MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis ATCC 10988 chromosome

Total Repeats: 333

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017262	GCAAA	2	10	213	222	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017262	TATTT	2	10	3860	3869	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017262	ACAAA	2	10	3898	3907	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017262	TGACG	2	10	26585	26594	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017262	AAAGC	2	10	33278	33287	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017262	CTTTG	2	10	37299	37308	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017262	TGCTT	2	10	55280	55289	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017262	TATCA	2	10	56856	56865	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017262	GAAAA	2	10	57259	57268	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017262	ACCCC	2	10	57297	57306	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
11	NC_017262	TAAAA	2	10	57374	57383	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017262	CTAAG	2	10	58779	58788	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017262	TATAT	2	10	61248	61257	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017262	TCAGG	2	10	65689	65698	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017262	AGTGA	2	10	72680	72689	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017262	GTCTT	2	10	73049	73058	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017262	CTCAA	2	10	92638	92647	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_017262	AATCC	2	10	92875	92884	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_017262	TTTAA	2	10	93852	93861	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017262	GTCAG	2	10	101376	101385	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017262	TTGAG	2	10	106834	106843	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017262	ATTGA	2	10	125495	125504	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017262	AAAGG	2	10	132744	132753	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017262	ATATT	2	10	134445	134454	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017262	CTATC	2	10	136601	136610	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_017262	AATAA	2	10	139700	139709	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017262	TAAAA	2	10	143883	143892	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017262	ATGTT	2	10	158885	158894	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017262	TTCCT	2	10	162640	162649	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_017262	TTTCT	2	10	168360	168369	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017262	AATCT	2	10	187338	187347	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017262	TTGTT	2	10	194118	194127	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017262	GGGGT	2	10	201364	201373	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017262	TTTTA	2	10	214484	214493	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017262	GATAG	2	10	218724	218733	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017262	TTGAG	2	10	221003	221012	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017262	GGTCT	2	10	221831	221840	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017262	TCCAA	2	10	229813	229822	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_017262	TCTAG	2	10	229842	229851	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017262	AAAGG	2	10	231536	231545	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017262	GAAAA	2	10	286026	286035	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017262	AAAAC	2	10	294624	294633	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017262	TTATC	2	10	311320	311329	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_017262	AAAAT	2	10	311918	311927	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017262	TAAAA	2	10	318170	318179	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017262	ATTTT	2	10	318180	318189	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017262	ACCCT	2	10	333769	333778	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
48	NC_017262	AAGAA	2	10	336115	336124	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017262	TTTAA	2	10	346191	346200	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017262	TTCAT	2	10	360660	360669	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_017262	CTGTC	2	10	376334	376343	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_017262	ATGCA	2	10	395384	395393	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017262	GCCCT	2	10	398968	398977	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
54	NC_017262	TTTTC	2	10	410146	410155	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017262	ATTAT	2	10	414953	414962	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017262	AAGGG	2	10	416421	416430	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017262	AATAG	2	10	417472	417481	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017262	AAAAC	2	10	420273	420282	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_017262	TCCAA	2	10	433718	433727	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
60	NC_017262	TCCAA	2	10	433859	433868	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_017262	ATCCA	2	10	434131	434140	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_017262	AGTTT	2	10	437874	437883	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017262	TTATT	2	10	452293	452302	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017262	CTCAT	2	10	459420	459429	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_017262	ATGTT	2	10	459504	459513	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017262	TTTAA	2	10	474190	474199	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017262	ATATC	2	10	474258	474267	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017262	TTTAA	2	10	482438	482447	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017262	TTTTA	2	10	496629	496638	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017262	TTGTT	2	10	510672	510681	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017262	TAAAA	2	10	510974	510983	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017262	TGATT	2	10	511102	511111	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017262	CATCT	2	10	511328	511337	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_017262	CCTTA	2	10	513314	513323	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
