MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Buchnera aphidicola str. Ak (Acyrthosiphon kondoi) chromosome

Total Repeats: 397

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017256	AAAATT	2	12	2129	2140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017256	ATATTA	2	12	2713	2724	50 %	50 %	0 %	0 %	384227458
3	NC_017256	TTTTAT	2	12	3035	3046	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384227458
4	NC_017256	ATCGGT	2	12	3210	3221	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384227459
5	NC_017256	TAGGTT	2	12	3337	3348	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384227459
6	NC_017256	TGAAAT	2	12	3826	3837	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384227460
7	NC_017256	TTAGAA	2	12	4279	4290	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384227461
8	NC_017256	AAAACA	2	12	5831	5842	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384227462
9	NC_017256	AATATA	2	12	9747	9758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384227466
10	NC_017256	GCCATT	3	18	12686	12703	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384227468
11	NC_017256	TTTCTA	2	12	13026	13037	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384227468
12	NC_017256	TAAAAT	2	12	14331	14342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384227469
13	NC_017256	TTTAAT	2	12	14937	14948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017256	ATTAAT	2	12	17275	17286	50 %	50 %	0 %	0 %	384227472
15	NC_017256	TAATAT	2	12	20632	20643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017256	ATTTTA	2	12	20679	20690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017256	TATTTT	2	12	20711	20722	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017256	TAATAT	2	12	23524	23535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017256	ATTTTA	2	12	24788	24799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017256	ATAAAA	2	12	25655	25666	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384227480
21	NC_017256	TTTTAA	2	12	26275	26286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384227481
22	NC_017256	GTATCA	2	12	27368	27379	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384227481
23	NC_017256	TAATGA	2	12	30108	30119	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384227483
24	NC_017256	CTTTTA	2	12	33848	33859	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384227486
25	NC_017256	ATAAAA	2	12	35760	35771	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017256	TTATAT	2	12	35816	35827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017256	CTACTG	2	12	42488	42499	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384227489
28	NC_017256	GATTTC	2	12	44843	44854	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384227490
29	NC_017256	CCCATA	2	12	46056	46067	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384227492
30	NC_017256	AGAAAC	2	12	47246	47257	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384227494
31	NC_017256	ATTTTT	2	12	48495	48506	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017256	GTCTTT	2	12	49097	49108	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384227496
33	NC_017256	ATATTA	2	12	53535	53546	50 %	50 %	0 %	0 %	384227500
34	NC_017256	ATCTTT	2	12	55466	55477	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384227502
35	NC_017256	TTTTAA	2	12	57896	57907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017256	TTTTTA	2	12	59993	60004	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384227506
37	NC_017256	ATCTGT	2	12	60481	60492	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384227506
38	NC_017256	TAAAGA	2	12	66283	66294	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384227512
39	NC_017256	ATACTA	2	12	72231	72242	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017256	TTAATA	2	12	72616	72627	50 %	50 %	0 %	0 %	384227518
41	NC_017256	ATATAA	2	12	75724	75735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384227519
42	NC_017256	ATAGAA	2	12	76555	76566	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384227520
43	NC_017256	TGATTT	2	12	76648	76659	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384227520
44	NC_017256	AACAAA	2	12	79892	79903	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384227523
45	NC_017256	TGTTAT	2	12	80971	80982	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384227524
46	NC_017256	TAAAAA	2	12	82618	82629	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384227526
47	NC_017256	TGATTT	2	12	83999	84010	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384227527
48	NC_017256	AAAAAT	2	12	84642	84653	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384227528
49	NC_017256	TTAAAT	2	12	84837	84848	50 %	50 %	0 %	0 %	384227528
50	NC_017256	ATTTTT	2	12	85277	85288	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384227529
51	NC_017256	GTAATA	2	12	86243	86254	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384227530
52	NC_017256	ATTTTT	2	12	87408	87419	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384227532
53	NC_017256	TTTATA	2	12	87888	87899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017256	CAATTA	2	12	88671	88682	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384227534
55	NC_017256	AAAATA	2	12	88719	88730	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384227534
56	NC_017256	ATTAAA	2	12	89024	89035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384227534
57	NC_017256	TTTTTC	2	12	90961	90972	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384227535
58	NC_017256	ATTTTA	2	12	91534	91545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017256	TTTTGA	2	12	92035	92046	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384227536
60	NC_017256	TTAGTA	2	12	92859	92870	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384227536
61	NC_017256	GTTTTG	2	12	95552	95563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384227538
62	NC_017256	TTGGTT	2	12	97621	97632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384227540
