MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. Ak (Acyrthosiphon kondoi) chromosome

Total Repeats: 385

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017256	TCTT	2	8	93	100	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017256	TTAG	2	8	6988	6995	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017256	TAAA	2	8	14118	14125	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017256	TTAA	2	8	14859	14866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017256	TATT	2	8	18258	18265	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017256	ATAA	2	8	18283	18290	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017256	ATTT	2	8	18779	18786	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017256	AATT	2	8	20477	20484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017256	TAAT	2	8	20552	20559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017256	TTAA	2	8	20574	20581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017256	GAAT	2	8	20902	20909	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017256	TTTA	2	8	20916	20923	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017256	ATTA	2	8	24810	24817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017256	TAAA	2	8	29208	29215	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017256	AATT	2	8	29239	29246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017256	TAAA	2	8	31207	31214	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017256	TAGA	2	8	35694	35701	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017256	ATAA	2	8	36053	36060	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017256	CAAT	2	8	36125	36132	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017256	TAAA	2	8	45819	45826	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017256	GTTT	2	8	47181	47188	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017256	TATT	2	8	48262	48269	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017256	CTAC	2	8	48473	48480	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017256	CTGC	2	8	48754	48761	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017256	TAAA	2	8	48818	48825	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017256	AAAT	2	8	49991	49998	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017256	AATA	3	12	57347	57358	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017256	ATTT	2	8	62949	62956	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017256	ATCA	2	8	62974	62981	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017256	ATTT	2	8	63047	63054	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017256	TGAT	2	8	64812	64819	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017256	ATTA	2	8	64993	65000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017256	TAAA	2	8	65040	65047	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017256	AAAT	2	8	66062	66069	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017256	ATTA	2	8	70779	70786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017256	ATTT	2	8	74595	74602	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017256	TATT	2	8	76429	76436	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017256	TAAA	2	8	87186	87193	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017256	TAAT	2	8	87713	87720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017256	AATT	2	8	87847	87854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017256	TCAT	2	8	93059	93066	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017256	AATT	2	8	94312	94319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017256	ATTT	2	8	94325	94332	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017256	TTAT	2	8	95820	95827	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017256	ATAA	2	8	101525	101532	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017256	ATTT	2	8	101550	101557	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017256	AAAT	2	8	101909	101916	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017256	TTAT	2	8	101929	101936	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017256	AATA	2	8	103126	103133	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017256	ATAA	2	8	104047	104054	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017256	TATT	2	8	104158	104165	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017256	AAAT	2	8	111482	111489	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017256	TAAA	2	8	111723	111730	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017256	TATT	2	8	113322	113329	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017256	ATTA	2	8	114002	114009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017256	TATT	2	8	114036	114043	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017256	AAAT	2	8	117368	117375	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017256	ATAA	2	8	118062	118069	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017256	ATTG	2	8	124099	124106	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017256	AAAT	2	8	124428	124435	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017256	TAAA	2	8	124493	124500	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017256	TTTA	2	8	124592	124599	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017256	TTAA	2	8	124603	124610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017256	ATCA	2	8	124882	124889	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017256	TAAA	2	8	124997	125004	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017256	ACAA	2	8	125141	125148	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017256	ATCA	2	8	125251	125258	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017256	TAAA	2	8	125423	125430	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017256	ATTA	2	8	125547	125554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017256	TTCT	2	8	125579	125586	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017256	GATT	2	8	125639	125646	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017256	CTTT	2	8	125733	125740	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017256	TAAT	2	8	126026	126033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017256	AAAT	2	8	126190	126197	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017256	TTTA	2	8	127922	127929	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017256	TAAA	2	8	127946	127953	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017256	ATTA	2	8	127983	127990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017256	TAAT	2	8	129197	129204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017256	TTAA	2	8	129239	129246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017256	TAAT	2	8	130737	130744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017256	ATAA	2	8	130755	130762	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017256	TTAA	2	8	130779	130786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017256	AGAA	2	8	138042	138049	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017256	AATG	2	8	138641	138648	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017256	ATTG	2	8	138733	138740	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017256	TATT	2	8	140308	140315	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017256	ATAA	2	8	140333	140340	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017256	ATTT	2	8	143419	143426	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017256	AGAA	2	8	143500	143507	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017256	TTTG	2	8	143707	143714	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017256	ATTT	2	8	143777	143784	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017256	ATTT	2	8	146069	146076	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017256	AAAT	2	8	149216	149223	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017256	AGAT	2	8	149736	149743	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017256	TAAT	2	8	153059	153066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017256	ATTA	2	8	154388	154395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017256	ATAA	2	8	154408	154415	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017256	TTTC	2	8	160591	160598	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017256	ATAA	2	8	160632	160639	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017256	AAAT	2	8	160691	160698	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017256	CTTT	2	8	165692	165699	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017256	ATTT	2	8	169437	169444	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017256	AAAT	2	8	169447	169454	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017256	TTTA	2	8	179679	179686	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017256	AATA	2	8	179826	179833	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017256	AAAT	2	8	179880	179887	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017256	TATT	2	8	179992	179999	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017256	ATTT	4	16	180030	180045	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017256	TAAA	2	8	180046	180053	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017256	ATTA	2	8	181956	181963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017256	ATTT	2	8	182049	182056	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017256	TCGA	2	8	183622	183629	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017256	ATAA	2	8	183699	183706	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017256	TCTT	2	8	183717	183724	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017256	TAAA	2	8	184352	184359	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017256	TAAT	2	8	184437	184444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017256	ATTT	2	8	188210	188217	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017256	TAAA	2	8	195461	195468	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017256	ACTA	2	8	198007	198014	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017256	ATAA	2	8	198080	198087	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017256	ATTA	2	8	201060	201067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017256	TAAT	2	8	201097	201104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017256	TGTT	2	8	201115	201122	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017256	TTTA	2	8	201159	201166	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017256	ATTA	2	8	202100	202107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017256	GAAG	2	8	202698	202705	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017256	ATAA	2	8	203326	203333	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017256	TAAA	2	8	203360	203367	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017256	AATA	2	8	205639	205646	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017256	GTTT	2	8	211574	211581	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017256	ATTA	3	12	211690	211701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017256	TTTA	2	8	211752	211759	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017256	ATAG	2	8	211955	211962	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017256	TAAT	2	8	212023	212030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017256	TAAA	2	8	215153	215160	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017256	ATTA	2	8	223587	223594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017256	ATTT	2	8	227591	227598	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017256	AAAT	2	8	231000	231007	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017256	AAAC	2	8	232304	232311	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_017256	ATTT	2	8	235042	235049	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017256	TAAT	2	8	235085	235092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017256	ACAA	2	8	242297	242304	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017256	AAAG	2	8	242682	242689	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017256	ATTA	2	8	242911	242918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017256	TAAA	2	8	248175	248182	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017256	CTAT	2	8	250471	250478	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017256	AGAA	2	8	250689	250696	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017256	CATC	2	8	250893	250900	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_017256	TAAT	2	8	251402	251409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017256	ATAA	2	8	251757	251764	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017256	ATAA	2	8	251776	251783	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.