MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. Ak (Acyrthosiphon kondoi) chromosome

Total Repeats: 572

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017256	AAAAT	2	10	1819	1828	80 %	20 %	0 %	0 %	384227457
2	NC_017256	TTTTA	2	10	2939	2948	20 %	80 %	0 %	0 %	384227458
3	NC_017256	GATTG	2	10	3182	3191	20 %	40 %	40 %	0 %	384227459
4	NC_017256	ATGTT	2	10	4675	4684	20 %	60 %	20 %	0 %	384227462
5	NC_017256	AAAAT	2	10	5479	5488	80 %	20 %	0 %	0 %	384227462
6	NC_017256	TGACT	2	10	7929	7938	20 %	40 %	20 %	20 %	384227464
7	NC_017256	TATAT	2	10	9879	9888	40 %	60 %	0 %	0 %	384227466
8	NC_017256	ATTTT	2	10	12229	12238	20 %	80 %	0 %	0 %	384227467
9	NC_017256	CATTT	2	10	13360	13369	20 %	60 %	0 %	20 %	384227468
10	NC_017256	TAGGT	2	10	14636	14645	20 %	40 %	40 %	0 %	384227470
11	NC_017256	ATTTT	2	10	14846	14855	20 %	80 %	0 %	0 %	384227470
12	NC_017256	TTTCA	2	10	15160	15169	20 %	60 %	0 %	20 %	384227471
13	NC_017256	ATATA	2	10	15842	15851	60 %	40 %	0 %	0 %	384227471
14	NC_017256	TATAT	2	10	16574	16583	40 %	60 %	0 %	0 %	384227471
15	NC_017256	TATCT	2	10	16620	16629	20 %	60 %	0 %	20 %	384227471
16	NC_017256	CAAAA	2	10	17663	17672	80 %	0 %	0 %	20 %	384227472
17	NC_017256	TGATA	2	10	20257	20266	40 %	40 %	20 %	0 %	384227474
18	NC_017256	AACAA	2	10	21136	21145	80 %	0 %	0 %	20 %	384227475
19	NC_017256	AGTAA	2	10	21556	21565	60 %	20 %	20 %	0 %	384227475
20	NC_017256	TATTT	2	10	22945	22954	20 %	80 %	0 %	0 %	384227478
21	NC_017256	TAAAA	2	10	23668	23677	80 %	20 %	0 %	0 %	384227479
22	NC_017256	TAATT	2	10	24028	24037	40 %	60 %	0 %	0 %	384227479
23	NC_017256	ATACA	2	10	24555	24564	60 %	20 %	0 %	20 %	384227479
24	NC_017256	ATCTC	2	10	25083	25092	20 %	40 %	0 %	40 %	384227480
25	NC_017256	TTTCT	2	10	27036	27045	0 %	80 %	0 %	20 %	384227481
26	NC_017256	CCATT	2	10	28972	28981	20 %	40 %	0 %	40 %	384227482
27	NC_017256	ATTTT	2	10	29771	29780	20 %	80 %	0 %	0 %	384227483
28	NC_017256	ATCTA	2	10	29952	29961	40 %	40 %	0 %	20 %	384227483
29	NC_017256	ATAAA	2	10	30639	30648	80 %	20 %	0 %	0 %	384227484
30	NC_017256	TTGTA	2	10	30921	30930	20 %	60 %	20 %	0 %	384227484
31	NC_017256	CTGGT	2	10	31323	31332	0 %	40 %	40 %	20 %	384227485
32	NC_017256	TTTTG	2	10	32912	32921	0 %	80 %	20 %	0 %	384227485
33	NC_017256	GCAAT	2	10	33370	33379	40 %	20 %	20 %	20 %	384227485
34	NC_017256	TATTT	2	10	34110	34119	20 %	80 %	0 %	0 %	384227486
35	NC_017256	AAAAG	2	10	34578	34587	80 %	0 %	20 %	0 %	384227486
36	NC_017256	CTTGT	2	10	37388	37397	0 %	60 %	20 %	20 %	384227488
37	NC_017256	ACGAA	2	10	37423	37432	60 %	0 %	20 %	20 %	384227488
38	NC_017256	AAATA	2	10	38213	38222	80 %	20 %	0 %	0 %	384227488
39	NC_017256	ATTCT	2	10	39923	39932	20 %	60 %	0 %	20 %	384227488
40	NC_017256	CTTTG	2	10	40247	40256	0 %	60 %	20 %	20 %	384227488
41	NC_017256	TTCCA	2	10	42504	42513	20 %	40 %	0 %	40 %	384227489
42	NC_017256	ATTTT	2	10	43769	43778	20 %	80 %	0 %	0 %	384227489
43	NC_017256	TTGAT	2	10	45654	45663	20 %	60 %	20 %	0 %	384227491
44	NC_017256	GTCAT	2	10	46796	46805	20 %	40 %	20 %	20 %	384227493
45	NC_017256	ATATT	2	10	47775	47784	40 %	60 %	0 %	0 %	384227495
