MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Buchnera aphidicola str. JF99 (Acyrthosiphon pisum) chromosome

Total Repeats: 727

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017253	AAAGA	2	10	85	94	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017253	TTTAA	2	10	204	213	40 %	60 %	0 %	0 %	414562367
3	NC_017253	TTAAT	2	10	1702	1711	40 %	60 %	0 %	0 %	414562367
4	NC_017253	ATTTT	2	10	2765	2774	20 %	80 %	0 %	0 %	414562368
5	NC_017253	TTTTA	2	10	2947	2956	20 %	80 %	0 %	0 %	414562368
6	NC_017253	AAAAT	2	10	5474	5483	80 %	20 %	0 %	0 %	414562372
7	NC_017253	ATTAA	2	10	6034	6043	60 %	40 %	0 %	0 %	414562372
8	NC_017253	ATGAA	2	10	7590	7599	60 %	20 %	20 %	0 %	414562374
9	NC_017253	TTTTC	2	10	9696	9705	0 %	80 %	0 %	20 %	414562376
10	NC_017253	TATAT	2	10	9872	9881	40 %	60 %	0 %	0 %	414562376
11	NC_017253	AAAAT	2	10	10598	10607	80 %	20 %	0 %	0 %	414562376
12	NC_017253	TAAGG	2	10	12216	12225	40 %	20 %	40 %	0 %	414562377
13	NC_017253	TTTTC	2	10	12610	12619	0 %	80 %	0 %	20 %	414562378
14	NC_017253	ATTTC	2	10	13396	13405	20 %	60 %	0 %	20 %	414562378
15	NC_017253	GATAA	2	10	13577	13586	60 %	20 %	20 %	0 %	414562378
16	NC_017253	ATATA	2	10	14090	14099	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017253	TACAA	2	10	14757	14766	60 %	20 %	0 %	20 %	414562381
18	NC_017253	TTTCT	2	10	15057	15066	0 %	80 %	0 %	20 %	414562382
19	NC_017253	TTAGT	2	10	15192	15201	20 %	60 %	20 %	0 %	414562382
20	NC_017253	TATCT	2	10	16582	16591	20 %	60 %	0 %	20 %	414562382
21	NC_017253	CAAAA	2	10	17579	17588	80 %	0 %	0 %	20 %	414562383
22	NC_017253	ATTAA	2	10	18313	18322	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017253	TTTAT	2	10	20371	20380	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017253	TATTT	2	10	20684	20693	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017253	TACTT	2	10	20920	20929	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017253	TATAT	2	10	20936	20945	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017253	AACAA	2	10	21170	21179	80 %	0 %	0 %	20 %	414562386
28	NC_017253	ATTTG	2	10	22979	22988	20 %	60 %	20 %	0 %	414562389
29	NC_017253	ATTTT	2	10	23585	23594	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017253	TAAAA	2	10	23698	23707	80 %	20 %	0 %	0 %	414562390
31	NC_017253	TAATT	2	10	24055	24064	40 %	60 %	0 %	0 %	414562390
32	NC_017253	ATACA	2	10	24582	24591	60 %	20 %	0 %	20 %	414562390
33	NC_017253	TTTCT	2	10	27116	27125	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017253	TAAAC	2	10	27912	27921	60 %	20 %	0 %	20 %	414562392
35	NC_017253	AAAAT	2	10	28440	28449	80 %	20 %	0 %	0 %	414562392
36	NC_017253	AAAAT	2	10	29453	29462	80 %	20 %	0 %	0 %	414562393
37	NC_017253	TTTTA	2	10	30720	30729	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017253	TTGTA	2	10	30869	30878	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017253	TGATA	2	10	30942	30951	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017253	TATAA	2	10	33490	33499	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017253	ATCCA	2	10	34047	34056	40 %	20 %	0 %	40 %	414562395
42	NC_017253	TAAAT	2	10	34650	34659	60 %	40 %	0 %	0 %	414562395
43	NC_017253	CTTGT	2	10	37397	37406	0 %	60 %	20 %	20 %	414562398
44	NC_017253	AAATA	2	10	38222	38231	80 %	20 %	0 %	0 %	414562398
45	NC_017253	TACAT	2	10	39945	39954	40 %	40 %	0 %	20 %	414562398
46	NC_017253	CTTTG	2	10	40256	40265	0 %	60 %	20 %	20 %	414562398
47	NC_017253	TGATC	2	10	40449	40458	20 %	40 %	20 %	20 %	414562398
48	NC_017253	TGTTT	2	10	41688	41697	0 %	80 %	20 %	0 %	414562399