63	NC_017256	TAAAGT	2	12	99098	99109	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384227541
64	NC_017256	GACATT	2	12	99161	99172	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384227541
65	NC_017256	TTTTCT	2	12	100274	100285	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017256	TTTATT	2	12	101712	101723	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017256	TTTAAA	2	12	104097	104108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017256	ATAGTA	2	12	108723	108734	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384227549
69	NC_017256	ATTTAA	2	12	111363	111374	50 %	50 %	0 %	0 %	384227552
70	NC_017256	ATTTCA	2	12	111470	111481	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017256	AAAAGA	2	12	114456	114467	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384227555
72	NC_017256	AAAGAA	2	12	114475	114486	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384227555
73	NC_017256	TAAAAA	2	12	114924	114935	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384227555
74	NC_017256	TATTTT	2	12	116333	116344	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384227556
75	NC_017256	ATTAAT	2	12	116891	116902	50 %	50 %	0 %	0 %	384227556
76	NC_017256	AAATTT	2	12	117503	117514	50 %	50 %	0 %	0 %	384227557
77	NC_017256	ATTAAT	2	12	120688	120699	50 %	50 %	0 %	0 %	384227560
78	NC_017256	AAAAAG	2	12	122058	122069	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017256	ATTTTA	2	12	124636	124647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017256	TTTCTA	2	12	125474	125485	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017256	TTTAAA	2	12	125700	125711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017256	TAAAAA	2	12	125937	125948	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017256	AAAGAA	2	12	126468	126479	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384227565
84	NC_017256	AATATA	2	12	131656	131667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384227569
85	NC_017256	AATGAT	2	12	133235	133246	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384227570
86	NC_017256	ATTTCA	2	12	134038	134049	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_017256	TTAAAT	2	12	134150	134161	50 %	50 %	0 %	0 %	384227573
88	NC_017256	TTGATA	2	12	135753	135764	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384227574
89	NC_017256	TAAATA	2	12	137163	137174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384227574
90	NC_017256	ATTAAA	2	12	138137	138148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017256	ATTTTT	2	12	138577	138588	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017256	ATAAAA	2	12	139325	139336	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384227576
93	NC_017256	TTTTCT	2	12	140616	140627	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384227578
94	NC_017256	AGCAAT	2	12	141113	141124	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384227578
95	NC_017256	AAATAA	2	12	141487	141498	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384227578
96	NC_017256	TGCATA	2	12	142792	142803	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384227579
97	NC_017256	TAAAGT	2	12	145063	145074	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384227581
98	NC_017256	TATTAA	2	12	146506	146517	50 %	50 %	0 %	0 %	384227583
99	NC_017256	TAAAAT	2	12	148028	148039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384227584
100	NC_017256	TAATTT	2	12	150988	150999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384227587
101	NC_017256	AATATC	2	12	154786	154797	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384227589
102	NC_017256	ATTTAT	2	12	158293	158304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384227592
103	NC_017256	TCTTTA	2	12	158709	158720	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384227592
104	NC_017256	TAAAAA	2	12	167917	167928	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384227600
105	NC_017256	TTATTT	2	12	172271	172282	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384227603
106	NC_017256	TTTTTA	2	12	174646	174657	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384227607
107	NC_017256	AATTTA	2	12	176171	176182	50 %	50 %	0 %	0 %	384227607
108	NC_017256	TTTAAT	2	12	177513	177524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384227608
109	NC_017256	TAATGC	2	12	179135	179146	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384227609
110	NC_017256	AAAAAT	2	12	179747	179758	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017256	ATTTTT	2	12	181868	181879	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017256	TTTTTA	2	12	182107	182118	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017256	ATTTAT	2	12	184227	184238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017256	AAAGAA	2	12	185754	185765	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384227613
115	NC_017256	GTCTTT	2	12	185771	185782	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384227613
116	NC_017256	TATTAC	2	12	186515	186526	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_017256	TTAAGT	2	12	189557	189568	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384227617
118	NC_017256	TGCAAA	2	12	192386	192397	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384227619
119	NC_017256	TATTTT	2	12	194232	194243	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384227620
120	NC_017256	TTTTCC	2	12	196309	196320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384227621
121	NC_017256	GCCTGT	2	12	196640	196651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384227621
122	NC_017256	AATTAA	2	12	201303	201314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384227626
123	NC_017256	TTTTCT	2	12	201674	201685	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384227626
124	NC_017256	TTTTCT	2	12	203955	203966	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384227629
125	NC_017256	AATTTT	2	12	204180	204191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.