MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Buchnera aphidicola str. LL01 (Acyrthosiphon pisum) chromosome

Total Repeats: 730

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017255	AAAGA	2	10	86	95	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017255	TTTAA	2	10	205	214	40 %	60 %	0 %	0 %	384226875
3	NC_017255	TTAAT	2	10	1703	1712	40 %	60 %	0 %	0 %	384226875
4	NC_017255	ATTTT	2	10	2766	2775	20 %	80 %	0 %	0 %	384226876
5	NC_017255	TTTTA	2	10	2948	2957	20 %	80 %	0 %	0 %	384226876
6	NC_017255	AAAAT	2	10	5475	5484	80 %	20 %	0 %	0 %	384226880
7	NC_017255	ATTAA	2	10	6035	6044	60 %	40 %	0 %	0 %	384226880
8	NC_017255	ATGAA	2	10	7591	7600	60 %	20 %	20 %	0 %	384226882
9	NC_017255	TTTTC	2	10	9697	9706	0 %	80 %	0 %	20 %	384226884
10	NC_017255	TATAT	2	10	9873	9882	40 %	60 %	0 %	0 %	384226884
11	NC_017255	AAAAT	2	10	10599	10608	80 %	20 %	0 %	0 %	384226884
12	NC_017255	TAAGG	2	10	12218	12227	40 %	20 %	40 %	0 %	384226885
13	NC_017255	TTTTC	2	10	12612	12621	0 %	80 %	0 %	20 %	384226886
14	NC_017255	ATTTC	2	10	13398	13407	20 %	60 %	0 %	20 %	384226886
15	NC_017255	GATAA	2	10	13579	13588	60 %	20 %	20 %	0 %	384226886
16	NC_017255	ATATA	2	10	14092	14101	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017255	TACAA	2	10	14759	14768	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017255	TTTCT	2	10	15059	15068	0 %	80 %	0 %	20 %	384226889
19	NC_017255	TTAGT	2	10	15194	15203	20 %	60 %	20 %	0 %	384226889
20	NC_017255	TATCT	2	10	16584	16593	20 %	60 %	0 %	20 %	384226889
21	NC_017255	CAAAA	2	10	17581	17590	80 %	0 %	0 %	20 %	384226890
22	NC_017255	ATTAA	2	10	18316	18325	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017255	TTTAT	2	10	20376	20385	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017255	TATTT	2	10	20689	20698	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017255	TACTT	2	10	20925	20934	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017255	TATAT	2	10	20941	20950	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017255	AACAA	2	10	21175	21184	80 %	0 %	0 %	20 %	384226893
28	NC_017255	ATTTG	2	10	22984	22993	20 %	60 %	20 %	0 %	384226896
29	NC_017255	ATTTT	2	10	23590	23599	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017255	TAAAA	2	10	23703	23712	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017255	TAATT	2	10	24059	24068	40 %	60 %	0 %	0 %	384226897
32	NC_017255	ATACA	2	10	24586	24595	60 %	20 %	0 %	20 %	384226897
33	NC_017255	TTTCT	2	10	27121	27130	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017255	TAAAC	2	10	27916	27925	60 %	20 %	0 %	20 %	384226899
35	NC_017255	AAAAT	2	10	28444	28453	80 %	20 %	0 %	0 %	384226899
36	NC_017255	AAAAT	2	10	29457	29466	80 %	20 %	0 %	0 %	384226900
37	NC_017255	TTTTA	2	10	30725	30734	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017255	TTGTA	2	10	30888	30897	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017255	TGATA	2	10	30961	30970	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017255	TATAA	2	10	33509	33518	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017255	ATCCA	2	10	34066	34075	40 %	20 %	0 %	40 %	384226902
42	NC_017255	TAAAT	2	10	34669	34678	60 %	40 %	0 %	0 %	384226902
43	NC_017255	CTTGT	2	10	37416	37425	0 %	60 %	20 %	20 %	384226905
44	NC_017255	AAATA	2	10	38241	38250	80 %	20 %	0 %	0 %	384226905
45	NC_017255	TACAT	2	10	39964	39973	40 %	40 %	0 %	20 %	384226905
46	NC_017255	CTTTG	2	10	40275	40284	0 %	60 %	20 %	20 %	384226905