49	NC_017253	TCCAT	2	10	42224	42233	20 %	40 %	0 %	40 %	414562399
50	NC_017253	ATTTT	2	10	43801	43810	20 %	80 %	0 %	0 %	414562399
51	NC_017253	ATTTT	2	10	44789	44798	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017253	TTTAT	2	10	45688	45697	20 %	80 %	0 %	0 %	414562401
53	NC_017253	GTCAT	2	10	46843	46852	20 %	40 %	20 %	20 %	414562403
54	NC_017253	ATAAA	2	10	47850	47859	80 %	20 %	0 %	0 %	414562405
55	NC_017253	TAAAA	2	10	48384	48393	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017253	ATTAT	2	10	48892	48901	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017253	TTTAA	2	10	49002	49011	40 %	60 %	0 %	0 %	414562406
58	NC_017253	ATATT	2	10	49399	49408	40 %	60 %	0 %	0 %	414562406
59	NC_017253	ATTGT	2	10	49593	49602	20 %	60 %	20 %	0 %	414562406
60	NC_017253	GAGCA	2	10	50696	50705	40 %	0 %	40 %	20 %	414562407
61	NC_017253	ATAAA	2	10	50767	50776	80 %	20 %	0 %	0 %	414562407
62	NC_017253	TTTAA	2	10	51050	51059	40 %	60 %	0 %	0 %	414562408
63	NC_017253	AATAA	2	10	51107	51116	80 %	20 %	0 %	0 %	414562408
64	NC_017253	TGTAA	2	10	52231	52240	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017253	ATTGT	2	10	52648	52657	20 %	60 %	20 %	0 %	414562409
66	NC_017253	TAATT	2	10	53905	53914	40 %	60 %	0 %	0 %	414562410
67	NC_017253	GGAAA	2	10	54560	54569	60 %	0 %	40 %	0 %	414562411
68	NC_017253	GGAAT	2	10	54639	54648	40 %	20 %	40 %	0 %	414562411
69	NC_017253	AATTA	2	10	57068	57077	60 %	40 %	0 %	0 %	414562413
70	NC_017253	ATTAA	2	10	57593	57602	60 %	40 %	0 %	0 %	414562414
71	NC_017253	ATCTA	2	10	57817	57826	40 %	40 %	0 %	20 %	414562414
72	NC_017253	GAAAA	2	10	58183	58192	80 %	0 %	20 %	0 %	414562415
73	NC_017253	CTTTA	2	10	58307	58316	20 %	60 %	0 %	20 %	414562415
74	NC_017253	ATTTA	2	10	58825	58834	40 %	60 %	0 %	0 %	414562415
75	NC_017253	TTTAT	2	10	58910	58919	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017253	ATATT	2	10	61856	61865	40 %	60 %	0 %	0 %	414562417
77	NC_017253	CAATT	2	10	63576	63585	40 %	40 %	0 %	20 %	414562419
78	NC_017253	TACCG	2	10	64655	64664	20 %	20 %	20 %	40 %	414562420
79	NC_017253	TAATA	2	10	64746	64755	60 %	40 %	0 %	0 %	414562420
80	NC_017253	CATTC	2	10	65349	65358	20 %	40 %	0 %	40 %	414562421
81	NC_017253	AGAAT	2	10	66237	66246	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017253	AATGC	2	10	66868	66877	40 %	20 %	20 %	20 %	414562422
83	NC_017253	ATATT	2	10	66967	66976	40 %	60 %	0 %	0 %	414562422
84	NC_017253	AATGG	2	10	67754	67763	40 %	20 %	40 %	0 %	414562423
85	NC_017253	ATTTT	2	10	68362	68371	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017253	AGAAA	2	10	68897	68906	80 %	0 %	20 %	0 %	414562424
87	NC_017253	ATCCC	2	10	69119	69128	20 %	20 %	0 %	60 %	414562425
88	NC_017253	AAATC	2	10	69266	69275	60 %	20 %	0 %	20 %	414562425
89	NC_017253	CATAT	2	10	72027	72036	40 %	40 %	0 %	20 %	414562427
90	NC_017253	ATTAA	2	10	72228	72237	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017253	TAAAT	2	10	72996	73005	60 %	40 %	0 %	0 %	414562428
92	NC_017253	ATGTT	2	10	75047	75056	20 %	60 %	20 %	0 %	414562429
93	NC_017253	GAAAA	2	10	75769	75778	80 %	0 %	20 %	0 %	414562429
94	NC_017253	TTTTA	2	10	75942	75951	20 %	80 %	0 %	0 %	414562429
95	NC_017253	GAAAA	2	10	76133	76142	80 %	0 %	20 %	0 %	414562429
96	NC_017253	GCATG	2	10	76394	76403	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_017253	AAATT	2	10	76778	76787	60 %	40 %	0 %	0 %	414562431
98	NC_017253	AATAC	2	10	78539	78548	60 %	20 %	0 %	20 %	414562432
99	NC_017253	TAAAT	2	10	79975	79984	60 %	40 %	0 %	0 %	414562434
100	NC_017253	GCTAT	2	10	81197	81206	20 %	40 %	20 %	20 %	414562435
