MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. Ak (Acyrthosiphon kondoi) chromosome

Total Repeats: 185

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017256	AAAGA	2	10	76	85	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017256	ATATA	2	10	14052	14061	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017256	TAAAT	2	10	18104	18113	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017256	ATTTT	2	10	20766	20775	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017256	ATTTT	2	10	20848	20857	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017256	AATAT	2	10	20963	20972	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017256	ATTTT	2	10	27771	27780	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017256	ATTCA	2	10	36001	36010	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017256	TATAA	2	10	36229	36238	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017256	ATATT	2	10	48396	48405	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017256	TTATA	2	10	48826	48835	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017256	ACATT	2	10	55372	55381	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017256	TTTAT	2	10	58842	58851	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017256	TTGAT	2	10	60726	60735	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017256	TATTT	2	10	60839	60848	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017256	TTATT	2	10	62661	62670	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017256	TTTTA	2	10	64917	64926	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017256	AGAAT	2	10	66191	66200	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017256	AATAG	2	10	76161	76170	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017256	GCATG	2	10	76305	76314	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017256	ATATT	2	10	76900	76909	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017256	ATTAT	2	10	76928	76937	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017256	AATTA	2	10	76950	76959	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017256	TAAAT	2	10	86030	86039	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017256	TTAAA	2	10	87689	87698	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017256	TAATA	2	10	87813	87822	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017256	CCATG	2	10	93172	93181	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_017256	ATATA	2	10	95615	95624	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017256	ATATT	2	10	100307	100316	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017256	ATAAA	2	10	101890	101899	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017256	TGAAA	2	10	103100	103109	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017256	ATTAA	2	10	104069	104078	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017256	TTTTA	2	10	104217	104226	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017256	CAAAT	2	10	111590	111599	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017256	ATTAT	2	10	113360	113369	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017256	ATATA	2	10	117295	117304	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017256	ATTAT	2	10	124224	124233	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017256	ACTGA	2	10	124361	124370	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017256	ATAAA	2	10	125081	125090	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017256	AATAT	2	10	125831	125840	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017256	TAAAA	2	10	126085	126094	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017256	TATAA	2	10	128076	128085	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017256	ATAAA	2	10	129224	129233	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017256	TTATT	2	10	133561	133570	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017256	ATAAA	2	10	134125	134134	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017256	TTATT	2	10	137942	137951	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017256	TATAA	2	10	143667	143676	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017256	AAATT	2	10	143857	143866	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017256	TTTAT	2	10	154238	154247	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017256	TATTT	2	10	154279	154288	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017256	GTTAA	2	10	160535	160544	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017256	TATAT	2	10	164296	164305	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017256	ATTTT	2	10	164473	164482	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017256	TTTAA	2	10	164518	164527	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017256	ATATT	2	10	179778	179787	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017256	ATATT	2	10	180204	180213	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017256	TATAA	2	10	180467	180476	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017256	AAATA	2	10	182289	182298	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017256	ATATA	2	10	183738	183747	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017256	ATATT	2	10	189471	189480	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017256	TGAAA	2	10	198127	198136	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017256	ATATT	2	10	199686	199695	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017256	TATAA	2	10	201125	201134	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017256	ACTTT	2	10	202806	202815	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_017256	TATAT	2	10	205046	205055	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017256	TTTTA	2	10	211890	211899	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017256	AATTC	2	10	212172	212181	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017256	ATTTA	2	10	215061	215070	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017256	TCTTT	2	10	229114	229123	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017256	ATTTT	2	10	230941	230950	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017256	TAATA	2	10	231827	231836	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017256	TTTTA	2	10	232236	232245	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017256	AATTG	2	10	251039	251048	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017256	AGATT	2	10	252045	252054	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017256	ATTTT	2	10	259896	259905	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017256	ATTTT	2	10	274843	274852	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017256	ATGTA	2	10	281336	281345	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017256	TATAA	2	10	287462	287471	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017256	AATAT	2	10	295816	295825	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017256	AAATT	2	10	296883	296892	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017256	TTTAT	2	10	307259	307268	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017256	TATTT	2	10	325841	325850	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017256	TAAAT	2	10	326127	326136	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017256	TGATA	2	10	330883	330892	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017256	AATTA	2	10	330967	330976	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017256	AAAAT	2	10	331149	331158	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017256	TTAAT	2	10	334545	334554	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017256	AAAAT	2	10	339524	339533	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017256	ATTTA	2	10	348980	348989	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017256	AAATT	2	10	349018	349027	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017256	TGATA	2	10	354019	354028	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017256	AAAAT	2	10	354433	354442	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017256	TAATA	2	10	354666	354675	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017256	ATTAA	2	10	361684	361693	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017256	TATAA	2	10	364436	364445	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017256	ATTCT	3	15	365005	365019	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_017256	TTTGA	2	10	365373	365382	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017256	TAAAA	2	10	368948	368957	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017256	TCAAT	2	10	368986	368995	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017256	AAAAT	2	10	371532	371541	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017256	AAATG	2	10	376801	376810	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017256	TTATA	2	10	378419	378428	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017256	TAAAA	2	10	378483	378492	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017256	TTATA	2	10	383114	383123	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017256	ATTAT	2	10	383164	383173	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017256	AAATT	2	10	384468	384477	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017256	AATTT	2	10	384646	384655	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017256	TAAAT	2	10	384943	384952	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017256	TGTAT	2	10	389349	389358	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017256	TATAA	2	10	391231	391240	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017256	TTTCT	2	10	391520	391529	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_017256	TATTT	2	10	391824	391833	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017256	ATAAA	2	10	396231	396240	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017256	AAAAT	2	10	405408	405417	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017256	ATATA	2	10	407113	407122	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017256	ACATA	2	10	408234	408243	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_017256	AAAAT	2	10	408329	408338	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017256	AAAAT	2	10	412324	412333	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017256	TATTT	2	10	412392	412401	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017256	TTTAT	2	10	416073	416082	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017256	AAAAT	2	10	423223	423232	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017256	ACATT	2	10	426626	426635	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017256	TAAAA	2	10	428182	428191	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017256	AATAT	2	10	439874	439883	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017256	AAATA	2	10	443544	443553	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017256	TAAAA	2	10	443989	443998	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017256	CATCT	2	10	445984	445993	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
128	NC_017256	TTATT	2	10	449657	449666	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017256	TAATA	2	10	449726	449735	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017256	TAAAA	2	10	449756	449765	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017256	TATAA	3	15	450088	450102	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017256	GTGCT	2	10	450149	450158	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_017256	TTAAA	2	10	452111	452120	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017256	TAATA	2	10	455382	455391	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017256	AAAAT	2	10	455479	455488	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017256	ATTTA	2	10	455526	455535	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017256	TTAAC	2	10	456579	456588	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_017256	TATCT	2	10	456641	456650	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_017256	GAAAA	2	10	462748	462757	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017256	AATCA	2	10	471495	471504	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_017256	ATCTT	2	10	472293	472302	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_017256	ATCAA	2	10	476034	476043	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_017256	AATAG	2	10	483694	483703	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017256	TTTTA	2	10	488957	488966	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017256	CAATT	2	10	495803	495812	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_017256	AATTA	2	10	497357	497366	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017256	ATATT	2	10	497372	497381	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017256	AAAAG	2	10	497862	497871	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017256	TTTAT	2	10	503394	503403	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.