MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. LL01 (Acyrthosiphon pisum) chromosome

Total Repeats: 7953

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017255	GTT	2	6	232	237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384226875
2	NC_017255	AGC	2	6	261	266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384226875
3	NC_017255	TCA	2	6	274	279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384226875
4	NC_017255	ATT	2	6	297	302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226875
5	NC_017255	GGT	2	6	400	405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384226875
6	NC_017255	ATG	2	6	406	411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384226875
7	NC_017255	CTG	2	6	470	475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384226875
8	NC_017255	CTA	2	6	482	487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384226875
9	NC_017255	AAT	2	6	547	552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226875
10	NC_017255	TGT	2	6	603	608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384226875
11	NC_017255	AGC	2	6	660	665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384226875
12	NC_017255	AGG	2	6	678	683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384226875
13	NC_017255	CTG	2	6	713	718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384226875
14	NC_017255	CGC	2	6	803	808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384226875
15	NC_017255	TTA	2	6	844	849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226875
16	NC_017255	CAT	2	6	904	909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384226875
17	NC_017255	ATA	2	6	961	966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226875
18	NC_017255	TAG	2	6	1172	1177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384226875
19	NC_017255	ACT	2	6	1321	1326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384226875
20	NC_017255	GAA	2	6	1333	1338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384226875
21	NC_017255	TTG	2	6	1354	1359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384226875
22	NC_017255	GCA	2	6	1372	1377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384226875
23	NC_017255	GAT	2	6	1444	1449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384226875
24	NC_017255	ACT	2	6	1453	1458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384226875
25	NC_017255	AGA	2	6	1521	1526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384226875
26	NC_017255	TTA	2	6	1735	1740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226875
27	NC_017255	TTG	2	6	1799	1804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384226875
28	NC_017255	AGA	2	6	1869	1874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384226875
29	NC_017255	ATC	2	6	1911	1916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384226875
30	NC_017255	TCT	2	6	1948	1953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384226875
31	NC_017255	GTT	2	6	1957	1962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384226875
32	NC_017255	GCT	2	6	2029	2034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384226875
33	NC_017255	TTA	2	6	2044	2049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226875
34	NC_017255	TCA	2	6	2324	2329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384226876
35	NC_017255	ATT	2	6	2367	2372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226876
36	NC_017255	TCT	2	6	2388	2393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384226876
37	NC_017255	ATT	2	6	2395	2400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226876
38	NC_017255	CTG	2	6	2716	2721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384226876
39	NC_017255	ATT	2	6	2915	2920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226876
40	NC_017255	TGC	2	6	2968	2973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384226876
41	NC_017255	TGG	2	6	2976	2981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384226876
42	NC_017255	TAA	2	6	3025	3030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226876
43	NC_017255	TGG	2	6	3190	3195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384226877
44	NC_017255	ATT	2	6	3284	3289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226877
45	NC_017255	CCT	2	6	3580	3585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384226878
46	NC_017255	ATT	2	6	3586	3591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226878
47	NC_017255	ATT	2	6	3694	3699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226878
48	NC_017255	AGA	2	6	3762	3767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384226878
49	NC_017255	AGA	2	6	3786	3791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384226878
50	NC_017255	AGT	2	6	3870	3875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384226878
51	NC_017255	GAT	2	6	3928	3933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384226878
52	NC_017255	GTT	2	6	3942	3947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384226878
53	NC_017255	CTT	2	6	3962	3967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384226878
54	NC_017255	AAT	2	6	4050	4055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226879
55	NC_017255	TTA	2	6	4087	4092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226879
56	NC_017255	TGA	2	6	4193	4198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384226879
57	NC_017255	TAA	2	6	4213	4218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226879
58	NC_017255	ATA	2	6	4255	4260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226879
59	NC_017255	CAT	2	6	4301	4306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384226879
60	NC_017255	TTC	2	6	4380	4385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384226879
61	NC_017255	AAT	2	6	4452	4457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226879
62	NC_017255	ATC	2	6	4483	4488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384226879
63	NC_017255	TAT	2	6	4624	4629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226880
64	NC_017255	TAT	2	6	4645	4650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226880
65	NC_017255	TAA	2	6	4702	4707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226880
