MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Buchnera aphidicola str. Ua (Uroleucon ambrosiae) chromosome

Total Repeats: 399

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017259	TAAAAA	2	12	85	96	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017259	ATATTA	2	12	2720	2731	50 %	50 %	0 %	0 %	384228037
3	NC_017259	TTTTAT	2	12	3042	3053	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384228037
4	NC_017259	GGTTTA	2	12	3347	3358	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384228038
5	NC_017259	TAGCAT	2	12	4177	4188	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384228040
6	NC_017259	ATCGTA	2	12	8721	8732	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384228044
7	NC_017259	ATCATA	2	12	9579	9590	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384228045
8	NC_017259	CATCAG	2	12	9842	9853	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384228045
9	NC_017259	CTAATT	2	12	10946	10957	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384228045
10	NC_017259	TATATT	2	12	12229	12240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228046
11	NC_017259	TTAAAA	2	12	14981	14992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017259	TGATAT	2	12	15503	15514	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384228050
13	NC_017259	ATAAAA	2	12	18284	18295	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017259	TTTTTA	2	12	22519	22530	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384228057
15	NC_017259	ATTTTT	2	12	23088	23099	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017259	TGAAAT	2	12	23126	23137	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017259	AGATCA	2	12	25153	25164	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384228059
18	NC_017259	TTTTAA	2	12	25760	25771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228060
19	NC_017259	GTATCA	2	12	26856	26867	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384228060
20	NC_017259	TCCATA	2	12	28262	28273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228061
21	NC_017259	TATAAA	2	12	28714	28725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017259	TTTAGA	2	12	28884	28895	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384228062
23	NC_017259	TAAATA	2	12	30137	30148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017259	TATAAA	2	12	31807	31818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228063
25	NC_017259	ATAAAT	2	12	34667	34678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017259	AATATT	2	12	37326	37337	50 %	50 %	0 %	0 %	384228066
27	NC_017259	CATATA	2	12	40282	40293	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384228067
28	NC_017259	CTACTG	2	12	41847	41858	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384228067
29	NC_017259	TAATTT	2	12	43255	43266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228067
30	NC_017259	TAATCC	2	12	44315	44326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228068
31	NC_017259	GTTTTT	2	12	48406	48417	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384228074
32	NC_017259	TATTTA	2	12	48774	48785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228074
33	NC_017259	AATGCA	2	12	51921	51932	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384228076
34	NC_017259	AAATTA	2	12	53068	53079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228077
35	NC_017259	TATTTT	2	12	57494	57505	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384228081
36	NC_017259	TAAAAA	2	12	61316	61327	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384228084
37	NC_017259	ATTTTT	2	12	63602	63613	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017259	TAAAGA	2	12	63711	63722	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384228087
39	NC_017259	GATATT	2	12	64393	64404	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384228087
40	NC_017259	TAATTT	2	12	64683	64694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228087
41	NC_017259	CATGTG	2	12	66566	66577	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384228090
42	NC_017259	TTTTAT	2	12	66800	66811	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384228090
43	NC_017259	TTTCCT	2	12	69485	69496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228092
44	NC_017259	TTGTTT	2	12	69573	69584	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017259	TTAGAA	2	12	69863	69874	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384228093
46	NC_017259	AAAAAG	2	12	71037	71048	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384228093
47	NC_017259	TCTAAT	2	12	75405	75416	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384228096
48	NC_017259	ATTTTT	2	12	75848	75859	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384228096
49	NC_017259	ATTGAT	2	12	77457	77468	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384228098
50	NC_017259	TCATTA	2	12	78587	78598	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384228099
51	NC_017259	TAAAAA	2	12	79500	79511	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384228100
52	NC_017259	TTTTAA	2	12	79778	79789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228101
53	NC_017259	AATTTT	2	12	81430	81441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228102
54	NC_017259	ATTTTT	2	12	84699	84710	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384228107
55	NC_017259	TTTTTC	2	12	88231	88242	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384228110
56	NC_017259	TAAAAA	2	12	88932	88943	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384228111
57	NC_017259	TTAGTA	2	12	90113	90124	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384228111
58	NC_017259	TGATAT	2	12	90126	90137	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384228111
59	NC_017259	ATTTTT	2	12	90684	90695	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384228112
60	NC_017259	GGTATT	2	12	91688	91699	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384228113
61	NC_017259	CAGGAT	2	12	91974	91985	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384228113