46	NC_017256	ATTTT	2	10	48066	48075	20 %	80 %	0 %	0 %	384227495
47	NC_017256	TTTAA	2	10	48934	48943	40 %	60 %	0 %	0 %	384227496
48	NC_017256	ATATT	2	10	49331	49340	40 %	60 %	0 %	0 %	384227496
49	NC_017256	ATGAT	2	10	51501	51510	40 %	40 %	20 %	0 %	384227498
50	NC_017256	GCAGT	2	10	53247	53256	20 %	20 %	40 %	20 %	384227499
51	NC_017256	ATATA	2	10	53602	53611	60 %	40 %	0 %	0 %	384227500
52	NC_017256	AAATA	2	10	55769	55778	80 %	20 %	0 %	0 %	384227502
53	NC_017256	TTTTA	2	10	55817	55826	20 %	80 %	0 %	0 %	384227502
54	NC_017256	TTAAA	2	10	57526	57535	60 %	40 %	0 %	0 %	384227504
55	NC_017256	CTTTA	2	10	58240	58249	20 %	60 %	0 %	20 %	384227505
56	NC_017256	TATAT	2	10	61784	61793	40 %	60 %	0 %	0 %	384227507
57	NC_017256	TGTAT	2	10	62295	62304	20 %	60 %	20 %	0 %	384227507
58	NC_017256	TAATA	2	10	64671	64680	60 %	40 %	0 %	0 %	384227510
59	NC_017256	TTCAG	2	10	65332	65341	20 %	40 %	20 %	20 %	384227511
60	NC_017256	AGAAA	2	10	66410	66419	80 %	0 %	20 %	0 %	384227512
61	NC_017256	GAATA	2	10	66748	66757	60 %	20 %	20 %	0 %	384227512
62	NC_017256	TGCAT	2	10	66829	66838	20 %	40 %	20 %	20 %	384227512
63	NC_017256	ATAAA	2	10	67506	67515	80 %	20 %	0 %	0 %	384227513
64	NC_017256	TGTTT	2	10	67562	67571	0 %	80 %	20 %	0 %	384227513
65	NC_017256	ACATA	2	10	67595	67604	60 %	20 %	0 %	20 %	384227513
66	NC_017256	AGAAA	2	10	68868	68877	80 %	0 %	20 %	0 %	384227514
67	NC_017256	TTTCT	2	10	69544	69553	0 %	80 %	0 %	20 %	384227515
68	NC_017256	CATAT	2	10	71907	71916	40 %	40 %	0 %	20 %	384227517
69	NC_017256	ATAAA	2	10	72874	72883	80 %	20 %	0 %	0 %	384227518
70	NC_017256	TCATG	2	10	72978	72987	20 %	40 %	20 %	20 %	384227518
71	NC_017256	GTGAT	2	10	73456	73465	20 %	40 %	40 %	0 %	384227518
72	NC_017256	GAATT	2	10	74158	74167	40 %	40 %	20 %	0 %	384227518
73	NC_017256	AATTT	2	10	75832	75841	40 %	60 %	0 %	0 %	384227519
74	NC_017256	TACAA	2	10	75872	75881	60 %	20 %	0 %	20 %	384227519
75	NC_017256	TAAAT	2	10	76481	76490	60 %	40 %	0 %	0 %	384227520
76	NC_017256	TGAAT	2	10	78158	78167	40 %	40 %	20 %	0 %	384227521
77	NC_017256	TTTCT	2	10	78474	78483	0 %	80 %	0 %	20 %	384227521
78	NC_017256	TATAA	2	10	82227	82236	60 %	40 %	0 %	0 %	384227526
79	NC_017256	AATTA	2	10	83204	83213	60 %	40 %	0 %	0 %	384227526
80	NC_017256	TGAAA	2	10	83570	83579	60 %	20 %	20 %	0 %	384227527
81	NC_017256	CTTAA	2	10	83727	83736	40 %	40 %	0 %	20 %	384227527
82	NC_017256	TACTA	2	10	86772	86781	40 %	40 %	0 %	20 %	384227531
83	NC_017256	TATTT	2	10	86880	86889	20 %	80 %	0 %	0 %	384227531
84	NC_017256	AATTT	2	10	88608	88617	40 %	60 %	0 %	0 %	384227534
85	NC_017256	TAAAA	2	10	88688	88697	80 %	20 %	0 %	0 %	384227534
86	NC_017256	TTAGA	2	10	88894	88903	40 %	40 %	20 %	0 %	384227534
87	NC_017256	ATAAA	2	10	89878	89887	80 %	20 %	0 %	0 %	384227534
88	NC_017256	TAATT	2	10	89927	89936	40 %	60 %	0 %	0 %	384227534
89	NC_017256	AAAGT	2	10	90073	90082	60 %	20 %	20 %	0 %	384227534
90	NC_017256	ATATT	2	10	90157	90166	40 %	60 %	0 %	0 %	384227534
91	NC_017256	AAAAT	2	10	90438	90447	80 %	20 %	0 %	0 %	384227534
