MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. LL01 (Acyrthosiphon pisum) chromosome

Total Repeats: 486

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017255	CAAT	2	8	13944	13951	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017255	TAAA	2	8	14275	14282	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017255	TAAA	2	8	18238	18245	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017255	AAAT	2	8	20485	20492	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017255	CAAT	2	8	20633	20640	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017255	ATTG	2	8	22942	22949	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017255	AAGA	2	8	23787	23794	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017255	TTAA	2	8	23799	23806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017255	TTAA	2	8	24883	24890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017255	ATTC	2	8	25886	25893	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017255	AAGA	2	8	26363	26370	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017255	TAGT	2	8	26599	26606	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017255	TAAT	2	8	26740	26747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017255	TAAT	2	8	27238	27245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017255	ATTG	2	8	29269	29276	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017255	TTTC	2	8	30314	30321	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017255	TTGT	2	8	30396	30403	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017255	AACT	2	8	31088	31095	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017255	TGCT	2	8	31101	31108	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017255	TTTA	2	8	35644	35651	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017255	ATTA	2	8	35773	35780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017255	TAAA	2	8	40597	40604	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017255	AATT	2	8	44703	44710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017255	ATTA	2	8	44862	44869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017255	AATT	2	8	45863	45870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017255	AAAG	2	8	45873	45880	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017255	AAGT	2	8	48368	48375	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017255	ATTT	2	8	48451	48458	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017255	TAAA	2	8	48486	48493	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017255	CTAC	2	8	48557	48564	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017255	CTGC	2	8	48839	48846	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017255	AATT	2	8	57435	57442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017255	TGAA	2	8	60821	60828	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017255	TAAA	2	8	60883	60890	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017255	ATTT	2	8	62751	62758	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017255	TTAA	2	8	63115	63122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017255	AATG	2	8	63145	63152	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017255	TTTA	2	8	64900	64907	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017255	TAAT	2	8	67547	67554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017255	TAAA	2	8	71222	71229	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017255	AGAT	2	8	74691	74698	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017255	TTTG	2	8	74732	74739	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017255	TTAT	2	8	76313	76320	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017255	AATT	2	8	87872	87879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017255	TTTA	2	8	88173	88180	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017255	TTGG	2	8	88405	88412	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017255	TAAA	2	8	88496	88503	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017255	ATTT	2	8	88597	88604	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017255	AAAT	2	8	88703	88710	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017255	CAAA	2	8	89184	89191	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017255	CAAT	2	8	89238	89245	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017255	AATA	2	8	89655	89662	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017255	ATTT	2	8	90035	90042	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017255	TAAA	2	8	91464	91471	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017255	TCAT	2	8	93041	93048	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017255	TTTA	2	8	94311	94318	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017255	ATTT	3	12	95799	95810	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017255	AAAT	2	8	101471	101478	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017255	AATT	2	8	101595	101602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017255	TATT	2	8	101702	101709	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017255	AATA	2	8	101897	101904	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017255	GATA	2	8	111488	111495	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017255	TAAT	2	8	115657	115664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017255	ATAA	2	8	125894	125901	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017255	TAAT	2	8	125908	125915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017255	ATTA	2	8	127719	127726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017255	TAAT	2	8	128929	128936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017255	AAAT	2	8	128953	128960	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017255	TTAA	2	8	128965	128972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017255	TGAT	2	8	130434	130441	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017255	TTAA	2	8	130470	130477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017255	TAAA	2	8	133714	133721	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017255	GATT	2	8	140622	140629	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017255	TGCA	2	8	141315	141322	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017255	TATT	2	8	141452	141459	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017255	CAAC	2	8	142004	142011	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017255	CAGA	2	8	143210	143217	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017255	AGAA	2	8	143393	143400	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017255	ATAA	2	8	143470	143477	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017255	ATTT	2	8	146009	146016	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017255	AAAT	2	8	146032	146039	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017255	TTAT	2	8	146067	146074	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017255	ATTT	2	8	148279	148286	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017255	TTGT	2	8	149703	149710	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017255	ATTA	2	8	154187	154194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017255	TCTA	2	8	154272	154279	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017255	AATT	2	8	155034	155041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017255	ATTT	2	8	156940	156947	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017255	TAAA	2	8	157100	157107	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017255	AACC	2	8	157785	157792	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017255	TGAT	2	8	157925	157932	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017255	TCTT	2	8	158041	158048	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017255	TATG	2	8	158290	158297	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017255	TAAT	2	8	158329	158336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017255	AACT	2	8	158663	158670	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017255	TTTA	2	8	159283	159290	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017255	AATT	2	8	159376	159383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017255	AAAT	2	8	160632	160639	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017255	ATTT	2	8	169360	169367	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017255	TAAA	2	8	169368	169375	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017255	ATTT	2	8	179969	179976	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017255	TAAA	2	8	183428	183435	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017255	CAAT	2	8	183464	183471	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017255	TAAA	2	8	184463	184470	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017255	ATTA	2	8	184516	184523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017255	ATTT	2	8	189676	189683	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017255	TAAA	2	8	189866	189873	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017255	AATT	2	8	190122	190129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017255	TAAA	2	8	190400	190407	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017255	TTAA	2	8	190561	190568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017255	TAAT	2	8	201195	201202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017255	ATTA	2	8	202168	202175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017255	AGAA	2	8	202204	202211	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017255	ATTA	2	8	202236	202243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017255	ATTA	2	8	203034	203041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017255	ACTT	2	8	203576	203583	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017255	TTTA	2	8	205086	205093	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017255	ATTA	2	8	211936	211943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017255	TATT	2	8	211954	211961	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017255	AATT	2	8	212043	212050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017255	ATTT	2	8	212281	212288	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017255	ACTA	2	8	212361	212368	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017255	TAAT	2	8	212371	212378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017255	ATGT	2	8	214621	214628	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017255	TAAA	2	8	215214	215221	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017255	TATT	2	8	215335	215342	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017255	CTAT	2	8	218640	218647	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017255	ATTT	2	8	218655	218662	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017255	ATTA	2	8	218703	218710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017255	ATTA	2	8	223662	223669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017255	TTAA	2	8	229342	229349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017255	ATTA	2	8	231201	231208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017255	AGAT	2	8	231431	231438	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017255	ATTT	2	8	232426	232433	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017255	ATAA	2	8	232491	232498	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017255	TATT	2	8	232531	232538	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017255	ATCA	2	8	232604	232611	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017255	ATTT	2	8	233815	233822	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017255	ATTT	2	8	235448	235455	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017255	TTCT	2	8	242700	242707	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017255	ATTT	2	8	242932	242939	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017255	CAGC	2	8	243472	243479	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_017255	ATTT	2	8	247009	247016	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017255	GAAT	2	8	247066	247073	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017255	TAAT	2	8	247155	247162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017255	AGCT	2	8	247194	247201	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017255	AGAA	2	8	248319	248326	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017255	TCTA	2	8	250605	250612	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_017255	AATT	2	8	250759	250766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017255	CTGC	2	8	251148	251155	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_017255	AAGT	2	8	251186	251193	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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153	NC_017255	AAAT	2	8	251932	251939	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.