MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. TLW03 (Acyrthosiphon pisum) chromosome

Total Repeats: 305

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017252	GGAATT	2	12	3230	3241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384225823
2	NC_017252	AAAACA	2	12	5835	5846	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384225826
3	NC_017252	CATCAG	2	12	9834	9845	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384225830
4	NC_017252	ACTGAA	2	12	11123	11134	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384225830
5	NC_017252	TAAAAA	2	12	11542	11553	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384225831
6	NC_017252	GCCATT	2	12	12735	12746	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384225832
7	NC_017252	TGAACG	2	12	12764	12775	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384225832
8	NC_017252	TGAATA	2	12	15560	15571	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384225835
9	NC_017252	ATTAAT	2	12	17199	17210	50 %	50 %	0 %	0 %	384225836
10	NC_017252	AATGAT	2	12	30162	30173	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384225845
11	NC_017252	AGAAAA	2	12	32972	32983	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384225846
12	NC_017252	ACATAT	2	12	40976	40987	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384225850
13	NC_017252	CTACTG	2	12	42542	42553	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384225850
14	NC_017252	ATTTCG	2	12	44900	44911	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384225851
15	NC_017252	AGAAAC	2	12	47322	47333	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384225855
16	NC_017252	TCATTT	2	12	47585	47596	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384225855
17	NC_017252	TATAGA	2	12	48125	48136	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384225856
18	NC_017252	GTTTTT	2	12	49186	49197	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384225857
19	NC_017252	CAATTT	2	12	51397	51408	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384225859
20	NC_017252	ATCTTT	2	12	55556	55567	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384225863
21	NC_017252	ATTTTT	2	12	60082	60093	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384225867
22	NC_017252	ATCTGT	2	12	60571	60582	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384225867
23	NC_017252	TTCAAA	2	12	65480	65491	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384225872
24	NC_017252	TAAAGA	2	12	66349	66360	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384225873
25	NC_017252	TAATTT	2	12	67318	67329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384225873
26	NC_017252	TTAAAA	2	12	72919	72930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384225877
27	NC_017252	TACTAT	2	12	73572	73583	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384225877
28	NC_017252	AAATCA	2	12	75191	75202	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384225878
29	NC_017252	GATATG	2	12	75354	75365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384225878
30	NC_017252	ATAGAA	2	12	76603	76614	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384225880
31	NC_017252	TGATTT	2	12	76696	76707	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384225880
32	NC_017252	GAAAAA	2	12	79489	79500	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384225882
33	NC_017252	TATTGA	2	12	81469	81480	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384225884
34	NC_017252	TAATAT	2	12	82656	82667	50 %	50 %	0 %	0 %	384225887
35	NC_017252	ATTTCT	2	12	83197	83208	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384225887
36	NC_017252	TTTTAA	2	12	83944	83955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384225888
37	NC_017252	AATAAA	2	12	84554	84565	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384225889
38	NC_017252	TAAAAA	2	12	85639	85650	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384225890
39	NC_017252	ATGTTA	2	12	86916	86927	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384225892
40	NC_017252	ATTTTT	2	12	87305	87316	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384225893
41	NC_017252	TAAAAT	2	12	87734	87745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384225895
42	NC_017252	TTTTTC	2	12	90949	90960	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384225896
43	NC_017252	TGAAAA	2	12	92415	92426	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384225897
44	NC_017252	AACATT	2	12	99139	99150	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384225902
45	NC_017252	TTATTT	2	12	102079	102090	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384225905
46	NC_017252	ATAGTA	2	12	108557	108568	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384225910
47	NC_017252	TTGATG	2	12	109893	109904	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384225912
48	NC_017252	TAAAAA	2	12	121888	121899	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384225924
49	NC_017252	TGTTCT	2	12	122916	122927	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384225925
50	NC_017252	ATTTTA	2	12	124337	124348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384225927
51	NC_017252	TTTTTC	2	12	125434	125445	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384225927
52	NC_017252	AAAGAA	2	12	126201	126212	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384225928
53	NC_017252	TTTTTA	2	12	126924	126935	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384225928
54	NC_017252	TCTTTT	2	12	127406	127417	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384225929
55	NC_017252	AATGAT	2	12	132926	132937	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384225934
56	NC_017252	TTAAAT	2	12	133840	133851	50 %	50 %	0 %	0 %	384225937
57	NC_017252	ATTTTC	2	12	138474	138485	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384225939
58	NC_017252	TAAAAA	2	12	139217	139228	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384225940
59	NC_017252	ATTCAT	2	12	139885	139896	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384225941
60	NC_017252	TTTTTA	2	12	140357	140368	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384225942
61	NC_017252	ATAAAA	2	12	141376	141387	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384225942
62	NC_017252	TTTTAT	2	12	141687	141698	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384225942
