MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. Ak (Acyrthosiphon kondoi) plasmid pLeu

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017257	ATA	3	9	367	375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228017
2	NC_017257	CTT	2	6	474	479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228017
3	NC_017257	TTC	3	9	509	517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228017
4	NC_017257	TTG	2	6	655	660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384228017
5	NC_017257	TTA	2	6	839	844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228017
6	NC_017257	GAA	2	6	914	919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228017
7	NC_017257	TCT	2	6	985	990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228017
8	NC_017257	AAG	2	6	1101	1106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228017
9	NC_017257	TAT	2	6	1116	1121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228017
10	NC_017257	GGT	2	6	1127	1132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384228017
11	NC_017257	TAT	2	6	1570	1575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228018
12	NC_017257	CAA	2	6	1593	1598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384228018
13	NC_017257	TAG	2	6	1651	1656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228018
14	NC_017257	TAG	2	6	1681	1686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228018
15	NC_017257	ATT	2	6	1691	1696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228018
16	NC_017257	TCT	2	6	1836	1841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228018
17	NC_017257	TTC	2	6	1981	1986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228018
18	NC_017257	TAT	2	6	2381	2386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228019
19	NC_017257	TAA	2	6	2470	2475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228019
20	NC_017257	TAA	2	6	2499	2504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228019
21	NC_017257	TAA	2	6	2653	2658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228019
22	NC_017257	ATA	2	6	2720	2725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228019
23	NC_017257	ATA	3	9	2881	2889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228019
24	NC_017257	TTA	2	6	3037	3042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228020
25	NC_017257	TCA	2	6	3171	3176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228020
26	NC_017257	ATA	2	6	3375	3380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228020
27	NC_017257	TAG	2	6	3452	3457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228020
28	NC_017257	TAA	2	6	3496	3501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228020
29	NC_017257	TAA	2	6	3568	3573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228020
30	NC_017257	ATG	2	6	3634	3639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228020
31	NC_017257	AGA	2	6	3746	3751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228020
32	NC_017257	AGA	2	6	3776	3781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228020
33	NC_017257	CTA	2	6	3796	3801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228020
34	NC_017257	ATT	2	6	3837	3842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228020
35	NC_017257	TAA	2	6	3872	3877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228020
36	NC_017257	TAG	2	6	3883	3888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228020
37	NC_017257	TTC	2	6	3908	3913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228020
38	NC_017257	TCA	2	6	3920	3925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228020
39	NC_017257	AGA	2	6	3945	3950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228020
40	NC_017257	TAG	2	6	3971	3976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228020
41	NC_017257	TGC	2	6	4094	4099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384228020
42	NC_017257	TAA	2	6	4166	4171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228020
43	NC_017257	CAA	2	6	4173	4178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384228020
44	NC_017257	ATT	2	6	4256	4261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228020
45	NC_017257	TCT	2	6	4287	4292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228020
46	NC_017257	TTG	2	6	4378	4383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384228020
47	NC_017257	GAT	2	6	4499	4504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228020
48	NC_017257	ATA	2	6	4516	4521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228020
49	NC_017257	TAA	2	6	4541	4546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228020
50	NC_017257	AAG	2	6	4707	4712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228021
51	NC_017257	GAA	2	6	4766	4771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228021
52	NC_017257	GGA	2	6	4781	4786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384228021
53	NC_017257	TTC	2	6	5238	5243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384228021
54	NC_017257	TAG	2	6	5268	5273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228021
55	NC_017257	CTA	2	6	5331	5336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228021
56	NC_017257	TAT	3	9	5370	5378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228021
57	NC_017257	TGA	2	6	5407	5412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228021
58	NC_017257	ATA	2	6	5667	5672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228021
59	NC_017257	AAT	2	6	5733	5738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228021
60	NC_017257	GAA	2	6	5745	5750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228022
61	NC_017257	CTA	2	6	5918	5923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228022
62	NC_017257	TTA	2	6	6272	6277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228022
63	NC_017257	ATC	2	6	6318	6323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228022
64	NC_017257	AGG	2	6	6324	6329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384228022
65	NC_017257	GAA	2	6	6382	6387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228022
66	NC_017257	TGA	2	6	6447	6452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228022
67	NC_017257	CAC	2	6	6488	6493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384228022
68	NC_017257	CAC	2	6	6596	6601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384228022
69	NC_017257	TAA	2	6	6672	6677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228022
70	NC_017257	AGA	2	6	6798	6803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384228022
71	NC_017257	AGC	2	6	6810	6815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384228022
72	NC_017257	ATA	2	6	6823	6828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228022
73	NC_017257	TTG	2	6	6863	6868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384228022
74	NC_017257	GTT	2	6	6959	6964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384228022
75	NC_017257	ATG	2	6	6998	7003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228022
76	NC_017257	CTA	2	6	7019	7024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228022
77	NC_017257	GTC	2	6	7043	7048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384228022
78	NC_017257	AGG	2	6	7056	7061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384228022
79	NC_017257	CAT	2	6	7083	7088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228022
80	NC_017257	GCT	2	6	7090	7095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384228022
81	NC_017257	GCA	2	6	7096	7101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384228022
82	NC_017257	ATA	2	6	7139	7144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228022
83	NC_017257	TAA	2	6	7152	7157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228022
84	NC_017257	TTG	2	6	7189	7194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384228023
85	NC_017257	ATT	3	9	7227	7235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228023
86	NC_017257	TTA	2	6	7377	7382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228023
87	NC_017257	TAG	2	6	7435	7440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228023
88	NC_017257	TAA	3	9	7502	7510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228023
89	NC_017257	ACT	2	6	7511	7516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384228023
90	NC_017257	GAT	2	6	7650	7655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384228023
91	NC_017257	TTA	2	6	7658	7663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228023
92	NC_017257	TTA	2	6	7671	7676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384228023
93	NC_017257	AAT	2	6	7677	7682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384228023

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.