MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. JF98 (Acyrthosiphon pisum) chromosome

Total Repeats: 345

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017254	AAAGA	2	10	85	94	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017254	ATATA	2	10	14090	14099	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017254	TACAA	2	10	14757	14766	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017254	TTTCT	2	10	15057	15066	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017254	TTAGT	2	10	15191	15200	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017254	TATCT	2	10	16581	16590	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017254	ATTAA	2	10	18311	18320	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017254	TTTAT	2	10	20369	20378	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017254	TATTT	2	10	20682	20691	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017254	TACTT	2	10	20918	20927	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017254	TATAT	2	10	20934	20943	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017254	ATTTT	2	10	23584	23593	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017254	TAAAA	2	10	23697	23706	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017254	TTTTA	2	10	30720	30729	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017254	TTGTA	2	10	30883	30892	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017254	TGATA	2	10	30956	30965	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017254	TATAA	2	10	33504	33513	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017254	CTTGT	2	10	37411	37420	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017254	AAATA	2	10	38236	38245	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017254	TACAT	2	10	39959	39968	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017254	CTTTG	2	10	40270	40279	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017254	TGATC	2	10	40463	40472	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017254	TGTTT	2	10	41702	41711	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017254	TCCAT	2	10	42238	42247	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_017254	ATTTT	2	10	43815	43824	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017254	ATTTT	2	10	44804	44813	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017254	TAAAA	2	10	48399	48408	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017254	ATTAT	2	10	48907	48916	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017254	GTATT	2	10	48971	48980	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017254	TTTAA	2	10	49017	49026	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017254	ATATT	2	10	49415	49424	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017254	ATTGT	2	10	49609	49618	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017254	TGTAA	2	10	52247	52256	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017254	TAATT	2	10	53922	53931	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017254	TTTAT	2	10	58927	58936	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017254	ATATT	2	10	61873	61882	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017254	CATTC	2	10	65368	65377	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_017254	AGAAT	2	10	66257	66266	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017254	AATGC	2	10	66888	66897	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017254	ATATT	2	10	66986	66995	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017254	ATTTT	2	10	68381	68390	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017254	ATCCC	2	10	69138	69147	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
43	NC_017254	AAATC	2	10	69285	69294	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_017254	ATTAA	2	10	72248	72257	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017254	TAAAT	2	10	73018	73027	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017254	ATGTT	2	10	75055	75064	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017254	GAAAA	2	10	75777	75786	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017254	GAAAA	2	10	76141	76150	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017254	GCATG	2	10	76402	76411	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_017254	GATAT	2	10	81760	81769	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017254	TTAAA	2	10	87613	87622	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017254	TCAAA	2	10	88570	88579	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017254	TTAAA	2	10	89024	89033	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017254	TTTAC	2	10	89095	89104	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017254	TAAAA	2	10	90436	90445	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017254	AAATT	2	10	90737	90746	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017254	AATAT	2	10	91551	91560	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017254	CCATG	2	10	93165	93174	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_017254	AGATC	2	10	96061	96070	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017254	ATATT	2	10	96558	96567	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017254	AATAT	2	10	101450	101459	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017254	AATTA	2	10	101826	101835	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017254	CAGAA	2	10	102472	102481	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017254	TATTT	2	10	103942	103951	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017254	ATTTA	2	10	111173	111182	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017254	TTTTA	2	10	111524	111533	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017254	TAATT	2	10	117021	117030	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017254	ATATA	2	10	117167	117176	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017254	ATTAT	2	10	123945	123954	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017254	AAAGA	2	10	124654	124663	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017254	ATTAA	2	10	124738	124747	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017254	AAAAT	2	10	124804	124813	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017254	ATTTT	2	10	124989	124998	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017254	TAAAA	2	10	125805	125814	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017254	AATTT	2	10	125975	125984	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017254	GAAAA	2	10	126906	126915	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017254	TTGTA	2	10	127694	127703	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017254	TATAA	2	10	127828	127837	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017254	TATTG	2	10	128388	128397	