63	NC_017252	TTAAAT	2	12	142332	142343	50 %	50 %	0 %	0 %	384225943
64	NC_017252	CTTTTT	2	12	143977	143988	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384225944
65	NC_017252	TAAAGT	2	12	144984	144995	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384225945
66	NC_017252	CATCAA	2	12	150671	150682	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384225952
67	NC_017252	CTAAAT	2	12	153657	153668	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384225953
68	NC_017252	ATTAGA	2	12	155439	155450	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384225955
69	NC_017252	GAATAA	2	12	156604	156615	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384225956
70	NC_017252	ATTTAA	2	12	158844	158855	50 %	50 %	0 %	0 %	384225957
71	NC_017252	GAATTT	2	12	161703	161714	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384225960
72	NC_017252	TTTCCT	2	12	163587	163598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384225961
73	NC_017252	TTATTT	2	12	172205	172216	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384225968
74	NC_017252	TTTTTA	2	12	174582	174593	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384225972
75	NC_017252	ATTTTA	2	12	176830	176841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384225973
76	NC_017252	TTTAAT	2	12	177449	177460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384225973
77	NC_017252	CTGGAA	2	12	177673	177684	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384225973
78	NC_017252	AAAGAT	2	12	181570	181581	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384225975
79	NC_017252	ATATAA	2	12	181819	181830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384225975
80	NC_017252	ATTTTT	2	12	181971	181982	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384225976
81	NC_017252	AAAAGA	2	12	185856	185867	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384225979
82	NC_017252	GTCTTT	2	12	185874	185885	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384225979
83	NC_017252	GCTTTA	2	12	186010	186021	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384225979
84	NC_017252	AAATTC	2	12	187396	187407	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384225980
85	NC_017252	TTTATT	2	12	188456	188467	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384225982
86	NC_017252	ATTTTT	2	12	194343	194354	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384225985
87	NC_017252	TTAATT	2	12	195946	195957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384225986
88	NC_017252	ATTAAT	2	12	196896	196907	50 %	50 %	0 %	0 %	384225986
89	NC_017252	TTTTCC	2	12	197352	197363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384225986
90	NC_017252	TGACAA	2	12	199024	199035	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384225987
91	NC_017252	GTTTTA	2	12	201010	201021	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384225990
92	NC_017252	TTTTCT	2	12	201763	201774	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384225991
93	NC_017252	ATAGAA	2	12	204765	204776	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384225995
94	NC_017252	ATTGGT	2	12	205657	205668	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384225996
95	NC_017252	AGATAT	2	12	206209	206220	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384225998
96	NC_017252	CATTCG	2	12	207461	207472	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384225999
97	NC_017252	ATTTTT	2	12	208027	208038	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384225999
98	NC_017252	CCTAAT	2	12	208225	208236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384225999
99	NC_017252	TTTTAA	2	12	209530	209541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226001
100	NC_017252	TTGTTT	2	12	210232	210243	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384226001
101	NC_017252	CCTATT	2	12	210278	210289	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384226001
102	NC_017252	TTTATA	2	12	212495	212506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384226002
103	NC_017252	ATTAAT	2	12	214170	214181	50 %	50 %	0 %	0 %	384226004
104	NC_017252	AAAATT	2	12	216197	216208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226007
105	NC_017252	CTAATC	2	12	217180	217191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384226008
106	NC_017252	TTTTAT	2	12	217216	217227	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384226008
107	NC_017252	GAAAAA	2	12	220068	220079	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384226009
108	NC_017252	TTTTAT	2	12	221878	221889	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384226011
109	NC_017252	TGGAAA	2	12	224630	224641	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384226013
110	NC_017252	AGAATT	2	12	227012	227023	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384226014
111	NC_017252	TTATCT	2	12	227601	227612	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384226014
112	NC_017252	GATATT	2	12	227986	227997	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384226015
113	NC_017252	AGAAAA	2	12	229200	229211	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384226016
114	NC_017252	GTATTT	2	12	230263	230274	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384226018
115	NC_017252	CAATAT	2	12	231354	231365	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384226019
116	NC_017252	TCCAGT	2	12	233459	233470	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384226021
117	NC_017252	AGCTCC	2	12	233576	233587	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384226021
118	NC_017252	ATTTTT	2	12	237614	237625	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384226024
119	NC_017252	TAATAC	2	12	239643	239654	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384226026
120	NC_017252	ATTTTT	2	12	240189	240200	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384226027
121	NC_017252	CAAAAA	2	12	241479	241490	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384226028
122	NC_017252	AAATAT	2	12	242082	242093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384226028
123	NC_017252	TATTTT	2	12	242810	242821	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384226029
124	NC_017252	TTTTTC	2	12	246342	246353	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384226031
125	NC_017252	TTAATA	2	12	249129	249140	50 %	50 %	0 %	0 %	384226034
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.