MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. Ak (Acyrthosiphon kondoi) chromosome

Total Repeats: 312

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017256	ATATTA	2	12	2713	2724	50 %	50 %	0 %	0 %	384227458
2	NC_017256	TTTTAT	2	12	3035	3046	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384227458
3	NC_017256	ATCGGT	2	12	3210	3221	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384227459
4	NC_017256	TAGGTT	2	12	3337	3348	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384227459
5	NC_017256	TGAAAT	2	12	3826	3837	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384227460
6	NC_017256	TTAGAA	2	12	4279	4290	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384227461
7	NC_017256	AAAACA	2	12	5831	5842	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384227462
8	NC_017256	AATATA	2	12	9747	9758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384227466
9	NC_017256	GCCATT	3	18	12686	12703	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384227468
10	NC_017256	TTTCTA	2	12	13026	13037	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384227468
11	NC_017256	TAAAAT	2	12	14331	14342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384227469
12	NC_017256	ATTAAT	2	12	17275	17286	50 %	50 %	0 %	0 %	384227472
13	NC_017256	ATAAAA	2	12	25655	25666	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384227480
14	NC_017256	TTTTAA	2	12	26275	26286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384227481
15	NC_017256	GTATCA	2	12	27368	27379	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384227481
16	NC_017256	TAATGA	2	12	30108	30119	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384227483
17	NC_017256	CTTTTA	2	12	33848	33859	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384227486
18	NC_017256	CTACTG	2	12	42488	42499	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384227489
19	NC_017256	GATTTC	2	12	44843	44854	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384227490
20	NC_017256	CCCATA	2	12	46056	46067	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384227492
21	NC_017256	AGAAAC	2	12	47246	47257	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384227494
22	NC_017256	GTCTTT	2	12	49097	49108	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384227496
23	NC_017256	ATATTA	2	12	53535	53546	50 %	50 %	0 %	0 %	384227500
24	NC_017256	ATCTTT	2	12	55466	55477	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384227502
25	NC_017256	TTTTTA	2	12	59993	60004	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384227506
26	NC_017256	ATCTGT	2	12	60481	60492	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384227506
27	NC_017256	TAAAGA	2	12	66283	66294	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384227512
28	NC_017256	TTAATA	2	12	72616	72627	50 %	50 %	0 %	0 %	384227518
29	NC_017256	ATATAA	2	12	75724	75735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384227519
30	NC_017256	ATAGAA	2	12	76555	76566	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384227520
31	NC_017256	TGATTT	2	12	76648	76659	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384227520
32	NC_017256	AACAAA	2	12	79892	79903	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384227523
33	NC_017256	TGTTAT	2	12	80971	80982	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384227524
34	NC_017256	TAAAAA	2	12	82618	82629	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384227526
35	NC_017256	TGATTT	2	12	83999	84010	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384227527
36	NC_017256	AAAAAT	2	12	84642	84653	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384227528
37	NC_017256	TTAAAT	2	12	84837	84848	50 %	50 %	0 %	0 %	384227528
38	NC_017256	ATTTTT	2	12	85277	85288	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384227529
39	NC_017256	GTAATA	2	12	86243	86254	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384227530
40	NC_017256	ATTTTT	2	12	87408	87419	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384227532
41	NC_017256	CAATTA	2	12	88671	88682	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384227534
42	NC_017256	AAAATA	2	12	88719	88730	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384227534
43	NC_017256	ATTAAA	2	12	89024	89035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384227534
44	NC_017256	TTTTTC	2	12	90961	90972	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384227535
45	NC_017256	TTTTGA	2	12	92035	92046	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384227536
46	NC_017256	TTAGTA	2	12	92859	92870	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384227536
47	NC_017256	GTTTTG	2	12	95552	95563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384227538
48	NC_017256	TTGGTT	2	12	97621	97632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384227540
49	NC_017256	TAAAGT	2	12	99098	99109	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384227541
50	NC_017256	GACATT	2	12	99161	99172	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384227541
51	NC_017256	ATAGTA	2	12	108723	108734	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384227549
52	NC_017256	ATTTAA	2	12	111363	111374	50 %	50 %	0 %	0 %	384227552
53	NC_017256	AAAAGA	2	12	114456	114467	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384227555
54	NC_017256	AAAGAA	2	12	114475	114486	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384227555
55	NC_017256	TAAAAA	2	12	114924	114935	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384227555
56	NC_017256	TATTTT	2	12	116333	116344	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384227556
57	NC_017256	ATTAAT	2	12	116891	116902	50 %	50 %	0 %	0 %	384227556
58	NC_017256	AAATTT	2	12	117503	117514	50 %	50 %	0 %	0 %	384227557
59	NC_017256	ATTAAT	2	12	120688	120699	50 %	50 %	0 %	0 %	384227560
60	NC_017256	AAAGAA	2	12	126468	126479	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384227565
61	NC_017256	AATATA	2	12	131656	131667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384227569
62	NC_017256	AATGAT	2	12	133235	133246	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384227570