47	NC_017255	TGATC	2	10	40468	40477	20 %	40 %	20 %	20 %	384226905
48	NC_017255	TGTTT	2	10	41707	41716	0 %	80 %	20 %	0 %	384226906
49	NC_017255	TCCAT	2	10	42243	42252	20 %	40 %	0 %	40 %	384226906
50	NC_017255	ATTTT	2	10	43820	43829	20 %	80 %	0 %	0 %	384226906
51	NC_017255	ATTTT	2	10	44808	44817	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017255	TTTAT	2	10	45707	45716	20 %	80 %	0 %	0 %	384226908
53	NC_017255	GTCAT	2	10	46862	46871	20 %	40 %	20 %	20 %	384226910
54	NC_017255	ATAAA	2	10	47869	47878	80 %	20 %	0 %	0 %	384226912
55	NC_017255	TAAAA	2	10	48403	48412	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017255	ATTAT	2	10	48911	48920	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017255	TTTAA	2	10	49021	49030	40 %	60 %	0 %	0 %	384226913
58	NC_017255	ATATT	2	10	49418	49427	40 %	60 %	0 %	0 %	384226913
59	NC_017255	ATTGT	2	10	49612	49621	20 %	60 %	20 %	0 %	384226913
60	NC_017255	GAGCA	2	10	50715	50724	40 %	0 %	40 %	20 %	384226914
61	NC_017255	ATAAA	2	10	50786	50795	80 %	20 %	0 %	0 %	384226914
62	NC_017255	TTTAA	2	10	51069	51078	40 %	60 %	0 %	0 %	384226915
63	NC_017255	AATAA	2	10	51126	51135	80 %	20 %	0 %	0 %	384226915
64	NC_017255	TGTAA	2	10	52250	52259	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017255	ATTGT	2	10	52667	52676	20 %	60 %	20 %	0 %	384226916
66	NC_017255	TAATT	2	10	53924	53933	40 %	60 %	0 %	0 %	384226917
67	NC_017255	GGAAA	2	10	54579	54588	60 %	0 %	40 %	0 %	384226918
68	NC_017255	GGAAT	2	10	54658	54667	40 %	20 %	40 %	0 %	384226918
69	NC_017255	AATTA	2	10	57087	57096	60 %	40 %	0 %	0 %	384226920
70	NC_017255	ATTAA	2	10	57612	57621	60 %	40 %	0 %	0 %	384226921
71	NC_017255	ATCTA	2	10	57836	57845	40 %	40 %	0 %	20 %	384226921
72	NC_017255	GAAAA	2	10	58202	58211	80 %	0 %	20 %	0 %	384226922
73	NC_017255	CTTTA	2	10	58326	58335	20 %	60 %	0 %	20 %	384226922
74	NC_017255	ATTTA	2	10	58844	58853	40 %	60 %	0 %	0 %	384226922
75	NC_017255	TTTAT	2	10	58929	58938	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017255	ATATT	2	10	61875	61884	40 %	60 %	0 %	0 %	384226924
77	NC_017255	CAATT	2	10	63595	63604	40 %	40 %	0 %	20 %	384226926
78	NC_017255	TACCG	2	10	64674	64683	20 %	20 %	20 %	40 %	384226927
79	NC_017255	TAATA	2	10	64765	64774	60 %	40 %	0 %	0 %	384226927
80	NC_017255	CATTC	2	10	65368	65377	20 %	40 %	0 %	40 %	384226928
81	NC_017255	AGAAT	2	10	66256	66265	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017255	AATGC	2	10	66887	66896	40 %	20 %	20 %	20 %	384226929
83	NC_017255	ATATT	2	10	66986	66995	40 %	60 %	0 %	0 %	384226929
84	NC_017255	AATGG	2	10	67773	67782	40 %	20 %	40 %	0 %	384226930
85	NC_017255	ATTTT	2	10	68381	68390	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017255	AGAAA	2	10	68916	68925	80 %	0 %	20 %	0 %	384226931
87	NC_017255	ATCCC	2	10	69138	69147	20 %	20 %	0 %	60 %	384226932
88	NC_017255	AAATC	2	10	69285	69294	60 %	20 %	0 %	20 %	384226932
89	NC_017255	CATAT	2	10	72046	72055	40 %	40 %	0 %	20 %	384226934
90	NC_017255	ATTAA	2	10	72247	72256	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017255	TAAAT	2	10	73015	73024	60 %	40 %	0 %	0 %	384226935
92	NC_017255	ATGTT	2	10	75050	75059	20 %	60 %	20 %	0 %	384226936
93	NC_017255	GAAAA	2	10	75772	75781	80 %	0 %	20 %	0 %	384226936
94	NC_017255	TTTTA	2	10	75945	75954	20 %	80 %	0 %	0 %	384226936
95	NC_017255	GAAAA	2	10	76136	76145	80 %	0 %	20 %	0 %	384226936
