MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Yersinia pestis biovar Medievalis str. Harbin 35 plasmid pCD

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017263	ATCTAT	2	12	2471	2482	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384412642
2	NC_017263	GATGTC	2	12	5998	6009	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017263	TTTCCA	2	12	8018	8029	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384412648
4	NC_017263	TACATT	2	12	11706	11717	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017263	ATTTTT	2	12	16503	16514	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017263	TTAAAC	2	12	18484	18495	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017263	TTATTT	2	12	21485	21496	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017263	CAAGAT	2	12	22839	22850	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017263	AATTAC	2	12	26273	26284	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017263	TGAGCG	2	12	28055	28066	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017263	GAAGAT	2	12	28140	28151	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017263	CAAGAA	2	12	28182	28193	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017263	TAGAAC	2	12	29304	29315	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017263	TTGGTT	2	12	34259	34270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017263	TAACGT	2	12	35760	35771	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384412662
16	NC_017263	GTTACT	2	12	36053	36064	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017263	TTATGT	2	12	36110	36121	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017263	TTTTGC	2	12	41419	41430	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384412665
19	NC_017263	GGTTAT	2	12	43512	43523	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017263	AATTGA	2	12	44545	44556	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017263	TGAATG	2	12	46374	46385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384412669
22	NC_017263	AGGCAC	2	12	47354	47365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384412671
23	NC_017263	AAGATT	2	12	49109	49120	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384412672
24	NC_017263	CCGGTT	2	12	53725	53736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017263	CCAATC	2	12	53749	53760	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017263	TTTCCA	2	12	57266	57277	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384412680
27	NC_017263	TGGAAA	2	12	58416	58427	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384412682
28	NC_017263	CAATTG	2	12	59495	59506	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384412683

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.