92	NC_017256	TTAAA	2	10	90622	90631	60 %	40 %	0 %	0 %	384227534
93	NC_017256	GTTTT	2	10	90797	90806	0 %	80 %	20 %	0 %	384227534
94	NC_017256	ATTTT	2	10	90823	90832	20 %	80 %	0 %	0 %	384227534
95	NC_017256	ACTTT	2	10	91067	91076	20 %	60 %	0 %	20 %	384227535
96	NC_017256	CTAGG	2	10	92286	92295	20 %	20 %	40 %	20 %	384227536
97	NC_017256	CTTTT	2	10	93423	93432	0 %	80 %	0 %	20 %	384227537
98	NC_017256	AATTA	2	10	94049	94058	60 %	40 %	0 %	0 %	384227537
99	NC_017256	TTTTA	2	10	100844	100853	20 %	80 %	0 %	0 %	384227542
100	NC_017256	TCAAA	2	10	106693	106702	60 %	20 %	0 %	20 %	384227547
101	NC_017256	ATTGA	2	10	106980	106989	40 %	40 %	20 %	0 %	384227547
102	NC_017256	TGATA	2	10	107979	107988	40 %	40 %	20 %	0 %	384227548
103	NC_017256	TAAAA	2	10	108072	108081	80 %	20 %	0 %	0 %	384227548
104	NC_017256	GTATT	2	10	108356	108365	20 %	60 %	20 %	0 %	384227548
105	NC_017256	ATTTT	2	10	109130	109139	20 %	80 %	0 %	0 %	384227549
106	NC_017256	CATTA	2	10	110686	110695	40 %	40 %	0 %	20 %	384227551
107	NC_017256	ATTTA	2	10	111324	111333	40 %	60 %	0 %	0 %	384227552
108	NC_017256	GGAAT	2	10	112450	112459	40 %	20 %	40 %	0 %	384227553
109	NC_017256	AAAGA	2	10	113417	113426	80 %	0 %	20 %	0 %	384227554
110	NC_017256	AATTT	2	10	115421	115430	40 %	60 %	0 %	0 %	384227555
111	NC_017256	ATAAA	2	10	115679	115688	80 %	20 %	0 %	0 %	384227555
112	NC_017256	TTAGT	2	10	116149	116158	20 %	60 %	20 %	0 %	384227556
113	NC_017256	ATAAA	2	10	116211	116220	80 %	20 %	0 %	0 %	384227556
114	NC_017256	ATAAA	2	10	116761	116770	80 %	20 %	0 %	0 %	384227556
115	NC_017256	AAAGT	2	10	116971	116980	60 %	20 %	20 %	0 %	384227556
116	NC_017256	TATTT	2	10	118141	118150	20 %	80 %	0 %	0 %	384227558
117	NC_017256	ATTTT	2	10	118176	118185	20 %	80 %	0 %	0 %	384227558
118	NC_017256	TTTTA	2	10	118312	118321	20 %	80 %	0 %	0 %	384227558
119	NC_017256	TAAAA	2	10	119187	119196	80 %	20 %	0 %	0 %	384227559
120	NC_017256	ATTTT	2	10	121008	121017	20 %	80 %	0 %	0 %	384227561
121	NC_017256	AATTT	2	10	122832	122841	40 %	60 %	0 %	0 %	384227563
122	NC_017256	TTATA	2	10	123182	123191	40 %	60 %	0 %	0 %	384227563
123	NC_017256	AATTT	2	10	126223	126232	40 %	60 %	0 %	0 %	384227565
124	NC_017256	TTGTT	2	10	127666	127675	0 %	80 %	20 %	0 %	384227566
125	NC_017256	AAAAT	2	10	127782	127791	80 %	20 %	0 %	0 %	384227566
126	NC_017256	TTTTC	2	10	128851	128860	0 %	80 %	0 %	20 %	384227567
127	NC_017256	AAAAT	2	10	129185	129194	80 %	20 %	0 %	0 %	384227567
128	NC_017256	GTTCA	2	10	129735	129744	20 %	40 %	20 %	20 %	384227568
129	NC_017256	CAAAA	2	10	130869	130878	80 %	0 %	0 %	20 %	384227569
130	NC_017256	AATAT	2	10	131188	131197	60 %	40 %	0 %	0 %	384227569
131	NC_017256	ATTTT	2	10	133829	133838	20 %	80 %	0 %	0 %	384227572
132	NC_017256	CAATA	2	10	135317	135326	60 %	20 %	0 %	20 %	384227574
133	NC_017256	AATTT	2	10	136709	136718	40 %	60 %	0 %	0 %	384227574
134	NC_017256	TTAAT	2	10	137466	137475	40 %	60 %	0 %	0 %	384227574
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136	NC_017256	ATACA	2	10	139787	139796	60 %	20 %	0 %	20 %	384227576
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