96	NC_017255	GCATG	2	10	76397	76406	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_017255	AAATT	2	10	76781	76790	60 %	40 %	0 %	0 %	384226938
98	NC_017255	AATAC	2	10	78542	78551	60 %	20 %	0 %	20 %	384226939
99	NC_017255	TAAAT	2	10	79978	79987	60 %	40 %	0 %	0 %	384226941
100	NC_017255	GCTAT	2	10	81200	81209	20 %	40 %	20 %	20 %	384226942
101	NC_017255	GATAT	2	10	81754	81763	40 %	40 %	20 %	0 %	384226943
102	NC_017255	ATAAA	2	10	82506	82515	80 %	20 %	0 %	0 %	384226944
103	NC_017255	AATTA	2	10	83175	83184	60 %	40 %	0 %	0 %	384226945
104	NC_017255	TTAAT	2	10	83636	83645	40 %	60 %	0 %	0 %	384226946
105	NC_017255	CAAAT	2	10	85414	85423	60 %	20 %	0 %	20 %	384226948
106	NC_017255	TTAAA	2	10	87608	87617	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017255	AATAT	2	10	87719	87728	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017255	TAATA	2	10	87751	87760	60 %	40 %	0 %	0 %	384226953
109	NC_017255	TCAAA	2	10	88564	88573	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_017255	TTAAA	2	10	89018	89027	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017255	TTTAC	2	10	89089	89098	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_017255	TAAAA	2	10	90428	90437	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017255	AAATT	2	10	90729	90738	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017255	AATAT	2	10	91542	91551	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017255	CCATG	2	10	93155	93164	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_017255	GCAAT	2	10	94987	94996	40 %	20 %	20 %	20 %	384226957
117	NC_017255	GAATT	2	10	95119	95128	40 %	40 %	20 %	0 %	384226957
118	NC_017255	AGATC	2	10	96051	96060	40 %	20 %	20 %	20 %	384226958
119	NC_017255	ATATT	2	10	96547	96556	40 %	60 %	0 %	0 %	384226958
120	NC_017255	GATAT	2	10	97280	97289	40 %	40 %	20 %	0 %	384226959
121	NC_017255	TTTTA	2	10	100841	100850	20 %	80 %	0 %	0 %	384226962
122	NC_017255	AATAT	2	10	101438	101447	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017255	AATTA	2	10	101813	101822	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017255	CAGAA	2	10	102459	102468	60 %	0 %	20 %	20 %	384226963
125	NC_017255	TAAAT	2	10	103237	103246	60 %	40 %	0 %	0 %	384226964
126	NC_017255	TATTT	2	10	103332	103341	20 %	80 %	0 %	0 %	384226965
127	NC_017255	TATTT	2	10	103928	103937	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017255	GAATT	2	10	106653	106662	40 %	40 %	20 %	0 %	384226968
129	NC_017255	TAAAA	2	10	107807	107816	80 %	20 %	0 %	0 %	384226969
130	NC_017255	TAAAA	2	10	107906	107915	80 %	20 %	0 %	0 %	384226969
131	NC_017255	ATTTT	2	10	108964	108973	20 %	80 %	0 %	0 %	384226970
132	NC_017255	TAATT	2	10	110194	110203	40 %	60 %	0 %	0 %	384226972
133	NC_017255	ATTAT	2	10	110521	110530	40 %	60 %	0 %	0 %	384226972
134	NC_017255	ATTTA	2	10	111158	111167	40 %	60 %	0 %	0 %	384226973
135	NC_017255	TTTTA	2	10	111509	111518	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017255	TGTTT	2	10	116740	116749	0 %	80 %	20 %	0 %	384226977
137	NC_017255	AGTAA	2	10	116831	116840	60 %	20 %	20 %	0 %	384226977
138	NC_017255	TAATT	2	10	117004	117013	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017255	ATATA	2	10	117150	117159	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017255	AGAAA	2	10	117261	117270	80 %	0 %	20 %	0 %	384226978
141	NC_017255	TATTT	2	10	117890	117899	20 %	80 %	0 %	0 %	384226979
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