MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis ATCC 10988 chromosome

Total Repeats: 1426

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017262	GCAAA	2	10	213	222	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017262	GCTTG	2	10	428	437	0 %	40 %	40 %	20 %	384410944
3	NC_017262	GCAAG	2	10	2473	2482	40 %	0 %	40 %	20 %	384410945
4	NC_017262	CTTTT	2	10	2710	2719	0 %	80 %	0 %	20 %	384410945
5	NC_017262	TATTT	2	10	3860	3869	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017262	ACAAA	2	10	3898	3907	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017262	GGTCT	2	10	4719	4728	0 %	40 %	40 %	20 %	384410946
8	NC_017262	CGTCG	2	10	5154	5163	0 %	20 %	40 %	40 %	384410946
9	NC_017262	GGCAA	2	10	5906	5915	40 %	0 %	40 %	20 %	384410947
10	NC_017262	GCTAT	2	10	9369	9378	20 %	40 %	20 %	20 %	384410951
11	NC_017262	TTGAT	2	10	10361	10370	20 %	60 %	20 %	0 %	384410952
12	NC_017262	TTATT	2	10	11227	11236	20 %	80 %	0 %	0 %	384410953
13	NC_017262	GAAAT	2	10	11312	11321	60 %	20 %	20 %	0 %	384410953
14	NC_017262	AGCAT	2	10	13923	13932	40 %	20 %	20 %	20 %	384410954
15	NC_017262	CGGCG	2	10	13968	13977	0 %	0 %	60 %	40 %	384410954
16	NC_017262	CTTTC	2	10	18213	18222	0 %	60 %	0 %	40 %	384410957
17	NC_017262	ATAAA	2	10	18904	18913	80 %	20 %	0 %	0 %	384410957
18	NC_017262	CCATG	2	10	19416	19425	20 %	20 %	20 %	40 %	384410958
19	NC_017262	TCGGC	2	10	21886	21895	0 %	20 %	40 %	40 %	384410961
20	NC_017262	TGTCG	2	10	22451	22460	0 %	40 %	40 %	20 %	384410962
21	NC_017262	TTCTC	2	10	23701	23710	0 %	60 %	0 %	40 %	384410963
22	NC_017262	GAACC	2	10	24083	24092	40 %	0 %	20 %	40 %	384410963
23	NC_017262	ACTGA	2	10	24624	24633	40 %	20 %	20 %	20 %	384410963
24	NC_017262	TGACG	2	10	26585	26594	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017262	CGCCA	2	10	27040	27049	20 %	0 %	20 %	60 %	384410964
26	NC_017262	GATCA	2	10	27888	27897	40 %	20 %	20 %	20 %	384410965
27	NC_017262	CCAAT	2	10	29148	29157	40 %	20 %	0 %	40 %	384410967
28	NC_017262	TCCCA	2	10	30009	30018	20 %	20 %	0 %	60 %	384410968
29	NC_017262	TTTCA	2	10	30201	30210	20 %	60 %	0 %	20 %	384410969
30	NC_017262	GATCC	2	10	31987	31996	20 %	20 %	20 %	40 %	384410970
31	NC_017262	AAAGC	2	10	33278	33287	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017262	TGATC	2	10	34102	34111	20 %	40 %	20 %	20 %	384410972
33	NC_017262	CTTTG	2	10	37299	37308	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017262	GCAAA	2	10	38069	38078	60 %	0 %	20 %	20 %	384410975
35	NC_017262	CTTGG	2	10	38315	38324	0 %	40 %	40 %	20 %	384410976
36	NC_017262	AACAC	2	10	39717	39726	60 %	0 %	0 %	40 %	384410977
37	NC_017262	CATCG	2	10	41751	41760	20 %	20 %	20 %	40 %	384410979
38	NC_017262	GACAT	2	10	43384	43393	40 %	20 %	20 %	20 %	384410981
39	NC_017262	AGAAA	2	10	43857	43866	80 %	0 %	20 %	0 %	384410981
40	NC_017262	GATAT	2	10	43875	43884	40 %	40 %	20 %	0 %	384410981
41	NC_017262	CAAAG	2	10	44262	44271	60 %	0 %	20 %	20 %	384410981
42	NC_017262	ATTCC	2	10	45643	45652	20 %	40 %	0 %	40 %	384410982
43	NC_017262	TATTT	2	10	49174	49183	20 %	80 %	0 %	0 %	384410984
44	NC_017262	TGTTC	2	10	52823	52832	0 %	60 %	20 %	20 %	384410988
45	NC_017262	ACTTT	2	10	53291	53300	20 %	60 %	0 %	20 %	384410989
46	NC_017262	TGCTT	2	10	55280	55289	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017262	TATCA	2	10	56856	56865	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017262	GAAAA	2	10	57259	57268	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017262	ACCCC	2	10	57297	57306	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