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017254	TAAAA	2	10	128937	128946	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017254	GTTCA	2	10	129474	129483	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017254	TTATT	2	10	133272	133281	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017254	TTATT	2	10	137655	137664	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017254	CTATT	2	10	151273	151282	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_017254	CTTTT	2	10	151504	151513	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017254	TTAAT	2	10	153036	153045	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017254	ATTTT	2	10	154219	154228	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017254	ATATA	2	10	157250	157259	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017254	ATATT	2	10	157485	157494	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017254	ATATT	2	10	158462	158471	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017254	CTAAT	2	10	159088	159097	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_017254	ATCTT	2	10	161006	161015	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_017254	GTATT	2	10	177788	177797	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017254	AAAAT	2	10	179725	179734	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017254	AATTT	2	10	180494	180503	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017254	TAAAA	2	10	181399	181408	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017254	ATTAT	2	10	181895	181904	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017254	AAGTG	2	10	190513	190522	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017254	TATAA	2	10	190758	190767	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017254	GGAAA	2	10	191043	191052	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017254	ATCAG	2	10	195325	195334	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_017254	TTTCT	2	10	195488	195497	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017254	TTATT	2	10	201260	201269	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017254	ACTTT	2	10	202968	202977	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_017254	ATATA	2	10	205204	205213	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017254	CCAGG	2	10	208739	208748	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
107	NC_017254	TAAAT	2	10	209138	209147	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017254	TATAT	2	10	209662	209671	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017254	AAATT	2	10	209853	209862	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017254	TAAAT	2	10	210142	210151	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017254	ATTTT	2	10	210671	210680	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017254	GATAT	2	10	210991	211000	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017254	TAATT	2	10	211950	211959	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017254	ATTTT	2	10	212279	212288	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017254	TAATA	2	10	212334	212343	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017254	TTATT	2	10	215283	215292	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017254	TAATC	2	10	223828	223837	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_017254	TGGAA	2	10	225453	225462	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017254	CTATT	2	10	226119	226128	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_017254	TAAAA	2	10	230543	230552	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017254	CTTTT	2	10	230619	230628	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017254	TGATA	2	10	231396	231405	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017254	GTATT	2	10	235450	235459	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017254	TGATT	2	10	236210	236219	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017254	CGTTC	2	10	243732	243741	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
126	NC_017254	AATGA	2	10	245116	245125	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017254	TAAAA	2	10	247050	247059	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017254	ATTGT	2	10	249497	249506	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017254	TTTTC	2	10	249565	249574	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_017254	ATGTT	2	10	250724	250733	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017254	GGAAA	2	10	251477	251486	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017254	AGATT	2	10	252175	252184	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017254	ATTTT	2	10	254458	254467	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017254	TTAAT	2	10	256388	256397	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017254	TAAAA	2	10	258057	258066	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017254	AAATT	2	10	262229	262238	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017254	TTAAT	2	10	263248	263257	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017254	AATTT	2	10	264330	264339	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017254	AATTC	2	10	265807	265816	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_017254	ATTAT	2	10	266095	266104	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017254	TAAAA	2	10	267552	267561	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017254	AATTT	2	10	269459	269468	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017254	TTATT	2	10	271737	271746	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017254	TCTTT	2	10	273358	273367	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_017254	ATTTT	2	10	277760	277769	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017254	ATAAA	2	10	279027	279036	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017254	AAAAT	2	10	280468	280477	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017254	TTTTA	2	10	281527	281536	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017254	TAAAT	2	10	281556	281565	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017254	ATTAG	2	10	284699	284708	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017254	ATAAG	2	10	290198	290207	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017254	ATATT	2	10	295654	295663	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017254	TTAAA	2	10	295962	295971	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_017254	ATGTA	2	10	297147	297156	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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340	NC_017254	ATATT	2	10	636757	636766	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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344	NC_017254	ATTTT	2	10	640907	640916	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.