7088	7093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384417084
86	NC_017267	TGC	2	6	7104	7109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417084
87	NC_017267	GCG	2	6	7128	7133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417084
88	NC_017267	CAA	2	6	7207	7212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384417084
89	NC_017267	GCT	2	6	7252	7257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417084
90	NC_017267	GCC	2	6	7275	7280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417084
91	NC_017267	AGC	2	6	7320	7325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417084
92	NC_017267	CGT	2	6	7355	7360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417084
93	NC_017267	GCC	2	6	7391	7396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417084
94	NC_017267	CGC	2	6	7439	7444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417084
95	NC_017267	GCC	2	6	7610	7615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417085
96	NC_017267	GCT	2	6	7616	7621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417085
97	NC_017267	CGC	2	6	7658	7663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417085
98	NC_017267	GGC	2	6	7736	7741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417085
99	NC_017267	GCC	2	6	7782	7787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417085
100	NC_017267	TGT	2	6	7855	7860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384417085
101	NC_017267	ACT	2	6	7861	7866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384417085
102	NC_017267	CGT	2	6	7869	7874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417085
103	NC_017267	CTG	2	6	7882	7887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417085
104	NC_017267	CGC	2	6	7952	7957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417085
105	NC_017267	GAA	2	6	8043	8048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384417085
106	NC_017267	GTG	2	6	8088	8093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417085
107	NC_017267	GAG	2	6	8109	8114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384417085
108	NC_017267	CTG	2	6	8115	8120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417085
109	NC_017267	CCG	2	6	8123	8128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417085
110	NC_017267	GCC	2	6	8241	8246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417085
111	NC_017267	GCA	2	6	8272	8277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417085
112	NC_017267	GCG	2	6	8283	8288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417085
113	NC_017267	TGC	2	6	8333	8338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417085
114	NC_017267	GGC	2	6	8366	8371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417085
115	NC_017267	CCA	2	6	8635	8640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384417086
116	NC_017267	GCC	2	6	8656	8661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417086
117	NC_017267	GGT	2	6	8666	8671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417086
118	NC_017267	CGT	2	6	8783	8788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417086
119	NC_017267	TGG	2	6	8797	8802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384417086
120	NC_017267	GCC	2	6	8810	8815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417086
121	NC_017267	TCG	2	6	8851	8856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417086
122	NC_017267	CGG	2	6	8885	8890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417086
123	NC_017267	CGC	2	6	8945	8950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417086
124	NC_017267	CAC	2	6	8988	8993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384417086
125	NC_017267	GAA	2	6	8994	8999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384417086
126	NC_017267	CAT	2	6	9038	9043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384417086
127	NC_017267	GCC	2	6	9060	9065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417086
128	NC_017267	GGC	2	6	9077	9082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384417086
129	NC_017267	CTG	2	6	9129	9134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417086
130	NC_017267	ATG	2	6	9237	9242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384417086
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132	NC_017267	TGT	2	6	9694	9699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384417087
133	NC_017267	GTC	2	6	9732	9737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417087
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169	NC_017267	TGC	2	6	11579	11584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384417088
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254	NC_017267	GTT	2	6	17359	17364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384417095
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258	NC_017267	CGC	2	6	17555	17560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384417095
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378	NC_017267	AGC	2	6	25384	25389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384417101
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