50	NC_017262	TAAAA	2	10	57374	57383	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017262	CTAAG	2	10	58779	58788	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_017262	TATAT	2	10	61248	61257	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017262	TGGCA	2	10	63673	63682	20 %	20 %	40 %	20 %	384410997
54	NC_017262	TCAGG	2	10	65689	65698	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017262	CTTTC	2	10	70016	70025	0 %	60 %	0 %	40 %	384411002
56	NC_017262	CCAGA	2	10	71712	71721	40 %	0 %	20 %	40 %	384411003
57	NC_017262	AGTGA	2	10	72680	72689	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017262	GTCTT	2	10	73049	73058	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_017262	AAGCG	2	10	75283	75292	40 %	0 %	40 %	20 %	384411006
60	NC_017262	CACAG	2	10	76519	76528	40 %	0 %	20 %	40 %	384411008
61	NC_017262	GCCGC	2	10	78434	78443	0 %	0 %	40 %	60 %	384411009
62	NC_017262	CAGGG	2	10	79463	79472	20 %	0 %	60 %	20 %	384411010
63	NC_017262	GCTTT	2	10	83597	83606	0 %	60 %	20 %	20 %	384411014
64	NC_017262	ATGGC	2	10	83739	83748	20 %	20 %	40 %	20 %	384411014
65	NC_017262	CTGAC	2	10	92154	92163	20 %	20 %	20 %	40 %	384411022
66	NC_017262	CTCAA	2	10	92638	92647	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_017262	AATCC	2	10	92875	92884	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_017262	TTTAA	2	10	93852	93861	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017262	TGAAA	2	10	97681	97690	60 %	20 %	20 %	0 %	384411027
70	NC_017262	TATCT	2	10	99139	99148	20 %	60 %	0 %	20 %	384411030
71	NC_017262	GTCAG	2	10	101376	101385	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017262	CTGAA	2	10	104889	104898	40 %	20 %	20 %	20 %	384411036
73	NC_017262	TTGAG	2	10	106834	106843	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017262	CAGGT	2	10	107315	107324	20 %	20 %	40 %	20 %	384411038
75	NC_017262	AAGGT	2	10	108993	109002	40 %	20 %	40 %	0 %	384411039
76	NC_017262	TCTAT	2	10	114505	114514	20 %	60 %	0 %	20 %	384411043
77	NC_017262	CCATT	2	10	115206	115215	20 %	40 %	0 %	40 %	384411044
78	NC_017262	GAGGG	2	10	115414	115423	20 %	0 %	80 %	0 %	384411044
79	NC_017262	ATTGA	2	10	115910	115919	40 %	40 %	20 %	0 %	384411044
80	NC_017262	GAGGG	2	10	117895	117904	20 %	0 %	80 %	0 %	384411046
81	NC_017262	GCCGT	2	10	121982	121991	0 %	20 %	40 %	40 %	384411051
82	NC_017262	TCAGT	2	10	122036	122045	20 %	40 %	20 %	20 %	384411051
83	NC_017262	ACCTT	2	10	122852	122861	20 %	40 %	0 %	40 %	384411052
84	NC_017262	GGGCA	2	10	123913	123922	20 %	0 %	60 %	20 %	384411054
85	NC_017262	ATTGA	2	10	125495	125504	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017262	TATTT	2	10	125957	125966	20 %	80 %	0 %	0 %	384411056
87	NC_017262	CTCGG	2	10	126608	126617	0 %	20 %	40 %	40 %	384411057
88	NC_017262	GCTTT	2	10	127412	127421	0 %	60 %	20 %	20 %	384411057
89	NC_017262	AGGGC	2	10	130487	130496	20 %	0 %	60 %	20 %	384411060
90	NC_017262	ATCAA	2	10	130538	130547	60 %	20 %	0 %	20 %	384411060
91	NC_017262	GGCGG	2	10	130761	130770	0 %	0 %	80 %	20 %	384411060
92	NC_017262	ATGGA	2	10	131726	131735	40 %	20 %	40 %	0 %	384411061
93	NC_017262	AAAGG	2	10	132744	132753	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017262	GGCAT	2	10	133452	133461	20 %	20 %	40 %	20 %	384411062
95	NC_017262	ATATT	2	10	134445	134454	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017262	CAGCC	2	10	135248	135257	20 %	0 %	20 %	60 %	384411063
97	NC_017262	CTATC	2	10	136601	136610	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
98	NC_017262	CGCAG	2	10	137972	137981	20 %	0 %	40 %	40 %	384411064
99	NC_017262	TCTGC	2	10	138387	138396	0 %	40 %	20 %	40 %	384411064
