MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. Ak (Acyrthosiphon kondoi) chromosome

Total Repeats: 85

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017256	AAAATT	2	12	2129	2140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017256	TTTAAT	2	12	14937	14948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017256	TAATAT	2	12	20632	20643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017256	ATTTTA	2	12	20679	20690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017256	TATTTT	2	12	20711	20722	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017256	TAATAT	2	12	23524	23535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017256	ATTTTA	2	12	24788	24799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017256	ATAAAA	2	12	35760	35771	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017256	TTATAT	2	12	35816	35827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017256	ATTTTT	2	12	48495	48506	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017256	TTTTAA	2	12	57896	57907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017256	ATACTA	2	12	72231	72242	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017256	TTTATA	2	12	87888	87899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017256	ATTTTA	2	12	91534	91545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017256	TTTTCT	2	12	100274	100285	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017256	TTTATT	2	12	101712	101723	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017256	TTTAAA	2	12	104097	104108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017256	ATTTCA	2	12	111470	111481	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017256	AAAAAG	2	12	122058	122069	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017256	ATTTTA	2	12	124636	124647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017256	TTTCTA	2	12	125474	125485	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017256	TTTAAA	2	12	125700	125711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017256	TAAAAA	2	12	125937	125948	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017256	ATTTCA	2	12	134038	134049	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017256	ATTAAA	2	12	138137	138148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017256	ATTTTT	2	12	138577	138588	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017256	AAAAAT	2	12	179747	179758	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017256	ATTTTT	2	12	181868	181879	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017256	TTTTTA	2	12	182107	182118	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017256	ATTTAT	2	12	184227	184238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017256	TATTAC	2	12	186515	186526	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017256	AATTTT	2	12	204180	204191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017256	ATGTTT	2	12	211804	211815	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017256	ATATTT	2	12	221618	221629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017256	AGAAAA	2	12	229077	229088	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017256	TTATAT	2	12	230860	230871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017256	ATATAA	2	12	248200	248211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017256	TTAATT	2	12	250640	250651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017256	AAAAAT	2	12	251884	251895	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017256	TAAAAA	2	12	255422	255433	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017256	ATTTTT	2	12	258546	258557	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017256	TAATTT	2	12	274820	274831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017256	AATATA	2	12	284497	284508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017256	TTTTTC	2	12	298675	298686	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017256	AATTTA	2	12	307241	307252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017256	TATTTT	2	12	307342	307353	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017256	TAAAAA	2	12	319767	319778	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017256	TATTTT	2	12	330697	330708	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017256	TAAATA	2	12	332276	332287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017256	TTATTT	2	12	349197	349208	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017256	ATTTTT	2	12	364384	364395	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017256	TAAAAA	2	12	364478	364489	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017256	TAACTT	2	12	365251	365262	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017256	CTATAA	2	12	368871	368882	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017256	TTAAAT	2	12	383054	383065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017256	ATATAA	2	12	407010	407021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017256	AATAAA	2	12	414593	414604	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017256	ACTATA	2	12	421088	421099	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017256	TAAAAA	2	12	427339	427350	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017256	CACTAT	2	12	427648	427659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017256	TTTTAT	2	12	432601	432612	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017256	TTTTAA	2	12	434171	434182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017256	TAAATT	2	12	476126	476137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017256	AAATTT	2	12	495178	495189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017256	TGAAAT	2	12	495842	495853	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017256	TAATTT	2	12	496763	496774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017256	TAAAAA	2	12	539330	539341	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017256	ATTAAA	2	12	569449	569460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017256	TATTTA	2	12	572714	572725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017256	TATTTT	2	12	575559	575570	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017256	ATTTGA	2	12	581428	581439	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017256	TAAATT	2	12	582825	582836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017256	AAATAA	2	12	583230	583241	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017256	AAAATA	2	12	584767	584778	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017256	AATATA	2	12	593242	593253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017256	TAAATT	2	12	596004	596015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017256	TAAAAA	2	12	603001	603012	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017256	TCATAA	2	12	610910	610921	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017256	TTTAAT	2	12	613024	613035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017256	AAATAT	2	12	615444	615455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017256	AATTAA	2	12	624709	624720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017256	AAAAAT	2	12	634640	634651	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017256	ATTGAT	2	12	634790	634801	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017256	TTAAAT	2	12	641560	641571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017256	TTATAT	2	12	641599	641610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.