MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Yersinia pestis biovar Medievalis str. Harbin 35 plasmid pPCP

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017264	AACG	2	8	4	11	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017264	TCGC	2	8	328	335	0 %	25 %	25 %	50 %	384412694
3	NC_017264	CATT	2	8	382	389	25 %	50 %	0 %	25 %	384412694
4	NC_017264	GCTG	2	8	895	902	0 %	25 %	50 %	25 %	384412694
5	NC_017264	CTCA	2	8	1380	1387	25 %	25 %	0 %	50 %	384412696
6	NC_017264	TCAG	2	8	1631	1638	25 %	25 %	25 %	25 %	384412696
7	NC_017264	CAGA	2	8	1830	1837	50 %	0 %	25 %	25 %	384412696
8	NC_017264	TCAG	2	8	2534	2541	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017264	ACAG	2	8	2549	2556	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017264	AACA	2	8	2918	2925	75 %	0 %	0 %	25 %	384412697
11	NC_017264	CTCA	2	8	3415	3422	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017264	TGTA	2	8	4208	4215	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017264	ATTT	2	8	4312	4319	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017264	CTGT	2	8	4622	4629	0 %	50 %	25 %	25 %	384412699
15	NC_017264	GAAA	2	8	4722	4729	75 %	0 %	25 %	0 %	384412699
16	NC_017264	TCTT	2	8	5496	5503	0 %	75 %	0 %	25 %	384412700
17	NC_017264	ATGA	2	8	6976	6983	50 %	25 %	25 %	0 %	384412702
18	NC_017264	AATC	2	8	6985	6992	50 %	25 %	0 %	25 %	384412702
19	NC_017264	TACA	2	8	7449	7456	50 %	25 %	0 %	25 %	384412702
20	NC_017264	TCCT	2	8	7800	7807	0 %	50 %	0 %	50 %	384412703
21	NC_017264	ACAG	2	8	8559	8566	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017264	ACGA	2	8	8656	8663	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_017264	TGCC	2	8	8666	8673	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017264	CTGT	2	8	8939	8946	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017264	ACAA	2	8	9196	9203	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017264	TAAT	2	8	9253	9260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.