MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Buchnera aphidicola str. Ak (Acyrthosiphon kondoi) plasmid pTrp

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017258	ATC	2	6	77	82	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384227453
2	NC_017258	ATC	2	6	96	101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384227453
3	NC_017258	TTA	2	6	106	111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384227453
4	NC_017258	CAG	2	6	119	124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384227453
5	NC_017258	TAA	2	6	129	134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384227453
6	NC_017258	ATT	2	6	160	165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384227453
7	NC_017258	TGA	2	6	336	341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384227453
8	NC_017258	TAT	2	6	387	392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384227453
9	NC_017258	TAA	2	6	746	751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384227453
10	NC_017258	AAT	2	6	826	831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384227453
11	NC_017258	AGC	2	6	837	842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384227453
12	NC_017258	TAT	2	6	908	913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384227453
13	NC_017258	GAA	2	6	1001	1006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384227453
14	NC_017258	TAG	2	6	1038	1043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384227453
15	NC_017258	AGT	2	6	1209	1214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384227453
16	NC_017258	AAG	2	6	1331	1336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384227453
17	NC_017258	TGG	2	6	1350	1355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384227453
18	NC_017258	CAA	2	6	1436	1441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384227453
19	NC_017258	GTT	2	6	1459	1464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384227453
20	NC_017258	TAA	2	6	1520	1525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384227453
21	NC_017258	TTG	2	6	1618	1623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384227454
22	NC_017258	TAA	2	6	1777	1782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384227454
23	NC_017258	TCA	2	6	1826	1831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384227454
24	NC_017258	TAG	2	6	1837	1842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384227454
25	NC_017258	TGG	2	6	1850	1855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384227454
26	NC_017258	CAT	2	6	1856	1861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384227454
27	NC_017258	CAT	2	6	1894	1899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384227454
28	NC_017258	ATG	2	6	1909	1914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384227454
29	NC_017258	TAA	2	6	1979	1984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384227454
30	NC_017258	TAT	2	6	2000	2005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384227454
31	NC_017258	AAC	2	6	2093	2098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384227454
32	NC_017258	TCA	2	6	2125	2130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384227454
33	NC_017258	CTT	2	6	2137	2142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384227454
34	NC_017258	ATG	2	6	2317	2322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384227455
35	NC_017258	TAA	3	9	2335	2343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384227455
36	NC_017258	TAA	2	6	2374	2379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384227455
37	NC_017258	ATT	2	6	2394	2399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384227455
38	NC_017258	AGA	2	6	2444	2449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384227455
39	NC_017258	TTG	2	6	2452	2457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384227455
40	NC_017258	ATT	2	6	2499	2504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384227455
41	NC_017258	TTA	2	6	2554	2559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384227455
42	NC_017258	AGA	2	6	2639	2644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384227455
43	NC_017258	TAG	3	9	2660	2668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384227455
44	NC_017258	ATT	2	6	2761	2766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384227455
45	NC_017258	ATT	2	6	2845	2850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384227455
46	NC_017258	TAA	3	9	3197	3205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017258	TAA	2	6	3268	3273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017258	TTA	2	6	3459	3464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017258	TTA	2	6	3593	3598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.