MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. Ua (Uroleucon ambrosiae) chromosome

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017259	TAAAAA	2	12	85	96	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017259	TTAAAA	2	12	14981	14992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017259	ATAAAA	2	12	18284	18295	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017259	ATTTTT	2	12	23088	23099	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017259	TGAAAT	2	12	23126	23137	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017259	TATAAA	2	12	28714	28725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017259	TAAATA	2	12	30137	30148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017259	ATAAAT	2	12	34667	34678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017259	ATTTTT	2	12	63602	63613	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017259	TTGTTT	2	12	69573	69584	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017259	TGTTAT	2	12	92895	92906	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017259	TTATAA	2	12	98753	98764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017259	ATTTTT	2	12	100191	100202	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017259	ATTTAT	2	12	113755	113766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017259	ATATTT	2	12	119676	119687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017259	AATTTA	2	12	130191	130202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017259	AATTTT	2	12	155957	155968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017259	ATTTTA	2	12	169559	169570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017259	TTTAAT	2	12	175114	175125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017259	ATAAAT	2	12	192754	192765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017259	AATTTT	2	12	203134	203145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017259	ATATTG	2	12	210121	210132	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017259	TTATAT	2	12	212102	212113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017259	AAAGAA	2	12	218341	218352	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017259	TATATT	2	12	276565	276576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017259	CATTAT	2	12	284169	284180	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017259	AATTTA	2	12	292711	292722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017259	TTAATA	2	12	292755	292766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017259	TATATT	2	12	294518	294529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017259	AATTAA	2	12	299168	299179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017259	TATTAA	2	12	304933	304944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017259	ATTTTT	2	12	311614	311625	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017259	TATATC	2	12	324212	324223	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017259	TTAAAA	2	12	338515	338526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017259	ATTAAA	2	12	343417	343428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017259	TTCATG	2	12	343479	343490	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017259	CAAACA	2	12	345807	345818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017259	ATTTAT	2	12	354322	354333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017259	ATATCA	2	12	354501	354512	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017259	AATATA	2	12	367167	367178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017259	ATTTAA	2	12	389764	389775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017259	AAACTT	2	12	391005	391016	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017259	AATATT	2	12	391053	391064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017259	ATAAAA	2	12	419200	419211	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017259	TACAAT	2	12	422148	422159	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017259	AATTAA	2	12	433277	433288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017259	AATCAA	2	12	448080	448091	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017259	AAAATT	2	12	448333	448344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017259	ATAAAA	2	12	485409	485420	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017259	TTTTAT	2	12	489440	489451	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017259	ATAATT	2	12	490257	490268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017259	CAAAAT	2	12	503249	503260	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017259	CAATTT	2	12	518737	518748	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017259	CATGTA	2	12	523185	523196	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017259	ATATAA	2	12	538789	538800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017259	ATTAAA	2	12	546356	546367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017259	TTTTAT	2	12	549850	549861	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017259	ATTAAT	2	12	549961	549972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017259	AATTTA	2	12	556532	556543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017259	TTTGAT	2	12	566031	566042	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017259	TCATAA	2	12	567309	567320	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017259	ATTACA	2	12	575022	575033	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017259	TTAAAA	2	12	580476	580487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017259	TATAAA	2	12	585064	585075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017259	ATATCT	2	12	593524	593535	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017259	TGTTTT	2	12	614574	614585	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.