66	NC_017255	AGT	2	6	4852	4857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384226880
67	NC_017255	ACA	2	6	4897	4902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384226880
68	NC_017255	ATT	2	6	5081	5086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226880
69	NC_017255	ATT	2	6	5147	5152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226880
70	NC_017255	TGT	2	6	5155	5160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384226880
71	NC_017255	AGA	2	6	5170	5175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384226880
72	NC_017255	TAG	3	9	5202	5210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384226880
73	NC_017255	ATT	2	6	5306	5311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226880
74	NC_017255	ATG	2	6	5313	5318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384226880
75	NC_017255	TAT	2	6	5358	5363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226880
76	NC_017255	ACC	2	6	5371	5376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384226880
77	NC_017255	TTA	2	6	5423	5428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226880
78	NC_017255	TAT	2	6	5518	5523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226880
79	NC_017255	CTA	2	6	5559	5564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384226880
80	NC_017255	CTG	2	6	5631	5636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384226880
81	NC_017255	TGC	2	6	5671	5676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384226880
82	NC_017255	ATT	2	6	5687	5692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226880
83	NC_017255	TGC	2	6	5743	5748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384226880
84	NC_017255	GAT	2	6	5774	5779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384226880
85	NC_017255	ATT	2	6	5821	5826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226880
86	NC_017255	TTG	2	6	5880	5885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384226880
87	NC_017255	AAT	2	6	5891	5896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226880
88	NC_017255	TGA	2	6	5902	5907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384226880
89	NC_017255	ATT	3	9	5964	5972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226880
90	NC_017255	GAA	2	6	5984	5989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384226880
91	NC_017255	TAA	2	6	5992	5997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226880
92	NC_017255	TGG	2	6	6182	6187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384226881
93	NC_017255	GAA	2	6	6211	6216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384226881
94	NC_017255	ATT	2	6	6247	6252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226881
95	NC_017255	GAA	2	6	6310	6315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384226881
96	NC_017255	TGG	2	6	6369	6374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384226881
97	NC_017255	TAT	2	6	6401	6406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226881
98	NC_017255	ATT	2	6	6453	6458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226881
99	NC_017255	ATA	2	6	6632	6637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226881
100	NC_017255	ATT	2	6	6666	6671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226881
101	NC_017255	TAA	2	6	6708	6713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226881
102	NC_017255	ATT	2	6	6719	6724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226881
103	NC_017255	GCT	2	6	6826	6831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384226881
104	NC_017255	ATA	2	6	6860	6865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226881
105	NC_017255	AAT	2	6	6998	7003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226882
106	NC_017255	ATC	2	6	7017	7022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384226882
107	NC_017255	ATT	2	6	7026	7031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226882
108	NC_017255	GTC	2	6	7038	7043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384226882
109	NC_017255	CAA	2	6	7131	7136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384226882
110	NC_017255	ATA	2	6	7291	7296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226882
111	NC_017255	GGT	2	6	7443	7448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384226882
112	NC_017255	ATG	2	6	7494	7499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384226882
113	NC_017255	ACC	2	6	7652	7657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384226882
114	NC_017255	TGA	2	6	7712	7717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384226882
115	NC_017255	TAT	2	6	7732	7737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226882
116	NC_017255	ATA	2	6	7744	7749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226882
117	NC_017255	CAG	2	6	7807	7812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384226882
118	NC_017255	AGA	2	6	7835	7840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384226882
119	NC_017255	CAA	2	6	7870	7875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384226882
120	NC_017255	CTG	2	6	7915	7920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384226882
121	NC_017255	CAA	2	6	7945	7950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384226882
122	NC_017255	GTC	2	6	8041	8046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384226882
123	NC_017255	ATT	2	6	8136	8141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226882
124	NC_017255	TAT	2	6	8306	8311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226882
125	NC_017255	TGA	2	6	8324	8329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384226882
126	NC_017255	GAA	2	6	8367	8372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384226882
127	NC_017255	TTA	2	6	8543	8548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226883
128	NC_017255	GAA	2	6	8600	8605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384226883
129	NC_017255	AGG	2	6	8620	8625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384226883
130	NC_017255	TGT	2	6	8647	8652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384226883
131	NC_017255	GAA	2	6	8729	8734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384226883
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