MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. Ua (Uroleucon ambrosiae) plasmid pLeu

Total Repeats: 86

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017261	CTA	2	6	431	436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228028
2	NC_017261	GAA	2	6	443	448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228028
3	NC_017261	CTT	2	6	461	466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228028
4	NC_017261	TCT	2	6	498	503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228028
5	NC_017261	TTG	2	6	642	647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384228028
6	NC_017261	TTA	2	6	659	664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228028
7	NC_017261	TAA	2	6	713	718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228028
8	NC_017261	TCA	2	6	862	867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228028
9	NC_017261	GAA	2	6	901	906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228028
10	NC_017261	TCT	2	6	972	977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228028
11	NC_017261	TTA	2	6	1102	1107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228028
12	NC_017261	AGG	2	6	1113	1118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384228028
13	NC_017261	TAT	2	6	1496	1501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228029
14	NC_017261	CAA	2	6	1519	1524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384228029
15	NC_017261	TTG	2	6	1547	1552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384228029
16	NC_017261	GTT	2	6	1579	1584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384228029
17	NC_017261	TAG	2	6	1607	1612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228029
18	NC_017261	CAT	2	6	1742	1747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228029
19	NC_017261	TAG	2	6	1751	1756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228029
20	NC_017261	TCT	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228029
21	NC_017261	ATA	2	6	1811	1816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228029
22	NC_017261	TAT	2	6	2307	2312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228030
23	NC_017261	ATA	2	6	2476	2481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228030
24	NC_017261	ATA	2	6	2484	2489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228030
25	NC_017261	ATT	2	6	2566	2571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228030
26	NC_017261	AGA	2	6	2606	2611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228030
27	NC_017261	TAA	2	6	2698	2703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228030
28	NC_017261	ATT	2	6	2704	2709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228030
29	NC_017261	TTA	2	6	2961	2966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228031
30	NC_017261	TAG	2	6	3148	3153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228031
31	NC_017261	TGA	2	6	3346	3351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228031
32	NC_017261	TTG	2	6	3408	3413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384228031
33	NC_017261	CTA	2	6	3537	3542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228031
34	NC_017261	ATG	2	6	3558	3563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228031
35	NC_017261	AGA	2	6	3670	3675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228031
36	NC_017261	AGA	2	6	3700	3705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228031
37	NC_017261	TAG	2	6	3766	3771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228031
38	NC_017261	TAG	2	6	3807	3812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228031
39	NC_017261	GTA	2	6	3813	3818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228031
40	NC_017261	TTC	2	6	3832	3837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228031
41	NC_017261	TCA	2	6	3844	3849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228031
42	NC_017261	ATT	2	6	3884	3889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228031
43	NC_017261	AGC	2	6	3949	3954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384228031
44	NC_017261	TGA	2	6	4006	4011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228031
45	NC_017261	TAA	2	6	4090	4095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228031
46	NC_017261	ACA	2	6	4096	4101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384228031
47	NC_017261	TAA	2	6	4153	4158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228031
48	NC_017261	ATT	2	6	4180	4185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228031
49	NC_017261	CTA	3	9	4215	4223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228031
50	NC_017261	TAG	2	6	4350	4355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228031
51	NC_017261	ATA	2	6	4440	4445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228031
52	NC_017261	TAA	2	6	4465	4470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228031
53	NC_017261	AAT	2	6	4494	4499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228031
54	NC_017261	TAC	2	6	4571	4576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228032
55	NC_017261	TGC	2	6	4686	4691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384228032
56	NC_017261	AAG	2	6	4700	4705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228032
57	NC_017261	ATC	2	6	4790	4795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228032
58	NC_017261	CTT	2	6	4823	4828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228032
59	NC_017261	TAT	2	6	5044	5049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228032
60	NC_017261	ATT	2	6	5242	5247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228032
61	NC_017261	TGA	2	6	5307	5312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228032
62	NC_017261	ATA	3	9	5567	5575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228032
63	NC_017261	GTG	2	6	5627	5632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384228032
64	NC_017261	TGT	2	6	5680	5685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384228033
65	NC_017261	GTA	2	6	5775	5780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228033
66	NC_017261	CAA	2	6	5838	5843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384228033
67	NC_017261	ATC	2	6	6217	6222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228033
68	NC_017261	TTA	2	6	6261	6266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228033
69	NC_017261	ATT	2	6	6420	6425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228033
70	NC_017261	CAC	2	6	6495	6500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384228033
71	NC_017261	TGA	2	6	6541	6546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228033
72	NC_017261	TAA	2	6	6562	6567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228033
73	NC_017261	AGA	2	6	6697	6702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228033
74	NC_017261	GCT	2	6	6710	6715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384228033
75	NC_017261	TTG	2	6	6762	6767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384228033
76	NC_017261	GTT	2	6	6858	6863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384228033
77	NC_017261	CTA	2	6	6918	6923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228033
78	NC_017261	GCT	4	12	6992	7003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384228033
79	NC_017261	AAT	2	6	7049	7054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228033
80	NC_017261	GTT	3	9	7087	7095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384228034
81	NC_017261	ATT	3	9	7126	7134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228034
82	NC_017261	TTA	2	6	7276	7281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228034
83	NC_017261	TCA	2	6	7306	7311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228034
84	NC_017261	CTT	2	6	7411	7416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228034
85	NC_017261	ATA	2	6	7586	7591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228034
86	NC_017261	TAA	2	6	7680	7685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228034

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.