MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis ATCC 10988 chromosome

Total Repeats: 115

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017262	TCCGAA	2	12	8810	8821	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017262	GCGAAA	2	12	17289	17300	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017262	TAATTT	2	12	36918	36929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017262	TGAAAA	2	12	44571	44582	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017262	ACCGCA	2	12	55747	55758	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017262	TGACAA	2	12	60577	60588	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017262	ATTCTT	2	12	82956	82967	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017262	GACATC	2	12	83468	83479	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017262	TTTTTC	2	12	93801	93812	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017262	AAAATT	2	12	93823	93834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017262	TTTCCG	2	12	101298	101309	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017262	AAAAAC	2	12	137482	137493	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017262	GCATCC	2	12	153687	153698	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017262	TTTTCT	2	12	184034	184045	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017262	CTTGGC	2	12	193888	193899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017262	CAAAAA	2	12	194053	194064	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017262	CTCTAT	2	12	262678	262689	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017262	AGAAAT	2	12	263770	263781	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017262	AGAGAA	2	12	296215	296226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017262	GATAAA	2	12	300019	300030	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017262	TAAGGC	2	12	346287	346298	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017262	ATCTAT	2	12	359956	359967	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017262	AAAAAT	2	12	417428	417439	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017262	TATCGC	2	12	432700	432711	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017262	GACAAA	2	12	441953	441964	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017262	AAAATT	2	12	475736	475747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017262	TCCCAT	2	12	513371	513382	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017262	TATTTT	2	12	515857	515868	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017262	AAAGAT	2	12	547983	547994	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017262	ATCAAT	2	12	574710	574721	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017262	ATGCTT	2	12	632878	632889	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017262	TTGTCT	2	12	661368	661379	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017262	AGATAT	2	12	701396	701407	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017262	GATCTA	2	12	730607	730618	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017262	ATGTCT	2	12	732088	732099	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017262	TTAAAA	2	12	749171	749182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017262	ATAAAA	2	12	749464	749475	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017262	ATTTTT	2	12	749515	749526	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017262	AGAAAA	2	12	760605	760616	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017262	AAAGGA	2	12	788174	788185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017262	AAAAAG	2	12	798229	798240	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017262	ATAAAA	2	12	802293	802304	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017262	CCGCCC	2	12	814426	814437	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
44	NC_017262	TAAAAA	2	12	842370	842381	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017262	CAAAAA	2	12	853805	853816	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017262	TAAAAA	2	12	858326	858337	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017262	AGAGCA	2	12	881350	881361	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017262	GGCAAA	2	12	892589	892600	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017262	AAAAGA	2	12	904820	904831	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017262	TTTGAA	2	12	930482	930493	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017262	GTCACT	2	12	932585	932596	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017262	GCGATT	2	12	941617	941628	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017262	CTGCTT	2	12	945419	945430	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017262	ACAGTT	2	12	965041	965052	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017262	ATTTTT	2	12	1069328	1069339	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017262	AATATA	4	24	1081999	1082022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017262	TTCCTA	2	12	1083572	1083583	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017262	ATTTTT	2	12	1127367	1127378	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017262	CAAAAG	2	12	1154517	1154528	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017262	CTTTTT	2	12	1159214	1159225	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017262	CAATTT	2	12	1162857	1162868	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017262	TTTTAA	2	12	1181203	1181214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017262	CTGTTC	2	12	1200618	1200629	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017262	TGTTTT	2	12	1231672	1231683	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017262	AAAGCG	2	12	1231734	1231745	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017262	ATTTTT	2	12	1261377	1261388	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017262	ATAAAA	2	12	1267555	1267566	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017262	TGATTT	2	12	1273345	1273356	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017262	GATCGT	2	12	1304497	1304508	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017262	GGCAAA	2	12	1320718	1320729	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017262	AATAAA	2	12	1327556	1327567	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017262	TAAAAA	2	12	1354304	1354315	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017262	TAAAAA	2	12	1380536	1380547	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017262	AATTAA	2	12	1380551	1380562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017262	TAAAAA	2	12	1380613	1380624	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017262	ATTTAT	2	12	1390893	1390904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017262	TTATGT	2	12	1408093	1408104	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017262	AAATTT	2	12	1408396	1408407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017262	AGGCTC	2	12	1432018	1432029	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017262	TTTTAA	2	12	1451156	1451167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017262	CTGTTT	2	12	1489525	1489536	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017262	TATTGA	2	12	1508683	1508694	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017262	AGATAA	2	12	1511578	1511589	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017262	TCGGTA	2	12	1538951	1538962	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017262	TAAATA	2	12	1541749	1541760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017262	TATATT	2	12	1542148	1542159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017262	TTTCCT	2	12	1556805	1556816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017262	GACAGT	2	12	1576139	1576150	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_017262	ATTCTT	2	12	1592911	1592922	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_017262	CTCTTT	2	12	1605236	1605247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017262	GAAAAG	2	12	1609182	1609193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017262	ATTTGT	2	12	1625379	1625390	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017262	GAATAA	2	12	1627201	1627212	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017262	AAATCG	2	12	1633919	1633930	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_017262	TTCTTT	2	12	1643945	1643956	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_017262	GCTTTT	2	12	1656449	1656460	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_017262	TAAAAA	2	12	1671771	1671782	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017262	ATTTTT	2	12	1709450	1709461	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017262	CAATAA	2	12	1727842	1727853	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_017262	TTTAAT	2	12	1727985	1727996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017262	CTTTTC	2	12	1744266	1744277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017262	ATTTTT	2	12	1756387	1756398	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017262	TTTTAT	2	12	1761688	1761699	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017262	AAACAA	2	12	1766804	1766815	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_017262	CAAAAA	2	12	1815479	1815490	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_017262	ATTTTT	2	12	1822352	1822363	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017262	GTGATT	2	12	1840802	1840813	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017262	ATCAAA	2	12	1876466	1876477	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_017262	ATTGAT	2	12	1881415	1881426	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017262	TATTTT	2	12	1882167	1882178	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017262	TAATTT	2	12	1905452	1905463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017262	ATGATA	2	12	1971924	1971935	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017262	ATAAGT	2	12	1975391	1975402	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017262	GAAAAA	2	12	1984366	1984377	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017262	TAAAAA	2	12	2016672	2016683	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.