62	NC_017259	GTTTTG	2	12	92838	92849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384228113
63	NC_017259	TGTTAT	2	12	92895	92906	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017259	TTAGAA	2	12	94996	95007	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384228115
65	NC_017259	ATTAAT	2	12	96327	96338	50 %	50 %	0 %	0 %	384228116
66	NC_017259	CAAAAT	2	12	96645	96656	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384228116
67	NC_017259	ATTTTT	2	12	97705	97716	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384228117
68	NC_017259	TTATAA	2	12	98753	98764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017259	ATTTTT	2	12	100191	100202	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017259	GAAGTA	2	12	101770	101781	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384228120
71	NC_017259	TAAAAA	2	12	106346	106357	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384228125
72	NC_017259	ATTTAA	2	12	108236	108247	50 %	50 %	0 %	0 %	384228127
73	NC_017259	ATTTAT	2	12	111071	111082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228130
74	NC_017259	ATCAAA	2	12	111762	111773	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384228130
75	NC_017259	AGTTTT	2	12	112769	112780	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384228131
76	NC_017259	ATTATG	2	12	112783	112794	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384228131
77	NC_017259	ATTTAT	2	12	113755	113766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017259	AAATAT	2	12	116423	116434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228134
79	NC_017259	ATAAAA	2	12	116635	116646	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384228134
80	NC_017259	AAATAA	2	12	117215	117226	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384228134
81	NC_017259	ATATTT	2	12	119676	119687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017259	TAAAAA	2	12	122569	122580	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384228139
83	NC_017259	AATATC	2	12	123357	123368	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384228139
84	NC_017259	TAATAT	2	12	124186	124197	50 %	50 %	0 %	0 %	384228139
85	NC_017259	AATGAT	2	12	124936	124947	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384228140
86	NC_017259	GTCAAA	2	12	125467	125478	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384228142
87	NC_017259	TTAAAT	2	12	125816	125827	50 %	50 %	0 %	0 %	384228143
88	NC_017259	AAATTA	2	12	125889	125900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228143
89	NC_017259	TTAATA	2	12	127422	127433	50 %	50 %	0 %	0 %	384228144
90	NC_017259	TTAATG	2	12	127485	127496	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384228144
91	NC_017259	ATAAAA	2	12	127734	127745	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384228144
92	NC_017259	AATTTA	2	12	130191	130202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017259	CTTGTT	2	12	131411	131422	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384228146
94	NC_017259	ATATTT	2	12	131717	131728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228147
95	NC_017259	CTTTTT	2	12	135680	135691	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384228150
96	NC_017259	GTTTAG	2	12	136295	136306	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384228150
97	NC_017259	TAAAGT	2	12	136699	136710	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384228151
98	NC_017259	AAATTA	2	12	136736	136747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228151
99	NC_017259	AATTTA	2	12	136858	136869	50 %	50 %	0 %	0 %	384228152
100	NC_017259	TAAACA	2	12	136902	136913	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384228152
101	NC_017259	CATCTA	2	12	142433	142444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228157
102	NC_017259	TTAATT	2	12	142667	142678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228157
103	NC_017259	CTTTTT	2	12	142754	142765	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384228157
104	NC_017259	TTATTT	2	12	146136	146147	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384228159
105	NC_017259	TATTTT	2	12	146488	146499	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384228159
106	NC_017259	TTCCTA	2	12	146667	146678	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384228159
107	NC_017259	TATGTT	2	12	147862	147873	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384228161
108	NC_017259	TTAATA	2	12	152547	152558	50 %	50 %	0 %	0 %	384228163
109	NC_017259	AATTTT	2	12	155957	155968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017259	CTTTTG	2	12	156361	156372	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384228166
111	NC_017259	GATTAA	2	12	157530	157541	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384228168
112	NC_017259	TTAAAT	2	12	159124	159135	50 %	50 %	0 %	0 %	384228169
113	NC_017259	TGCTAT	2	12	160570	160581	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384228170
114	NC_017259	ATTAAA	2	12	162569	162580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228171
115	NC_017259	TAAAAA	2	12	162685	162696	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384228171
116	NC_017259	TATTGA	2	12	163198	163209	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384228171
117	NC_017259	TAAAAA	2	12	165205	165216	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384228173
118	NC_017259	ATTTTT	2	12	166165	166176	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384228176
119	NC_017259	TAATCA	2	12	166285	166296	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384228176
120	NC_017259	AATTTT	2	12	168173	168184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228177
121	NC_017259	TTAATT	2	12	169035	169046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228177
122	NC_017259	ATTTTA	2	12	169559	169570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017259	TTTATC	2	12	170734	170745	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384228178
124	NC_017259	AAGATA	2	12	172217	172228	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384228179
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.