100	NC_017262	ATGAT	2	10	138557	138566	40 %	40 %	20 %	0 %	384411065
101	NC_017262	AATAA	2	10	139700	139709	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017262	TAAAA	2	10	143883	143892	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017262	TGCCA	2	10	144799	144808	20 %	20 %	20 %	40 %	384411071
104	NC_017262	AGGGC	2	10	145834	145843	20 %	0 %	60 %	20 %	384411072
105	NC_017262	ACCGA	2	10	149114	149123	40 %	0 %	20 %	40 %	384411075
106	NC_017262	AAACC	2	10	150544	150553	60 %	0 %	0 %	40 %	384411076
107	NC_017262	ATTTT	2	10	155112	155121	20 %	80 %	0 %	0 %	384411079
108	NC_017262	ACTTT	2	10	155342	155351	20 %	60 %	0 %	20 %	384411079
109	NC_017262	ATGTT	2	10	158885	158894	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017262	CCAAG	2	10	159511	159520	40 %	0 %	20 %	40 %	384411082
111	NC_017262	CGGCT	2	10	160296	160305	0 %	20 %	40 %	40 %	384411083
112	NC_017262	AAGAT	2	10	160468	160477	60 %	20 %	20 %	0 %	384411083
113	NC_017262	TAGCA	2	10	162107	162116	40 %	20 %	20 %	20 %	384411084
114	NC_017262	TTCCT	2	10	162640	162649	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_017262	CTGCA	2	10	164363	164372	20 %	20 %	20 %	40 %	384411085
116	NC_017262	TTTCT	2	10	168360	168369	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_017262	GATCA	2	10	168663	168672	40 %	20 %	20 %	20 %	384411089
118	NC_017262	GTTGC	2	10	170745	170754	0 %	40 %	40 %	20 %	384411090
119	NC_017262	GGTTC	2	10	171026	171035	0 %	40 %	40 %	20 %	384411090
120	NC_017262	TGATC	2	10	172759	172768	20 %	40 %	20 %	20 %	384411093
121	NC_017262	GCAGG	2	10	175897	175906	20 %	0 %	60 %	20 %	384411094
122	NC_017262	AAATC	2	10	176562	176571	60 %	20 %	0 %	20 %	384411095
123	NC_017262	TGAAC	2	10	178061	178070	40 %	20 %	20 %	20 %	384411095
124	NC_017262	AGGGG	2	10	178322	178331	20 %	0 %	80 %	0 %	384411095
125	NC_017262	TGGTT	2	10	178805	178814	0 %	60 %	40 %	0 %	384411095
126	NC_017262	ATGAA	2	10	179488	179497	60 %	20 %	20 %	0 %	384411095
127	NC_017262	GCAAG	2	10	181016	181025	40 %	0 %	40 %	20 %	384411096
128	NC_017262	ATCAG	2	10	181680	181689	40 %	20 %	20 %	20 %	384411097
129	NC_017262	GCCAA	2	10	182162	182171	40 %	0 %	20 %	40 %	384411097
130	NC_017262	GATGA	2	10	182491	182500	40 %	20 %	40 %	0 %	384411097
131	NC_017262	AATCT	2	10	187338	187347	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_017262	GGGCG	2	10	188647	188656	0 %	0 %	80 %	20 %	384411103
133	NC_017262	CATAT	2	10	189256	189265	40 %	40 %	0 %	20 %	384411104
134	NC_017262	ATGGT	2	10	191661	191670	20 %	40 %	40 %	0 %	384411106
135	NC_017262	CGAAA	2	10	191896	191905	60 %	0 %	20 %	20 %	384411106
136	NC_017262	CAAGC	2	10	192125	192134	40 %	0 %	20 %	40 %	384411106
137	NC_017262	AAAGA	2	10	192922	192931	80 %	0 %	20 %	0 %	384411107
138	NC_017262	TTGTT	2	10	194118	194127	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017262	TGCGA	2	10	195092	195101	20 %	20 %	40 %	20 %	384411110
140	NC_017262	GGGTC	2	10	196747	196756	0 %	20 %	60 %	20 %	384411112
141	NC_017262	TGAAA	2	10	196825	196834	60 %	20 %	20 %	0 %	384411112
142	NC_017262	GAAAA	2	10	197524	197533	80 %	0 %	20 %	0 %	384411113
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145	NC_017262	GGGGT	2	10	201364	201373	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017262	AGGGC	2	10	202256	202265	20 %	0 %	60 %	20 %	384411118
147	NC_017262	TTGGC	2	10	207774	207783	0 %	40 %	40 %	20 %	384411123
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150	NC_017262	GGAAT	2	10	212177	212186	40 %	20 %	40 %	0 %	384411126
151	NC_017262	AGATC	2	10	212394	212403	40 %	20 %	20 %	20 %	384411126
