MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Buchnera aphidicola str. JF98 (Acyrthosiphon pisum) chromosome

Total Repeats: 9742

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017254	ACT	2	6	1	6	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017254	TAA	3	9	29	37	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017254	ATT	3	9	43	51	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017254	GTT	2	6	231	236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384226397
5	NC_017254	AGC	2	6	260	265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384226397
6	NC_017254	TCA	2	6	273	278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384226397
7	NC_017254	ATT	2	6	296	301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226397
8	NC_017254	GGT	2	6	399	404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384226397
9	NC_017254	ATG	2	6	405	410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384226397
10	NC_017254	CTG	2	6	469	474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384226397
11	NC_017254	CTA	2	6	481	486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384226397
12	NC_017254	AAT	2	6	546	551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226397
13	NC_017254	TGT	2	6	602	607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384226397
14	NC_017254	AGC	2	6	659	664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384226397
15	NC_017254	AGG	2	6	677	682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384226397
16	NC_017254	CTG	2	6	712	717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384226397
17	NC_017254	CGC	2	6	802	807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384226397
18	NC_017254	TTA	2	6	843	848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226397
19	NC_017254	CAT	2	6	903	908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384226397
20	NC_017254	ATA	2	6	960	965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226397
21	NC_017254	TAG	2	6	1171	1176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384226397
22	NC_017254	ACT	2	6	1320	1325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384226397
23	NC_017254	GAA	2	6	1332	1337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384226397
24	NC_017254	TTG	2	6	1353	1358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384226397
25	NC_017254	GCA	2	6	1371	1376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384226397
26	NC_017254	GAT	2	6	1443	1448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384226397
27	NC_017254	ACT	2	6	1452	1457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384226397
28	NC_017254	AGA	2	6	1520	1525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384226397
29	NC_017254	TTA	2	6	1734	1739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226397
30	NC_017254	TTG	2	6	1798	1803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384226397
31	NC_017254	AGA	2	6	1868	1873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384226397
32	NC_017254	ATC	2	6	1910	1915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384226397
33	NC_017254	TCT	2	6	1947	1952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384226397
34	NC_017254	GTT	2	6	1956	1961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384226397
35	NC_017254	AAT	2	6	1971	1976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226397
36	NC_017254	GCT	2	6	2028	2033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384226397
37	NC_017254	TTA	2	6	2043	2048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226397
38	NC_017254	ATA	2	6	2174	2179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017254	TCA	2	6	2323	2328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384226398
40	NC_017254	ATT	2	6	2366	2371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226398
41	NC_017254	TCT	2	6	2387	2392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384226398
42	NC_017254	ATT	2	6	2394	2399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226398
43	NC_017254	CTG	2	6	2715	2720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384226398
44	NC_017254	ATT	2	6	2914	2919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226398
45	NC_017254	TGC	2	6	2967	2972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384226398
46	NC_017254	TGG	2	6	2975	2980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384226398
47	NC_017254	TAA	2	6	3024	3029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226398
48	NC_017254	TGG	2	6	3189	3194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384226399
49	NC_017254	ATT	2	6	3283	3288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226399
50	NC_017254	ATT	2	6	3414	3419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017254	ATT	2	6	3424	3429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017254	CCT	2	6	3579	3584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384226400
53	NC_017254	ATT	2	6	3585	3590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226400
54	NC_017254	ATT	2	6	3693	3698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226400
55	NC_017254	AGA	2	6	3761	3766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384226400
56	NC_017254	AGA	2	6	3785	3790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384226400
57	NC_017254	AGT	2	6	3869	3874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384226400
58	NC_017254	GAT	2	6	3927	3932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384226400
59	NC_017254	GTT	2	6	3941	3946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384226400
60	NC_017254	CTT	2	6	3961	3966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384226400
61	NC_017254	AAT	2	6	4049	4054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226401
62	NC_017254	TTA	2	6	4086	4091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226401
63	NC_017254	TGA	2	6	4192	4197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384226401
64	NC_017254	TAA	2	6	4212	4217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226401
65	NC_017254	ATT	2	6	4219	4224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226401
66	NC_017254	ATA	2	6	4254	4259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226401
67	NC_017254	CAT	2	6	4300	4305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384226401
68	NC_017254	AAT	2	6	4451	4456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226401
69	NC_017254	ATC	2	6	4482	4487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384226401
70	NC_017254	AAT	3	9	4523	4531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017254	TAT	2	6	4623	4628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226402
72	NC_017254	TAT	2	6	4644	4649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226402
73	NC_017254	TAA	2	6	4701	4706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226402
74	NC_017254	AGT	2	6	4851	4856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384226402
75	NC_017254	ATG	2	6	4901	4906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384226402
76	NC_017254	ATT	2	6	5080	5085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226402
77	NC_017254	ATT	2	6	5146	5151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226402
78	NC_017254	TGT	2	6	5154	5159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384226402
