MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. LL01 (Acyrthosiphon pisum) chromosome

Total Repeats: 210

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017255	AAAGA	2	10	86	95	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017255	ATATA	2	10	14092	14101	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017255	TACAA	2	10	14759	14768	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017255	ATTAA	2	10	18316	18325	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017255	TTTAT	2	10	20376	20385	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017255	TATTT	2	10	20689	20698	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017255	TACTT	2	10	20925	20934	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017255	TATAT	2	10	20941	20950	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017255	ATTTT	2	10	23590	23599	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017255	TAAAA	2	10	23703	23712	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017255	TTTCT	2	10	27121	27130	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017255	TTTTA	2	10	30725	30734	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017255	TTGTA	2	10	30888	30897	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017255	TGATA	2	10	30961	30970	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017255	TATAA	2	10	33509	33518	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017255	ATTTT	2	10	44808	44817	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017255	TAAAA	2	10	48403	48412	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017255	ATTAT	2	10	48911	48920	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017255	TGTAA	2	10	52250	52259	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017255	TTTAT	2	10	58929	58938	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017255	AGAAT	2	10	66256	66265	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017255	ATTTT	2	10	68381	68390	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017255	ATTAA	2	10	72247	72256	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017255	GCATG	2	10	76397	76406	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017255	TTAAA	2	10	87608	87617	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017255	AATAT	2	10	87719	87728	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017255	TCAAA	2	10	88564	88573	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017255	TTAAA	2	10	89018	89027	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017255	TTTAC	2	10	89089	89098	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017255	TAAAA	2	10	90428	90437	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017255	AAATT	2	10	90729	90738	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017255	AATAT	2	10	91542	91551	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017255	CCATG	2	10	93155	93164	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_017255	AATAT	2	10	101438	101447	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017255	AATTA	2	10	101813	101822	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017255	TATTT	2	10	103928	103937	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017255	TTTTA	2	10	111509	111518	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017255	TAATT	2	10	117004	117013	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017255	ATATA	2	10	117150	117159	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017255	TTGTA	2	10	127674	127683	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017255	TATAA	2	10	127808	127817	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017255	TTATT	2	10	133251	133260	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017255	ATTTT	2	10	154196	154205	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017255	AAGAA	2	10	155382	155391	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017255	ATATA	2	10	157230	157239	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017255	ATATT	2	10	157465	157474	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017255	ATATT	2	10	158442	158451	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017255	CTAAT	2	10	159067	159076	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017255	AAAAT	2	10	179702	179711	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017255	AATTT	2	10	180479	180488	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017255	AAGTG	2	10	190493	190502	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017255	TATAA	2	10	190738	190747	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017255	GGAAA	2	10	191023	191032	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017255	TTATT	2	10	201239	201248	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017255	ACTTT	2	10	202947	202956	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017255	ATATA	2	10	205181	205190	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017255	TAATT	2	10	211926	211935	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017255	ATTTT	2	10	212255	212264	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017255	TAATA	2	10	212310	212319	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017255	TTATT	2	10	215258	215267	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017255	TAATC	2	10	223802	223811	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017255	TGATA	2	10	231367	231376	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017255	GTATT	2	10	235421	235430	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017255	TGATT	2	10	236180	236189	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017255	CGTTC	2	10	243702	243711	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_017255	TAAAA	2	10	247020	247029	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017255	ATGTT	2	10	250696	250705	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017255	AGATT	2	10	252146	252155	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017255	ATTTT	2	10	254428	254437	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017255	TTAAT	2	10	256359	256368	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017255	TAAAA	2	10	258026	258035	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017255	TAAAA	2	10	267519	267528	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017255	AATGA	2	10	268358	268367	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017255	AATTT	2	10	269426	269435	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017255	ATTTT	2	10	277721	277730	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017255	ATAAA	2	10	278988	278997	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017255	AAAAT	2	10	280427	280436	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017255	TTTTA	2	10	281485	281494	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017255	TAAAT	2	10	281514	281523	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017255	