101	NC_017253	GATAT	2	10	81751	81760	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017253	ATAAA	2	10	82503	82512	80 %	20 %	0 %	0 %	414562437
103	NC_017253	AATTA	2	10	83172	83181	60 %	40 %	0 %	0 %	414562438
104	NC_017253	TTAAT	2	10	83636	83645	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017253	CAAAT	2	10	85416	85425	60 %	20 %	0 %	20 %	414562440
106	NC_017253	TTAAA	2	10	87610	87619	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017253	AATAT	2	10	87721	87730	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017253	TAATA	2	10	87753	87762	60 %	40 %	0 %	0 %	414562445
109	NC_017253	TCAAA	2	10	88566	88575	60 %	20 %	0 %	20 %	414562446
110	NC_017253	TTAAA	2	10	89020	89029	60 %	40 %	0 %	0 %	414562446
111	NC_017253	TTTAC	2	10	89091	89100	20 %	60 %	0 %	20 %	414562446
112	NC_017253	TAAAA	2	10	90431	90440	80 %	20 %	0 %	0 %	414562446
113	NC_017253	AAATT	2	10	90732	90741	60 %	40 %	0 %	0 %	414562446
114	NC_017253	AATAT	2	10	91545	91554	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017253	CCATG	2	10	93158	93167	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_017253	GCAAT	2	10	94990	94999	40 %	20 %	20 %	20 %	414562451
117	NC_017253	GAATT	2	10	95122	95131	40 %	40 %	20 %	0 %	414562451
118	NC_017253	TAAAA	2	10	95773	95782	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017253	AGATC	2	10	96054	96063	40 %	20 %	20 %	20 %	414562452
120	NC_017253	ATATT	2	10	96550	96559	40 %	60 %	0 %	0 %	414562452
121	NC_017253	GATAT	2	10	97283	97292	40 %	40 %	20 %	0 %	414562453
122	NC_017253	TTTTA	2	10	100844	100853	20 %	80 %	0 %	0 %	414562456
123	NC_017253	AATAT	2	10	101441	101450	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017253	AATTA	2	10	101817	101826	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017253	CAGAA	2	10	102463	102472	60 %	0 %	20 %	20 %	414562457
126	NC_017253	TAAAT	2	10	103241	103250	60 %	40 %	0 %	0 %	414562458
127	NC_017253	TATTT	2	10	103336	103345	20 %	80 %	0 %	0 %	414562459
128	NC_017253	TATTT	2	10	103932	103941	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017253	GAATT	2	10	106656	106665	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017253	TAAAA	2	10	107810	107819	80 %	20 %	0 %	0 %	414562462
131	NC_017253	TAAAA	2	10	107909	107918	80 %	20 %	0 %	0 %	414562462
132	NC_017253	ATTTT	2	10	108967	108976	20 %	80 %	0 %	0 %	414562463
133	NC_017253	TAATT	2	10	110197	110206	40 %	60 %	0 %	0 %	414562465
134	NC_017253	ATTAT	2	10	110524	110533	40 %	60 %	0 %	0 %	414562465
135	NC_017253	ATTTA	2	10	111161	111170	40 %	60 %	0 %	0 %	414562466
136	NC_017253	TTTTA	2	10	111512	111521	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017253	TGTTT	2	10	116743	116752	0 %	80 %	20 %	0 %	414562470
138	NC_017253	AGTAA	2	10	116834	116843	60 %	20 %	20 %	0 %	414562470
139	NC_017253	TAATT	2	10	117007	117016	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017253	ATATA	2	10	117153	117162	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017253	GAAAA	2	10	117265	117274	80 %	0 %	20 %	0 %	414562471
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271	NC_017253	TGATT	2	10	236175	236184	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
272	NC_017253	TAATA	2	10	236837	236846	60 %	40 %	0 %	0 %	414562574
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404	NC_017253	AATTA	2	10	364348	364357	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
405	NC_017253	TAAAA	3	15	365759	365773	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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