79	NC_017254	AGA	2	6	5169	5174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384226402
80	NC_017254	TAG	3	9	5201	5209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384226402
81	NC_017254	ATT	2	6	5305	5310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226402
82	NC_017254	ATG	2	6	5312	5317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384226402
83	NC_017254	TAT	2	6	5357	5362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226402
84	NC_017254	ACC	2	6	5370	5375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384226402
85	NC_017254	TTA	2	6	5422	5427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226402
86	NC_017254	TAT	2	6	5517	5522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226402
87	NC_017254	CTA	2	6	5558	5563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384226402
88	NC_017254	CTG	2	6	5630	5635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384226402
89	NC_017254	TGC	2	6	5670	5675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384226402
90	NC_017254	ATT	2	6	5686	5691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226402
91	NC_017254	TGC	2	6	5742	5747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384226402
92	NC_017254	GAT	2	6	5773	5778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384226402
93	NC_017254	ATT	2	6	5820	5825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226402
94	NC_017254	TTG	2	6	5879	5884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384226402
95	NC_017254	AAT	2	6	5890	5895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226402
96	NC_017254	TGA	2	6	5901	5906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384226402
97	NC_017254	ATT	3	9	5963	5971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226402
98	NC_017254	GAA	2	6	5983	5988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384226402
99	NC_017254	TAA	2	6	5991	5996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226402
100	NC_017254	TAA	2	6	6082	6087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017254	TGG	2	6	6181	6186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384226403
102	NC_017254	GAA	2	6	6210	6215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384226403
103	NC_017254	ATT	2	6	6246	6251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226403
104	NC_017254	GAA	2	6	6309	6314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384226403
105	NC_017254	TGG	2	6	6368	6373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384226403
106	NC_017254	TAT	2	6	6400	6405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226403
107	NC_017254	ATT	2	6	6452	6457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226403
108	NC_017254	ATA	2	6	6631	6636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226403
109	NC_017254	ATT	2	6	6665	6670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226403
110	NC_017254	TAA	2	6	6707	6712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226403
111	NC_017254	ATT	2	6	6718	6723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226403
112	NC_017254	GCT	2	6	6825	6830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384226403
113	NC_017254	ATA	2	6	6859	6864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226403
114	NC_017254	TAG	2	6	6982	6987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017254	AAT	2	6	6997	7002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226404
116	NC_017254	ATC	2	6	7016	7021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384226404
117	NC_017254	ATT	2	6	7025	7030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226404
118	NC_017254	GTC	2	6	7037	7042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384226404
119	NC_017254	CAA	2	6	7130	7135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384226404
120	NC_017254	ATA	2	6	7290	7295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226404
121	NC_017254	GGT	2	6	7442	7447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384226404
122	NC_017254	ATG	2	6	7493	7498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384226404
123	NC_017254	ACC	2	6	7651	7656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384226404
124	NC_017254	TGA	2	6	7711	7716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384226404
125	NC_017254	TAT	2	6	7731	7736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226404
126	NC_017254	ATA	2	6	7743	7748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226404
127	NC_017254	CAG	2	6	7806	7811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384226404
128	NC_017254	AGA	2	6	7834	7839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384226404
129	NC_017254	CAA	2	6	7869	7874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384226404
130	NC_017254	CTG	2	6	7914	7919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384226404
131	NC_017254	CAA	2	6	7944	7949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384226404
132	NC_017254	GTC	2	6	8040	8045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384226404
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134	NC_017254	ATT	2	6	8179	8184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226404
135	NC_017254	TAT	2	6	8305	8310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226404
136	NC_017254	TGA	2	6	8323	8328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384226404
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251	NC_017254	TAA	2	6	15668	15673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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253	NC_017254	ACA	2	6	15755	15760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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255	NC_017254	TAT	2	6	16034	16039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_017254	TAT	2	6	16059	16064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_017254	TAT	2	6	16077	16082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_017254	AAC	2	6	16190	16195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_017254	TAT	2	6	16297	16302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_017254	TCT	2	6	16432	16437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
261	NC_017254	TAT	2	6	16563	16568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_017254	ACA	2	6	16569	16574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
263	NC_017254	ATG	2	6	16650	16655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384226411
264	NC_017254	AAT	2	6	16812	16817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226411
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266	NC_017254	TAA	2	6	16912	16917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226411
267	NC_017254	TAA	2	6	16927	16932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226411
268	NC_017254	TAA	2	6	16949	16954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226411
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274	NC_017254	TAC	2	6	17396	17401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384226411
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292	NC_017254	AAT	2	6	18339	18344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_017254	ATT	2	6	18353	18358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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