ATTAG	2	10	284658	284667	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017255	ATGTA	2	10	297100	297109	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017255	AATTT	2	10	298558	298567	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017255	TAAAA	2	10	299342	299351	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017255	GCAAT	2	10	303316	303325	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_017255	TTTAT	2	10	307612	307621	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017255	ATAAA	2	10	313194	313203	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017255	ATAAA	2	10	315408	315417	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017255	TAAAA	2	10	320125	320134	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017255	ATTTT	2	10	326214	326223	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017255	TTAAA	2	10	326275	326284	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017255	ATATT	2	10	326298	326307	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017255	ATAAA	2	10	326630	326639	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017255	TTTAA	2	10	331039	331048	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017255	TAATT	2	10	331139	331148	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017255	CATAA	2	10	342311	342320	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017255	ATTAT	2	10	353950	353959	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017255	TTTAT	2	10	354711	354720	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017255	CATAA	2	10	357481	357490	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017255	ATATT	2	10	357794	357803	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017255	TATAA	2	10	359317	359326	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017255	AATTA	2	10	364366	364375	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017255	TAAAA	3	15	365777	365791	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017255	AAATT	2	10	368920	368929	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017255	TATTT	2	10	373140	373149	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017255	TAAAA	2	10	378490	378499	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017255	TATTT	2	10	380494	380503	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017255	TTTAT	2	10	382258	382267	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017255	CTATC	2	10	382580	382589	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_017255	TAAAA	2	10	386648	386657	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017255	ATTGA	2	10	391863	391872	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017255	TAAAA	2	10	396394	396403	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017255	AAAAG	2	10	397297	397306	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017255	TATAT	2	10	397590	397599	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017255	ATATA	2	10	397600	397609	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017255	AATTG	2	10	400125	400134	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017255	ATTAA	2	10	400135	400144	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017255	GAAAA	2	10	400922	400931	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017255	TTTTC	2	10	400980	400989	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017255	TAAAA	2	10	401349	401358	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017255	TAAAT	2	10	412276	412285	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017255	TAAAA	2	10	412449	412458	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017255	AAATT	2	10	412547	412556	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017255	TTTAT	2	10	414842	414851	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017255	TTTAT	2	10	416211	416220	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017255	TCTAT	2	10	421708	421717	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_017255	AAAAT	2	10	423307	423316	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017255	AATTA	2	10	431420	431429	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017255	AAATA	2	10	432850	432859	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017255	TTACA	2	10	433675	433684	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_017255	TAAAA	3	15	444235	444249	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017255	TATTT	2	10	445237	445246	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017255	ATATA	2	10	447579	447588	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017255	TTATT	2	10	449878	449887	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017255	GTGCT	2	10	450372	450381	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_017255	TTATA	2	10	452244	452253	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017255	TAAAT	2	10	455520	455529	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017255	TAGAA	2	10	456085	456094	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017255	AAAAT	2	10	456382	456391	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017255	ATTAC	2	10	467212	467221	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_017255	TAATA	2	10	470631	470640	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017255	TAAAT	2	10	476139	476148	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017255	AAATT	2	10	476262	476271	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017255	CAAAT	2	10	476314	476323	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_017255	ACAGA	2	10	476433	476442	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_017255	TAAAT	2	10	480315	480324	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017255	AAATT	2	10	481990	481999	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017255	ATAAA	2	10	488686	488695	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017255	TTATA	2	10	489146	489155	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017255	CATAT	2	10	495071	495080	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
150	NC_017255	TTAAT	2	10	496150	496159	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_017255	GAAAT	2	10	497637	497646	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_017255	AAATA	2	10	581495	581504	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_017255	TTATA	2	10	588955	588964	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_017255	TTTAA	2	10	593286	593295	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_017255	AAATT	2	10	594492	594501	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_017255	TTAAA	2	10	594503	594512	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_017255	TATAA	2	10	598879	598888	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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210	NC_017255	CAATT	2	10	641634	641643	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.