63	NC_017256	TTAAAT	2	12	134150	134161	50 %	50 %	0 %	0 %	384227573
64	NC_017256	TTGATA	2	12	135753	135764	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384227574
65	NC_017256	TAAATA	2	12	137163	137174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384227574
66	NC_017256	ATAAAA	2	12	139325	139336	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384227576
67	NC_017256	TTTTCT	2	12	140616	140627	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384227578
68	NC_017256	AGCAAT	2	12	141113	141124	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384227578
69	NC_017256	AAATAA	2	12	141487	141498	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384227578
70	NC_017256	TGCATA	2	12	142792	142803	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384227579
71	NC_017256	TAAAGT	2	12	145063	145074	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384227581
72	NC_017256	TATTAA	2	12	146506	146517	50 %	50 %	0 %	0 %	384227583
73	NC_017256	TAAAAT	2	12	148028	148039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384227584
74	NC_017256	TAATTT	2	12	150988	150999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384227587
75	NC_017256	AATATC	2	12	154786	154797	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384227589
76	NC_017256	ATTTAT	2	12	158293	158304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384227592
77	NC_017256	TCTTTA	2	12	158709	158720	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384227592
78	NC_017256	TAAAAA	2	12	167917	167928	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384227600
79	NC_017256	TTATTT	2	12	172271	172282	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384227603
80	NC_017256	TTTTTA	2	12	174646	174657	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384227607
81	NC_017256	AATTTA	2	12	176171	176182	50 %	50 %	0 %	0 %	384227607
82	NC_017256	TTTAAT	2	12	177513	177524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384227608
83	NC_017256	TAATGC	2	12	179135	179146	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384227609
84	NC_017256	AAAGAA	2	12	185754	185765	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384227613
85	NC_017256	GTCTTT	2	12	185771	185782	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384227613
86	NC_017256	TTAAGT	2	12	189557	189568	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384227617
87	NC_017256	TGCAAA	2	12	192386	192397	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384227619
88	NC_017256	TATTTT	2	12	194232	194243	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384227620
89	NC_017256	TTTTCC	2	12	196309	196320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384227621
90	NC_017256	GCCTGT	2	12	196640	196651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384227621
91	NC_017256	AATTAA	2	12	201303	201314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384227626
92	NC_017256	TTTTCT	2	12	201674	201685	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384227626
93	NC_017256	TTTTCT	2	12	203955	203966	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384227629
94	NC_017256	ATAGAA	2	12	204638	204649	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384227630
95	NC_017256	CATTAG	2	12	207283	207294	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384227633
96	NC_017256	ATTTTT	2	12	207849	207860	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384227633
97	NC_017256	TTTAGA	2	12	211003	211014	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384227635
98	NC_017256	ATTTTT	2	12	213593	213604	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384227637
99	NC_017256	CCTATA	2	12	213819	213830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384227638
100	NC_017256	TTGTAT	2	12	216257	216268	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384227641
101	NC_017256	TTTTAT	2	12	217131	217142	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384227641
102	NC_017256	TAAATC	2	12	220019	220030	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384227642
103	NC_017256	TTAATA	2	12	226287	226298	50 %	50 %	0 %	0 %	384227646
104	NC_017256	TAGAAC	2	12	226424	226435	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384227647
105	NC_017256	TTAAAG	2	12	226562	226573	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384227647
106	NC_017256	TCCACC	2	12	233558	233569	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	384227653
107	NC_017256	AAATAT	2	12	235715	235726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384227655
108	NC_017256	ATTTTT	2	12	237457	237468	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384227656
109	NC_017256	TTTCTA	2	12	238090	238101	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384227657
110	NC_017256	TTTAAT	2	12	238440	238451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384227657
111	NC_017256	ATTTTT	2	12	240032	240043	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384227659
112	NC_017256	ATTTTT	2	12	240451	240462	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384227659
113	NC_017256	GCTAAT	2	12	244099	244110	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384227661
114	NC_017256	AATGAT	2	12	245187	245198	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384227662
115	NC_017256	TCTTTT	2	12	246875	246886	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384227663
116	NC_017256	AGAATG	2	12	248946	248957	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384227666
117	NC_017256	ATCAAT	2	12	249507	249518	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384227666
118	NC_017256	CTTTTT	2	12	254074	254085	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384227668
119	NC_017256	TTTTTA	2	12	254334	254345	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384227668
120	NC_017256	TTTGGA	2	12	262465	262476	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384227676
121	NC_017256	CAATTT	2	12	263257	263268	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384227676
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.