152	NC_017262	TTTTA	2	10	214484	214493	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017262	CATGA	2	10	215219	215228	40 %	20 %	20 %	20 %	384411129
154	NC_017262	GGGTG	2	10	215503	215512	0 %	20 %	80 %	0 %	384411129
155	NC_017262	ATTGA	2	10	216083	216092	40 %	40 %	20 %	0 %	384411129
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158	NC_017262	CACGA	2	10	219168	219177	40 %	0 %	20 %	40 %	384411132
159	NC_017262	CCGAT	2	10	219501	219510	20 %	20 %	20 %	40 %	384411133
160	NC_017262	TGATT	2	10	220583	220592	20 %	60 %	20 %	0 %	384411134
161	NC_017262	TTGAG	2	10	221003	221012	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017262	CAGGT	2	10	221484	221493	20 %	20 %	40 %	20 %	384411135
163	NC_017262	GGTCT	2	10	221831	221840	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
164	NC_017262	CTGTC	2	10	224808	224817	0 %	40 %	20 %	40 %	384411139
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166	NC_017262	TCTAG	2	10	229842	229851	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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201	NC_017262	CATTA	2	10	286877	286886	40 %	40 %	0 %	20 %	384411184
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209	NC_017262	GCCCT	2	10	294827	294836	0 %	20 %	20 %	60 %	384411195
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215	NC_017262	TACCA	2	10	314897	314906	40 %	20 %	0 %	40 %	384411212
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237	NC_017262	GGATT	2	10	348124	348133	20 %	40 %	40 %	0 %	384411241
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249	NC_017262	TAAAA	2	10	364075	364084	80 %	20 %	0 %	0 %	384411255
250	NC_017262	CAATT	2	10	364331	364340	40 %	40 %	0 %	20 %	384411256
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258	NC_017262	CTGTC	2	10	376334	376343	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
259	NC_017262	TAGCC	2	10	376965	376974	20 %	20 %	20 %	40 %	384411265
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262	NC_017262	TGAAG	2	10	379806	379815	40 %	20 %	40 %	0 %	384411267
263	NC_017262	AGGTA	2	10	384448	384457	40 %	20 %	40 %	0 %	384411271
264	NC_017262	CCGAA	2	10	386317	386326	40 %	0 %	20 %	40 %	384411273
265	NC_017262	ATGCC	2	10	394459	394468	20 %	20 %	20 %	40 %	384411280
266	NC_017262	ATGCA	2	10	395384	395393	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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395	NC_017262	TTTAA	2	10	554102	554111	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
396	NC_017262	AAATG	2	10	554339	554348	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
397	NC_017262	GGCGC	2	10	558006	558015	0 %	0 %	60 %	40 %	384411413
398	NC_017262	GATGC	2	10	562245	562254	20 %	20 %	40 %	20 %	384411417
399	NC_017262	GGCAT	2	10	562733	562742	20 %	20 %	40 %	20 %	384411417
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401	NC_017262	ATCCT	2	10	571233	571242	20 %	40 %	0 %	40 %	384411423
402	NC_017262	TAGGA	2	10	573468	573477	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
403	NC_017262	ATGTT	2	10	574473	574482	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
404	NC_017262	GTAAA	2	10	574638	574647	60 %	20 %	20 %	0 %	384411426
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406	NC_017262	ATCGG	2	10	577286	577295	20 %	20 %	40 %	20 %	384411428
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434	NC_017262	TTTTA	2	10	626569	626578	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_017262	CATTT	2	10	720523	720532	20 %	60 %	0 %	20 %	384411544

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