75	NC_017262	GAAAA	2	10	547100	547109	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017262	AAACT	2	10	548188	548197	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017262	TTTAA	2	10	554102	554111	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017262	AAATG	2	10	554339	554348	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017262	TAGGA	2	10	573468	573477	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017262	ATGTT	2	10	574473	574482	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017262	GATAT	2	10	574748	574757	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017262	CGATA	2	10	579876	579885	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_017262	ATATT	2	10	583562	583571	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017262	GAACC	2	10	590500	590509	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_017262	ATAAA	2	10	623288	623297	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017262	TTTTA	2	10	626569	626578	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017262	AAAAG	2	10	626645	626654	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017262	TTCAT	2	10	628893	628902	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017262	CATGA	2	10	640496	640505	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017262	TAAAA	2	10	640621	640630	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017262	GAAAA	2	10	641535	641544	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017262	ACCGC	2	10	650954	650963	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
93	NC_017262	ATAAA	2	10	661421	661430	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017262	AAGGA	2	10	681062	681071	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017262	CTTTT	2	10	684841	684850	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017262	AAATA	2	10	709518	709527	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017262	ATTCT	2	10	729695	729704	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_017262	TTGAG	2	10	732291	732300	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017262	AAGAA	2	10	734442	734451	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017262	TAAAA	2	10	735337	735346	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017262	TTATT	2	10	748762	748771	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017262	AAAAT	2	10	749099	749108	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017262	AGAAT	2	10	749300	749309	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017262	CATTT	2	10	749529	749538	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_017262	TTTTC	2	10	749615	749624	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017262	TAAAA	2	10	768442	768451	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017262	ATTTT	2	10	772359	772368	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017262	AAATA	2	10	772428	772437	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017262	TTATC	2	10	774589	774598	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_017262	TAAAA	2	10	779115	779124	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017262	GAACA	2	10	786111	786120	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_017262	TATAA	2	10	797090	797099	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017262	AAAAG	2	10	797142	797151	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017262	ATCCG	2	10	812993	813002	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_017262	ATCCT	2	10	814503	814512	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_017262	GCCCA	2	10	814538	814547	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
117	NC_017262	GCCCA	2	10	815349	815358	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
118	NC_017262	GCCCA	2	10	817133	817142	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
119	NC_017262	GATAA	2	10	822089	822098	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017262	TTCAA	2	10	823117	823126	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_017262	CTTGT	2	10	830218	830227	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017262	ATTAT	2	10	842008	842017	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017262	ATAAA	2	10	842496	842505	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017262	AACAT	2	10	842555	842564	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_017262	TTTTA	2	10	858262	858271	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017262	AATGT	2	10	862157	862166	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017262	TTATT	2	10	866939	866948	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017262	TATCC	2	10	885738	885747	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
129	NC_017262	CAAGC	2	10	893575	893584	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
130	NC_017262	AAATT	2	10	901549	901558	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017262	GCCTT	2	10	909700	909709	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
132	NC_017262	TCCAA	2	10	912412	912421	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
133	NC_017262	AGGCT	2	10	912465	912474	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017262	CTCAA	2	10	913287	913296	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
135	NC_017262	ATTTT	2	10	917149	917158	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017262	TTTTA	2	10	917963	917972	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017262	TATGA	2	10	918428	918437	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017262	ATATT	2	10	918452	918461	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017262	TCAGC	2	10	921319	921328	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
140	NC_017262	AAAAT	2	10	932824	932833	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017262	TTTAT	2	10	934292	934301	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017262	CATCC	2	10	934350	934359	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
143	NC_017262	ATATT	2	10	960767	960776	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017262	GTTCT	2	10	965387	965396	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_017262	AGTAG	2	10	966520	966529	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017262	CTCAA	2	10	974854	974863	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
147	NC_017262	CTATT	2	10	978355	978364	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_017262	ATTTT	2	10	1000949	1000958	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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330	NC_017262	AATCG	2	10	2015211	2015220	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
331	NC_017262	AAAAT	2	10	2016613	2016622	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
332	NC_017262	TTTTC	2	10	2020961	2020970	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
333	NC_017262	AAAAG	2	10	2021023	2021032	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.